Protein–RNA interactions for Protein: Q13472

TOP3A, DNA topoisomerase 3-alpha, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,001 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP3AQ13472 AC079209.1-202ENST00000521953 522 ntTSL 3 BASIC4.38□□□□□ -1.71
TOP3AQ13472 CARD16-203ENST00000525374 503 ntTSL 3 BASIC4.38□□□□□ -1.71
TOP3AQ13472 AP000755.2-201ENST00000526777 571 ntTSL 5 BASIC4.38□□□□□ -1.71
TOP3AQ13472 AC090092.1-201ENST00000530576 510 ntTSL 2 BASIC4.38□□□□□ -1.71
TOP3AQ13472 AL137161.1-201ENST00000532231 390 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
TOP3AQ13472 SNHG1-208ENST00000538266 347 ntTSL 3 BASIC4.38□□□□□ -1.71
TOP3AQ13472 LINC02366-202ENST00000541949 696 ntTSL 3 BASIC4.38□□□□□ -1.71
TOP3AQ13472 SETP7-201ENST00000552169 453 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
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TOP3AQ13472 CERS3-AS1-202ENST00000560718 432 ntTSL 3 BASIC4.38□□□□□ -1.71
TOP3AQ13472 AC015912.2-201ENST00000571053 181 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
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TOP3AQ13472 AP001496.1-201ENST00000579113 471 ntTSL 4 BASIC4.38□□□□□ -1.71
TOP3AQ13472 AC024619.4-201ENST00000580924 316 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
TOP3AQ13472 LINC02210-208ENST00000585118 546 ntTSL 1 (best) BASIC4.38□□□□□ -1.71
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TOP3AQ13472 DPPA3P3-201ENST00000603842 430 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
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TOP3AQ13472 AC093799.2-201ENST00000610062 578 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
TOP3AQ13472 AC006329.2-201ENST00000611491 394 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
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TOP3AQ13472 AL353662.3-201ENST00000625131 237 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
TOP3AQ13472 POSTN-210ENST00000541481 3113 ntTSL 1 (best) BASIC4.38□□□□□ -1.71
TOP3AQ13472 THOC2-202ENST00000355725 4930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.38□□□□□ -1.71
TOP3AQ13472 MRE11-202ENST00000323977 2588 ntTSL 1 (best) BASIC4.38□□□□□ -1.71
TOP3AQ13472 C21orf91-201ENST00000284881 5433 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC4.38□□□□□ -1.71
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TOP3AQ13472 C9orf153-204ENST00000613665 1738 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC4.38□□□□□ -1.71
TOP3AQ13472 ARHGAP5-206ENST00000539826 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.38□□□□□ -1.71
TOP3AQ13472 C6orf10-205ENST00000527965 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.37□□□□□ -1.71
TOP3AQ13472 DMD-230ENST00000620040 13746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.37□□□□□ -1.71
TOP3AQ13472 LINC00158-201ENST00000332587 1476 ntTSL 1 (best) BASIC4.37□□□□□ -1.71
TOP3AQ13472 ZNF700-202ENST00000482090 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.37□□□□□ -1.71
TOP3AQ13472 ABI3BP-201ENST00000284322 4498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.37□□□□□ -1.71
TOP3AQ13472 OSBPL9P4-201ENST00000371707 1800 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
TOP3AQ13472 AC015813.6-201ENST00000624409 5808 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
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TOP3AQ13472 TAB3-204ENST00000378932 3698 ntTSL 1 (best) BASIC4.37□□□□□ -1.71
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TOP3AQ13472 GBE1-205ENST00000489715 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.36□□□□□ -1.71
TOP3AQ13472 AC009951.1-201ENST00000623674 2614 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
TOP3AQ13472 AC121333.1-201ENST00000567488 2709 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
TOP3AQ13472 NLGN1-206ENST00000457714 8242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.36□□□□□ -1.71
TOP3AQ13472 OR8D1-202ENST00000641015 8286 ntAPPRIS P1 BASIC4.36□□□□□ -1.71
TOP3AQ13472 OR8D1-203ENST00000641897 8285 ntAPPRIS P1 BASIC4.36□□□□□ -1.71
TOP3AQ13472 ZEB1-205ENST00000446923 6267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.36□□□□□ -1.71
TOP3AQ13472 DEFB107A-201ENST00000335021 389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.36□□□□□ -1.71
TOP3AQ13472 DEFB107B-201ENST00000355602 389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.36□□□□□ -1.71
TOP3AQ13472 Y_RNA.146-201ENST00000363549 102 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
TOP3AQ13472 RNU6-61P-201ENST00000365528 109 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
TOP3AQ13472 RNU6-637P-201ENST00000384050 107 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
TOP3AQ13472 RNU6-146P-201ENST00000384602 108 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
TOP3AQ13472 Y_RNA.576-201ENST00000384781 102 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
TOP3AQ13472 MRM2-202ENST00000407040 582 ntTSL 3 BASIC4.36□□□□□ -1.71
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