Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5W8

SNX13, Sorting nexin-13, humanhuman

Predictions only

Length 968 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX13Q9Y5W8 AL451054.2-201ENST00000420896 202 ntBASIC4□□□□□ -1.77
SNX13Q9Y5W8 MYCBP2-AS1-201ENST00000422231 519 ntTSL 3 BASIC4□□□□□ -1.77
SNX13Q9Y5W8 RPL7AP25-201ENST00000423357 805 ntBASIC4□□□□□ -1.77
SNX13Q9Y5W8 RPL27AP8-201ENST00000424277 446 ntBASIC4□□□□□ -1.77
SNX13Q9Y5W8 AC091493.1-201ENST00000426218 411 ntTSL 3 BASIC4□□□□□ -1.77
SNX13Q9Y5W8 TIMM9P3-201ENST00000428659 274 ntBASIC4□□□□□ -1.77
SNX13Q9Y5W8 RPS20P5-201ENST00000434808 360 ntBASIC4□□□□□ -1.77
SNX13Q9Y5W8 USP9YP28-201ENST00000435142 589 ntBASIC4□□□□□ -1.77
SNX13Q9Y5W8 AF228730.2-201ENST00000438784 848 ntBASIC4□□□□□ -1.77
SNX13Q9Y5W8 RPS15AP9-201ENST00000439856 381 ntBASIC4□□□□□ -1.77
SNX13Q9Y5W8 AC018693.1-201ENST00000442829 550 ntTSL 4 BASIC4□□□□□ -1.77
SNX13Q9Y5W8 HMGN2P16-201ENST00000456802 261 ntBASIC4□□□□□ -1.77
SNX13Q9Y5W8 RPS20P20-201ENST00000460498 340 ntBASIC4□□□□□ -1.77
SNX13Q9Y5W8 VN1R105P-201ENST00000486595 910 ntBASIC4□□□□□ -1.77
SNX13Q9Y5W8 AL049874.1-201ENST00000489560 388 ntBASIC4□□□□□ -1.77
SNX13Q9Y5W8 RPL35P6-201ENST00000490024 372 ntBASIC4□□□□□ -1.77
SNX13Q9Y5W8 MRPS33-209ENST00000496958 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4□□□□□ -1.77
SNX13Q9Y5W8 AC019235.1-201ENST00000503847 207 ntBASIC4□□□□□ -1.77
SNX13Q9Y5W8 FTH1P9-201ENST00000513251 355 ntBASIC4□□□□□ -1.77
SNX13Q9Y5W8 AC008700.1-202ENST00000513657 468 ntTSL 5 BASIC4□□□□□ -1.77
SNX13Q9Y5W8 SCARNA15.2-201ENST00000516409 127 ntBASIC4□□□□□ -1.77
SNX13Q9Y5W8 RNU6-314P-201ENST00000516574 104 ntBASIC4□□□□□ -1.77
SNX13Q9Y5W8 MIR2114-201ENST00000516645 80 ntBASIC4□□□□□ -1.77
SNX13Q9Y5W8 IGKV2-38-201ENST00000517443 247 ntBASIC4□□□□□ -1.77
SNX13Q9Y5W8 AC084768.1-201ENST00000518926 923 ntTSL 3 BASIC4□□□□□ -1.77
SNX13Q9Y5W8 SDCBP-207ENST00000520168 1097 ntTSL 2 BASIC4□□□□□ -1.77
SNX13Q9Y5W8 AC113145.1-201ENST00000522408 412 ntTSL 5 BASIC4□□□□□ -1.77
SNX13Q9Y5W8 OR5G4P-201ENST00000525251 760 ntBASIC4□□□□□ -1.77
SNX13Q9Y5W8 AP000827.1-201ENST00000527814 258 ntBASIC4□□□□□ -1.77
SNX13Q9Y5W8 AC023442.3-203ENST00000530946 533 ntTSL 4 BASIC4□□□□□ -1.77
SNX13Q9Y5W8 AP003034.1-201ENST00000534621 422 ntBASIC4□□□□□ -1.77
SNX13Q9Y5W8 APPL2-203ENST00000546731 684 ntTSL 2 BASIC4□□□□□ -1.77
SNX13Q9Y5W8 AL160314.2-204ENST00000554730 380 ntTSL 5 BASIC4□□□□□ -1.77
SNX13Q9Y5W8 AL445074.1-201ENST00000555362 318 ntTSL 2 BASIC4□□□□□ -1.77
SNX13Q9Y5W8 AC076968.1-201ENST00000566418 429 ntTSL 5 BASIC4□□□□□ -1.77
SNX13Q9Y5W8 AC022968.1-201ENST00000567372 442 ntBASIC4□□□□□ -1.77
SNX13Q9Y5W8 RPL23AP84-201ENST00000571193 464 ntBASIC4□□□□□ -1.77
SNX13Q9Y5W8 AC044840.1-201ENST00000577641 472 ntTSL 3 BASIC4□□□□□ -1.77
