Protein–RNA interactions for Protein: Q15834

CCDC85B, Coiled-coil domain-containing protein 85B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 202 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC85BQ15834 KTN1-202ENST00000395308 4134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
CCDC85BQ15834 POLK-217ENST00000515295 1438 ntTSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
CCDC85BQ15834 ATF7IP2-201ENST00000324570 3396 ntTSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
CCDC85BQ15834 GABRG1-201ENST00000295452 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
CCDC85BQ15834 FOXP1-IT1-201ENST00000498714 3539 ntTSL 2 BASIC5.2□□□□□ -1.58
CCDC85BQ15834 ORC3-201ENST00000257789 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
CCDC85BQ15834 LRRC39-201ENST00000342895 1881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
CCDC85BQ15834 OFD1P9Y-201ENST00000417699 1491 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
CCDC85BQ15834 ACSL5-202ENST00000354655 3351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.19□□□□□ -1.58
CCDC85BQ15834 TJP1-209ENST00000545208 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
CCDC85BQ15834 LINC01541-202ENST00000568095 3105 ntTSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
CCDC85BQ15834 SLC5A12-202ENST00000396005 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
CCDC85BQ15834 POU2F1-202ENST00000367862 14038 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
CCDC85BQ15834 OR8H2-203ENST00000641311 3092 ntAPPRIS P2 BASIC5.19□□□□□ -1.58
CCDC85BQ15834 RNU6-1249P-201ENST00000363237 111 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
CCDC85BQ15834 SNORA23-201ENST00000365128 182 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
CCDC85BQ15834 Y_RNA.445-201ENST00000384168 102 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
CCDC85BQ15834 RNU6-1160P-201ENST00000384546 104 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
CCDC85BQ15834 MIR153-1-201ENST00000384914 90 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
CCDC85BQ15834 RNA5SP219-201ENST00000390940 113 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
CCDC85BQ15834 AC110754.1-201ENST00000399740 601 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
CCDC85BQ15834 PPIAP9-201ENST00000403866 498 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
CCDC85BQ15834 RNU6-712P-201ENST00000410558 100 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
CCDC85BQ15834 AL590705.3-201ENST00000416066 474 ntTSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
CCDC85BQ15834 ARHGAP26-IT1-201ENST00000433186 388 ntTSL 3 BASIC5.19□□□□□ -1.58
CCDC85BQ15834 KRR1-202ENST00000438169 975 ntTSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
CCDC85BQ15834 AC004691.1-201ENST00000440376 547 ntTSL 3 BASIC5.19□□□□□ -1.58
CCDC85BQ15834 AC073465.2-201ENST00000440938 498 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
CCDC85BQ15834 AL358232.1-201ENST00000448030 501 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
CCDC85BQ15834 FABP5P13-201ENST00000452144 328 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
CCDC85BQ15834 FGF7P3-201ENST00000454645 303 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
CCDC85BQ15834 FPGT-203ENST00000467578 601 ntTSL 2 BASIC5.19□□□□□ -1.58
CCDC85BQ15834 AC100871.2-201ENST00000522005 327 ntTSL 3 BASIC5.19□□□□□ -1.58
CCDC85BQ15834 COPS8P3-201ENST00000526024 482 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
CCDC85BQ15834 AP000755.2-201ENST00000526777 571 ntTSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
CCDC85BQ15834 ATPAF1-210ENST00000532925 998 ntTSL 2 BASIC5.19□□□□□ -1.58
CCDC85BQ15834 GYPA-211ENST00000535709 695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
CCDC85BQ15834 LINC02293-202ENST00000548385 358 ntTSL 3 BASIC5.19□□□□□ -1.58
CCDC85BQ15834 AC011611.2-201ENST00000549888 358 ntTSL 3 BASIC5.19□□□□□ -1.58
CCDC85BQ15834 IMMP1LP2-201ENST00000552954 492 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
CCDC85BQ15834 AC106729.1-201ENST00000567777 466 ntTSL 3 BASIC5.19□□□□□ -1.58
CCDC85BQ15834 RPL23AP84-201ENST00000571193 464 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
CCDC85BQ15834 AC023043.2-201ENST00000589678 1026 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
CCDC85BQ15834 AC020910.1-201ENST00000599404 413 ntTSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
CCDC85BQ15834 AC022893.3-201ENST00000607665 437 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
CCDC85BQ15834 AL450472.3-201ENST00000615578 367 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
CCDC85BQ15834 LINC01378-205ENST00000615833 158 ntTSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
CCDC85BQ15834 AC092683.2-203ENST00000618807 788 ntTSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
CCDC85BQ15834 AC019206.1-201ENST00000621938 425 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
