Protein–RNA interactions for Protein: Q13247

SRSF6, Serine/arginine-rich splicing factor 6, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 344 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF6Q13247 RPL30P9-201ENST00000465586 330 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
SRSF6Q13247 SAR1B-211ENST00000509937 455 ntTSL 5 BASIC2.29□□□□□ -2.04
SRSF6Q13247 AC025768.1-201ENST00000510057 267 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
SRSF6Q13247 RNU1-104P-201ENST00000517280 175 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
SRSF6Q13247 TRIQK-207ENST00000519069 598 ntTSL 4 BASIC2.29□□□□□ -2.04
SRSF6Q13247 OR4R1P-201ENST00000529879 463 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
SRSF6Q13247 ZDHHC20P3-201ENST00000531576 336 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
SRSF6Q13247 OR8K4P-201ENST00000534608 872 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
SRSF6Q13247 ATF7IP2-206ENST00000543967 998 ntTSL 2 BASIC2.29□□□□□ -2.04
SRSF6Q13247 AC130462.1-201ENST00000548144 549 ntTSL 5 BASIC2.29□□□□□ -2.04
SRSF6Q13247 LINC02309-201ENST00000553679 207 ntTSL 3 BASIC2.29□□□□□ -2.04
SRSF6Q13247 CMC2-208ENST00000564249 890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.29□□□□□ -2.04
SRSF6Q13247 AC007906.1-201ENST00000568648 510 ntTSL 5 BASIC2.29□□□□□ -2.04
SRSF6Q13247 AC130650.1-201ENST00000570581 415 ntTSL 2 BASIC2.29□□□□□ -2.04
SRSF6Q13247 AC012669.1-201ENST00000603209 283 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
SRSF6Q13247 AC025811.1-201ENST00000604312 472 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
SRSF6Q13247 AC010894.2-203ENST00000606406 499 ntTSL 3 BASIC2.29□□□□□ -2.04
SRSF6Q13247 AC034238.1-213ENST00000611148 150 ntTSL 5 BASIC2.29□□□□□ -2.04
SRSF6Q13247 TAB2-201ENST00000367456 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.29□□□□□ -2.04
SRSF6Q13247 AKAP9-203ENST00000359028 12247 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.29□□□□□ -2.04
SRSF6Q13247 P2RY12-201ENST00000302632 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.28□□□□□ -2.04
SRSF6Q13247 SLC4A7-201ENST00000295736 7757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.28□□□□□ -2.04
SRSF6Q13247 CHD1-201ENST00000284049 6457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.28□□□□□ -2.04
SRSF6Q13247 UHMK1-204ENST00000545294 8117 ntTSL 2 BASIC2.28□□□□□ -2.04
SRSF6Q13247 Y_RNA.164-201ENST00000363709 102 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
SRSF6Q13247 RNU1-91P-201ENST00000364746 163 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
SRSF6Q13247 RNA5SP354-201ENST00000391247 136 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
SRSF6Q13247 U3.29-201ENST00000391296 212 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
SRSF6Q13247 RNU2-17P-201ENST00000410290 190 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
SRSF6Q13247 AL135786.1-201ENST00000415892 214 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
SRSF6Q13247 FABP5P3-201ENST00000437960 408 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
SRSF6Q13247 MRPL50P4-201ENST00000446432 475 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
SRSF6Q13247 DYNLL1P6-201ENST00000503440 264 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
SRSF6Q13247 AC104803.1-201ENST00000506917 529 ntTSL 3 BASIC2.28□□□□□ -2.04
SRSF6Q13247 SNHG27-202ENST00000507933 491 ntTSL 2 BASIC2.28□□□□□ -2.04
SRSF6Q13247 AC104827.1-202ENST00000511917 1049 ntTSL 1 (best) BASIC2.28□□□□□ -2.04
SRSF6Q13247 AC090739.1-201ENST00000522190 708 ntTSL 3 BASIC2.28□□□□□ -2.04
SRSF6Q13247 PPP1R42-212ENST00000522909 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.28□□□□□ -2.04
SRSF6Q13247 RANP3-201ENST00000530970 276 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
SRSF6Q13247 MAL2-203ENST00000534619 578 ntTSL 4 BASIC2.28□□□□□ -2.04
SRSF6Q13247 AC022509.2-201ENST00000540392 699 ntTSL 3 BASIC2.28□□□□□ -2.04
SRSF6Q13247 AC138907.2-201ENST00000561479 866 ntTSL 3 BASIC2.28□□□□□ -2.04
SRSF6Q13247 AC145350.4-201ENST00000562827 866 ntTSL 3 BASIC2.28□□□□□ -2.04
SRSF6Q13247 AC133485.5-201ENST00000563407 866 ntTSL 3 BASIC2.28□□□□□ -2.04
SRSF6Q13247 MIR3670-2-201ENST00000582974 65 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
SRSF6Q13247 MIR3670-1-201ENST00000584160 65 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
SRSF6Q13247 MIR3670-3-201ENST00000584855 65 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
SRSF6Q13247 AC009977.1-201ENST00000586015 570 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
SRSF6Q13247 MIR3670-4-201ENST00000612260 65 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
SRSF6Q13247 AL353748.2-201ENST00000622148 471 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
