Protein–RNA interactions for Protein: Q13946

PDE7A, High affinity cAMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase 7A, humanhuman

Predictions only

Length 482 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE7AQ13946 AC104619.2-201ENST00000514293 646 ntTSL 3 BASIC3.08□□□□□ -1.92
PDE7AQ13946 CASP1P1-201ENST00000526345 212 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
PDE7AQ13946 LINC01481-201ENST00000552998 629 ntTSL 2 BASIC3.08□□□□□ -1.92
PDE7AQ13946 LINC02410-201ENST00000553095 393 ntTSL 2 BASIC3.08□□□□□ -1.92
PDE7AQ13946 LINC01467-201ENST00000554211 1187 ntTSL 1 (best) BASIC3.08□□□□□ -1.92
PDE7AQ13946 AC073657.2-201ENST00000605661 303 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
PDE7AQ13946 ESRRAP2-204ENST00000606337 280 ntTSL 5 BASIC3.08□□□□□ -1.92
PDE7AQ13946 U3.45-201ENST00000607547 219 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
PDE7AQ13946 AL050303.3-201ENST00000613704 284 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
PDE7AQ13946 PDCD6IPP1-201ENST00000615124 579 ntTSL 2 BASIC3.08□□□□□ -1.92
PDE7AQ13946 MESTIT1_2.1-201ENST00000616328 235 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
PDE7AQ13946 HOTAIRM1_2.1-201ENST00000616712 215 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
PDE7AQ13946 AC018816.2-201ENST00000621460 353 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
PDE7AQ13946 TTN-AS1-263ENST00000627527 784 ntTSL 5 BASIC3.08□□□□□ -1.92
PDE7AQ13946 FAM35BP-202ENST00000497389 3337 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
PDE7AQ13946 C2orf73-208ENST00000615983 1376 ntTSL 1 (best) BASIC3.08□□□□□ -1.92
PDE7AQ13946 PCF11-AS1-201ENST00000602322 1516 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
PDE7AQ13946 PKHD1L1-201ENST00000378402 13076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.08□□□□□ -1.92
PDE7AQ13946 ADAM5-201ENST00000359790 1663 ntTSL 1 (best) BASIC3.08□□□□□ -1.92
PDE7AQ13946 ANKRD26P2-201ENST00000445530 1710 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
PDE7AQ13946 RICTOR-201ENST00000296782 7505 ntTSL 1 (best) BASIC3.07□□□□□ -1.92
PDE7AQ13946 MANEA-201ENST00000358812 4575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.07□□□□□ -1.92
PDE7AQ13946 Z83843.1-201ENST00000604070 3685 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
PDE7AQ13946 OR6C70-201ENST00000327335 939 ntAPPRIS P1 BASIC3.07□□□□□ -1.92
PDE7AQ13946 AL672167.1-206ENST00000356293 943 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
PDE7AQ13946 RNU6-223P-201ENST00000362830 107 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
PDE7AQ13946 RNU6-931P-201ENST00000363850 107 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
PDE7AQ13946 RNU1-33P-201ENST00000364249 162 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
PDE7AQ13946 RNU6-777P-201ENST00000364265 104 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
PDE7AQ13946 MIR449B-201ENST00000384995 97 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
PDE7AQ13946 MIR514A1-201ENST00000385133 98 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
PDE7AQ13946 MIR670-201ENST00000390142 98 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
PDE7AQ13946 TRAJ31-201ENST00000390506 57 ntAPPRIS P1 BASIC3.07□□□□□ -1.92
PDE7AQ13946 SNORA11-201ENST00000408789 128 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
PDE7AQ13946 FGF12-AS1-201ENST00000414920 580 ntTSL 4 BASIC3.07□□□□□ -1.92
PDE7AQ13946 RPS15AP6-201ENST00000420703 385 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
PDE7AQ13946 AC069157.1-201ENST00000421749 137 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
PDE7AQ13946 F10-AS1-201ENST00000424635 417 ntTSL 5 BASIC3.07□□□□□ -1.92
PDE7AQ13946 AL355303.1-201ENST00000428920 680 ntTSL 3 BASIC3.07□□□□□ -1.92
PDE7AQ13946 GCA-203ENST00000429691 824 ntTSL 3 BASIC3.07□□□□□ -1.92
PDE7AQ13946 PPEF1-AS1-201ENST00000430641 430 ntTSL 5 BASIC3.07□□□□□ -1.92
PDE7AQ13946 HMGN2P31-201ENST00000432430 273 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
PDE7AQ13946 AC097347.1-201ENST00000438499 517 ntTSL 3 BASIC3.07□□□□□ -1.92
PDE7AQ13946 AL445490.2-201ENST00000440492 441 ntTSL 3 BASIC3.07□□□□□ -1.92
PDE7AQ13946 HMGB3P8-201ENST00000449709 577 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
PDE7AQ13946 ANKRD26P4-201ENST00000455755 950 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
PDE7AQ13946 AC016933.1-201ENST00000504735 539 ntTSL 2 BASIC3.07□□□□□ -1.92
PDE7AQ13946 AC006499.5-201ENST00000505037 514 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
PDE7AQ13946 AC034244.1-201ENST00000507687 207 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
PDE7AQ13946 AC026780.1-201ENST00000512237 952 ntTSL 3 BASIC3.07□□□□□ -1.92
