Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZTR5

CFAP47, Cilia- and flagella-associated protein 47, humanhuman

Predictions only

Length 3,102 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFAP47Q6ZTR5 AC066616.2-201ENST00000559334 1481 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
CFAP47Q6ZTR5 LIFR-201ENST00000263409 10089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.6□□□□□ -2.15
CFAP47Q6ZTR5 TOMM22P1-201ENST00000418578 312 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
CFAP47Q6ZTR5 AC004946.1-201ENST00000421825 751 ntTSL 3 BASIC1.6□□□□□ -2.15
CFAP47Q6ZTR5 AL162414.1-201ENST00000426204 744 ntTSL 3 BASIC1.6□□□□□ -2.15
CFAP47Q6ZTR5 AL365400.1-201ENST00000431854 640 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
CFAP47Q6ZTR5 AC010976.1-211ENST00000454503 644 ntTSL 2 BASIC1.6□□□□□ -2.15
CFAP47Q6ZTR5 AC092620.2-201ENST00000458007 744 ntTSL 2 BASIC1.6□□□□□ -2.15
CFAP47Q6ZTR5 SNORD114-27-201ENST00000363766 70 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
CFAP47Q6ZTR5 RNA5SP338-201ENST00000410495 85 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
CFAP47Q6ZTR5 CBX3P5-201ENST00000552017 521 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
CFAP47Q6ZTR5 STMN1P1-201ENST00000617809 440 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
CFAP47Q6ZTR5 POLK-217ENST00000515295 1438 ntTSL 1 (best) BASIC1.59□□□□□ -2.16
CFAP47Q6ZTR5 ERBIN-212ENST00000508515 4374 ntTSL 5 BASIC1.59□□□□□ -2.16
CFAP47Q6ZTR5 HMGB1P5-201ENST00000255320 642 ntBASIC1.59□□□□□ -2.16
CFAP47Q6ZTR5 AMD1P1-201ENST00000457220 922 ntBASIC1.59□□□□□ -2.16
CFAP47Q6ZTR5 AC090819.1-201ENST00000523800 1111 ntBASIC1.59□□□□□ -2.16
CFAP47Q6ZTR5 LINC02490-201ENST00000559915 601 ntTSL 3 BASIC1.59□□□□□ -2.16
CFAP47Q6ZTR5 MSMB-201ENST00000581478 386 ntTSL 1 (best) BASIC1.59□□□□□ -2.16
CFAP47Q6ZTR5 AC004542.1-201ENST00000602955 264 ntTSL 3 BASIC1.59□□□□□ -2.16
CFAP47Q6ZTR5 AC034102.8-201ENST00000615146 484 ntBASIC1.59□□□□□ -2.16
CFAP47Q6ZTR5 AC092159.4-201ENST00000624944 550 ntBASIC1.59□□□□□ -2.16
CFAP47Q6ZTR5 CNBD1-202ENST00000518476 1594 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC1.59□□□□□ -2.16
CFAP47Q6ZTR5 C1orf146-201ENST00000370373 871 ntTSL 5 BASIC1.58□□□□□ -2.16
CFAP47Q6ZTR5 RPL39P40-201ENST00000445481 146 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
CFAP47Q6ZTR5 LINC02164-201ENST00000566684 272 ntTSL 3 BASIC1.58□□□□□ -2.16
CFAP47Q6ZTR5 AC112191.3-201ENST00000604371 277 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
CFAP47Q6ZTR5 AC083806.3-201ENST00000614016 455 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
CFAP47Q6ZTR5 AC121761.2-201ENST00000617300 689 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
CFAP47Q6ZTR5 AC008121.3-201ENST00000618726 433 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
CFAP47Q6ZTR5 RBM12B-AS1-201ENST00000623283 653 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
CFAP47Q6ZTR5 USF3-202ENST00000478658 8461 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC1.58□□□□□ -2.16
CFAP47Q6ZTR5 USP15-203ENST00000353364 14950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.58□□□□□ -2.16
CFAP47Q6ZTR5 RNU6-35P-201ENST00000384530 107 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
CFAP47Q6ZTR5 AL445183.3-201ENST00000414168 502 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
CFAP47Q6ZTR5 RPL31P35-201ENST00000431058 377 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
CFAP47Q6ZTR5 MIR4435-2HG-213ENST00000451884 423 ntTSL 3 BASIC1.58□□□□□ -2.16
CFAP47Q6ZTR5 AL121584.1-201ENST00000453972 519 ntTSL 3 BASIC1.58□□□□□ -2.16
CFAP47Q6ZTR5 SNORA70.14-201ENST00000516205 110 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
CFAP47Q6ZTR5 AC010511.1-202ENST00000590229 573 ntTSL 4 BASIC1.58□□□□□ -2.16
CFAP47Q6ZTR5 MDM2-206ENST00000350057 1401 ntTSL 1 (best) BASIC1.58□□□□□ -2.16
CFAP47Q6ZTR5 Y_RNA.390-201ENST00000383932 102 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
CFAP47Q6ZTR5 SNORA26.7-201ENST00000391288 122 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
CFAP47Q6ZTR5 RPL9P9-201ENST00000418824 636 ntTSL 2 BASIC1.57□□□□□ -2.16
CFAP47Q6ZTR5 EBAG9P1-201ENST00000418955 543 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
CFAP47Q6ZTR5 AC092783.1-201ENST00000435832 231 ntTSL 3 BASIC1.57□□□□□ -2.16
CFAP47Q6ZTR5 XKRY2-201ENST00000442362 1093 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
CFAP47Q6ZTR5 RNU6-717P-201ENST00000459076 104 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
CFAP47Q6ZTR5 AC025033.1-201ENST00000463883 194 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
CFAP47Q6ZTR5 KATNBL1P4-201ENST00000503545 918 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
CFAP47Q6ZTR5 MIR4506-201ENST00000584693 77 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
