Protein–RNA interactions for Protein: Q16288

NTRK3, NT-3 growth factor receptor, humanhuman

Predictions only

Length 839 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NTRK3Q16288 AC074124.1-201ENST00000502368 375 ntTSL 3 BASIC4.84□□□□□ -1.63
NTRK3Q16288 RNU4-29P-201ENST00000515943 174 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
NTRK3Q16288 TRAPPC2P2-201ENST00000517589 409 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
NTRK3Q16288 AC021736.1-201ENST00000521143 563 ntTSL 4 BASIC4.84□□□□□ -1.63
NTRK3Q16288 IFITM8P-201ENST00000522529 394 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
NTRK3Q16288 FAM60DP-201ENST00000524174 632 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
NTRK3Q16288 SUB1P1-201ENST00000524415 382 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
NTRK3Q16288 AC125611.2-201ENST00000551907 647 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
NTRK3Q16288 AL160314.2-204ENST00000554730 380 ntTSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
NTRK3Q16288 RPS3AP23-202ENST00000574601 686 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
NTRK3Q16288 LINC01909-202ENST00000584919 815 ntTSL 3 BASIC4.84□□□□□ -1.63
NTRK3Q16288 AP001429.1-201ENST00000602568 530 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
NTRK3Q16288 AL121992.2-201ENST00000606262 256 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
NTRK3Q16288 LINC00923-207ENST00000619015 505 ntTSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
NTRK3Q16288 CCL14-203ENST00000620991 426 ntTSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
NTRK3Q16288 AC215522.3-201ENST00000635602 354 ntTSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
NTRK3Q16288 PCDH15-209ENST00000395433 6942 ntTSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
NTRK3Q16288 MCF2-201ENST00000338585 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
NTRK3Q16288 AC083843.2-201ENST00000568248 6253 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
NTRK3Q16288 UBE4A-201ENST00000252108 6103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
NTRK3Q16288 AC010186.3-201ENST00000537616 2508 ntTSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.64
NTRK3Q16288 PARP8-201ENST00000281631 7177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.64
NTRK3Q16288 EIF3H-209ENST00000521861 3959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.64
NTRK3Q16288 GALNT11-203ENST00000422997 2371 ntTSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.64
NTRK3Q16288 AL139811.1-201ENST00000424779 2299 ntBASIC4.84□□□□□ -1.64
NTRK3Q16288 TMEM30A-202ENST00000370050 3775 ntTSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.64
NTRK3Q16288 MUC12-202ENST00000379442 16737 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
NTRK3Q16288 HMGB1-204ENST00000399489 1727 ntTSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
NTRK3Q16288 ALG14-201ENST00000370205 9367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
NTRK3Q16288 PLCB4-204ENST00000378501 5833 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
NTRK3Q16288 EPHA3-202ENST00000452448 2546 ntTSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
NTRK3Q16288 RC3H1-201ENST00000258349 10988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
NTRK3Q16288 MMRN1-204ENST00000508372 3234 ntTSL 2 BASIC4.83□□□□□ -1.64
NTRK3Q16288 Y_RNA.529-201ENST00000384586 119 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
NTRK3Q16288 RNU2-29P-201ENST00000410423 189 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
NTRK3Q16288 RNU4-65P-201ENST00000410473 140 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
NTRK3Q16288 RNU6-193P-201ENST00000410977 107 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
NTRK3Q16288 RNA5SP107-201ENST00000411358 122 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
NTRK3Q16288 BEND7P1-201ENST00000422058 457 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
NTRK3Q16288 MTCO3P46-201ENST00000425787 232 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
NTRK3Q16288 AC008850.1-201ENST00000427546 362 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
NTRK3Q16288 AC005094.1-201ENST00000440420 368 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
NTRK3Q16288 RPL23AP33-201ENST00000442301 452 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
NTRK3Q16288 AL121871.1-201ENST00000443413 436 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
NTRK3Q16288 AL078587.1-201ENST00000448580 542 ntTSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
NTRK3Q16288 RN7SL585P-201ENST00000470538 280 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
NTRK3Q16288 RPS27AP1-201ENST00000475545 471 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
NTRK3Q16288 RN7SL481P-201ENST00000477764 299 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
NTRK3Q16288 AC006517.1-201ENST00000480485 328 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
