Protein–RNA interactions for Protein: P55822

SH3BGR, SH3 domain-binding glutamic acid-rich protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 239 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BGRP55822 AL451062.2-201ENST00000427515 271 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
SH3BGRP55822 TRIM60P8Y-201ENST00000436338 762 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
SH3BGRP55822 AC093155.1-201ENST00000440164 826 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
SH3BGRP55822 AC004854.1-201ENST00000440356 349 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
SH3BGRP55822 AL845311.1-201ENST00000444791 891 ntTSL 3 BASIC2.9□□□□□ -1.95
SH3BGRP55822 WASF1P1-201ENST00000447560 1131 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
SH3BGRP55822 GAS5-221ENST00000450589 632 ntTSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.95
SH3BGRP55822 RPL31P60-201ENST00000478450 367 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
SH3BGRP55822 RPL7P38-201ENST00000488396 739 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
SH3BGRP55822 AC084024.2-201ENST00000503480 791 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
SH3BGRP55822 AC010273.1-201ENST00000504129 946 ntTSL 5 BASIC2.9□□□□□ -1.95
SH3BGRP55822 SNORA48.10-201ENST00000516965 160 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
SH3BGRP55822 LINC02460-201ENST00000543558 536 ntTSL 4 BASIC2.9□□□□□ -1.95
SH3BGRP55822 LINC02329-201ENST00000554753 511 ntTSL 5 BASIC2.9□□□□□ -1.95
SH3BGRP55822 TIMM9-203ENST00000555061 598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.95
SH3BGRP55822 AC215217.1-201ENST00000562162 347 ntTSL 3 BASIC2.9□□□□□ -1.95
SH3BGRP55822 ANKRD36BP2-206ENST00000575193 1245 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
SH3BGRP55822 VN1R83P-201ENST00000595685 445 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
SH3BGRP55822 CKS1BP3-201ENST00000600888 237 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
SH3BGRP55822 AC090948.3-201ENST00000606713 551 ntTSL 4 BASIC2.9□□□□□ -1.95
SH3BGRP55822 LINC02098-202ENST00000609260 554 ntTSL 3 BASIC2.9□□□□□ -1.95
SH3BGRP55822 PART1_2.1-201ENST00000612397 250 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
SH3BGRP55822 BX664730.1-201ENST00000616196 800 ntTSL 5 BASIC2.9□□□□□ -1.95
SH3BGRP55822 AC159540.2-206ENST00000619371 355 ntTSL 3 BASIC2.9□□□□□ -1.95
SH3BGRP55822 AL157770.1-201ENST00000623049 439 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
SH3BGRP55822 AC009975.2-201ENST00000635306 1429 ntTSL 5 BASIC2.9□□□□□ -1.95
SH3BGRP55822 PLSCR5-201ENST00000443512 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.95
SH3BGRP55822 MTND5P1-201ENST00000445440 1375 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
SH3BGRP55822 TSGA10-205ENST00000410001 3036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
SH3BGRP55822 CCDC82-201ENST00000278520 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
SH3BGRP55822 RNA5SP267-201ENST00000364893 126 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
SH3BGRP55822 KIF27-203ENST00000376347 1030 ntTSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
SH3BGRP55822 RNU6-1072P-201ENST00000384703 107 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
SH3BGRP55822 RNU6-443P-201ENST00000384780 107 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
SH3BGRP55822 TRAV7-201ENST00000390429 337 ntAPPRIS P1 BASIC2.89□□□□□ -1.95
SH3BGRP55822 SNORA40.2-201ENST00000390847 128 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
SH3BGRP55822 EIF4EBP2P3-201ENST00000403144 334 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
SH3BGRP55822 AL024474.1-201ENST00000404655 591 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
SH3BGRP55822 VN1R51P-201ENST00000411675 945 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
SH3BGRP55822 HMGN1P24-201ENST00000412282 298 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
SH3BGRP55822 AC007161.1-201ENST00000418534 1061 ntTSL 3 BASIC2.89□□□□□ -1.95
SH3BGRP55822 BBIP1-203ENST00000423273 492 ntTSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
SH3BGRP55822 MTCO2P23-201ENST00000425216 680 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
SH3BGRP55822 MTCO1P3-201ENST00000429327 192 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
SH3BGRP55822 OR4K11P-201ENST00000431829 904 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
SH3BGRP55822 AC090774.1-201ENST00000435925 246 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
SH3BGRP55822 GTF2IP7-202ENST00000436677 309 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
SH3BGRP55822 AC006028.1-201ENST00000438379 402 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
SH3BGRP55822 OR10R1P-201ENST00000441524 1141 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
SH3BGRP55822 BBIP1-206ENST00000447005 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.89□□□□□ -1.95