PDE7AQ13946 MTND5P4-201ENST00000514978 288 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
PDE7AQ13946 AC106744.2-202ENST00000515123 448 ntTSL 3 BASIC3.07□□□□□ -1.92
PDE7AQ13946 RNU6-798P-201ENST00000516912 103 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
PDE7AQ13946 OR5G4P-201ENST00000525251 760 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
PDE7AQ13946 C11orf1-204ENST00000530214 599 ntTSL 5 BASIC3.07□□□□□ -1.92
PDE7AQ13946 LINC02384-205ENST00000539404 785 ntTSL 3 BASIC3.07□□□□□ -1.92
PDE7AQ13946 OR7K1P-201ENST00000546439 926 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
PDE7AQ13946 AC090503.2-201ENST00000551135 981 ntTSL 3 BASIC3.07□□□□□ -1.92
PDE7AQ13946 SARNP-203ENST00000552080 726 ntTSL 2 BASIC3.07□□□□□ -1.92
PDE7AQ13946 AC023510.1-201ENST00000555862 490 ntTSL 2 BASIC3.07□□□□□ -1.92
PDE7AQ13946 AC120045.1-201ENST00000563502 251 ntTSL 3 BASIC3.07□□□□□ -1.92
PDE7AQ13946 AC139426.2-201ENST00000568289 251 ntTSL 3 BASIC3.07□□□□□ -1.92
PDE7AQ13946 AC068313.1-201ENST00000604028 1008 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
PDE7AQ13946 MIR92B-201ENST00000607575 96 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
PDE7AQ13946 AC072039.2-201ENST00000608883 439 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
PDE7AQ13946 AL157817.1-201ENST00000614264 790 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
PDE7AQ13946 AL355365.1-201ENST00000616480 294 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
PDE7AQ13946 AC019226.1-201ENST00000625666 515 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
PDE7AQ13946 LINC02246-205ENST00000627623 417 ntTSL 5 BASIC3.07□□□□□ -1.92
PDE7AQ13946 TEX41-300ENST00000631048 69 ntTSL 5 BASIC3.07□□□□□ -1.92
PDE7AQ13946 PCMTD1P7-201ENST00000634506 357 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
PDE7AQ13946 AC007218.2-201ENST00000636913 179 ntTSL 5 BASIC3.07□□□□□ -1.92
PDE7AQ13946 TRAPPC13-204ENST00000438419 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC3.07□□□□□ -1.92
PDE7AQ13946 PHTF2-202ENST00000275575 4541 ntTSL 1 (best) BASIC3.07□□□□□ -1.92
PDE7AQ13946 NEB-218ENST00000603639 25578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.07□□□□□ -1.92
PDE7AQ13946 NEB-219ENST00000604864 25578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.07□□□□□ -1.92
PDE7AQ13946 CDC27-207ENST00000531206 3177 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.06□□□□□ -1.92
PDE7AQ13946 PKIB-202ENST00000354275 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.06□□□□□ -1.92
PDE7AQ13946 RNU6-853P-201ENST00000364306 107 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
PDE7AQ13946 AKAP14-202ENST00000371422 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.06□□□□□ -1.92
PDE7AQ13946 DAZ4-201ENST00000382296 2048 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC3.06□□□□□ -1.92
PDE7AQ13946 RNU6-723P-201ENST00000383973 107 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
PDE7AQ13946 MIR490-201ENST00000384865 128 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
PDE7AQ13946 MIR7-3-201ENST00000384898 110 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
PDE7AQ13946 SNORA48.8-201ENST00000391324 134 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
PDE7AQ13946 SENP7-204ENST00000394085 1483 ntTSL 1 (best) BASIC3.06□□□□□ -1.92
PDE7AQ13946 RNA5SP44-201ENST00000410446 133 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
PDE7AQ13946 HMGN1P24-201ENST00000412282 298 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
PDE7AQ13946 BX323014.1-201ENST00000412876 237 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
PDE7AQ13946 LINC00845-201ENST00000417931 696 ntTSL 2 BASIC3.06□□□□□ -1.92
PDE7AQ13946 LINC02238-201ENST00000424953 557 ntTSL 5 BASIC3.06□□□□□ -1.92
PDE7AQ13946 LSM1P1-201ENST00000438629 273 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
PDE7AQ13946 Z73417.1-201ENST00000447373 778 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
PDE7AQ13946 PDSS1P2-201ENST00000449397 678 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
PDE7AQ13946 RNU6-420P-201ENST00000458780 107 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
PDE7AQ13946 AC008155.2-201ENST00000464337 397 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
PDE7AQ13946 AL049874.1-201ENST00000489560 388 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
PDE7AQ13946 AC021678.1-201ENST00000505195 936 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
PDE7AQ13946 AC109454.3-201ENST00000512748 669 ntTSL 3 BASIC3.06□□□□□ -1.92
PDE7AQ13946 LINC01216-201ENST00000515728 824 ntTSL 5 BASIC3.06□□□□□ -1.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 109.1 ms