Protein–RNA interactions for Protein: Q15906

VPS72, Vacuolar protein sorting-associated protein 72 homolog, humanhuman

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Length 364 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS72Q15906 MIR1277-201ENST00000408536 78 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
VPS72Q15906 Y_RNA.598-201ENST00000410480 95 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
VPS72Q15906 AC079150.1-201ENST00000413043 383 ntTSL 3 BASIC4.88□□□□□ -1.63
VPS72Q15906 EI24P1-201ENST00000416584 867 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
VPS72Q15906 OR1AA1P-201ENST00000419597 916 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
VPS72Q15906 AC005482.1-201ENST00000420758 575 ntTSL 4 BASIC4.88□□□□□ -1.63
VPS72Q15906 LINC01797-202ENST00000433432 765 ntTSL 3 BASIC4.88□□□□□ -1.63
VPS72Q15906 RPL21P112-201ENST00000434403 463 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
VPS72Q15906 LINC01757-201ENST00000435552 480 ntTSL 2 BASIC4.88□□□□□ -1.63
VPS72Q15906 HMGB1P31-201ENST00000437242 427 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
VPS72Q15906 AL591721.1-201ENST00000439849 751 ntTSL 3 BASIC4.88□□□□□ -1.63
VPS72Q15906 SNRPEP8-201ENST00000442866 260 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
VPS72Q15906 AP1S3-208ENST00000446015 499 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
VPS72Q15906 GHRL-209ENST00000446937 217 ntTSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
VPS72Q15906 RPS17P13-201ENST00000448974 407 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
VPS72Q15906 MTND2P24-201ENST00000453434 806 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
VPS72Q15906 AL133351.1-201ENST00000456189 417 ntTSL 2 BASIC4.88□□□□□ -1.63
VPS72Q15906 AP000873.1-201ENST00000463987 400 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
VPS72Q15906 MCCC1-AS1-201ENST00000471731 765 ntTSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
VPS72Q15906 AC096577.1-203ENST00000506386 541 ntTSL 3 BASIC4.88□□□□□ -1.63
VPS72Q15906 AC006390.1-201ENST00000508068 283 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
VPS72Q15906 AC023141.12-201ENST00000512399 199 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
VPS72Q15906 RNU4ATAC17P-201ENST00000517272 120 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
VPS72Q15906 AP002833.1-201ENST00000530572 566 ntTSL 3 BASIC4.88□□□□□ -1.63
VPS72Q15906 SMILR-201ENST00000533992 553 ntTSL 4 BASIC4.88□□□□□ -1.63
VPS72Q15906 LINC01405-202ENST00000547607 674 ntTSL 3 BASIC4.88□□□□□ -1.63
VPS72Q15906 AC009135.1-201ENST00000549303 776 ntTSL 2 BASIC4.88□□□□□ -1.63
VPS72Q15906 HSPE1P3-201ENST00000559254 309 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
VPS72Q15906 AC137800.2-201ENST00000574375 120 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
VPS72Q15906 AC010928.3-201ENST00000587712 541 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
VPS72Q15906 SNRPGP15-201ENST00000600149 222 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
VPS72Q15906 AC090578.1-201ENST00000604955 591 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
VPS72Q15906 AC008250.2-201ENST00000615261 205 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
VPS72Q15906 AC124864.2-201ENST00000624736 186 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
VPS72Q15906 ZNF382-203ENST00000435416 3865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
VPS72Q15906 OR11H5P-202ENST00000641612 1325 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
VPS72Q15906 BCLAF1-207ENST00000527759 4373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
VPS72Q15906 DMXL2-202ENST00000449909 7465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
VPS72Q15906 MGAT4A-204ENST00000414521 3709 ntTSL 2 BASIC4.88□□□□□ -1.63
VPS72Q15906 LINC02475-202ENST00000512678 2622 ntTSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
VPS72Q15906 PIKFYVE-201ENST00000264380 9901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
VPS72Q15906 CASP1-210ENST00000528974 1402 ntTSL 2 BASIC4.88□□□□□ -1.63
VPS72Q15906 ATL2-202ENST00000402054 1883 ntTSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
VPS72Q15906 SLC44A5-201ENST00000370855 4406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
VPS72Q15906 PTPN22-201ENST00000359785 3654 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
VPS72Q15906 TAX1BP1-213ENST00000543117 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.87□□□□□ -1.63
VPS72Q15906 KIAA0825-203ENST00000513200 4942 ntTSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
VPS72Q15906 PKN2-AS1-202ENST00000458097 3542 ntTSL 2 BASIC4.87□□□□□ -1.63
VPS72Q15906 RASA1-205ENST00000512763 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.87□□□□□ -1.63
VPS72Q15906 NEGR1-201ENST00000306821 5577 ntTSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