SH3BGRP55822 NUTM2A-AS1-209ENST00000447424 571 ntTSL 3 BASIC2.89□□□□□ -1.95
SH3BGRP55822 AL009048.1-201ENST00000450437 298 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
SH3BGRP55822 AC117465.1-201ENST00000457125 522 ntTSL 3 BASIC2.89□□□□□ -1.95
SH3BGRP55822 LINC00430-201ENST00000457672 597 ntTSL 3 BASIC2.89□□□□□ -1.95
SH3BGRP55822 snoU109.3-201ENST00000459477 145 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
SH3BGRP55822 AC087588.1-201ENST00000462203 316 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
SH3BGRP55822 AL358832.1-201ENST00000497800 389 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
SH3BGRP55822 UBE2V1P12-201ENST00000503954 474 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
SH3BGRP55822 LINC02198-202ENST00000505371 526 ntTSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
SH3BGRP55822 AC008243.1-202ENST00000506527 481 ntTSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
SH3BGRP55822 AC074250.1-201ENST00000511117 192 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
SH3BGRP55822 AC113155.1-201ENST00000511141 769 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
SH3BGRP55822 AC011405.1-201ENST00000514207 248 ntTSL 3 BASIC2.89□□□□□ -1.95
SH3BGRP55822 AP001317.1-201ENST00000531194 960 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
SH3BGRP55822 GLYCAM1-201ENST00000546596 285 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
SH3BGRP55822 AC025265.2-201ENST00000551905 478 ntTSL 3 BASIC2.89□□□□□ -1.95
SH3BGRP55822 AMZ2P1-203ENST00000565833 850 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
SH3BGRP55822 AF001550.1-201ENST00000572747 573 ntTSL 4 BASIC2.89□□□□□ -1.95
SH3BGRP55822 MTND3P13-201ENST00000574391 343 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
SH3BGRP55822 AC015688.2-201ENST00000584523 262 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
SH3BGRP55822 AC010928.1-202ENST00000589354 473 ntTSL 3 BASIC2.89□□□□□ -1.95
SH3BGRP55822 AC098617.1-216ENST00000602099 708 ntTSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
SH3BGRP55822 AC024153.1-201ENST00000603103 365 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
SH3BGRP55822 HNRNPDLP4-201ENST00000605144 301 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
SH3BGRP55822 AC004852.3-201ENST00000614131 326 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
SH3BGRP55822 KPNA5-202ENST00000368564 11311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
SH3BGRP55822 PRKACB-219ENST00000614872 4306 ntTSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
SH3BGRP55822 MTRNR2L10-201ENST00000545075 1530 ntAPPRIS P1 BASIC2.88□□□□□ -1.95
SH3BGRP55822 HERC4-201ENST00000277817 4371 ntTSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
SH3BGRP55822 KIAA1841-211ENST00000612149 4202 ntTSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
SH3BGRP55822 snoZ40.1-201ENST00000364540 72 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
SH3BGRP55822 SNORA67.1-201ENST00000364749 141 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
SH3BGRP55822 LINC01545-201ENST00000377879 521 ntTSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
SH3BGRP55822 RPS3AP25-201ENST00000411660 793 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
SH3BGRP55822 AC007064.1-201ENST00000412238 351 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
SH3BGRP55822 BX323014.1-201ENST00000412876 237 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
SH3BGRP55822 OR4K6P-201ENST00000416478 897 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
SH3BGRP55822 AC093843.1-201ENST00000424395 512 ntTSL 2 BASIC2.88□□□□□ -1.95
SH3BGRP55822 RPL7P44-201ENST00000424827 742 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
SH3BGRP55822 LINC01611-201ENST00000428896 477 ntTSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
SH3BGRP55822 NANOGP2-201ENST00000435391 727 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
SH3BGRP55822 AL445687.1-201ENST00000439946 251 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
SH3BGRP55822 AL358794.1-201ENST00000445689 381 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
SH3BGRP55822 AL109741.2-201ENST00000455561 343 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
SH3BGRP55822 RN7SL807P-201ENST00000470923 297 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
SH3BGRP55822 RPL7P49-201ENST00000471402 708 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
SH3BGRP55822 CSN1S1-204ENST00000507772 895 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
SH3BGRP55822 LINC02428-201ENST00000508099 527 ntTSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
SH3BGRP55822 MEPE-206ENST00000511670 550 ntTSL 4 BASIC2.88□□□□□ -1.95
SH3BGRP55822 RNU6-798P-201ENST00000516912 103 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
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