Protein–RNA interactions for Protein: Q149N8

SHPRH, E3 ubiquitin-protein ligase SHPRH, humanhuman

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Length 1,683 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHPRHQ149N8 C11orf40-201ENST00000307616 654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.33□□□□□ -2.04
SHPRHQ149N8 SNORA7.1-201ENST00000363750 139 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
SHPRHQ149N8 HSPE1P26-201ENST00000405341 275 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
SHPRHQ149N8 RNU6-603P-201ENST00000411403 107 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
SHPRHQ149N8 PAICSP7-201ENST00000419829 962 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
SHPRHQ149N8 AL353148.1-204ENST00000426752 477 ntTSL 5 BASIC2.33□□□□□ -2.04
SHPRHQ149N8 UBE2V2P1-201ENST00000434717 398 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
SHPRHQ149N8 OR8X1P-201ENST00000534542 869 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
SHPRHQ149N8 AC008015.1-201ENST00000555505 465 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
SHPRHQ149N8 AF230666.1-202ENST00000608375 870 ntTSL 5 BASIC2.33□□□□□ -2.04
SHPRHQ149N8 Z98749.2-208ENST00000381646 500 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
SHPRHQ149N8 MAGI2-AS2-201ENST00000411616 476 ntTSL 2 BASIC2.32□□□□□ -2.04
SHPRHQ149N8 CLIC4P1-201ENST00000453177 535 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
SHPRHQ149N8 AC092155.2-201ENST00000454675 477 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
SHPRHQ149N8 PTGES3P5-201ENST00000455109 434 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
SHPRHQ149N8 AC107398.1-201ENST00000486904 505 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
SHPRHQ149N8 LINC01455-201ENST00000503167 561 ntTSL 4 BASIC2.32□□□□□ -2.04
SHPRHQ149N8 AL161670.1-201ENST00000554348 137 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
SHPRHQ149N8 AC092138.2-201ENST00000563811 428 ntTSL 5 BASIC2.32□□□□□ -2.04
SHPRHQ149N8 AC016877.3-201ENST00000606778 504 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
SHPRHQ149N8 C3orf49-203ENST00000616659 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.32□□□□□ -2.04
SHPRHQ149N8 CLECL1-204ENST00000621400 611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.32□□□□□ -2.04
SHPRHQ149N8 CFTRP2-201ENST00000634304 199 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
SHPRHQ149N8 MBNL3-212ENST00000538204 11294 ntTSL 1 (best) BASIC2.32□□□□□ -2.04
SHPRHQ149N8 MTND4P23-201ENST00000447723 1363 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
SHPRHQ149N8 KTN1-204ENST00000395311 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.31□□□□□ -2.04
SHPRHQ149N8 MT-ND3-201ENST00000361227 346 ntAPPRIS P1 BASIC2.31□□□□□ -2.04
SHPRHQ149N8 RNA5SP489-201ENST00000410986 109 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
SHPRHQ149N8 AC099060.1-201ENST00000427806 448 ntTSL 3 BASIC2.31□□□□□ -2.04
SHPRHQ149N8 RNU7-157P-201ENST00000459600 66 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
SHPRHQ149N8 AC092991.1-201ENST00000477176 376 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
SHPRHQ149N8 ARL4AP2-201ENST00000507378 601 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
SHPRHQ149N8 LINC02480-201ENST00000511875 612 ntTSL 2 BASIC2.31□□□□□ -2.04
SHPRHQ149N8 SNORD116-26-201ENST00000516006 96 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
SHPRHQ149N8 PARPBP-212ENST00000543784 992 ntTSL 2 BASIC2.31□□□□□ -2.04
SHPRHQ149N8 AC087636.1-201ENST00000554787 573 ntTSL 4 BASIC2.31□□□□□ -2.04
SHPRHQ149N8 OR4G1P-201ENST00000588632 938 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
SHPRHQ149N8 AC090953.1-201ENST00000604305 1092 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
SHPRHQ149N8 DUXAP9-208ENST00000622815 614 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
SHPRHQ149N8 MIR3199-2-201ENST00000636243 86 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
SHPRHQ149N8 AL118496.1-201ENST00000440201 1812 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
SHPRHQ149N8 EFTUD1P2-201ENST00000514817 1603 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
SHPRHQ149N8 MIR96-201ENST00000362288 78 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
SHPRHQ149N8 MIR124-3-201ENST00000384866 87 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
SHPRHQ149N8 AC092832.1-201ENST00000422934 400 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
SHPRHQ149N8 AC005703.2-201ENST00000453339 343 ntTSL 2 BASIC2.31□□□□□ -2.04
SHPRHQ149N8 AL606519.1-201ENST00000458146 580 ntTSL 2 BASIC2.31□□□□□ -2.04
SHPRHQ149N8 AC093689.1-201ENST00000514737 246 ntTSL 5 BASIC2.31□□□□□ -2.04
SHPRHQ149N8 AC069228.1-202ENST00000550272 737 ntTSL 3 BASIC2.31□□□□□ -2.04
SHPRHQ149N8 SNORD39.2-201ENST00000579995 76 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
