Protein–RNA interactions for Protein: Q15431

SYCP1, Synaptonemal complex protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 976 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCP1Q15431 AC079804.2-201ENST00000490376 200 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
SYCP1Q15431 AC135721.1-201ENST00000497954 479 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
SYCP1Q15431 AC004052.1-202ENST00000505680 516 ntTSL 3 BASIC2.73□□□□□ -1.97
SYCP1Q15431 DISC1FP1-204ENST00000563681 466 ntTSL 3 BASIC2.73□□□□□ -1.97
SYCP1Q15431 ATP5F1P7-201ENST00000567330 760 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
SYCP1Q15431 AC007953.2-201ENST00000603299 193 ntTSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
SYCP1Q15431 ATP1B3P1-201ENST00000605365 821 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
SYCP1Q15431 AP002826.1-201ENST00000608835 315 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
SYCP1Q15431 MIR6715A-201ENST00000615929 79 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
SYCP1Q15431 AC068544.1-201ENST00000635064 248 ntTSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
SYCP1Q15431 AC130650.2-201ENST00000618736 2403 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
SYCP1Q15431 MS4A14-202ENST00000395001 3401 ntTSL 5 BASIC2.72□□□□□ -1.97
SYCP1Q15431 CDK1-202ENST00000373809 1613 ntTSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
SYCP1Q15431 WWP1-201ENST00000265428 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
SYCP1Q15431 RNU1-105P-201ENST00000363470 161 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
SYCP1Q15431 OR1A2-201ENST00000381951 930 ntAPPRIS P1 BASIC2.72□□□□□ -1.97
SYCP1Q15431 ARL2BPP3-201ENST00000421226 480 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
SYCP1Q15431 MTCO2P17-201ENST00000424336 677 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
SYCP1Q15431 AC012497.1-201ENST00000429392 575 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
SYCP1Q15431 WARS2P1-201ENST00000429678 537 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
SYCP1Q15431 ARL5AP4-201ENST00000430731 512 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
SYCP1Q15431 AL589935.1-218ENST00000434683 529 ntTSL 3 BASIC2.72□□□□□ -1.97
SYCP1Q15431 MTND4LP10-201ENST00000435146 291 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
SYCP1Q15431 AC010105.1-201ENST00000437290 385 ntTSL 5 BASIC2.72□□□□□ -1.97
SYCP1Q15431 snoU13.28-201ENST00000459235 104 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
SYCP1Q15431 OR52A4P-202ENST00000481634 799 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
SYCP1Q15431 SRI-210ENST00000490437 570 ntTSL 2 BASIC2.72□□□□□ -1.97
SYCP1Q15431 AC008696.2-201ENST00000503323 825 ntTSL 3 BASIC2.72□□□□□ -1.97
SYCP1Q15431 LINC02229-201ENST00000508486 661 ntTSL 3 BASIC2.72□□□□□ -1.97
SYCP1Q15431 AC093248.1-201ENST00000513197 417 ntTSL 2 BASIC2.72□□□□□ -1.97
SYCP1Q15431 SETP12-201ENST00000514068 805 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
SYCP1Q15431 TAS2R43-201ENST00000531678 1027 ntAPPRIS P1 BASIC2.72□□□□□ -1.97
SYCP1Q15431 MRPL42-204ENST00000548545 692 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC2.72□□□□□ -1.97
SYCP1Q15431 CKS1BP1-201ENST00000555221 240 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
SYCP1Q15431 TRAV28-201ENST00000557548 323 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
SYCP1Q15431 AC018904.1-201ENST00000560594 542 ntTSL 3 BASIC2.72□□□□□ -1.97
SYCP1Q15431 AC074051.3-201ENST00000570238 358 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
SYCP1Q15431 MIR5694-201ENST00000581190 76 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
SYCP1Q15431 VN1R90P-201ENST00000595717 726 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
SYCP1Q15431 AL033523.1-201ENST00000605153 153 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
SYCP1Q15431 AC012443.1-201ENST00000605605 231 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
SYCP1Q15431 AC244517.5-202ENST00000623741 500 ntTSL 3 BASIC2.72□□□□□ -1.97
SYCP1Q15431 SPAM1-206ENST00000460182 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.71□□□□□ -1.97
SYCP1Q15431 Z82209.1-201ENST00000422141 2135 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
SYCP1Q15431 TMEM232-201ENST00000455884 2501 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC2.71□□□□□ -1.98
SYCP1Q15431 SNORD51.1-201ENST00000365405 77 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
SYCP1Q15431 SNAPC3-201ENST00000380799 753 ntTSL 3 BASIC2.71□□□□□ -1.98
SYCP1Q15431 RNU2-52P-201ENST00000410680 190 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
