Protein–RNA interactions for Protein: Q14534

SQLE, Squalene monooxygenase, humanhuman

Predictions only

Length 574 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SQLEQ14534 CTHRC1-204ENST00000520880 560 ntTSL 4 BASIC3.38□□□□□ -1.87
SQLEQ14534 SMILR-201ENST00000533992 553 ntTSL 4 BASIC3.38□□□□□ -1.87
SQLEQ14534 DIAPH2-AS1-203ENST00000542084 450 ntTSL 5 BASIC3.38□□□□□ -1.87
SQLEQ14534 LINC02460-201ENST00000543558 536 ntTSL 4 BASIC3.38□□□□□ -1.87
SQLEQ14534 LINC00640-203ENST00000556479 576 ntTSL 2 BASIC3.38□□□□□ -1.87
SQLEQ14534 LINC02345-201ENST00000557883 766 ntTSL 3 BASIC3.38□□□□□ -1.87
SQLEQ14534 LINC01491-201ENST00000558434 505 ntTSL 3 BASIC3.38□□□□□ -1.87
SQLEQ14534 SMG1P7-203ENST00000573141 619 ntTSL 2 BASIC3.38□□□□□ -1.87
SQLEQ14534 AC006116.8-203ENST00000587448 465 ntTSL 3 BASIC3.38□□□□□ -1.87
SQLEQ14534 AP000403.1-201ENST00000603349 851 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
SQLEQ14534 AC112187.2-201ENST00000604345 283 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
SQLEQ14534 AC092354.1-201ENST00000606057 376 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
SQLEQ14534 CT45A10-202ENST00000617981 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.38□□□□□ -1.87
SQLEQ14534 AC138393.3-201ENST00000618397 573 ntTSL 3 BASIC3.38□□□□□ -1.87
SQLEQ14534 CT45A7-202ENST00000620885 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.38□□□□□ -1.87
SQLEQ14534 C3orf85-208ENST00000622536 925 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC3.38□□□□□ -1.87
SQLEQ14534 AC007494.3-201ENST00000624660 743 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
SQLEQ14534 AC012442.3-202ENST00000636742 206 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
SQLEQ14534 SLC39A10-202ENST00000409086 5432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.38□□□□□ -1.87
SQLEQ14534 MBNL3-204ENST00000370853 2661 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC3.38□□□□□ -1.87
SQLEQ14534 DICER1-203ENST00000526495 10331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.38□□□□□ -1.87
SQLEQ14534 SMC1B-201ENST00000357450 4201 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.38□□□□□ -1.87
SQLEQ14534 MME-216ENST00000615825 5523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.38□□□□□ -1.87
SQLEQ14534 PTBP2-211ENST00000609116 12014 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.37□□□□□ -1.87
SQLEQ14534 IBTK-209ENST00000510291 4109 ntTSL 1 (best) BASIC3.37□□□□□ -1.87
SQLEQ14534 ZNF833P-201ENST00000424938 1494 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
SQLEQ14534 OXR1-206ENST00000449762 2621 ntTSL 1 (best) BASIC3.37□□□□□ -1.87
SQLEQ14534 VPS13C-203ENST00000395896 14579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.37□□□□□ -1.87
SQLEQ14534 KNTC1-204ENST00000436959 2412 ntTSL 2 BASIC3.37□□□□□ -1.87
SQLEQ14534 AL672167.1-206ENST00000356293 943 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
SQLEQ14534 RNU6-28P-201ENST00000362378 107 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
SQLEQ14534 RNA5SP119-201ENST00000362715 117 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
SQLEQ14534 SNORA73.2-201ENST00000364946 201 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
SQLEQ14534 RNU6-359P-201ENST00000365466 108 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
SQLEQ14534 RNU6-805P-201ENST00000365643 106 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
SQLEQ14534 DYNLT3P1-201ENST00000378574 347 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
SQLEQ14534 SNORD116-9-201ENST00000384000 95 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
SQLEQ14534 SNORD116-3-201ENST00000384287 95 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
SQLEQ14534 SNORD116-7-201ENST00000384404 95 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
SQLEQ14534 SNORD116-5-201ENST00000384462 95 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
SQLEQ14534 MIR30B-201ENST00000384850 88 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
SQLEQ14534 SAR1AP2-201ENST00000392696 594 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
SQLEQ14534 EIF4EBP2P3-201ENST00000403144 334 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
SQLEQ14534 AL021407.1-201ENST00000404531 386 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
SQLEQ14534 MIR1302-8-201ENST00000408342 128 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
SQLEQ14534 MRPL30-202ENST00000409145 562 ntTSL 2 BASIC3.37□□□□□ -1.87
SQLEQ14534 LIMS1-AS1-201ENST00000411710 477 ntTSL 3 BASIC3.37□□□□□ -1.87
SQLEQ14534 TPMTP3-201ENST00000411928 735 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
SQLEQ14534 AC091705.1-201ENST00000412197 209 ntTSL 5 BASIC3.37□□□□□ -1.87
