Protein–RNA interactions for Protein: Q15858

SCN9A, Sodium channel protein type 9 subunit alpha, humanhuman

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Length 1,988 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN9AQ15858 CPXCR1-201ENST00000276127 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.32□□□□□ -2.04
SCN9AQ15858 AC006548.1-201ENST00000427470 102 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
SCN9AQ15858 AC005160.1-201ENST00000432405 381 ntTSL 3 BASIC2.32□□□□□ -2.04
SCN9AQ15858 RPL7P29-201ENST00000437151 728 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
SCN9AQ15858 MDM2-217ENST00000478070 692 ntTSL 1 (best) BASIC2.32□□□□□ -2.04
SCN9AQ15858 AC008885.2-201ENST00000509506 930 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
SCN9AQ15858 AC133963.2-201ENST00000513686 578 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
SCN9AQ15858 RNU6-551P-201ENST00000516661 103 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
SCN9AQ15858 AC027031.1-201ENST00000517318 489 ntTSL 3 BASIC2.32□□□□□ -2.04
SCN9AQ15858 FAM92A1P1-201ENST00000528023 890 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
SCN9AQ15858 AC046158.1-201ENST00000563408 719 ntTSL 3 BASIC2.32□□□□□ -2.04
SCN9AQ15858 MIR3690-201ENST00000580266 75 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
SCN9AQ15858 AC044873.1-201ENST00000580487 399 ntTSL 3 BASIC2.32□□□□□ -2.04
SCN9AQ15858 MIR4303-201ENST00000581299 66 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
SCN9AQ15858 AL133393.1-201ENST00000603277 287 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
SCN9AQ15858 C8orf59-213ENST00000619594 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.32□□□□□ -2.04
SCN9AQ15858 CR381572.1-201ENST00000625098 102 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
SCN9AQ15858 AL121594.5-201ENST00000631724 573 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
SCN9AQ15858 ZNF644-212ENST00000621077 2056 ntTSL 5 BASIC2.32□□□□□ -2.04
SCN9AQ15858 Y_RNA.338-201ENST00000365320 114 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
SCN9AQ15858 SPINK9-201ENST00000377906 453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.31□□□□□ -2.04
SCN9AQ15858 RNU6-14P-201ENST00000384630 106 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
SCN9AQ15858 HMGB1P10-201ENST00000395823 563 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
SCN9AQ15858 AGR3-202ENST00000402239 563 ntTSL 2 BASIC2.31□□□□□ -2.04
SCN9AQ15858 RNA5SP270-201ENST00000411361 118 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
SCN9AQ15858 AC092745.2-202ENST00000411880 369 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
SCN9AQ15858 MAMDC2-AS1-203ENST00000420573 339 ntTSL 3 BASIC2.31□□□□□ -2.04
SCN9AQ15858 AC009299.3-203ENST00000435692 1096 ntTSL 5 BASIC2.31□□□□□ -2.04
SCN9AQ15858 HMGB1P45-201ENST00000435986 653 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
SCN9AQ15858 VPS13A-211ENST00000484581 1155 ntTSL 2 BASIC2.31□□□□□ -2.04
SCN9AQ15858 AC090543.1-201ENST00000492168 485 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
SCN9AQ15858 PDCD10-216ENST00000492396 814 ntTSL 5 BASIC2.31□□□□□ -2.04
SCN9AQ15858 GZMAP1-201ENST00000503054 631 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
SCN9AQ15858 AIG1P1-201ENST00000503376 148 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
SCN9AQ15858 RNU6-56P-201ENST00000516986 93 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
SCN9AQ15858 HMGB1P1-201ENST00000522557 636 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
SCN9AQ15858 AP002812.3-201ENST00000527012 551 ntTSL 5 BASIC2.31□□□□□ -2.04
SCN9AQ15858 AC090912.2-203ENST00000581177 477 ntTSL 3 BASIC2.31□□□□□ -2.04
SCN9AQ15858 RPP40P2-201ENST00000603596 712 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
SCN9AQ15858 CCDC30-203ENST00000428554 3063 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.31□□□□□ -2.04
SCN9AQ15858 ERBIN-202ENST00000380935 6692 ntTSL 5 BASIC2.31□□□□□ -2.04
SCN9AQ15858 RGS18-201ENST00000367460 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.31□□□□□ -2.04
SCN9AQ15858 LINC01967-201ENST00000356047 755 ntTSL 5 BASIC2.3□□□□□ -2.04