SHPRHQ149N8 AC090398.1-202ENST00000580403 457 ntTSL 2 BASIC2.31□□□□□ -2.04
SHPRHQ149N8 AC123786.2-201ENST00000603459 275 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
SHPRHQ149N8 LINC01355-202ENST00000604481 400 ntTSL 2 BASIC2.31□□□□□ -2.04
SHPRHQ149N8 AC126118.1-201ENST00000607744 628 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
SHPRHQ149N8 DAOA-AS1_1.1-201ENST00000613021 201 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
SHPRHQ149N8 AC007256.1-201ENST00000392253 2765 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
SHPRHQ149N8 BRDT-206ENST00000402388 3125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.3□□□□□ -2.04
SHPRHQ149N8 CNOT6LP1-201ENST00000559681 1462 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
SHPRHQ149N8 ZNF451-208ENST00000491832 3632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.3□□□□□ -2.04
SHPRHQ149N8 RNU4-13P-201ENST00000364019 141 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
SHPRHQ149N8 SNORA16.1-201ENST00000364597 132 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
SHPRHQ149N8 RNU6-342P-201ENST00000384521 104 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
SHPRHQ149N8 RN7SKP101-201ENST00000411376 320 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
SHPRHQ149N8 MRLN-201ENST00000414264 422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.3□□□□□ -2.04
SHPRHQ149N8 AC017048.2-201ENST00000431455 822 ntTSL 3 BASIC2.3□□□□□ -2.04
SHPRHQ149N8 RPS15AP7-201ENST00000439294 405 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
SHPRHQ149N8 ELOCP10-201ENST00000440624 327 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
SHPRHQ149N8 AC009474.2-201ENST00000451383 136 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
SHPRHQ149N8 TH2LCRR-203ENST00000457489 439 ntTSL 3 BASIC2.3□□□□□ -2.04
SHPRHQ149N8 AC026347.1-201ENST00000463255 474 ntTSL 3 BASIC2.3□□□□□ -2.04
SHPRHQ149N8 RPL21P39-201ENST00000463605 483 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
SHPRHQ149N8 AC021146.7-201ENST00000509604 775 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
SHPRHQ149N8 HMGB1P47-201ENST00000511281 589 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
SHPRHQ149N8 RNA5SP82-201ENST00000516707 92 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
SHPRHQ149N8 AP002748.2-201ENST00000528671 348 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
SHPRHQ149N8 AL078603.1-201ENST00000603824 313 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
SHPRHQ149N8 ELOCP34-201ENST00000604436 327 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
SHPRHQ149N8 AC242426.3-202ENST00000607149 2397 ntTSL 5 BASIC2.3□□□□□ -2.04
SHPRHQ149N8 POLR2J4-204ENST00000418424 324 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
SHPRHQ149N8 HMGB3P21-201ENST00000452483 547 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
SHPRHQ149N8 LINC02430-201ENST00000504755 476 ntTSL 3 BASIC2.29□□□□□ -2.04
SHPRHQ149N8 MTND4LP22-201ENST00000508209 276 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
SHPRHQ149N8 AC105429.2-201ENST00000610567 517 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
SHPRHQ149N8 LRRCC1-202ENST00000414626 4493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.29□□□□□ -2.04
SHPRHQ149N8 NEB-203ENST00000397345 26202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.29□□□□□ -2.04
SHPRHQ149N8 NEB-209ENST00000427231 26202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.29□□□□□ -2.04
SHPRHQ149N8 CEP57L1-203ENST00000368970 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.29□□□□□ -2.04
SHPRHQ149N8 MIER3-204ENST00000381226 5210 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.29□□□□□ -2.04
SHPRHQ149N8 SLCO1B3-202ENST00000381545 2805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.29□□□□□ -2.04
SHPRHQ149N8 LINC01611-201ENST00000428896 477 ntTSL 5 BASIC2.28□□□□□ -2.04
SHPRHQ149N8 TPT1P14-201ENST00000448018 505 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
SHPRHQ149N8 AL353780.1-201ENST00000455583 458 ntTSL 2 BASIC2.28□□□□□ -2.04
SHPRHQ149N8 LINC02488-201ENST00000504287 652 ntTSL 2 BASIC2.28□□□□□ -2.04
SHPRHQ149N8 MIR4512-201ENST00000583257 77 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
SHPRHQ149N8 AC009318.3-201ENST00000616916 503 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
SHPRHQ149N8 CPXCR1-203ENST00000614120 1485 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.28□□□□□ -2.04
SHPRHQ149N8 USP53-202ENST00000450251 6072 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.28□□□□□ -2.04
SHPRHQ149N8 SERPINI2-202ENST00000461846 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.28□□□□□ -2.04
SHPRHQ149N8 TAS2R15P-201ENST00000390674 928 ntBASIC2.28□□□□□ -2.05
SHPRHQ149N8 AL121972.1-201ENST00000402023 252 ntBASIC2.28□□□□□ -2.05
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