SQLEQ14534 RAD23BP2-201ENST00000416003 1207 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
SQLEQ14534 AC245291.1-201ENST00000419501 328 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
SQLEQ14534 LINC01204-201ENST00000422047 639 ntTSL 3 BASIC3.37□□□□□ -1.87
SQLEQ14534 LINC01857-201ENST00000429730 492 ntTSL 2 BASIC3.37□□□□□ -1.87
SQLEQ14534 AC244035.1-201ENST00000430042 390 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
SQLEQ14534 LINC01884-201ENST00000433429 440 ntTSL 3 BASIC3.37□□□□□ -1.87
SQLEQ14534 AL353705.1-201ENST00000433468 480 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
SQLEQ14534 LARP1BP3-201ENST00000437229 869 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
SQLEQ14534 AL512286.1-201ENST00000439244 400 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
SQLEQ14534 AC118469.1-201ENST00000442943 488 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
SQLEQ14534 AL353691.1-201ENST00000451332 387 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
SQLEQ14534 SATB1-AS1-204ENST00000453361 726 ntTSL 3 BASIC3.37□□□□□ -1.87
SQLEQ14534 AC112229.2-201ENST00000456683 476 ntTSL 5 BASIC3.37□□□□□ -1.87
SQLEQ14534 FAM172BP-201ENST00000487497 1089 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
SQLEQ14534 DSTNP2-201ENST00000504533 515 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
SQLEQ14534 AC093297.2-207ENST00000505401 692 ntTSL 3 BASIC3.37□□□□□ -1.87
SQLEQ14534 AC011396.1-201ENST00000507391 312 ntTSL 3 BASIC3.37□□□□□ -1.87
SQLEQ14534 AC004062.1-201ENST00000509926 645 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
SQLEQ14534 AC098868.1-201ENST00000512628 624 ntTSL 2 BASIC3.37□□□□□ -1.87
SQLEQ14534 RNU6-711P-201ENST00000517255 106 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
SQLEQ14534 RANP9-201ENST00000519957 271 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
SQLEQ14534 AP001205.1-201ENST00000521625 449 ntTSL 3 BASIC3.37□□□□□ -1.87
SQLEQ14534 AC103952.1-201ENST00000521872 590 ntTSL 3 BASIC3.37□□□□□ -1.87
SQLEQ14534 AP000889.1-201ENST00000530968 660 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
SQLEQ14534 SETP7-201ENST00000552169 453 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
SQLEQ14534 FOPNL-204ENST00000573396 735 ntTSL 3 BASIC3.37□□□□□ -1.87
SQLEQ14534 AL031985.2-201ENST00000600955 480 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
SQLEQ14534 AL160281.1-201ENST00000605307 311 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
SQLEQ14534 BCRP9-201ENST00000605312 388 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
SQLEQ14534 AC004832.5-201ENST00000608677 401 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
SQLEQ14534 AC009090.3-201ENST00000616553 565 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
SQLEQ14534 AC068831.7-201ENST00000616954 363 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
SQLEQ14534 AC040168.1-201ENST00000623594 991 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
SQLEQ14534 LINC01002-206ENST00000631772 539 ntTSL 4 BASIC3.37□□□□□ -1.87
SQLEQ14534 AC092192.1-201ENST00000633154 1018 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
SQLEQ14534 CR383658.2-201ENST00000547576 1525 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
SQLEQ14534 AC007823.1-201ENST00000569932 1566 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
SQLEQ14534 TTN-204ENST00000360870 18218 ntTSL 5 BASIC3.36□□□□□ -1.87
SQLEQ14534 PAPPA-AS1-201ENST00000445861 2450 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
SQLEQ14534 OR10AG1-202ENST00000641071 2807 ntAPPRIS P1 BASIC3.36□□□□□ -1.87
SQLEQ14534 ATP2B1-203ENST00000393164 3127 ntTSL 1 (best) BASIC3.36□□□□□ -1.87
SQLEQ14534 ATP8A2P3-201ENST00000426792 1536 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
SQLEQ14534 RNU4-21P-201ENST00000362802 126 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
SQLEQ14534 Y_RNA.97-201ENST00000363094 102 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
SQLEQ14534 RNU6-289P-201ENST00000364093 107 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
SQLEQ14534 ESD-201ENST00000378697 1079 ntTSL 5 BASIC3.36□□□□□ -1.87
SQLEQ14534 RNU4-78P-201ENST00000410940 126 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
SQLEQ14534 HSFY4P-201ENST00000415994 1181 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
SQLEQ14534 RPL7P46-201ENST00000425129 740 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
SQLEQ14534 AL445669.1-201ENST00000426743 755 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
SQLEQ14534 AC017048.2-201ENST00000431455 822 ntTSL 3 BASIC3.36□□□□□ -1.87
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