Protein–RNA interactions for Protein: Q13838

DDX39B, Spliceosome RNA helicase DDX39B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 428 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX39BQ13838 PIK3C2G-202ENST00000433979 4840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.96
DDX39BQ13838 CHD9-218ENST00000566029 13110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
DDX39BQ13838 AL136537.2-201ENST00000562049 2471 ntTSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
DDX39BQ13838 SCFD1-207ENST00000544052 2058 ntTSL 2 BASIC2.83□□□□□ -1.96
DDX39BQ13838 ZNF705G-201ENST00000400156 3644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.83□□□□□ -1.96
DDX39BQ13838 AL672167.1-206ENST00000356293 943 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
DDX39BQ13838 RNU6-270P-201ENST00000364131 105 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
DDX39BQ13838 SNRPE-201ENST00000367208 355 ntTSL 2 BASIC2.83□□□□□ -1.96
DDX39BQ13838 MIR514A1-201ENST00000385133 98 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
DDX39BQ13838 RNU2-42P-201ENST00000410697 113 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
DDX39BQ13838 AC096533.1-201ENST00000411645 353 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
DDX39BQ13838 OFD1P1Y-201ENST00000411756 1225 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
DDX39BQ13838 BX682237.1-201ENST00000415016 335 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
DDX39BQ13838 Z85995.1-201ENST00000415547 335 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
DDX39BQ13838 C1DP1-201ENST00000426049 402 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
DDX39BQ13838 AC013262.1-201ENST00000426710 252 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
DDX39BQ13838 AL365496.1-201ENST00000426885 215 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
DDX39BQ13838 GTF2IP7-202ENST00000436677 309 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
DDX39BQ13838 NDUFAF4P2-201ENST00000445374 520 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
DDX39BQ13838 AL671855.1-201ENST00000446875 1203 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
DDX39BQ13838 RPL37P4-201ENST00000448908 268 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
DDX39BQ13838 AL162389.1-201ENST00000449233 177 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
DDX39BQ13838 TEX41-209ENST00000451478 452 ntTSL 2 BASIC2.83□□□□□ -1.96
DDX39BQ13838 AC098820.1-201ENST00000453157 512 ntTSL 2 BASIC2.83□□□□□ -1.96
DDX39BQ13838 SLC16A12-AS1-202ENST00000454270 478 ntTSL 2 BASIC2.83□□□□□ -1.96
DDX39BQ13838 RPL27AP5-201ENST00000469428 449 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
DDX39BQ13838 CAB39P1-201ENST00000502277 460 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
DDX39BQ13838 MTCYBP16-201ENST00000509187 1129 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
DDX39BQ13838 AC098799.2-201ENST00000509466 868 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
DDX39BQ13838 OR5BM1P-201ENST00000512021 366 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
DDX39BQ13838 SCARNA15.2-201ENST00000516409 127 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
DDX39BQ13838 RNU6-1282P-201ENST00000516735 96 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
DDX39BQ13838 SNORA31.22-201ENST00000517204 135 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
DDX39BQ13838 AC011377.1-201ENST00000517708 275 ntTSL 3 BASIC2.83□□□□□ -1.96
DDX39BQ13838 AC013509.1-201ENST00000524269 339 ntTSL 3 BASIC2.83□□□□□ -1.96
DDX39BQ13838 AP003181.1-201ENST00000528811 445 ntTSL 3 BASIC2.83□□□□□ -1.96
DDX39BQ13838 LINC02329-201ENST00000554753 511 ntTSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
DDX39BQ13838 AC009117.2-201ENST00000565374 504 ntTSL 3 BASIC2.83□□□□□ -1.96
DDX39BQ13838 C15orf65-201ENST00000569691 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
DDX39BQ13838 AP001429.1-201ENST00000602568 530 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
DDX39BQ13838 AC004542.2-201ENST00000602847 546 ntTSL 3 BASIC2.83□□□□□ -1.96
DDX39BQ13838 AC007179.3-201ENST00000604976 235 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
DDX39BQ13838 YPEL5P2-201ENST00000605553 359 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
DDX39BQ13838 RPL23AP88-201ENST00000605759 454 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
DDX39BQ13838 AC004067.1-201ENST00000608733 700 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
DDX39BQ13838 ATP5A1P2-202ENST00000616464 443 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
DDX39BQ13838 AC073348.1-201ENST00000623002 331 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
DDX39BQ13838 AC215522.3-201ENST00000635602 354 ntTSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
DDX39BQ13838 MAPK10-266ENST00000641066 6555 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
