Protein–RNA interactions for Protein: Q16799

RTN1, Reticulon-1, humanhuman

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Length 776 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTN1Q16799 AC020659.1-204ENST00000562920 400 ntTSL 3 BASIC5.71□□□□□ -1.5
RTN1Q16799 LINC01735-201ENST00000568112 279 ntTSL 3 BASIC5.71□□□□□ -1.5
RTN1Q16799 AC018462.2-201ENST00000605375 395 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
RTN1Q16799 STARD13-AS-221ENST00000608197 604 ntTSL 5 BASIC5.71□□□□□ -1.5
RTN1Q16799 CRISP3-201ENST00000263045 2170 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
RTN1Q16799 MTUS1-203ENST00000381861 3996 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC5.71□□□□□ -1.5
RTN1Q16799 KATNA1-202ENST00000335647 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
RTN1Q16799 PPIG-207ENST00000448752 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
RTN1Q16799 ZNF468-203ENST00000595646 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
RTN1Q16799 VSNL1-203ENST00000406397 2725 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
RTN1Q16799 AC083843.2-201ENST00000568248 6253 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
RTN1Q16799 FGF13-202ENST00000315930 19519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
RTN1Q16799 RASGRP1-209ENST00000559830 1910 ntTSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
RTN1Q16799 AC009951.1-201ENST00000623674 2614 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
RTN1Q16799 PINCR-201ENST00000440955 2228 ntTSL 2 BASIC5.7□□□□□ -1.5
RTN1Q16799 ITCH-201ENST00000262650 3089 ntTSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
RTN1Q16799 TMEM154-201ENST00000304385 10698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
RTN1Q16799 RNU6-490P-201ENST00000362985 107 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
RTN1Q16799 Y_RNA.496-201ENST00000384444 101 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
RTN1Q16799 Y_RNA.556-201ENST00000384677 113 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
RTN1Q16799 SNORA16.2-201ENST00000390991 127 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
RTN1Q16799 RNU6-754P-201ENST00000391166 107 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
RTN1Q16799 AC112721.2-201ENST00000409910 541 ntTSL 4 BASIC5.7□□□□□ -1.5
RTN1Q16799 RNU2-47P-201ENST00000410649 186 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
RTN1Q16799 AC010967.2-201ENST00000418451 333 ntTSL 2 BASIC5.7□□□□□ -1.5
RTN1Q16799 RPL21P109-201ENST00000422213 475 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
RTN1Q16799 AL590632.1-201ENST00000424289 371 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
RTN1Q16799 AL121957.1-202ENST00000437040 329 ntTSL 3 BASIC5.7□□□□□ -1.5
RTN1Q16799 AP000943.1-201ENST00000438416 712 ntTSL 3 BASIC5.7□□□□□ -1.5
RTN1Q16799 HMGB1P12-201ENST00000438594 598 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
RTN1Q16799 AC133865.1-201ENST00000438619 339 ntTSL 3 BASIC5.7□□□□□ -1.5
RTN1Q16799 AC010655.1-201ENST00000449336 292 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
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RTN1Q16799 AC010655.3-201ENST00000478818 450 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
RTN1Q16799 ENPP7P9-201ENST00000514456 627 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
RTN1Q16799 AC027308.1-201ENST00000517993 110 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
RTN1Q16799 AC079098.1-202ENST00000523150 573 ntTSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
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RTN1Q16799 AC092364.1-202ENST00000593824 565 ntTSL 4 BASIC5.7□□□□□ -1.5
RTN1Q16799 AC018695.3-201ENST00000602617 408 ntTSL 2 BASIC5.7□□□□□ -1.5
RTN1Q16799 AL109918.3-201ENST00000603072 338 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
RTN1Q16799 AL022401.1-201ENST00000619498 108 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
RTN1Q16799 ZNF345-216ENST00000640438 963 ntTSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
RTN1Q16799 CAST-201ENST00000309190 4282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
RTN1Q16799 SLC24A2-202ENST00000341998 10749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
RTN1Q16799 NOSTRIN-206ENST00000444448 2537 ntTSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
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RTN1Q16799 SMG1P4-204ENST00000523028 4131 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
RTN1Q16799 SAGE4P-201ENST00000442271 3381 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
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RTN1Q16799 SLMAP-206ENST00000428312 4132 ntTSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
RTN1Q16799 CD84-204ENST00000368048 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
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RTN1Q16799 LINC00871-201ENST00000555246 408 ntTSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
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RTN1Q16799 AC011487.3-201ENST00000593607 453 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
RTN1Q16799 AC006329.2-201ENST00000611491 394 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
RTN1Q16799 SNHG22-203ENST00000617833 660 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
RTN1Q16799 OR2A7-202ENST00000641841 2062 ntAPPRIS P1 BASIC5.69□□□□□ -1.5
RTN1Q16799 STARD9-201ENST00000290607 15567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
RTN1Q16799 SSR1-202ENST00000397511 3248 ntTSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
RTN1Q16799 MID2-202ENST00000443968 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
RTN1Q16799 AC005592.1-201ENST00000566527 1640 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
RTN1Q16799 AL158163.1-201ENST00000603915 1649 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
RTN1Q16799 SLC1A3-202ENST00000381918 3652 ntTSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
RTN1Q16799 IRF5P1-201ENST00000504852 2164 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
RTN1Q16799 MAK-203ENST00000474039 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
RTN1Q16799 CCDC82-202ENST00000423339 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
RTN1Q16799 RAD17-220ENST00000616683 3057 ntTSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
RTN1Q16799 GALNT3-202ENST00000409882 2107 ntTSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
RTN1Q16799 SYCP1-209ENST00000613524 3034 ntTSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
RTN1Q16799 HGF-201ENST00000222390 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
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