NTRK3Q16288 AC105137.1-201ENST00000484355 562 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
NTRK3Q16288 AF213884.1-201ENST00000488102 463 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
NTRK3Q16288 LINC02017-201ENST00000496829 474 ntTSL 3 BASIC4.83□□□□□ -1.64
NTRK3Q16288 LINC00492-201ENST00000504436 593 ntTSL 3 BASIC4.83□□□□□ -1.64
NTRK3Q16288 AC025554.1-201ENST00000505641 188 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
NTRK3Q16288 AC091885.1-201ENST00000506658 268 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
NTRK3Q16288 Y_RNA.675-201ENST00000516389 149 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
NTRK3Q16288 RNU6-64P-201ENST00000517119 105 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
NTRK3Q16288 DEFB108D-201ENST00000527787 222 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
NTRK3Q16288 OR5AL2P-201ENST00000532185 920 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
NTRK3Q16288 LINC00944-201ENST00000536517 421 ntTSL 2 BASIC4.83□□□□□ -1.64
NTRK3Q16288 AC055720.2-201ENST00000537724 172 ntTSL 3 BASIC4.83□□□□□ -1.64
NTRK3Q16288 TVP23BP1-201ENST00000557500 617 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
NTRK3Q16288 NCAPGP2-201ENST00000557911 754 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
NTRK3Q16288 AC026771.1-201ENST00000564672 415 ntTSL 2 BASIC4.83□□□□□ -1.64
NTRK3Q16288 AC022655.2-201ENST00000577280 318 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
NTRK3Q16288 LINC00649-204ENST00000593977 640 ntTSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
NTRK3Q16288 ATM-228ENST00000639240 498 ntTSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
NTRK3Q16288 ATM-230ENST00000640388 578 ntTSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
NTRK3Q16288 AC116667.1-201ENST00000604855 2072 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
NTRK3Q16288 ABI3BP-215ENST00000495063 3714 ntTSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
NTRK3Q16288 OR56A1-202ENST00000641423 6096 ntAPPRIS P1 BASIC4.83□□□□□ -1.64
NTRK3Q16288 STAG2-204ENST00000371157 5991 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
NTRK3Q16288 RIMS2-201ENST00000262231 3854 ntTSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
NTRK3Q16288 MATR3-228ENST00000620916 3134 ntTSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
NTRK3Q16288 ABI3BP-201ENST00000284322 4498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
NTRK3Q16288 AC004972.1-201ENST00000623934 2209 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
NTRK3Q16288 MAP2-202ENST00000360351 9711 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
NTRK3Q16288 RMDN2-204ENST00000406384 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
NTRK3Q16288 MTND4P23-201ENST00000447723 1363 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
NTRK3Q16288 DST-202ENST00000312431 17756 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
NTRK3Q16288 GPR34-201ENST00000378138 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
NTRK3Q16288 OBSCN-204ENST00000366707 26772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
NTRK3Q16288 CLEC7A-202ENST00000304084 1130 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
NTRK3Q16288 MIR383-201ENST00000362257 73 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
NTRK3Q16288 SNORD81.2-201ENST00000365153 76 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
NTRK3Q16288 RNU6-116P-201ENST00000384042 109 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
NTRK3Q16288 RNU6-356P-201ENST00000384140 107 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
NTRK3Q16288 MIR141-201ENST00000384975 95 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
NTRK3Q16288 RNU6-837P-201ENST00000391056 108 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
NTRK3Q16288 AC008154.2-201ENST00000420268 414 ntTSL 3 BASIC4.82□□□□□ -1.64
NTRK3Q16288 MTATP6P16-201ENST00000434543 526 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
NTRK3Q16288 FAR2P1-203ENST00000440931 187 ntTSL 2 BASIC4.82□□□□□ -1.64
NTRK3Q16288 AC006011.1-201ENST00000442758 349 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
NTRK3Q16288 AC018643.1-201ENST00000445459 414 ntTSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
NTRK3Q16288 AC105398.1-201ENST00000446073 402 ntTSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
NTRK3Q16288 MTND1P18-201ENST00000448191 573 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
NTRK3Q16288 RPL7P23-201ENST00000493874 747 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
NTRK3Q16288 RPS27AP13-201ENST00000498403 237 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
NTRK3Q16288 AC026427.2-201ENST00000506228 536 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
NTRK3Q16288 AC093206.1-201ENST00000515364 497 ntTSL 3 BASIC4.82□□□□□ -1.64
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