DDX39BQ13838 CCDC82-201ENST00000278520 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.82□□□□□ -1.96
DDX39BQ13838 GPBP1-201ENST00000264779 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
DDX39BQ13838 AP005901.5-201ENST00000545779 1796 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
DDX39BQ13838 TAB3-203ENST00000378930 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
DDX39BQ13838 MS4A14-202ENST00000395001 3401 ntTSL 5 BASIC2.82□□□□□ -1.96
DDX39BQ13838 AL049641.1-201ENST00000441055 1948 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
DDX39BQ13838 HTN1-201ENST00000246896 580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
DDX39BQ13838 CSN3-201ENST00000304954 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
DDX39BQ13838 MIR422A-201ENST00000362286 90 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
DDX39BQ13838 RNU6-28P-201ENST00000362378 107 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
DDX39BQ13838 MIR627-201ENST00000384979 97 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
DDX39BQ13838 MIR325-201ENST00000385260 98 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
DDX39BQ13838 DHFRP6-201ENST00000401776 268 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
DDX39BQ13838 RNU6ATAC10P-201ENST00000408635 111 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
DDX39BQ13838 AC005162.2-201ENST00000411479 578 ntTSL 4 BASIC2.82□□□□□ -1.96
DDX39BQ13838 RPL7P8-201ENST00000411964 730 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
DDX39BQ13838 AC007566.1-201ENST00000427458 643 ntTSL 5 BASIC2.82□□□□□ -1.96
DDX39BQ13838 MTND2P20-201ENST00000440805 661 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
DDX39BQ13838 AC095032.1-201ENST00000444810 527 ntTSL 3 BASIC2.82□□□□□ -1.96
DDX39BQ13838 RNU7-23P-201ENST00000459465 62 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
DDX39BQ13838 AC087588.1-201ENST00000462203 316 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
DDX39BQ13838 AL135752.1-201ENST00000479477 471 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
DDX39BQ13838 CCNG1-203ENST00000504553 732 ntTSL 3 BASIC2.82□□□□□ -1.96
DDX39BQ13838 AC008652.1-201ENST00000505261 469 ntTSL 3 BASIC2.82□□□□□ -1.96
DDX39BQ13838 AC118282.1-201ENST00000506408 765 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
DDX39BQ13838 LINC01088-208ENST00000511895 795 ntTSL 2 BASIC2.82□□□□□ -1.96
DDX39BQ13838 TTC39CP1-201ENST00000512513 755 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
DDX39BQ13838 AC010280.1-201ENST00000515199 340 ntTSL 2 BASIC2.82□□□□□ -1.96
DDX39BQ13838 RNU6-528P-201ENST00000516926 100 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
DDX39BQ13838 ZFPM2-AS1-207ENST00000524045 987 ntTSL 3 BASIC2.82□□□□□ -1.96
DDX39BQ13838 PIH1D2-206ENST00000528775 1025 ntTSL 5 BASIC2.82□□□□□ -1.96
DDX39BQ13838 SLC2A13P1-201ENST00000531560 322 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
DDX39BQ13838 HIGD1AP17-201ENST00000554576 276 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
DDX39BQ13838 LINC01584-203ENST00000567231 646 ntTSL 5 BASIC2.82□□□□□ -1.96
DDX39BQ13838 AC068135.2-201ENST00000569293 1028 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
DDX39BQ13838 MTND4LP25-201ENST00000570218 163 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
DDX39BQ13838 AC083760.1-201ENST00000589621 670 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
DDX39BQ13838 AC012493.2-201ENST00000595083 291 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
DDX39BQ13838 AC006539.2-201ENST00000601729 572 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
DDX39BQ13838 AC011451.2-201ENST00000604303 598 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
DDX39BQ13838 AP002802.2-201ENST00000605877 235 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
DDX39BQ13838 AC096577.2-201ENST00000611455 153 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
DDX39BQ13838 SMAD5-AS1_1.1-201ENST00000619886 266 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
DDX39BQ13838 AC008443.7-201ENST00000622195 246 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
DDX39BQ13838 OR8K3-202ENST00000623845 939 ntAPPRIS P1 BASIC2.82□□□□□ -1.96
DDX39BQ13838 AL121759.2-201ENST00000636173 570 ntTSL 4 BASIC2.82□□□□□ -1.96
DDX39BQ13838 AC072062.1-210ENST00000628464 1315 ntTSL 5 BASIC2.82□□□□□ -1.96
DDX39BQ13838 AC092447.7-201ENST00000422212 1621 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
DDX39BQ13838 SCOC-202ENST00000394201 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
DDX39BQ13838 C1orf141-202ENST00000371006 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC2.81□□□□□ -1.96
DDX39BQ13838 RAPGEF6-210ENST00000512052 3535 ntTSL 2 BASIC2.81□□□□□ -1.96
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