Protein–RNA interactions for Protein: Q96PN7

TRERF1, Transcriptional-regulating factor 1, humanhuman

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Length 1,200 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRERF1Q96PN7 SAMSN1-206ENST00000619120 2028 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
TRERF1Q96PN7 FILIP1-203ENST00000393004 7807 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
TRERF1Q96PN7 DDHD2-202ENST00000517385 4113 ntTSL 2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
TRERF1Q96PN7 OR56A5-201ENST00000340110 738 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
TRERF1Q96PN7 RNU6-1059P-201ENST00000363752 98 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
TRERF1Q96PN7 Y_RNA.274-201ENST00000364714 101 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
TRERF1Q96PN7 RNU6-338P-201ENST00000383888 105 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
TRERF1Q96PN7 SNORA66-201ENST00000384792 133 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
TRERF1Q96PN7 RPL31P45-201ENST00000419532 356 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
TRERF1Q96PN7 AC069257.1-202ENST00000425275 422 ntTSL 3 BASIC5.86□□□□□ -1.47
TRERF1Q96PN7 USP9YP30-201ENST00000430729 455 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
TRERF1Q96PN7 LINC01754-201ENST00000437920 750 ntTSL 3 BASIC5.86□□□□□ -1.47
TRERF1Q96PN7 RPS15AP27-201ENST00000449183 343 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
TRERF1Q96PN7 AC133473.1-201ENST00000455173 299 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
TRERF1Q96PN7 SCARNA18-201ENST00000459004 134 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
TRERF1Q96PN7 RN7SL443P-201ENST00000464331 290 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
TRERF1Q96PN7 AC108860.1-201ENST00000484521 383 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
TRERF1Q96PN7 AC105758.1-201ENST00000506038 399 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
TRERF1Q96PN7 RNA5SP43-201ENST00000516559 110 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
TRERF1Q96PN7 Y_RNA.700-201ENST00000516806 100 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
TRERF1Q96PN7 AC090692.1-202ENST00000525363 607 ntTSL 4 BASIC5.86□□□□□ -1.47
TRERF1Q96PN7 AC021006.3-201ENST00000530771 192 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
TRERF1Q96PN7 OR56A5-202ENST00000532411 942 ntAPPRIS P1 BASIC5.86□□□□□ -1.47
TRERF1Q96PN7 AC010175.1-201ENST00000538219 224 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
TRERF1Q96PN7 MIR5692C1-201ENST00000585309 91 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
TRERF1Q96PN7 RAC1P9-201ENST00000604990 392 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
TRERF1Q96PN7 EAF1-AS1-211ENST00000610011 316 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
TRERF1Q96PN7 AL354696.2-202ENST00000620300 613 ntTSL 2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
TRERF1Q96PN7 AP000843.1-201ENST00000624880 701 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
TRERF1Q96PN7 SRRM1-202ENST00000374389 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
TRERF1Q96PN7 SRSF11-201ENST00000370949 3034 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
TRERF1Q96PN7 SCN2A-201ENST00000283256 8660 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
TRERF1Q96PN7 LRRC53-201ENST00000294635 3859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
TRERF1Q96PN7 MS4A1-202ENST00000389939 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
TRERF1Q96PN7 MGAT4A-203ENST00000409391 2018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
TRERF1Q96PN7 AC090510.1-202ENST00000500850 2017 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
TRERF1Q96PN7 TMEM71-201ENST00000356838 1993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
TRERF1Q96PN7 KIAA0408-204ENST00000483725 3284 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
TRERF1Q96PN7 VWC2L-202ENST00000427124 4480 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
TRERF1Q96PN7 DNAH7-202ENST00000409063 1845 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
TRERF1Q96PN7 IL31RA-204ENST00000396834 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
TRERF1Q96PN7 PCDH9-203ENST00000456367 5072 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
TRERF1Q96PN7 CSPP1-201ENST00000262210 4367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
TRERF1Q96PN7 NUP155-202ENST00000381843 4200 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
TRERF1Q96PN7 ZNF630-207ENST00000616492 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
TRERF1Q96PN7 ZBTB44-210ENST00000530205 2179 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
TRERF1Q96PN7 Y_RNA.29-201ENST00000362570 113 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
TRERF1Q96PN7 RNU6-212P-201ENST00000362642 104 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
TRERF1Q96PN7 RNU6-61P-201ENST00000365528 109 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