VPS72Q15906 ADGRL2-211ENST00000370730 6173 ntTSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
VPS72Q15906 OR10A7-201ENST00000326258 951 ntAPPRIS P1 BASIC4.87□□□□□ -1.63
VPS72Q15906 RNU6-1249P-201ENST00000363237 111 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
VPS72Q15906 CIR1P3-201ENST00000405137 479 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
VPS72Q15906 AC009158.1-206ENST00000417476 454 ntTSL 3 BASIC4.87□□□□□ -1.63
VPS72Q15906 AC068599.1-201ENST00000422558 567 ntTSL 4 BASIC4.87□□□□□ -1.63
VPS72Q15906 MTND3P23-201ENST00000431980 347 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
VPS72Q15906 AC093019.2-201ENST00000432294 384 ntTSL 3 BASIC4.87□□□□□ -1.63
VPS72Q15906 MTND4LP10-201ENST00000435146 291 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
VPS72Q15906 NFU1P2-201ENST00000448700 469 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
VPS72Q15906 AC007879.3-202ENST00000448786 823 ntTSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
VPS72Q15906 PSPHP1-201ENST00000450062 261 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
VPS72Q15906 TRGVB-201ENST00000453257 471 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
VPS72Q15906 snoU13.3-201ENST00000459441 104 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
VPS72Q15906 HMGB1P36-201ENST00000487709 576 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
VPS72Q15906 AC096576.1-201ENST00000489014 359 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
VPS72Q15906 AC078817.1-201ENST00000492623 435 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
VPS72Q15906 RN7SL504P-201ENST00000494496 287 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
VPS72Q15906 AC022272.1-201ENST00000503478 777 ntTSL 2 BASIC4.87□□□□□ -1.63
VPS72Q15906 AC021678.1-201ENST00000505195 936 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
VPS72Q15906 SUB1-206ENST00000506237 908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.87□□□□□ -1.63
VPS72Q15906 LINC02061-201ENST00000514225 335 ntTSL 3 BASIC4.87□□□□□ -1.63
VPS72Q15906 RNU2-58P-201ENST00000516403 183 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
VPS72Q15906 RNU6-430P-201ENST00000517078 107 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
VPS72Q15906 AC083923.2-203ENST00000520512 372 ntTSL 3 BASIC4.87□□□□□ -1.63
VPS72Q15906 AP004371.1-201ENST00000525240 214 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
VPS72Q15906 KLRF1-203ENST00000537723 598 ntTSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
VPS72Q15906 AC009511.1-201ENST00000543527 191 ntTSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
VPS72Q15906 AC136188.1-201ENST00000546770 342 ntTSL 3 BASIC4.87□□□□□ -1.63
VPS72Q15906 AC009117.2-201ENST00000565374 504 ntTSL 3 BASIC4.87□□□□□ -1.63
VPS72Q15906 MSMB-201ENST00000581478 386 ntTSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
VPS72Q15906 AL161729.4-201ENST00000604650 476 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
VPS72Q15906 AC007563.2-202ENST00000607591 394 ntTSL 3 BASIC4.87□□□□□ -1.63
VPS72Q15906 SNORD91B-202ENST00000608459 222 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
VPS72Q15906 AC092954.2-201ENST00000609103 430 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
VPS72Q15906 AC073172.1-201ENST00000636967 851 ntTSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
VPS72Q15906 MMP16-201ENST00000286614 11558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
VPS72Q15906 INPP4B-220ENST00000513000 8831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
VPS72Q15906 POSTN-201ENST00000379742 3071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
VPS72Q15906 SLC44A5-202ENST00000370859 3896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.87□□□□□ -1.63
VPS72Q15906 ELAVL4-203ENST00000371821 3349 ntTSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
VPS72Q15906 SLC9C1-205ENST00000487372 3979 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
VPS72Q15906 CEP57L1-203ENST00000368970 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.86□□□□□ -1.63
VPS72Q15906 SPATA31D2P-201ENST00000429999 4388 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
VPS72Q15906 EIF2A-201ENST00000273435 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
VPS72Q15906 RNA5SP258-201ENST00000362750 119 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
VPS72Q15906 Y_RNA.70-201ENST00000362886 110 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
VPS72Q15906 RNU6-335P-201ENST00000364563 113 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
VPS72Q15906 Y_RNA.450-201ENST00000384198 113 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
VPS72Q15906 VN1R8P-201ENST00000407739 893 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
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