SNX13Q9Y5W8 LINC01905-202ENST00000588139 459 ntTSL 3 BASIC4□□□□□ -1.77
SNX13Q9Y5W8 ZNF788-206ENST00000596883 692 ntTSL 3 BASIC4□□□□□ -1.77
SNX13Q9Y5W8 AC025165.5-201ENST00000602802 578 ntBASIC4□□□□□ -1.77
SNX13Q9Y5W8 AC020910.2-201ENST00000603635 610 ntBASIC4□□□□□ -1.77
SNX13Q9Y5W8 AC107304.1-201ENST00000604229 296 ntBASIC4□□□□□ -1.77
SNX13Q9Y5W8 AC106900.2-201ENST00000604994 317 ntBASIC4□□□□□ -1.77
SNX13Q9Y5W8 AL121992.2-201ENST00000606262 256 ntBASIC4□□□□□ -1.77
SNX13Q9Y5W8 AC126118.1-201ENST00000607744 628 ntBASIC4□□□□□ -1.77
SNX13Q9Y5W8 BX323046.1-201ENST00000610145 535 ntBASIC4□□□□□ -1.77
SNX13Q9Y5W8 AC092794.1-201ENST00000612734 582 ntBASIC4□□□□□ -1.77
SNX13Q9Y5W8 AC018445.2-201ENST00000622987 260 ntBASIC4□□□□□ -1.77
SNX13Q9Y5W8 HSP90AA4P-202ENST00000506915 2228 ntBASIC4□□□□□ -1.77
SNX13Q9Y5W8 MTRNR2L6-201ENST00000604952 1447 ntAPPRIS P1 BASIC4□□□□□ -1.77
SNX13Q9Y5W8 CNGA1-201ENST00000358519 2627 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4□□□□□ -1.77
SNX13Q9Y5W8 UBE2D3-233ENST00000618836 3472 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4□□□□□ -1.77
SNX13Q9Y5W8 AL137003.2-201ENST00000606924 2538 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
SNX13Q9Y5W8 PRO1804-201ENST00000623780 2050 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
SNX13Q9Y5W8 UBE4A-202ENST00000431736 6061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.99□□□□□ -1.77
SNX13Q9Y5W8 PP2D1-202ENST00000389050 2151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.99□□□□□ -1.77
SNX13Q9Y5W8 FAM111B-206ENST00000620384 3405 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.99□□□□□ -1.77
SNX13Q9Y5W8 LINC00305-201ENST00000323355 873 ntTSL 1 (best) BASIC3.99□□□□□ -1.77
SNX13Q9Y5W8 RNU6-188P-201ENST00000364207 107 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
SNX13Q9Y5W8 SMIM11P1-201ENST00000369586 178 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
SNX13Q9Y5W8 AKAP14-203ENST00000371425 793 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.99□□□□□ -1.77
SNX13Q9Y5W8 SNORA37-201ENST00000384504 129 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
SNX13Q9Y5W8 AL583835.1-201ENST00000399570 407 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
SNX13Q9Y5W8 AL133270.1-201ENST00000402635 279 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
SNX13Q9Y5W8 NDUFS5P1-201ENST00000405668 289 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
SNX13Q9Y5W8 AC104462.1-201ENST00000414565 447 ntTSL 2 BASIC3.99□□□□□ -1.77
SNX13Q9Y5W8 ZNF90P2-204ENST00000419323 1075 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
SNX13Q9Y5W8 ISCA1P1-201ENST00000426679 387 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
SNX13Q9Y5W8 RPL7L1P10-201ENST00000427790 463 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
