Protein–RNA interactions for Protein: Q14839

CHD4, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,912 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHD4Q14839 JKAMP-212ENST00000556985 592 ntTSL 2 BASIC3.15□□□□□ -1.91
CHD4Q14839 AC114546.1-201ENST00000560140 473 ntTSL 3 BASIC3.15□□□□□ -1.91
CHD4Q14839 AL049838.1-201ENST00000563647 981 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
CHD4Q14839 AP005433.1-202ENST00000580845 521 ntTSL 4 BASIC3.15□□□□□ -1.91
CHD4Q14839 AC011494.1-201ENST00000596454 237 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
CHD4Q14839 AL670729.3-201ENST00000602345 574 ntTSL 4 BASIC3.15□□□□□ -1.91
CHD4Q14839 AL592148.2-201ENST00000612210 372 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
CHD4Q14839 AC104985.3-201ENST00000623479 597 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
CHD4Q14839 AC012593.1-211ENST00000625996 799 ntTSL 5 BASIC3.15□□□□□ -1.91
CHD4Q14839 SATB1-AS1-266ENST00000630271 813 ntTSL 5 BASIC3.15□□□□□ -1.91
CHD4Q14839 CAPZA2-215ENST00000639546 129 ntTSL 5 BASIC3.15□□□□□ -1.91
CHD4Q14839 ATXN3-248ENST00000558190 26812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.15□□□□□ -1.91
CHD4Q14839 AL136964.1-201ENST00000622038 2990 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
CHD4Q14839 RICTOR-201ENST00000296782 7505 ntTSL 1 (best) BASIC3.14□□□□□ -1.91
CHD4Q14839 AC011460.1-201ENST00000636268 1834 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
CHD4Q14839 LINC01625-201ENST00000454788 1690 ntTSL 2 BASIC3.14□□□□□ -1.91
CHD4Q14839 SLC39A10-202ENST00000409086 5432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.14□□□□□ -1.91
CHD4Q14839 HMGB1P5-201ENST00000255320 642 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
CHD4Q14839 RNU6-582P-201ENST00000362989 107 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
CHD4Q14839 SNRPE-201ENST00000367208 355 ntTSL 2 BASIC3.14□□□□□ -1.91
CHD4Q14839 MTCO2P8-201ENST00000412213 658 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
CHD4Q14839 AL590502.1-201ENST00000433019 505 ntTSL 2 BASIC3.14□□□□□ -1.91
CHD4Q14839 USP9YP7-201ENST00000436723 430 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
CHD4Q14839 MTCYBP42-201ENST00000444653 1130 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
CHD4Q14839 AC079776.3-201ENST00000450665 370 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
CHD4Q14839 USP9YP32-201ENST00000452432 430 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
CHD4Q14839 RNU7-140P-201ENST00000459546 60 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
CHD4Q14839 AC087385.1-201ENST00000475062 312 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
CHD4Q14839 LINC02049-201ENST00000490647 747 ntTSL 1 (best) BASIC3.14□□□□□ -1.91
CHD4Q14839 AC010273.1-201ENST00000504129 946 ntTSL 5 BASIC3.14□□□□□ -1.91
CHD4Q14839 AC091860.1-201ENST00000505723 432 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
CHD4Q14839 MTCYBP16-201ENST00000509187 1129 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
CHD4Q14839 LY96-202ENST00000518893 430 ntTSL 3 BASIC3.14□□□□□ -1.91
CHD4Q14839 AC063948.1-201ENST00000547360 379 ntTSL 5 BASIC3.14□□□□□ -1.91
CHD4Q14839 AC025030.2-201ENST00000552558 567 ntTSL 2 BASIC3.14□□□□□ -1.91
CHD4Q14839 LINC02329-201ENST00000554753 511 ntTSL 5 BASIC3.14□□□□□ -1.91
CHD4Q14839 LINC02274-201ENST00000555539 1174 ntTSL 1 (best) BASIC3.14□□□□□ -1.91
CHD4Q14839 AC079070.1-201ENST00000578740 555 ntTSL 2 BASIC3.14□□□□□ -1.91
CHD4Q14839 AP005136.1-201ENST00000579765 429 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
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CHD4Q14839 AC022150.3-201ENST00000599143 880 ntTSL 5 BASIC3.14□□□□□ -1.91
CHD4Q14839 AL035411.2-201ENST00000604022 421 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
CHD4Q14839 AC128687.1-201ENST00000605304 619 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
CHD4Q14839 AC139769.3-201ENST00000618383 175 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
CHD4Q14839 GPR34-203ENST00000620846 1282 ntTSL 1 (best) BASIC3.14□□□□□ -1.91
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CHD4Q14839 TPTE2P6-202ENST00000445572 1007 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
CHD4Q14839 AL162742.2-201ENST00000472915 244 ntTSL 5 BASIC3.13□□□□□ -1.91
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CHD4Q14839 AL136146.2-201ENST00000534594 494 ntTSL 2 BASIC3.13□□□□□ -1.91
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CHD4Q14839 AL133279.2-201ENST00000556546 428 ntTSL 3 BASIC3.13□□□□□ -1.91
CHD4Q14839 MIR3605-201ENST00000583214 100 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
CHD4Q14839 AC002487.1-201ENST00000604565 994 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
CHD4Q14839 AC069234.5-201ENST00000611056 416 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
CHD4Q14839 Metazoa_SRP.117-201ENST00000615106 292 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
CHD4Q14839 CDKN2B-AS.1-201ENST00000617921 150 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
CHD4Q14839 CR381572.1-201ENST00000625098 102 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
CHD4Q14839 AC111188.2-201ENST00000529697 1387 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
CHD4Q14839 ATP2B1-202ENST00000359142 6977 ntTSL 5 BASIC3.13□□□□□ -1.91
CHD4Q14839 SOBP-204ENST00000618129 1550 ntTSL 1 (best) BASIC3.13□□□□□ -1.91
CHD4Q14839 RGS21-201ENST00000417209 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.13□□□□□ -1.91
CHD4Q14839 AC073130.1-201ENST00000457033 1958 ntTSL 2 BASIC3.13□□□□□ -1.91
CHD4Q14839 AC016717.2-201ENST00000609089 5141 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
CHD4Q14839 MTND5P28-201ENST00000438005 1594 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
CHD4Q14839 AC007390.1-201ENST00000415722 356 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
CHD4Q14839 ARF4P2-201ENST00000430209 526 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
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