SCN9AQ15858 SNORA51.2-201ENST00000364595 132 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
SCN9AQ15858 RNU6-452P-201ENST00000384406 107 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
SCN9AQ15858 AL627390.1-201ENST00000396055 340 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
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SCN9AQ15858 TPTE2P6-202ENST00000445572 1007 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
SCN9AQ15858 ZNF33BP1-201ENST00000452497 1834 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
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SCN9AQ15858 AC104435.1-201ENST00000483483 166 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
SCN9AQ15858 AC093689.1-203ENST00000505967 299 ntTSL 3 BASIC2.3□□□□□ -2.04
SCN9AQ15858 AC104115.2-201ENST00000523026 687 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
SCN9AQ15858 AP003717.3-201ENST00000544832 1180 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
SCN9AQ15858 AP005433.1-202ENST00000580845 521 ntTSL 4 BASIC2.3□□□□□ -2.04
SCN9AQ15858 MAP3K2-203ENST00000409947 10992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.3□□□□□ -2.04
SCN9AQ15858 ZNF117-204ENST00000620222 5317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.3□□□□□ -2.04
SCN9AQ15858 RPL39-201ENST00000361575 401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.3□□□□□ -2.04
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SCN9AQ15858 RNU2-21P-201ENST00000410368 188 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
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SCN9AQ15858 AC104308.1-201ENST00000454621 333 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
SCN9AQ15858 AL138787.2-202ENST00000479395 385 ntTSL 2 BASIC2.3□□□□□ -2.04
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SCN9AQ15858 AP001109.1-201ENST00000587114 279 ntTSL 3 BASIC2.3□□□□□ -2.04
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SCN9AQ15858 AL591441.2-201ENST00000620059 535 ntTSL 5 BASIC2.3□□□□□ -2.04
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SCN9AQ15858 BTG3-AS1-201ENST00000626994 552 ntTSL 4 BASIC2.3□□□□□ -2.04
SCN9AQ15858 TAB2-205ENST00000538427 4240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.29□□□□□ -2.04
SCN9AQ15858 IL6ST-201ENST00000336909 8776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.29□□□□□ -2.04
SCN9AQ15858 NDUFAF4-201ENST00000316149 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.29□□□□□ -2.04
SCN9AQ15858 AP001350.1-201ENST00000601906 1524 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
SCN9AQ15858 AC083799.1-201ENST00000366451 910 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
SCN9AQ15858 MTATP6P31-201ENST00000406985 692 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
SCN9AQ15858 RNU6ATAC16P-201ENST00000408591 138 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
SCN9AQ15858 RPL19P1-201ENST00000411635 428 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
SCN9AQ15858 AL513331.1-201ENST00000411908 397 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
SCN9AQ15858 YWHAZP8-201ENST00000436935 731 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
SCN9AQ15858 AL513343.1-201ENST00000451818 792 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
SCN9AQ15858 CIR1P1-201ENST00000524055 1133 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
SCN9AQ15858 C14orf105-204ENST00000526336 598 ntTSL 4 BASIC2.29□□□□□ -2.04
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SCN9AQ15858 snoU13.31-201ENST00000607291 104 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
SCN9AQ15858 PCDH11Y-203ENST00000362095 4220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.29□□□□□ -2.04
SCN9AQ15858 NUP35-203ENST00000409798 1470 ntTSL 2 BASIC2.29□□□□□ -2.04
SCN9AQ15858 RNA5SP190-201ENST00000365222 118 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
SCN9AQ15858 MIR1250-201ENST00000408098 113 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
SCN9AQ15858 AC244098.2-201ENST00000422068 99 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
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