SYCP1Q15431 OFD1P11Y-201ENST00000418213 1177 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
SYCP1Q15431 AL355994.1-201ENST00000424379 260 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
SYCP1Q15431 AC234781.2-201ENST00000426370 994 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
SYCP1Q15431 AL590502.1-201ENST00000433019 505 ntTSL 2 BASIC2.71□□□□□ -1.98
SYCP1Q15431 AL359878.2-201ENST00000435531 407 ntTSL 3 BASIC2.71□□□□□ -1.98
SYCP1Q15431 LINC00412-201ENST00000444744 420 ntTSL 2 BASIC2.71□□□□□ -1.98
SYCP1Q15431 AC104389.3-201ENST00000445629 235 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
SYCP1Q15431 AC004160.1-211ENST00000445839 565 ntTSL 4 BASIC2.71□□□□□ -1.98
SYCP1Q15431 AP000936.2-201ENST00000447151 681 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
SYCP1Q15431 FAM172BP-201ENST00000487497 1089 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
SYCP1Q15431 AC109927.1-202ENST00000511951 282 ntTSL 3 BASIC2.71□□□□□ -1.98
SYCP1Q15431 LINC02358-201ENST00000514413 465 ntTSL 5 BASIC2.71□□□□□ -1.98
SYCP1Q15431 AP000462.3-201ENST00000545593 330 ntTSL 5 BASIC2.71□□□□□ -1.98
SYCP1Q15431 GLYCAM1-201ENST00000546596 285 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
SYCP1Q15431 LINC02386-203ENST00000552182 501 ntTSL 3 BASIC2.71□□□□□ -1.98
SYCP1Q15431 AC087749.2-201ENST00000583910 352 ntTSL 5 BASIC2.71□□□□□ -1.98
SYCP1Q15431 MIR3117-201ENST00000584034 78 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
SYCP1Q15431 AC245100.7-201ENST00000609678 442 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
SYCP1Q15431 MIR6895-201ENST00000613497 78 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
SYCP1Q15431 UBE2Q2P2-203ENST00000613592 761 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
SYCP1Q15431 CHORDC1-206ENST00000529987 1698 ntTSL 3 BASIC2.71□□□□□ -1.98
SYCP1Q15431 AC012361.1-201ENST00000447260 1498 ntTSL 1 (best) BASIC2.71□□□□□ -1.98
SYCP1Q15431 C1D-201ENST00000355848 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.7□□□□□ -1.98
SYCP1Q15431 TAB2-205ENST00000538427 4240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.7□□□□□ -1.98
SYCP1Q15431 SMARCAD1-206ENST00000509418 2348 ntTSL 2 BASIC2.7□□□□□ -1.98
SYCP1Q15431 CR848007.1-201ENST00000442354 1699 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
SYCP1Q15431 SDAD1P2-201ENST00000441308 2028 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
SYCP1Q15431 RPL21P132-201ENST00000331267 462 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
SYCP1Q15431 RNA5SP456-201ENST00000364002 114 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
SYCP1Q15431 CRLS1-202ENST00000378868 994 ntTSL 5 BASIC2.7□□□□□ -1.98
SYCP1Q15431 BCL2L15-203ENST00000393320 276 ntTSL 1 (best) BASIC2.7□□□□□ -1.98
SYCP1Q15431 AL139039.1-201ENST00000401900 692 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
SYCP1Q15431 RPL27AP8-201ENST00000424277 446 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
SYCP1Q15431 AC098826.1-201ENST00000433943 471 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
SYCP1Q15431 AL591848.2-201ENST00000442712 522 ntTSL 3 BASIC2.7□□□□□ -1.98
SYCP1Q15431 AC099677.4-201ENST00000446786 380 ntTSL 3 BASIC2.7□□□□□ -1.98
SYCP1Q15431 PLCB1-IT1-202ENST00000451443 251 ntTSL 3 BASIC2.7□□□□□ -1.98
SYCP1Q15431 AL450344.2-201ENST00000455229 614 ntTSL 5 BASIC2.7□□□□□ -1.98
SYCP1Q15431 CABYRP1-201ENST00000465493 1045 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
SYCP1Q15431 AC093752.2-201ENST00000506942 573 ntTSL 5 BASIC2.7□□□□□ -1.98
SYCP1Q15431 RNU6-1095P-201ENST00000516148 108 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
SYCP1Q15431 NRG1-IT1-202ENST00000521463 742 ntTSL 1 (best) BASIC2.7□□□□□ -1.98
SYCP1Q15431 CTAGE1-202ENST00000525417 1267 ntAPPRIS ALT2 BASIC2.7□□□□□ -1.98
SYCP1Q15431 AP000942.2-201ENST00000526310 628 ntTSL 3 BASIC2.7□□□□□ -1.98
SYCP1Q15431 LINC02329-201ENST00000554753 511 ntTSL 5 BASIC2.7□□□□□ -1.98
SYCP1Q15431 GTF3AP2-201ENST00000557014 266 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
SYCP1Q15431 AC078909.1-201ENST00000559509 464 ntTSL 2 BASIC2.7□□□□□ -1.98
SYCP1Q15431 LINC01570-201ENST00000561572 434 ntTSL 3 BASIC2.7□□□□□ -1.98
SYCP1Q15431 MIR4435-1-201ENST00000582552 80 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
SYCP1Q15431 VN1R88P-201ENST00000596787 292 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
SYCP1Q15431 AL359962.2-201ENST00000610044 303 ntTSL 5 BASIC2.7□□□□□ -1.98
SYCP1Q15431 AC073569.3-201ENST00000619055 682 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 116.2 ms