TRERF1Q96PN7 C1orf54-202ENST00000369099 600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
TRERF1Q96PN7 Y_RNA.478-201ENST00000384358 107 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
TRERF1Q96PN7 SNORA24.1-201ENST00000384401 135 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
TRERF1Q96PN7 RNU6-125P-201ENST00000384505 107 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
TRERF1Q96PN7 Y_RNA.518-201ENST00000384552 113 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
TRERF1Q96PN7 AL445189.1-201ENST00000405722 338 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
TRERF1Q96PN7 RNU6-55P-201ENST00000411092 107 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
TRERF1Q96PN7 AL133384.1-201ENST00000412744 351 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
TRERF1Q96PN7 BX682237.1-201ENST00000415016 335 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
TRERF1Q96PN7 AL139095.3-201ENST00000419672 1203 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
TRERF1Q96PN7 AL139819.1-201ENST00000429420 471 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
TRERF1Q96PN7 RPL7AP49-201ENST00000429522 581 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
TRERF1Q96PN7 AL590233.1-201ENST00000430017 456 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
TRERF1Q96PN7 AL591438.1-201ENST00000433508 581 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
TRERF1Q96PN7 AC016292.1-201ENST00000438344 235 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
TRERF1Q96PN7 KCND3-IT1-201ENST00000439736 376 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
TRERF1Q96PN7 AL390067.1-201ENST00000440009 420 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
TRERF1Q96PN7 PLCB1-IT1-202ENST00000451443 251 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
TRERF1Q96PN7 PTCHD1-AS-201ENST00000455399 718 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
TRERF1Q96PN7 RN7SL809P-201ENST00000482040 297 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
TRERF1Q96PN7 CEACAMP10-202ENST00000495431 496 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
TRERF1Q96PN7 Y_RNA.703-201ENST00000516846 111 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
TRERF1Q96PN7 RNU6-570P-201ENST00000517051 105 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
TRERF1Q96PN7 AC069120.1-201ENST00000521623 379 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
TRERF1Q96PN7 AC025437.5-201ENST00000522769 314 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
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TRERF1Q96PN7 AC023510.1-201ENST00000555862 490 ntTSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
TRERF1Q96PN7 AC091073.1-201ENST00000559620 666 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
TRERF1Q96PN7 AC084783.1-201ENST00000565846 910 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
TRERF1Q96PN7 MIR4675-201ENST00000577898 77 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
TRERF1Q96PN7 hsa-mir-548d-2.1-201ENST00000582790 97 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
TRERF1Q96PN7 AC067968.2-201ENST00000592583 566 ntTSL 4 BASIC5.85□□□□□ -1.47
TRERF1Q96PN7 AC104534.1-201ENST00000594558 566 ntTSL 4 BASIC5.85□□□□□ -1.47
TRERF1Q96PN7 AC103858.1-201ENST00000607019 476 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
TRERF1Q96PN7 MIR6820-201ENST00000611508 62 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
TRERF1Q96PN7 AC109462.4-201ENST00000637882 581 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
TRERF1Q96PN7 PROS2P-201ENST00000474651 1951 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
TRERF1Q96PN7 ZFP14-201ENST00000270001 7489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
TRERF1Q96PN7 LINC00507-201ENST00000540882 1935 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
TRERF1Q96PN7 AL022322.2-201ENST00000624072 20397 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
TRERF1Q96PN7 ARID2-202ENST00000422737 5481 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
TRERF1Q96PN7 ZEB1-202ENST00000361642 5990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
TRERF1Q96PN7 Z95114.1-201ENST00000624264 14574 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
TRERF1Q96PN7 AL672167.1-204ENST00000641875 3017 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
TRERF1Q96PN7 OBSCN-204ENST00000366707 26772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
TRERF1Q96PN7 ANKRD36B-202ENST00000359901 4297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
TRERF1Q96PN7 LINC01933-204ENST00000524295 3591 ntTSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
TRERF1Q96PN7 RAB18-209ENST00000621805 4894 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
TRERF1Q96PN7 FMN1-202ENST00000334528 12355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
TRERF1Q96PN7 AC009902.3-201ENST00000606235 2172 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
TRERF1Q96PN7 GABRG1-201ENST00000295452 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
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