Protein–RNA interactions for Protein: Q15413

RYR3, Ryanodine receptor 3, humanhuman

Predictions only

Length 4,870 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RYR3Q15413 AL355306.2-209ENST00000437803 357 ntTSL 2 BASIC1.16□□□□□ -2.22
RYR3Q15413 AL691517.1-201ENST00000440833 1235 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
RYR3Q15413 MTCO1P48-201ENST00000448024 1096 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
RYR3Q15413 TPRKBP1-201ENST00000456243 481 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
RYR3Q15413 COX6CP5-201ENST00000527162 228 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
RYR3Q15413 CARD18-202ENST00000530950 652 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.16□□□□□ -2.22
RYR3Q15413 uc_338.12-201ENST00000616344 181 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
RYR3Q15413 BRIP1-202ENST00000577598 3969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.16□□□□□ -2.22
RYR3Q15413 CGGBP1-202ENST00000398392 5298 ntAPPRIS P1 BASIC1.16□□□□□ -2.22
RYR3Q15413 ZNF117-204ENST00000620222 5317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.16□□□□□ -2.22
RYR3Q15413 U8.8-201ENST00000365399 135 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
RYR3Q15413 AC025281.1-201ENST00000567026 265 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
RYR3Q15413 RPS6KA6-204ENST00000620340 8169 ntTSL 5 BASIC1.16□□□□□ -2.22
RYR3Q15413 RNU1-51P-201ENST00000365345 176 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
RYR3Q15413 RPL23AP20-201ENST00000447965 421 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
RYR3Q15413 AC009474.2-201ENST00000451383 136 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
RYR3Q15413 BOLA3P3-201ENST00000505182 232 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
RYR3Q15413 LINC02446-201ENST00000544591 868 ntTSL 2 BASIC1.16□□□□□ -2.22
RYR3Q15413 AC104581.2-201ENST00000572227 430 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
RYR3Q15413 AC084035.1-201ENST00000634543 607 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
RYR3Q15413 PPIP5K2-201ENST00000321521 15407 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC1.16□□□□□ -2.22
RYR3Q15413 CUL2-206ENST00000421317 2376 ntTSL 2 BASIC1.16□□□□□ -2.22
RYR3Q15413 MTCO1P22-201ENST00000604619 1360 ntBASIC1.15□□□□□ -2.22
RYR3Q15413 SYNE1-207ENST00000367255 27748 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC1.15□□□□□ -2.22
RYR3Q15413 AC009563.1-202ENST00000523365 643 ntTSL 3 BASIC1.15□□□□□ -2.22
RYR3Q15413 AP002993.1-201ENST00000538624 210 ntTSL 5 BASIC1.15□□□□□ -2.22
RYR3Q15413 FRG1DP-201ENST00000635586 771 ntBASIC1.15□□□□□ -2.22
RYR3Q15413 RMDN2-203ENST00000402091 1973 ntTSL 2 BASIC1.15□□□□□ -2.22
RYR3Q15413 AL158064.1-201ENST00000627044 2242 ntTSL 4 BASIC1.15□□□□□ -2.22
RYR3Q15413 SI-201ENST00000264382 6011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.15□□□□□ -2.22
RYR3Q15413 AC010731.2-201ENST00000415275 440 ntTSL 3 BASIC1.15□□□□□ -2.23
RYR3Q15413 CYCSP48-201ENST00000417124 323 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
RYR3Q15413 AC068633.1-201ENST00000482142 787 ntTSL 5 BASIC1.15□□□□□ -2.23
RYR3Q15413 AC069439.2-201ENST00000496403 789 ntTSL 2 BASIC1.15□□□□□ -2.23
RYR3Q15413 RNA5SP76-201ENST00000516277 87 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
RYR3Q15413 AC022960.2-201ENST00000616300 666 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
RYR3Q15413 RBM12B-AS1-201ENST00000623283 653 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
RYR3Q15413 MTND4P23-201ENST00000447723 1363 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
RYR3Q15413 ANKRD36C-201ENST00000295246 2272 ntTSL 5 BASIC1.15□□□□□ -2.23
RYR3Q15413 EIF1AXP1-201ENST00000419267 435 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
RYR3Q15413 MAMDC2-AS1-203ENST00000420573 339 ntTSL 3 BASIC1.15□□□□□ -2.23
RYR3Q15413 GSAP-208ENST00000441833 737 ntTSL 1 (best) BASIC1.15□□□□□ -2.23
RYR3Q15413 HMGB3P21-201ENST00000452483 547 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
RYR3Q15413 AL390961.3-201ENST00000458171 485 ntTSL 5 BASIC1.15□□□□□ -2.23
RYR3Q15413 AC007953.2-201ENST00000603299 193 ntTSL 5 BASIC1.15□□□□□ -2.23
RYR3Q15413 VBP1-204ENST00000625964 1547 ntTSL 5 BASIC1.15□□□□□ -2.23
RYR3Q15413 RNU1-87P-201ENST00000363727 170 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
RYR3Q15413 PTPRC-202ENST00000367364 1017 ntTSL 1 (best) BASIC1.15□□□□□ -2.23
RYR3Q15413 USP9YP27-201ENST00000418455 438 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
RYR3Q15413 LINC01673-201ENST00000426418 468 ntTSL 3 BASIC1.15□□□□□ -2.23