SNX13Q9Y5W8 AL353612.1-201ENST00000428769 465 ntTSL 3 BASIC3.99□□□□□ -1.77
SNX13Q9Y5W8 AC011742.1-201ENST00000431448 434 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
SNX13Q9Y5W8 HMGB1P12-201ENST00000438594 598 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
SNX13Q9Y5W8 AC099566.1-201ENST00000442558 479 ntTSL 3 BASIC3.99□□□□□ -1.77
SNX13Q9Y5W8 AL160271.1-201ENST00000444708 829 ntTSL 3 BASIC3.99□□□□□ -1.77
SNX13Q9Y5W8 AP000844.1-201ENST00000446631 577 ntTSL 3 BASIC3.99□□□□□ -1.77
SNX13Q9Y5W8 AC079354.3-201ENST00000447111 311 ntTSL 2 BASIC3.99□□□□□ -1.77
SNX13Q9Y5W8 AC034195.1-202ENST00000451031 610 ntTSL 3 BASIC3.99□□□□□ -1.77
SNX13Q9Y5W8 AC018638.3-201ENST00000461273 132 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
SNX13Q9Y5W8 RPS4XP13-201ENST00000483219 789 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
SNX13Q9Y5W8 AC079382.1-201ENST00000493346 557 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
SNX13Q9Y5W8 HSPD1P15-201ENST00000505573 1122 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
SNX13Q9Y5W8 MEF2C-AS1-212ENST00000514158 713 ntTSL 5 BASIC3.99□□□□□ -1.77
SNX13Q9Y5W8 RN7SKP258-201ENST00000517151 304 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
SNX13Q9Y5W8 AP001922.4-201ENST00000526967 290 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
SNX13Q9Y5W8 MIR100HG-221ENST00000534297 572 ntTSL 4 BASIC3.99□□□□□ -1.77
SNX13Q9Y5W8 AC084398.2-201ENST00000551918 564 ntTSL 4 BASIC3.99□□□□□ -1.77
SNX13Q9Y5W8 AL359212.1-201ENST00000556608 614 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
SNX13Q9Y5W8 AC020659.1-204ENST00000562920 400 ntTSL 3 BASIC3.99□□□□□ -1.77
SNX13Q9Y5W8 AC055876.1-202ENST00000567053 138 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
SNX13Q9Y5W8 MIR4527HG-203ENST00000600127 704 ntTSL 5 BASIC3.99□□□□□ -1.77
SNX13Q9Y5W8 AC025449.1-201ENST00000603896 529 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
SNX13Q9Y5W8 AL354984.3-201ENST00000604803 325 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
SNX13Q9Y5W8 AC048347.1-201ENST00000624621 427 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
SNX13Q9Y5W8 PTP4A2-219ENST00000626355 606 ntTSL 5 BASIC3.99□□□□□ -1.77
SNX13Q9Y5W8 LINC01002-227ENST00000633363 541 ntTSL 1 (best) BASIC3.99□□□□□ -1.77
SNX13Q9Y5W8 SLCO1B1-201ENST00000256958 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.99□□□□□ -1.77
SNX13Q9Y5W8 USH2A-202ENST00000366942 6320 ntTSL 1 (best) BASIC3.99□□□□□ -1.77
SNX13Q9Y5W8 PCDH15-218ENST00000437009 6804 ntTSL 5 BASIC3.98□□□□□ -1.77
SNX13Q9Y5W8 ARHGAP42-201ENST00000298815 4752 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.98□□□□□ -1.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 98.4 ms