Protein–RNA interactions for Protein: Q15751

HERC1, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC1, humanhuman

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Length 4,861 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC1Q15751 MTATP6P11-201ENST00000428071 670 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
HERC1Q15751 RN7SL297P-201ENST00000483161 293 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
HERC1Q15751 AC022447.3-201ENST00000506865 495 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
HERC1Q15751 IGHVII-53-1-201ENST00000519538 255 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
HERC1Q15751 AL078612.2-201ENST00000525133 646 ntTSL 3 BASIC1.08□□□□□ -2.24
HERC1Q15751 AC103810.1-201ENST00000579873 453 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
HERC1Q15751 MIR5002-201ENST00000584713 97 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
HERC1Q15751 AL035411.2-201ENST00000604022 421 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
HERC1Q15751 MIR6132-201ENST00000622083 109 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
HERC1Q15751 GPR183-201ENST00000376414 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.08□□□□□ -2.24
HERC1Q15751 CEP83-202ENST00000397807 2737 ntTSL 5 BASIC1.08□□□□□ -2.24
HERC1Q15751 MINDY3-202ENST00000378036 2452 ntTSL 2 BASIC1.08□□□□□ -2.24
HERC1Q15751 DEFA7P-201ENST00000382676 285 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
HERC1Q15751 CPEB3_ribozyme.1-201ENST00000408115 78 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
HERC1Q15751 SPANXN4-202ENST00000446864 431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC1.08□□□□□ -2.24
HERC1Q15751 SNX5P1-201ENST00000505757 1041 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
HERC1Q15751 SUB1P4-201ENST00000566062 339 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
HERC1Q15751 AC023394.2-201ENST00000581987 792 ntTSL 5 BASIC1.08□□□□□ -2.24
HERC1Q15751 AC103987.3-201ENST00000582071 292 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
HERC1Q15751 FRG1DP-201ENST00000635586 771 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
HERC1Q15751 KTN1-204ENST00000395311 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.08□□□□□ -2.24
HERC1Q15751 DHFRP5-201ENST00000406944 564 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
HERC1Q15751 AC100807.1-201ENST00000517640 552 ntTSL 5 BASIC1.08□□□□□ -2.24
HERC1Q15751 AC022390.1-201ENST00000517854 434 ntTSL 3 BASIC1.08□□□□□ -2.24
HERC1Q15751 MMP2-AS1-201ENST00000565307 593 ntTSL 4 BASIC1.08□□□□□ -2.24
HERC1Q15751 CHD9-202ENST00000398510 11337 ntTSL 1 (best) BASIC1.08□□□□□ -2.24
HERC1Q15751 Y_RNA.167-201ENST00000363735 109 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
HERC1Q15751 Y_RNA.518-201ENST00000384552 113 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
HERC1Q15751 LINC01797-202ENST00000433432 765 ntTSL 3 BASIC1.07□□□□□ -2.24
HERC1Q15751 AP000852.1-201ENST00000472460 573 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
HERC1Q15751 AC109446.2-201ENST00000567872 497 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
HERC1Q15751 AL109933.3-201ENST00000619095 188 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
HERC1Q15751 AC009902.3-201ENST00000606235 2172 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
HERC1Q15751 OR6C2-202ENST00000641202 2105 ntAPPRIS P1 BASIC1.07□□□□□ -2.24
HERC1Q15751 RMDN2-205ENST00000407257 2280 ntTSL 5 BASIC1.07□□□□□ -2.24
HERC1Q15751 ALG6-201ENST00000263440 1895 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC1.07□□□□□ -2.24
HERC1Q15751 CCDC82-202ENST00000423339 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC1.07□□□□□ -2.24
HERC1Q15751 AC026780.2-201ENST00000503489 730 ntTSL 5 BASIC1.07□□□□□ -2.24
HERC1Q15751 AC008780.2-201ENST00000509844 820 ntTSL 2 BASIC1.07□□□□□ -2.24
HERC1Q15751 SNORA31.11-201ENST00000516528 139 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
HERC1Q15751 AC090753.1-201ENST00000522087 331 ntTSL 3 BASIC1.07□□□□□ -2.24
HERC1Q15751 AC022039.1-201ENST00000527110 488 ntTSL 2 BASIC1.07□□□□□ -2.24
HERC1Q15751 OR51L1-203ENST00000641819 7300 ntAPPRIS P1 BASIC1.07□□□□□ -2.24
HERC1Q15751 SI-201ENST00000264382 6011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.07□□□□□ -2.24
HERC1Q15751 AC118758.3-201ENST00000624628 24137 ntTSL 5 BASIC1.07□□□□□ -2.24
HERC1Q15751 ZNF117-204ENST00000620222 5317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.07□□□□□ -2.24
HERC1Q15751 RNU6-174P-201ENST00000410406 106 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
HERC1Q15751 AGBL4-IT1-201ENST00000457061 514 ntTSL 3 BASIC1.07□□□□□ -2.24
HERC1Q15751 AC025244.2-201ENST00000509215 422 ntTSL 3 BASIC1.07□□□□□ -2.24
HERC1Q15751 AP003467.2-201ENST00000520175 319 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
