Protein–RNA interactions for Protein: Q17RS7

GEN1, Flap endonuclease GEN homolog 1, humanhuman

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Length 908 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GEN1Q17RS7 AC104164.2-201ENST00000496953 495 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
GEN1Q17RS7 AC114786.4-201ENST00000508771 728 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
GEN1Q17RS7 AC008700.1-202ENST00000513657 468 ntTSL 5 BASIC4.3□□□□□ -1.72
GEN1Q17RS7 AL355097.1-201ENST00000555889 539 ntTSL 4 BASIC4.3□□□□□ -1.72
GEN1Q17RS7 AC090615.1-201ENST00000577519 154 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
GEN1Q17RS7 UBE2L4-201ENST00000587688 464 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
GEN1Q17RS7 PPP3CB-AS1-206ENST00000595935 675 ntTSL 5 BASIC4.3□□□□□ -1.72
GEN1Q17RS7 LLPHP1-201ENST00000603571 367 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
GEN1Q17RS7 AL139395.1-201ENST00000603662 160 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
GEN1Q17RS7 AC244472.2-201ENST00000617639 406 ntAPPRIS P1 BASIC4.3□□□□□ -1.72
GEN1Q17RS7 AL158801.5-201ENST00000623123 465 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
GEN1Q17RS7 AC009161.2-201ENST00000624626 138 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
GEN1Q17RS7 CNOT2-231ENST00000551483 4753 ntTSL 2 BASIC4.3□□□□□ -1.72
GEN1Q17RS7 PNISR-201ENST00000369239 5112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.3□□□□□ -1.72
GEN1Q17RS7 WHAMMP2-201ENST00000512149 5482 ntTSL 5 BASIC4.3□□□□□ -1.72
GEN1Q17RS7 DENND2C-203ENST00000393277 4730 ntTSL 5 BASIC4.3□□□□□ -1.72
GEN1Q17RS7 TAOK3-202ENST00000419821 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.3□□□□□ -1.72
GEN1Q17RS7 CLHC1-201ENST00000401408 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.3□□□□□ -1.72
GEN1Q17RS7 RAPH1-203ENST00000374493 3909 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.3□□□□□ -1.72
GEN1Q17RS7 AC046195.1-201ENST00000518973 4171 ntTSL 2 BASIC4.3□□□□□ -1.72
GEN1Q17RS7 SPAG17-201ENST00000336338 6924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.3□□□□□ -1.72
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GEN1Q17RS7 PPIP5K2-201ENST00000321521 15407 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.29□□□□□ -1.72
GEN1Q17RS7 C1D-201ENST00000355848 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.29□□□□□ -1.72
GEN1Q17RS7 IQCB2P-201ENST00000401788 1633 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
GEN1Q17RS7 PDE1A-205ENST00000435564 4885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.29□□□□□ -1.72
GEN1Q17RS7 RAP1GDS1-205ENST00000408927 3681 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC4.29□□□□□ -1.72
GEN1Q17RS7 AC092326.2-201ENST00000624772 1561 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
GEN1Q17RS7 RNA5SP258-201ENST00000362750 119 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
GEN1Q17RS7 RNU6-451P-201ENST00000362921 107 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
GEN1Q17RS7 SNORD56.2-201ENST00000363242 71 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
GEN1Q17RS7 RNU4-76P-201ENST00000364509 141 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
GEN1Q17RS7 CRISP3-203ENST00000371159 872 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.29□□□□□ -1.72
GEN1Q17RS7 SNORA20.2-201ENST00000383922 131 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
GEN1Q17RS7 RNU6-1207P-201ENST00000384343 107 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
GEN1Q17RS7 MIR93-201ENST00000385024 80 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
GEN1Q17RS7 TRAJ7-201ENST00000390530 59 ntAPPRIS P1 BASIC4.29□□□□□ -1.72
GEN1Q17RS7 RNA5SP118-201ENST00000410385 109 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
GEN1Q17RS7 HMGB3P12-201ENST00000438745 556 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
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GEN1Q17RS7 AL157882.1-201ENST00000447148 429 ntTSL 3 BASIC4.29□□□□□ -1.72
GEN1Q17RS7 PMCHL2-203ENST00000457791 237 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
GEN1Q17RS7 UBDP1-202ENST00000457888 382 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
GEN1Q17RS7 AC022364.2-201ENST00000457963 554 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
GEN1Q17RS7 AP001992.1-205ENST00000462248 379 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
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GEN1Q17RS7 AC105429.2-201ENST00000610567 517 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
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GEN1Q17RS7 CDKN3-212ENST00000620759 196 ntTSL 5 BASIC4.29□□□□□ -1.72
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GEN1Q17RS7 AL359697.1-201ENST00000624879 587 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
GEN1Q17RS7 ECT2-204ENST00000392692 4158 ntTSL 1 (best) BASIC4.29□□□□□ -1.72
GEN1Q17RS7 ABCA8-215ENST00000615593 3264 ntTSL 5 BASIC4.29□□□□□ -1.72
GEN1Q17RS7 MECOM-219ENST00000628990 4835 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.29□□□□□ -1.72
GEN1Q17RS7 ERICH3-AS1-202ENST00000612390 4874 ntTSL 1 (best) BASIC4.28□□□□□ -1.72
GEN1Q17RS7 CCDC102B-201ENST00000360242 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.28□□□□□ -1.72
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GEN1Q17RS7 MAPK10-253ENST00000641010 4072 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
GEN1Q17RS7 Y_RNA.263-201ENST00000364659 114 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
GEN1Q17RS7 RNU1-64P-201ENST00000365443 163 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
GEN1Q17RS7 RNU6-359P-201ENST00000365466 108 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
GEN1Q17RS7 RNU6-108P-201ENST00000365558 107 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
GEN1Q17RS7 RNU6-456P-201ENST00000384493 107 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
GEN1Q17RS7 MIR134-201ENST00000385258 73 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
GEN1Q17RS7 MT-TD-201ENST00000387419 68 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
GEN1Q17RS7 HIGD1C-201ENST00000398455 371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.28□□□□□ -1.72
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GEN1Q17RS7 AC108032.1-201ENST00000416706 207 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
GEN1Q17RS7 MAP1LC3BP1-201ENST00000417653 379 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
GEN1Q17RS7 AL513185.2-201ENST00000425543 193 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
GEN1Q17RS7 AC016912.1-201ENST00000432241 545 ntTSL 3 BASIC4.28□□□□□ -1.72
GEN1Q17RS7 HLA-N-201ENST00000437516 135 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
GEN1Q17RS7 SEPT14P3-201ENST00000439401 183 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
GEN1Q17RS7 ACBD3-AS1-201ENST00000440540 535 ntTSL 5 BASIC4.28□□□□□ -1.72
GEN1Q17RS7 AL691497.1-201ENST00000443270 449 ntTSL 2 BASIC4.28□□□□□ -1.72
GEN1Q17RS7 AL732372.2-207ENST00000445840 183 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
GEN1Q17RS7 AL162151.2-201ENST00000448875 158 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
GEN1Q17RS7 AC004888.1-201ENST00000450480 547 ntTSL 2 BASIC4.28□□□□□ -1.72
GEN1Q17RS7 SNRPGP6-201ENST00000451124 220 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
GEN1Q17RS7 SEPT14P2-201ENST00000453405 183 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
GEN1Q17RS7 snoU13.8-201ENST00000458890 104 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
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