CCDC85BQ15834 AC007998.5-201ENST00000622938 237 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
CCDC85BQ15834 APAF1-209ENST00000550527 6581 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
CCDC85BQ15834 DLX6-AS1-201ENST00000430027 15364 ntTSL 2 BASIC5.19□□□□□ -1.58
CCDC85BQ15834 MAPK10-338ENST00000641647 3362 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
CCDC85BQ15834 PDE4B-201ENST00000329654 3998 ntTSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
CCDC85BQ15834 NDUFAF4-201ENST00000316149 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
CCDC85BQ15834 RMST-209ENST00000639542 3269 ntTSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
CCDC85BQ15834 MYBPC1-202ENST00000361685 3871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
CCDC85BQ15834 CSDE1-202ENST00000339438 4006 ntTSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
CCDC85BQ15834 RNF180-202ENST00000389100 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
CCDC85BQ15834 AL022322.2-201ENST00000624072 20397 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
CCDC85BQ15834 VWC2L-202ENST00000427124 4480 ntTSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
CCDC85BQ15834 AASDH-201ENST00000205214 3590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
CCDC85BQ15834 SGO1-AS1-203ENST00000455626 2041 ntTSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
CCDC85BQ15834 AC025031.4-201ENST00000621248 3271 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
CCDC85BQ15834 GTDC1-206ENST00000409214 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
CCDC85BQ15834 RAD21-210ENST00000523986 2506 ntTSL 2 BASIC5.18□□□□□ -1.58
CCDC85BQ15834 MIR208A-201ENST00000362287 71 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
CCDC85BQ15834 RN7SKP185-201ENST00000362813 326 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
CCDC85BQ15834 SNORA33.2-201ENST00000365413 134 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
CCDC85BQ15834 Y_RNA.395-201ENST00000383945 109 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
CCDC85BQ15834 SNORA77-201ENST00000408716 125 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
CCDC85BQ15834 RNA5SP44-201ENST00000410446 133 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
CCDC85BQ15834 RNU6-1304P-201ENST00000411374 106 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
CCDC85BQ15834 AC079809.1-201ENST00000415468 276 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
CCDC85BQ15834 FABP5P14-201ENST00000437273 393 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
CCDC85BQ15834 AC004866.2-201ENST00000438285 481 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
CCDC85BQ15834 TRBV1-201ENST00000476502 284 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
CCDC85BQ15834 SLC9A9-AS1-201ENST00000479030 518 ntTSL 5 BASIC5.18□□□□□ -1.58
CCDC85BQ15834 AC022133.1-201ENST00000490961 571 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
CCDC85BQ15834 AC096736.2-201ENST00000507972 175 ntTSL 3 BASIC5.18□□□□□ -1.58
CCDC85BQ15834 RNU6-123P-201ENST00000516163 102 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
CCDC85BQ15834 RNU6-390P-201ENST00000516259 103 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
CCDC85BQ15834 AC008694.2-201ENST00000517591 306 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
CCDC85BQ15834 AP002383.3-201ENST00000545958 593 ntTSL 4 BASIC5.18□□□□□ -1.58
CCDC85BQ15834 DAZAP2-209ENST00000549732 601 ntTSL 2 BASIC5.18□□□□□ -1.58
CCDC85BQ15834 AC007151.1-201ENST00000572774 483 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
CCDC85BQ15834 AC011626.1-201ENST00000604710 562 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
CCDC85BQ15834 IGHV3-29-201ENST00000604817 344 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
CCDC85BQ15834 AC009570.1-201ENST00000609599 745 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
CCDC85BQ15834 RASSF8-215ENST00000611440 852 ntTSL 5 BASIC5.18□□□□□ -1.58
CCDC85BQ15834 BX005214.3-202ENST00000619809 325 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
CCDC85BQ15834 uc_338.7-201ENST00000621834 124 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
CCDC85BQ15834 AL445363.3-201ENST00000623080 671 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
CCDC85BQ15834 KIAA1524-208ENST00000625495 147 ntTSL 5 BASIC5.18□□□□□ -1.58
CCDC85BQ15834 AC008013.2-202ENST00000637965 364 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
CCDC85BQ15834 AC016687.3-202ENST00000505018 2404 ntTSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
CCDC85BQ15834 SLC12A6-216ENST00000560164 3744 ntTSL 2 BASIC5.18□□□□□ -1.58
CCDC85BQ15834 GLCE-201ENST00000261858 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
CCDC85BQ15834 POLR2B-213ENST00000639658 3300 ntTSL 5 BASIC5.18□□□□□ -1.58
CCDC85BQ15834 ZNF418-205ENST00000595830 3543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 83.7 ms