Protein–RNA interactions for Protein: P23469

PTPRE, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase epsilon, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPREP23469 AC076968.1-201ENST00000566418 429 ntTSL 5 BASIC6.57□□□□□ -1.36
PTPREP23469 AC022809.1-201ENST00000579247 428 ntTSL 3 BASIC6.57□□□□□ -1.36
PTPREP23469 AC005899.1-201ENST00000584125 563 ntTSL 5 BASIC6.57□□□□□ -1.36
PTPREP23469 TBCK-205ENST00000432496 3362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.57□□□□□ -1.36
PTPREP23469 ZNF227-208ENST00000589005 2943 ntTSL 2 BASIC6.57□□□□□ -1.36
PTPREP23469 MYB-226ENST00000528774 2277 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
PTPREP23469 LINC02401-201ENST00000550185 3059 ntTSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
PTPREP23469 AL606537.1-201ENST00000607258 2011 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
PTPREP23469 HSP90AA4P-202ENST00000506915 2228 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
PTPREP23469 CPED1-203ENST00000423795 2189 ntTSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
PTPREP23469 SEMA3A-201ENST00000265362 8225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
PTPREP23469 SLC1A3-215ENST00000612708 3832 ntTSL 5 BASIC6.56□□□□□ -1.36
PTPREP23469 CLSPN-202ENST00000318121 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
PTPREP23469 LEPR-208ENST00000616738 5081 ntTSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
PTPREP23469 KMO-203ENST00000366558 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
PTPREP23469 FYB1-204ENST00000505428 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
PTPREP23469 CCR5-201ENST00000292303 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
PTPREP23469 LINC01277-201ENST00000419957 2398 ntTSL 2 BASIC6.56□□□□□ -1.36
PTPREP23469 RNU1-136P-201ENST00000384181 164 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
PTPREP23469 MIR521-1-201ENST00000384902 87 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
PTPREP23469 U3.29-201ENST00000391296 212 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
PTPREP23469 MIR190B-201ENST00000401119 79 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
PTPREP23469 LINC01701-201ENST00000419614 451 ntTSL 2 BASIC6.56□□□□□ -1.36
PTPREP23469 AC090952.1-201ENST00000424242 446 ntTSL 3 BASIC6.56□□□□□ -1.36
PTPREP23469 MTCO1P39-201ENST00000426148 480 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
PTPREP23469 AL139148.1-201ENST00000427122 680 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
PTPREP23469 RPL12P17-201ENST00000432393 498 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
PTPREP23469 RN7SL172P-201ENST00000460535 303 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
PTPREP23469 RPL23AP65-201ENST00000475608 468 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
PTPREP23469 LNX1-AS1-203ENST00000511989 488 ntTSL 2 BASIC6.56□□□□□ -1.36
PTPREP23469 IGHVIII-47-1-201ENST00000518187 331 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
PTPREP23469 AC109466.1-204ENST00000519570 717 ntTSL 3 BASIC6.56□□□□□ -1.36
PTPREP23469 AL035078.3-201ENST00000525382 241 ntTSL 3 BASIC6.56□□□□□ -1.36
PTPREP23469 AC092470.1-201ENST00000546187 132 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
PTPREP23469 BRDTP1-201ENST00000605735 677 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
PTPREP23469 RDM1-226ENST00000619828 687 ntTSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
PTPREP23469 C4orf22-209ENST00000621014 228 ntTSL 3 BASIC6.56□□□□□ -1.36
PTPREP23469 RAD17-201ENST00000282891 2135 ntTSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
PTPREP23469 ZRANB3-211ENST00000619650 2494 ntTSL 5 BASIC6.56□□□□□ -1.36
PTPREP23469 LARP4-203ENST00000398473 6427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
PTPREP23469 ARIH1-201ENST00000379887 21681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
PTPREP23469 DLG1-213ENST00000443183 2516 ntTSL 2 BASIC6.55□□□□□ -1.36
PTPREP23469 SCAPER-207ENST00000563290 5028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
PTPREP23469 AC004158.1-201ENST00000564508 4319 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
PTPREP23469 NDRG3-201ENST00000349004 2964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
PTPREP23469 DLGAP5-202ENST00000395425 2954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
PTPREP23469 KCNAB1-212ENST00000490337 3122 ntTSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
PTPREP23469 OR5AS1-202ENST00000641320 7860 ntAPPRIS P1 BASIC6.55□□□□□ -1.36
PTPREP23469 MIR223-201ENST00000385204 110 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
PTPREP23469 LIMS1-AS1-201ENST00000411710 477 ntTSL 3 BASIC6.55□□□□□ -1.36