HERC1Q15751 AGGF1P8-201ENST00000562979 1000 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
HERC1Q15751 hsa-mir-3130-1.1-201ENST00000579223 75 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
HERC1Q15751 MUCL1-205ENST00000619042 243 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.07□□□□□ -2.24
HERC1Q15751 AL596220.1-201ENST00000622121 542 ntTSL 4 BASIC1.07□□□□□ -2.24
HERC1Q15751 MGAT4C-202ENST00000548651 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.07□□□□□ -2.24
HERC1Q15751 MIR3074-201ENST00000384885 81 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
HERC1Q15751 CKS1BP5-201ENST00000434172 273 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
HERC1Q15751 MIR4435-2HG-213ENST00000451884 423 ntTSL 3 BASIC1.07□□□□□ -2.24
HERC1Q15751 AP000873.1-201ENST00000463987 400 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
HERC1Q15751 AF131216.2-201ENST00000512316 564 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
HERC1Q15751 MBNL3-212ENST00000538204 11294 ntTSL 1 (best) BASIC1.07□□□□□ -2.24
HERC1Q15751 MTCO1P7-201ENST00000419523 1542 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
HERC1Q15751 MTND4P1-201ENST00000457501 1466 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
HERC1Q15751 SNORD88.1-201ENST00000408684 91 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
HERC1Q15751 RPL9P33-201ENST00000484311 566 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
HERC1Q15751 FABP5P5-201ENST00000515537 406 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
HERC1Q15751 SNORA70.14-201ENST00000516205 110 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
HERC1Q15751 AL160262.1-201ENST00000522264 254 ntTSL 3 BASIC1.06□□□□□ -2.24
HERC1Q15751 AC013244.3-201ENST00000605614 388 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
HERC1Q15751 AL137847.3-201ENST00000611521 109 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
HERC1Q15751 DEFB112-201ENST00000322246 342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.06□□□□□ -2.24
HERC1Q15751 MIR373-201ENST00000362273 69 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
HERC1Q15751 RN7SKP200-201ENST00000410564 320 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
HERC1Q15751 AC006076.1-201ENST00000423233 345 ntTSL 3 BASIC1.06□□□□□ -2.24
HERC1Q15751 AC078883.3-201ENST00000458314 512 ntTSL 2 BASIC1.06□□□□□ -2.24
HERC1Q15751 RFPL1S-203ENST00000539579 330 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
HERC1Q15751 AC008127.2-201ENST00000549925 1075 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
HERC1Q15751 PPP1R3A-201ENST00000284601 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.06□□□□□ -2.24
HERC1Q15751 OR5B12-202ENST00000641921 1807 ntAPPRIS P1 BASIC1.06□□□□□ -2.24
HERC1Q15751 USP15-203ENST00000353364 14950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.06□□□□□ -2.24
HERC1Q15751 RNU1-42P-201ENST00000364033 160 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
HERC1Q15751 RNU6-60P-201ENST00000364792 103 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
HERC1Q15751 GSAP-208ENST00000441833 737 ntTSL 1 (best) BASIC1.06□□□□□ -2.24
HERC1Q15751 U91324.1-201ENST00000442864 447 ntTSL 5 BASIC1.06□□□□□ -2.24
HERC1Q15751 HMGB3P21-201ENST00000452483 547 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
HERC1Q15751 LINC01997-201ENST00000494900 429 ntTSL 2 BASIC1.06□□□□□ -2.24
HERC1Q15751 AC112191.3-201ENST00000604371 277 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
HERC1Q15751 AC073387.2-201ENST00000604797 784 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
HERC1Q15751 AC010678.1-201ENST00000614118 713 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
HERC1Q15751 CD3D-202ENST00000392884 476 ntTSL 2 BASIC1.06□□□□□ -2.24
HERC1Q15751 TEX41-202ENST00000414256 604 ntTSL 5 BASIC1.06□□□□□ -2.24
HERC1Q15751 NDUFB4P5-201ENST00000415445 361 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
HERC1Q15751 RPL23AP39-201ENST00000415533 405 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
HERC1Q15751 MUPP-201ENST00000438111 566 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
HERC1Q15751 AC005297.2-201ENST00000450430 606 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
HERC1Q15751 AC234775.1-201ENST00000454247 670 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
HERC1Q15751 AL049830.2-201ENST00000480072 201 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
HERC1Q15751 RPL23AP44-201ENST00000482216 473 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
HERC1Q15751 RN7SL274P-201ENST00000492268 272 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
HERC1Q15751 AC079584.2-201ENST00000548756 515 ntTSL 3 BASIC1.06□□□□□ -2.24
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