SRSF6Q13247 AC027309.3-201ENST00000623419 351 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
SRSF6Q13247 AC040168.1-201ENST00000623594 991 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
SRSF6Q13247 PRKACB-204ENST00000370685 4481 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.28□□□□□ -2.04
SRSF6Q13247 AC010680.1-201ENST00000590024 3590 ntBASIC2.28□□□□□ -2.05
SRSF6Q13247 C1orf141-203ENST00000371007 2153 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.27□□□□□ -2.05
SRSF6Q13247 SIRT1-203ENST00000406900 3295 ntTSL 2 BASIC2.27□□□□□ -2.05
SRSF6Q13247 AC104454.1-201ENST00000421341 1401 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
SRSF6Q13247 MTND5P31-201ENST00000419366 1374 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
SRSF6Q13247 ENSAP3-201ENST00000312710 333 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
SRSF6Q13247 RNU6-1339P-201ENST00000363574 91 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
SRSF6Q13247 SPANXN3-201ENST00000370503 590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.27□□□□□ -2.05
SRSF6Q13247 RNU1-73P-201ENST00000383971 164 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
SRSF6Q13247 5S_rRNA.2-201ENST00000391293 112 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
SRSF6Q13247 NRG4-201ENST00000394907 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.27□□□□□ -2.05
SRSF6Q13247 AL136372.1-201ENST00000403060 228 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
SRSF6Q13247 AL035410.1-201ENST00000427409 427 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
SRSF6Q13247 AC007566.1-201ENST00000427458 643 ntTSL 5 BASIC2.27□□□□□ -2.05
SRSF6Q13247 AL121578.1-201ENST00000428051 892 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
SRSF6Q13247 MAP3K13-207ENST00000438798 388 ntTSL 2 BASIC2.27□□□□□ -2.05
SRSF6Q13247 AC009296.1-201ENST00000443146 155 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
SRSF6Q13247 AC096638.1-201ENST00000444678 216 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
SRSF6Q13247 RPS20P24-201ENST00000457473 361 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
SRSF6Q13247 AL162742.2-201ENST00000472915 244 ntTSL 5 BASIC2.27□□□□□ -2.05
SRSF6Q13247 RPS27P23-201ENST00000487608 251 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
SRSF6Q13247 RPL9P6-201ENST00000492764 598 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
SRSF6Q13247 AC010273.1-201ENST00000504129 946 ntTSL 5 BASIC2.27□□□□□ -2.05
SRSF6Q13247 GYPA-204ENST00000504786 357 ntTSL 1 (best) BASIC2.27□□□□□ -2.05
SRSF6Q13247 MEPE-206ENST00000511670 550 ntTSL 4 BASIC2.27□□□□□ -2.05
SRSF6Q13247 SNORA70.16-201ENST00000516390 95 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
SRSF6Q13247 AC025881.1-201ENST00000518851 512 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
SRSF6Q13247 AP005357.1-201ENST00000520749 476 ntTSL 3 BASIC2.27□□□□□ -2.05
SRSF6Q13247 AL136146.2-201ENST00000534594 494 ntTSL 2 BASIC2.27□□□□□ -2.05
SRSF6Q13247 AC004486.1-201ENST00000546846 233 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
SRSF6Q13247 OR11H5P-201ENST00000554039 926 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
SRSF6Q13247 EIF1AXP2-201ENST00000555940 413 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
SRSF6Q13247 LINC02328-203ENST00000557195 682 ntTSL 3 BASIC2.27□□□□□ -2.05
SRSF6Q13247 PSMA4-206ENST00000558341 719 ntTSL 5 BASIC2.27□□□□□ -2.05
SRSF6Q13247 C16orf97-203ENST00000566314 281 ntTSL 3 BASIC2.27□□□□□ -2.05
SRSF6Q13247 AC010546.1-201ENST00000569391 485 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
SRSF6Q13247 MIR1273D-201ENST00000577266 86 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
SRSF6Q13247 AC055876.5-201ENST00000605667 259 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
SRSF6Q13247 AC103810.6-201ENST00000606708 136 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
SRSF6Q13247 Z99129.2-201ENST00000619967 314 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
SRSF6Q13247 CR381653.2-201ENST00000624041 768 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
SRSF6Q13247 COMMD6-213ENST00000626103 120 ntTSL 5 BASIC2.27□□□□□ -2.05
SRSF6Q13247 CRISP3-204ENST00000433368 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.27□□□□□ -2.05
SRSF6Q13247 LINC00560-201ENST00000564593 1599 ntTSL 1 (best) BASIC2.27□□□□□ -2.05
SRSF6Q13247 SNORA67.1-201ENST00000364749 141 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
SRSF6Q13247 RNU6-198P-201ENST00000384258 104 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
SRSF6Q13247 MIR649-201ENST00000384843 97 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 93.9 ms