Protein–RNA interactions for Protein: Q16827

PTPRO, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase O, humanhuman

Predictions only

Length 1,216 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPROQ16827 AL138900.2-201ENST00000434098 156 ntTSL 3 BASIC4.68□□□□□ -1.66
PTPROQ16827 RPL23AP83-201ENST00000434984 473 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
PTPROQ16827 AC104850.1-201ENST00000435940 476 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
PTPROQ16827 AL451129.1-201ENST00000437471 285 ntTSL 3 BASIC4.68□□□□□ -1.66
PTPROQ16827 RPL23AP52-201ENST00000439311 478 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
PTPROQ16827 AL139275.2-201ENST00000444731 539 ntTSL 3 BASIC4.68□□□□□ -1.66
PTPROQ16827 AL390961.1-201ENST00000446557 319 ntTSL 2 BASIC4.68□□□□□ -1.66
PTPROQ16827 LINC01758-201ENST00000448001 458 ntTSL 3 BASIC4.68□□□□□ -1.66
PTPROQ16827 AC034195.1-202ENST00000451031 610 ntTSL 3 BASIC4.68□□□□□ -1.66
PTPROQ16827 AC067945.3-201ENST00000456176 386 ntTSL 5 BASIC4.68□□□□□ -1.66
PTPROQ16827 CEACAMP4-201ENST00000457676 421 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
PTPROQ16827 TPTE2P5-203ENST00000458118 728 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
PTPROQ16827 RBM43P1-201ENST00000476891 1081 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
PTPROQ16827 RPL31P60-201ENST00000478450 367 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
PTPROQ16827 AC082650.1-201ENST00000503542 575 ntTSL 4 BASIC4.68□□□□□ -1.66
PTPROQ16827 AC010460.1-201ENST00000507087 466 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
PTPROQ16827 VWA8P1-201ENST00000510889 176 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
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PTPROQ16827 AC022695.3-201ENST00000523385 478 ntTSL 3 BASIC4.68□□□□□ -1.66
PTPROQ16827 AC090539.1-201ENST00000523907 434 ntTSL 3 BASIC4.68□□□□□ -1.66
PTPROQ16827 AP003733.3-201ENST00000524942 788 ntTSL 2 BASIC4.68□□□□□ -1.66
PTPROQ16827 AL160237.1-201ENST00000554526 572 ntTSL 4 BASIC4.68□□□□□ -1.66
PTPROQ16827 AGGF1P4-201ENST00000568249 801 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
PTPROQ16827 AC009039.1-201ENST00000568711 471 ntTSL 4 BASIC4.68□□□□□ -1.66
PTPROQ16827 AL391840.1-201ENST00000571144 367 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
PTPROQ16827 AL670379.6-201ENST00000603753 252 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
PTPROQ16827 AL670379.11-201ENST00000604059 253 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
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PTPROQ16827 AL670379.1-201ENST00000604752 252 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
PTPROQ16827 AL670379.5-201ENST00000605253 252 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
PTPROQ16827 AL670379.12-201ENST00000605291 253 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
PTPROQ16827 AL670379.8-201ENST00000605353 252 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
PTPROQ16827 AL670379.7-201ENST00000605823 252 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
PTPROQ16827 AC103710.2-201ENST00000609912 942 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
PTPROQ16827 MAGI2-AS3-224ENST00000619135 205 ntTSL 5 BASIC4.68□□□□□ -1.66
PTPROQ16827 BRCA2-201ENST00000380152 11986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.68□□□□□ -1.66
PTPROQ16827 GPRC6A-201ENST00000310357 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
PTPROQ16827 CCNT2-201ENST00000264157 6917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
PTPROQ16827 ELAVL4-203ENST00000371821 3349 ntTSL 5 BASIC4.68□□□□□ -1.66
PTPROQ16827 STAU2-207ENST00000519961 3928 ntTSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
PTPROQ16827 FAM169A-203ENST00000510496 5810 ntTSL 5 BASIC4.68□□□□□ -1.66
PTPROQ16827 MME-201ENST00000360490 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
PTPROQ16827 SYNE2-203ENST00000357395 21555 ntTSL 5 BASIC4.68□□□□□ -1.66
PTPROQ16827 NFIB-210ENST00000543693 7622 ntTSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
PTPROQ16827 TENM1-201ENST00000371130 12875 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
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PTPROQ16827 CLEC7A-202ENST00000304084 1130 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
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PTPROQ16827 PTPN22-202ENST00000420377 2726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
PTPROQ16827 LRFN5-204ENST00000554171 4253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
PTPROQ16827 PEX3-201ENST00000367591 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
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PTPROQ16827 ZNF510-201ENST00000223428 5154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.66□□□□□ -1.66
PTPROQ16827 ANKRD26P2-201ENST00000445530 1710 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
PTPROQ16827 ZNF962P-201ENST00000443465 3140 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
PTPROQ16827 SLC25A46-206ENST00000509432 1596 ntTSL 2 BASIC4.66□□□□□ -1.66
PTPROQ16827 OR8D1-203ENST00000641897 8285 ntAPPRIS P1 BASIC4.66□□□□□ -1.66
PTPROQ16827 AL161912.2-201ENST00000565707 3007 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
PTPROQ16827 GPX8-203ENST00000503787 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.66□□□□□ -1.66
PTPROQ16827 TMEM71-201ENST00000356838 1993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.66□□□□□ -1.66
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