Protein–RNA interactions for Protein: Q15904

ATP6AP1, V-type proton ATPase subunit S1, humanhuman

Predictions only

Length 470 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP6AP1Q15904 PTMAP2-201ENST00000397627 327 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
ATP6AP1Q15904 DEFB116-201ENST00000400549 309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.67□□□□□ -1.98
ATP6AP1Q15904 AL031679.1-201ENST00000400616 525 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
ATP6AP1Q15904 AL136372.1-201ENST00000403060 228 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
ATP6AP1Q15904 AL356131.1-201ENST00000405826 414 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
ATP6AP1Q15904 RPS15AP38-201ENST00000413110 372 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
ATP6AP1Q15904 TPMTP2-201ENST00000414372 726 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
ATP6AP1Q15904 GRK5-IT1-201ENST00000421206 400 ntTSL 3 BASIC2.67□□□□□ -1.98
ATP6AP1Q15904 DIAPH3-AS1-201ENST00000422052 428 ntTSL 3 BASIC2.67□□□□□ -1.98
ATP6AP1Q15904 AC005160.1-201ENST00000432405 381 ntTSL 3 BASIC2.67□□□□□ -1.98
ATP6AP1Q15904 USP9YP24-201ENST00000434374 697 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
ATP6AP1Q15904 MTND4P6-201ENST00000438297 472 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
ATP6AP1Q15904 USP9YP17-201ENST00000444617 696 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
ATP6AP1Q15904 AL513412.1-201ENST00000445708 553 ntTSL 4 BASIC2.67□□□□□ -1.98
ATP6AP1Q15904 Z75741.1-201ENST00000446793 314 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
ATP6AP1Q15904 ST13P20-201ENST00000447996 1065 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
ATP6AP1Q15904 AC093422.2-201ENST00000452599 686 ntTSL 2 BASIC2.67□□□□□ -1.98
ATP6AP1Q15904 AP000705.1-201ENST00000454567 350 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
ATP6AP1Q15904 MTCO3P11-201ENST00000455103 774 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
ATP6AP1Q15904 MTND1P16-201ENST00000465177 898 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
ATP6AP1Q15904 AC003982.1-202ENST00000469928 248 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
ATP6AP1Q15904 LINC00973-201ENST00000473756 962 ntTSL 2 BASIC2.67□□□□□ -1.98
ATP6AP1Q15904 AC090525.1-201ENST00000479116 478 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
ATP6AP1Q15904 AC132825.2-201ENST00000483901 504 ntTSL 5 BASIC2.67□□□□□ -1.98
ATP6AP1Q15904 LINC02465-202ENST00000508724 503 ntTSL 3 BASIC2.67□□□□□ -1.98
ATP6AP1Q15904 AC093879.2-201ENST00000513645 427 ntTSL 3 BASIC2.67□□□□□ -1.98
ATP6AP1Q15904 SCARNA1-201ENST00000517138 166 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
ATP6AP1Q15904 AC027701.1-201ENST00000520155 823 ntTSL 3 BASIC2.67□□□□□ -1.98
ATP6AP1Q15904 MAL2-203ENST00000534619 578 ntTSL 4 BASIC2.67□□□□□ -1.98
ATP6AP1Q15904 PLCZ1-203ENST00000534932 525 ntTSL 4 BASIC2.67□□□□□ -1.98
ATP6AP1Q15904 LINC00508-201ENST00000538901 194 ntTSL 5 BASIC2.67□□□□□ -1.98
ATP6AP1Q15904 NDUFB1-204ENST00000555441 458 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.67□□□□□ -1.98
ATP6AP1Q15904 AC104002.1-201ENST00000557025 380 ntTSL 3 BASIC2.67□□□□□ -1.98
ATP6AP1Q15904 PSMA4-206ENST00000558341 719 ntTSL 5 BASIC2.67□□□□□ -1.98
ATP6AP1Q15904 COX6CP3-201ENST00000580869 223 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
ATP6AP1Q15904 MIR3670-2-201ENST00000582974 65 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
ATP6AP1Q15904 MIR3670-1-201ENST00000584160 65 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
ATP6AP1Q15904 MIR3670-3-201ENST00000584855 65 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
ATP6AP1Q15904 RPP40P2-201ENST00000603596 712 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
ATP6AP1Q15904 AC015871.2-201ENST00000603605 948 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
ATP6AP1Q15904 AL031176.1-201ENST00000604554 466 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
ATP6AP1Q15904 AC106900.2-201ENST00000604994 317 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
ATP6AP1Q15904 MIR4458HG-202ENST00000605918 1057 ntTSL 1 (best) BASIC2.67□□□□□ -1.98
ATP6AP1Q15904 MIR3670-4-201ENST00000612260 65 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
ATP6AP1Q15904 AC004696.1-201ENST00000614345 607 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
ATP6AP1Q15904 CR392039.5-201ENST00000623201 510 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
ATP6AP1Q15904 CR381653.2-201ENST00000624041 768 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
ATP6AP1Q15904 PCBP1-AS1-348ENST00000629506 667 ntTSL 5 BASIC2.67□□□□□ -1.98
ATP6AP1Q15904 OR4G3P-201ENST00000633500 913 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
ATP6AP1Q15904 PRKACB-207ENST00000394838 4294 ntTSL 5 BASIC2.67□□□□□ -1.98
