Protein–RNA interactions for Protein: Q16799

RTN1, Reticulon-1, humanhuman

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Length 776 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTN1Q16799 SMIM11P1-201ENST00000369586 178 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
RTN1Q16799 Y_RNA.399-201ENST00000383955 105 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
RTN1Q16799 SNORA51.8-201ENST00000384234 132 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
RTN1Q16799 ENSAP1-201ENST00000392855 326 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
RTN1Q16799 AL645733.1-201ENST00000402250 217 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
RTN1Q16799 AC080125.1-201ENST00000414888 684 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
RTN1Q16799 RPL23AP69-201ENST00000431134 458 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
RTN1Q16799 AC234775.1-201ENST00000454247 670 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
RTN1Q16799 LINC01846-201ENST00000505908 651 ntTSL 5 BASIC5.68□□□□□ -1.5
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RTN1Q16799 AC114316.1-201ENST00000511323 278 ntTSL 5 BASIC5.68□□□□□ -1.5
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RTN1Q16799 SNORD116.3-201ENST00000517176 78 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
RTN1Q16799 AC087854.1-201ENST00000519706 414 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
RTN1Q16799 AP005902.1-201ENST00000521358 186 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
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RTN1Q16799 GNAI2P1-201ENST00000541815 315 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
RTN1Q16799 AC026464.3-201ENST00000563634 564 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC5.68□□□□□ -1.5
RTN1Q16799 AC104695.3-201ENST00000604052 296 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
RTN1Q16799 AC018889.1-201ENST00000605372 397 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
RTN1Q16799 AL158032.1-201ENST00000605401 106 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
RTN1Q16799 AC079610.3-201ENST00000606960 147 ntTSL 3 BASIC5.68□□□□□ -1.5
RTN1Q16799 LDHA-225ENST00000625635 141 ntTSL 5 BASIC5.68□□□□□ -1.5
RTN1Q16799 FNBP1L-206ENST00000604705 1830 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.68□□□□□ -1.5
RTN1Q16799 PSG1-204ENST00000436291 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
RTN1Q16799 STAG2-205ENST00000371160 6045 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
RTN1Q16799 VCAM1-203ENST00000370115 2475 ntTSL 5 BASIC5.68□□□□□ -1.5
RTN1Q16799 SLC1A3-216ENST00000613445 4030 ntTSL 5 BASIC5.68□□□□□ -1.5
RTN1Q16799 DTNA-203ENST00000315456 1706 ntTSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
RTN1Q16799 AC009229.4-201ENST00000623854 1947 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
RTN1Q16799 DICER1-212ENST00000541352 5621 ntTSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
RTN1Q16799 GABRG2-202ENST00000361925 3767 ntTSL 3 BASIC5.67□□□□□ -1.5
RTN1Q16799 NBPF10-201ENST00000583866 13042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.67□□□□□ -1.5
RTN1Q16799 C3orf58-202ENST00000441925 3260 ntTSL 2 BASIC5.67□□□□□ -1.5
RTN1Q16799 ZFX-203ENST00000379177 7558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
RTN1Q16799 TET2-202ENST00000305737 9233 ntTSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
RTN1Q16799 AL590399.5-201ENST00000428709 3325 ntTSL 2 BASIC5.67□□□□□ -1.5
RTN1Q16799 NBPF10-202ENST00000617010 11630 ntTSL 5 BASIC5.67□□□□□ -1.5
RTN1Q16799 RNU4-65P-201ENST00000410473 140 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
RTN1Q16799 AC064875.1-202ENST00000421112 561 ntTSL 4 BASIC5.67□□□□□ -1.5
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RTN1Q16799 S100A12-201ENST00000368737 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
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RTN1Q16799 GYPB-202ENST00000502664 521 ntTSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
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RTN1Q16799 AC025244.2-201ENST00000509215 422 ntTSL 3 BASIC5.66□□□□□ -1.5
RTN1Q16799 AC079160.1-201ENST00000513489 739 ntTSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
RTN1Q16799 AC005798.1-201ENST00000513715 387 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
RTN1Q16799 LINC02014-201ENST00000514010 713 ntTSL 3 BASIC5.66□□□□□ -1.5
RTN1Q16799 Y_RNA.721-201ENST00000517207 102 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
RTN1Q16799 RNU6-709P-201ENST00000517257 104 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
RTN1Q16799 AC091163.1-201ENST00000524012 605 ntTSL 4 BASIC5.66□□□□□ -1.5
RTN1Q16799 AP000859.1-201ENST00000525536 307 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
RTN1Q16799 AC125603.1-201ENST00000552718 366 ntTSL 3 BASIC5.66□□□□□ -1.5
RTN1Q16799 AC051619.2-201ENST00000559063 397 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
RTN1Q16799 CYCSP40-201ENST00000575927 294 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
RTN1Q16799 CR381572.2-201ENST00000624852 397 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
RTN1Q16799 PROX1-AS1-244ENST00000630355 599 ntTSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
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