CFAP47Q6ZTR5 TPTE2-203ENST00000390680 1558 ntTSL 1 (best) BASIC1.57□□□□□ -2.16
CFAP47Q6ZTR5 SNORD6-201ENST00000365444 73 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
CFAP47Q6ZTR5 AL445305.1-201ENST00000432577 575 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
CFAP47Q6ZTR5 BBIP1-206ENST00000447005 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.57□□□□□ -2.16
CFAP47Q6ZTR5 AL035409.1-201ENST00000454305 497 ntTSL 2 BASIC1.57□□□□□ -2.16
CFAP47Q6ZTR5 DNAJC8P1-201ENST00000554535 372 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
CFAP47Q6ZTR5 AC073310.1-201ENST00000423226 1033 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
CFAP47Q6ZTR5 AC003084.1-201ENST00000427030 435 ntTSL 5 BASIC1.57□□□□□ -2.16
CFAP47Q6ZTR5 EZH2P1-201ENST00000431167 291 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
CFAP47Q6ZTR5 HMGB1P45-201ENST00000435986 653 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
CFAP47Q6ZTR5 RPS15AP1-201ENST00000457423 391 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
CFAP47Q6ZTR5 LINC01333-201ENST00000508083 724 ntTSL 1 (best) BASIC1.57□□□□□ -2.16
CFAP47Q6ZTR5 ABI1P1-201ENST00000603375 1120 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
CFAP47Q6ZTR5 AC098657.3-201ENST00000620434 263 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
CFAP47Q6ZTR5 RPL21P2-201ENST00000440049 481 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
CFAP47Q6ZTR5 AP000907.2-201ENST00000530827 353 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
CFAP47Q6ZTR5 AC092451.2-201ENST00000538746 658 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
CFAP47Q6ZTR5 EGLN3-AS1-201ENST00000555922 308 ntTSL 3 BASIC1.56□□□□□ -2.16
CFAP47Q6ZTR5 IGKV1-33-202ENST00000558152 324 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.56□□□□□ -2.16
CFAP47Q6ZTR5 AC103810.1-201ENST00000579873 453 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
CFAP47Q6ZTR5 IGKV1D-33-202ENST00000611734 324 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.56□□□□□ -2.16
CFAP47Q6ZTR5 AL512283.1-201ENST00000606756 1384 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
CFAP47Q6ZTR5 JMJD1C-210ENST00000542921 8149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.56□□□□□ -2.16
CFAP47Q6ZTR5 C11orf40-201ENST00000307616 654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.56□□□□□ -2.16
CFAP47Q6ZTR5 RNU6-174P-201ENST00000410406 106 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
CFAP47Q6ZTR5 COX6CP12-201ENST00000446748 202 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
CFAP47Q6ZTR5 HMGB3P15-201ENST00000507326 574 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
CFAP47Q6ZTR5 AC012413.1-201ENST00000521294 519 ntTSL 2 BASIC1.56□□□□□ -2.16
CFAP47Q6ZTR5 AC016573.1-201ENST00000523205 539 ntTSL 3 BASIC1.56□□□□□ -2.16
CFAP47Q6ZTR5 AL137804.1-201ENST00000528872 576 ntTSL 3 BASIC1.56□□□□□ -2.16
CFAP47Q6ZTR5 AL049869.2-201ENST00000556634 365 ntTSL 2 BASIC1.56□□□□□ -2.16
CFAP47Q6ZTR5 AP005057.1-201ENST00000583827 574 ntTSL 4 BASIC1.56□□□□□ -2.16
CFAP47Q6ZTR5 AC009314.1-201ENST00000603871 304 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
CFAP47Q6ZTR5 MTND5P7-201ENST00000413558 1798 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
CFAP47Q6ZTR5 NFIA-AS1-201ENST00000442027 384 ntTSL 2 BASIC1.55□□□□□ -2.16
CFAP47Q6ZTR5 AL139109.1-201ENST00000455491 297 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
CFAP47Q6ZTR5 AP002345.1-201ENST00000456493 928 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
CFAP47Q6ZTR5 RPS3AP22-201ENST00000488297 769 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
CFAP47Q6ZTR5 AC104581.2-201ENST00000572227 430 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
CFAP47Q6ZTR5 RMST_6.1-201ENST00000611980 203 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
CFAP47Q6ZTR5 VN1R74P-201ENST00000613259 503 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
CFAP47Q6ZTR5 AC009951.2-201ENST00000634873 644 ntTSL 5 BASIC1.55□□□□□ -2.16
CFAP47Q6ZTR5 TMEM27-201ENST00000380342 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.55□□□□□ -2.16
CFAP47Q6ZTR5 AL450326.2-201ENST00000421913 1962 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
CFAP47Q6ZTR5 AC069257.1-202ENST00000425275 422 ntTSL 3 BASIC1.55□□□□□ -2.16
CFAP47Q6ZTR5 AC009961.3-201ENST00000449832 765 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
CFAP47Q6ZTR5 SEPT7P3-201ENST00000455017 621 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
CFAP47Q6ZTR5 AC104435.1-201ENST00000483483 166 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
CFAP47Q6ZTR5 AC026780.2-201ENST00000503489 730 ntTSL 5 BASIC1.55□□□□□ -2.16
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