ATP6AP1Q15904 KCNIP4-IT1-201ENST00000627566 9848 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
ATP6AP1Q15904 AL022578.1-201ENST00000439330 1433 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
ATP6AP1Q15904 LTN1-201ENST00000361371 7685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.66□□□□□ -1.98
ATP6AP1Q15904 SYTL2-230ENST00000634661 6672 ntTSL 5 BASIC2.66□□□□□ -1.98
ATP6AP1Q15904 CHORDC1-206ENST00000529987 1698 ntTSL 3 BASIC2.66□□□□□ -1.98
ATP6AP1Q15904 ZNF807-201ENST00000328088 1707 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
ATP6AP1Q15904 SNORA25.6-201ENST00000364121 118 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
ATP6AP1Q15904 Y_RNA.311-201ENST00000365068 96 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
ATP6AP1Q15904 SNORA9.2-201ENST00000365361 133 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
ATP6AP1Q15904 LINC01545-201ENST00000377879 521 ntTSL 1 (best) BASIC2.66□□□□□ -1.98
ATP6AP1Q15904 SNORA54-201ENST00000384281 123 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
ATP6AP1Q15904 Y_RNA.548-201ENST00000384656 105 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
ATP6AP1Q15904 RNU6-952P-201ENST00000391164 108 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
ATP6AP1Q15904 RPL21P75-201ENST00000396599 483 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
ATP6AP1Q15904 TAF9BP1-201ENST00000396646 746 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
ATP6AP1Q15904 RPL21P28-201ENST00000401418 483 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
ATP6AP1Q15904 AL592114.1-201ENST00000403842 483 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
ATP6AP1Q15904 RNU4-47P-201ENST00000410876 114 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
ATP6AP1Q15904 AL161909.2-201ENST00000417577 409 ntTSL 5 BASIC2.66□□□□□ -1.98
ATP6AP1Q15904 RPL36AP36-201ENST00000418616 301 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
ATP6AP1Q15904 ATG3P1-201ENST00000419507 911 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
ATP6AP1Q15904 AL353678.1-201ENST00000422735 741 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
ATP6AP1Q15904 AL080248.1-201ENST00000428954 388 ntTSL 3 BASIC2.66□□□□□ -1.98
ATP6AP1Q15904 AL590999.1-206ENST00000437947 436 ntTSL 3 BASIC2.66□□□□□ -1.98
ATP6AP1Q15904 RAC1P7-201ENST00000445367 377 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
ATP6AP1Q15904 RPL21P39-201ENST00000463605 483 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
ATP6AP1Q15904 AC097493.1-201ENST00000463958 372 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
ATP6AP1Q15904 AC034236.1-201ENST00000469891 373 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
ATP6AP1Q15904 NCOR1P1-201ENST00000478176 406 ntTSL 1 (best) BASIC2.66□□□□□ -1.98
ATP6AP1Q15904 RPL21P93-201ENST00000480465 489 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
ATP6AP1Q15904 AC233702.1-201ENST00000482905 502 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
ATP6AP1Q15904 AC087190.1-201ENST00000484462 480 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
ATP6AP1Q15904 AC092059.1-201ENST00000485347 429 ntTSL 3 BASIC2.66□□□□□ -1.98
ATP6AP1Q15904 AC093591.1-201ENST00000491435 481 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
ATP6AP1Q15904 RPL21P129-201ENST00000491732 478 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
ATP6AP1Q15904 RPL21P16-201ENST00000495531 483 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
ATP6AP1Q15904 LINC02229-201ENST00000508486 661 ntTSL 3 BASIC2.66□□□□□ -1.98
ATP6AP1Q15904 AC108043.1-201ENST00000512696 574 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
ATP6AP1Q15904 TATDN1-206ENST00000519548 889 ntTSL 1 (best) BASIC2.66□□□□□ -1.98
ATP6AP1Q15904 LINC02143-201ENST00000519929 520 ntTSL 3 BASIC2.66□□□□□ -1.98
ATP6AP1Q15904 AP001458.1-201ENST00000532626 92 ntTSL 3 BASIC2.66□□□□□ -1.98
ATP6AP1Q15904 AC011611.1-201ENST00000552179 197 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
ATP6AP1Q15904 AC090985.1-201ENST00000554440 480 ntTSL 2 BASIC2.66□□□□□ -1.98
ATP6AP1Q15904 CYCSP2-201ENST00000558168 301 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
ATP6AP1Q15904 AC118755.2-201ENST00000584676 212 ntTSL 3 BASIC2.66□□□□□ -1.98
ATP6AP1Q15904 MTCO2P2-201ENST00000591258 225 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
ATP6AP1Q15904 AC245884.10-201ENST00000597355 337 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
ATP6AP1Q15904 LINC00907-211ENST00000601948 795 ntTSL 5 BASIC2.66□□□□□ -1.98
ATP6AP1Q15904 DUXAP4-201ENST00000603046 613 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
ATP6AP1Q15904 DUXAP11-201ENST00000603858 526 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
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