RYR3Q15413 NEFMP1-201ENST00000443423 1006 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
RYR3Q15413 AL078601.1-201ENST00000444542 271 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
RYR3Q15413 AC008885.2-201ENST00000509506 930 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
RYR3Q15413 ZDHHC20P3-201ENST00000531576 336 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
RYR3Q15413 AP000889.2-201ENST00000532684 490 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
RYR3Q15413 AL136298.1-202ENST00000556520 518 ntTSL 3 BASIC1.15□□□□□ -2.23
RYR3Q15413 AL353770.2-201ENST00000620024 78 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
RYR3Q15413 AC093157.1-203ENST00000416329 713 ntTSL 5 BASIC1.14□□□□□ -2.23
RYR3Q15413 RPL36AP6-201ENST00000435770 321 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
RYR3Q15413 RPL23AP14-201ENST00000468281 468 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
RYR3Q15413 AC109486.1-201ENST00000486833 374 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
RYR3Q15413 AC019176.1-201ENST00000518519 225 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
RYR3Q15413 CLEC2D-214ENST00000543300 399 ntTSL 1 (best) BASIC1.14□□□□□ -2.23
RYR3Q15413 CLEC2D-216ENST00000545918 288 ntTSL 1 (best) BASIC1.14□□□□□ -2.23
RYR3Q15413 AL449363.1-201ENST00000617815 186 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
RYR3Q15413 LINC02246-204ENST00000625278 740 ntTSL 5 BASIC1.14□□□□□ -2.23
RYR3Q15413 UEVLD-208ENST00000535484 1963 ntTSL 2 BASIC1.14□□□□□ -2.23
RYR3Q15413 AC009902.3-201ENST00000606235 2172 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
RYR3Q15413 OFD1P1Y-201ENST00000411756 1225 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
RYR3Q15413 AMD1P1-201ENST00000457220 922 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
RYR3Q15413 LINC00971-203ENST00000491849 452 ntTSL 3 BASIC1.14□□□□□ -2.23
RYR3Q15413 VPS29-210ENST00000552130 1057 ntTSL 1 (best) BASIC1.14□□□□□ -2.23
RYR3Q15413 AL139193.1-201ENST00000554967 539 ntTSL 4 BASIC1.14□□□□□ -2.23
RYR3Q15413 AC006272.2-201ENST00000594725 163 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
RYR3Q15413 KIF14-202ENST00000614960 6838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.14□□□□□ -2.23
RYR3Q15413 TAS2R15P-201ENST00000390674 928 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
RYR3Q15413 SETP15-201ENST00000412724 337 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
RYR3Q15413 AC004936.1-201ENST00000451755 361 ntTSL 3 BASIC1.14□□□□□ -2.23
RYR3Q15413 TFEC-208ENST00000484212 1245 ntTSL 2 BASIC1.14□□□□□ -2.23
RYR3Q15413 AC109464.2-201ENST00000510242 943 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
RYR3Q15413 AC012413.1-201ENST00000521294 519 ntTSL 2 BASIC1.14□□□□□ -2.23
RYR3Q15413 AL078612.2-201ENST00000525133 646 ntTSL 3 BASIC1.14□□□□□ -2.23
RYR3Q15413 AC021739.4-201ENST00000561417 569 ntTSL 4 BASIC1.14□□□□□ -2.23
RYR3Q15413 CDKN2B-AS.1-201ENST00000617921 150 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
RYR3Q15413 ZNF678-202ENST00000397097 8212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.14□□□□□ -2.23
RYR3Q15413 ZNF876P-202ENST00000398732 1485 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
RYR3Q15413 LINC01986-201ENST00000440867 590 ntTSL 5 BASIC1.14□□□□□ -2.23
RYR3Q15413 ARL5AP2-201ENST00000444698 533 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
RYR3Q15413 AC115618.2-201ENST00000453810 450 ntTSL 3 BASIC1.14□□□□□ -2.23
RYR3Q15413 AC078883.3-201ENST00000458314 512 ntTSL 2 BASIC1.14□□□□□ -2.23
RYR3Q15413 AC055876.1-202ENST00000567053 138 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
RYR3Q15413 AC009541.1-201ENST00000438279 2662 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
RYR3Q15413 SYNE1-212ENST00000423061 27436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.13□□□□□ -2.23
RYR3Q15413 RHEBP3-201ENST00000411920 351 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
RYR3Q15413 RPS15AP6-201ENST00000420703 385 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
RYR3Q15413 AC093084.1-201ENST00000424233 687 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
RYR3Q15413 AL136985.1-201ENST00000424592 395 ntTSL 3 BASIC1.13□□□□□ -2.23
RYR3Q15413 IPO7P1-201ENST00000442031 636 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
RYR3Q15413 LNX1-AS2-201ENST00000502410 347 ntTSL 5 BASIC1.13□□□□□ -2.23
RYR3Q15413 AP003170.4-201ENST00000543486 586 ntTSL 3 BASIC1.13□□□□□ -2.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 177.9 ms