PTPREP23469 CEACAMP1-201ENST00000434624 1035 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
PTPREP23469 CYCSP12-201ENST00000437729 300 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
PTPREP23469 RNU7-87P-201ENST00000459343 62 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
PTPREP23469 RN7SL329P-201ENST00000467740 299 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
PTPREP23469 AC006511.1-201ENST00000470614 315 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
PTPREP23469 RPS4XP1-201ENST00000482189 787 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
PTPREP23469 AC074255.1-201ENST00000511259 501 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
PTPREP23469 AC092440.1-201ENST00000512563 571 ntTSL 4 BASIC6.55□□□□□ -1.36
PTPREP23469 AC006427.1-201ENST00000514359 712 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
PTPREP23469 RNU6-352P-201ENST00000516908 107 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
PTPREP23469 AC090155.2-201ENST00000518854 267 ntTSL 3 BASIC6.55□□□□□ -1.36
PTPREP23469 SNHG1-211ENST00000539921 1071 ntTSL 2 BASIC6.55□□□□□ -1.36
PTPREP23469 AC233702.2-202ENST00000562547 291 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
PTPREP23469 AC023824.4-201ENST00000562572 476 ntTSL 3 BASIC6.55□□□□□ -1.36
PTPREP23469 MRPS21P7-201ENST00000566937 238 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
PTPREP23469 AC015813.2-201ENST00000578794 711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.55□□□□□ -1.36
PTPREP23469 MIR4308-201ENST00000580634 81 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
PTPREP23469 LINC00511-212ENST00000581183 657 ntTSL 3 BASIC6.55□□□□□ -1.36
PTPREP23469 AC037487.3-201ENST00000606668 112 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
PTPREP23469 OR5K1-202ENST00000642057 3466 ntAPPRIS P1 BASIC6.55□□□□□ -1.36
PTPREP23469 OR4F5-202ENST00000641515 2618 ntAPPRIS P1 BASIC6.55□□□□□ -1.36
PTPREP23469 DGKB-201ENST00000399322 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
PTPREP23469 ELOVL6-202ENST00000394607 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
PTPREP23469 PTBP3-207ENST00000458258 7995 ntTSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
PTPREP23469 YTHDC1-207ENST00000579690 2983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
PTPREP23469 F13B-201ENST00000367412 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
PTPREP23469 SLAIN1-201ENST00000267219 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
PTPREP23469 AC020656.2-201ENST00000613291 5309 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
PTPREP23469 WDR17-201ENST00000280190 4705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
PTPREP23469 ZNF189-201ENST00000259395 3115 ntTSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
PTPREP23469 DEFB4B-201ENST00000318157 332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
PTPREP23469 RPL9P7-201ENST00000330965 580 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
PTPREP23469 RNA5SP183-201ENST00000362452 119 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
PTPREP23469 Y_RNA.82-201ENST00000363000 102 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
PTPREP23469 Y_RNA.92-201ENST00000363043 102 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
PTPREP23469 Y_RNA.215-201ENST00000364204 112 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
PTPREP23469 Y_RNA.235-201ENST00000364412 102 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
PTPREP23469 Y_RNA.275-201ENST00000364726 110 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
PTPREP23469 Y_RNA.306-201ENST00000365015 102 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
PTPREP23469 Y_RNA.308-201ENST00000365043 101 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
PTPREP23469 Y_RNA.312-201ENST00000365089 102 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
PTPREP23469 Y_RNA.322-201ENST00000365151 102 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
PTPREP23469 RNU6-449P-201ENST00000383914 107 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
PTPREP23469 TRAJ34-201ENST00000390503 58 ntAPPRIS P1 BASIC6.54□□□□□ -1.36
PTPREP23469 AL645927.1-201ENST00000396783 406 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
PTPREP23469 MYO3B-202ENST00000408978 5529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
PTPREP23469 RNU6-257P-201ENST00000410238 98 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
PTPREP23469 AC234781.4-201ENST00000419384 244 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
PTPREP23469 AC012506.4-201ENST00000421563 541 ntTSL 4 BASIC6.54□□□□□ -1.36
PTPREP23469 LINC02095-201ENST00000430908 346 ntTSL 2 BASIC6.54□□□□□ -1.36
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