Protein–RNA interactions for Protein: Q15012

LAPTM4A, Lysosomal-associated transmembrane protein 4A, humanhuman

Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAPTM4AQ15012 AC026316.2-201ENST00000473110 263 ntTSL 3 BASIC5.65□□□□□ -1.5
LAPTM4AQ15012 AC117440.1-201ENST00000474107 571 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
LAPTM4AQ15012 RN7SL369P-201ENST00000477138 299 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
LAPTM4AQ15012 AC124945.1-201ENST00000485133 188 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
LAPTM4AQ15012 UBA52P7-201ENST00000486088 380 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
LAPTM4AQ15012 CSN1S1-203ENST00000507763 597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.5
LAPTM4AQ15012 TOMM22P4-201ENST00000511318 336 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
LAPTM4AQ15012 AC091435.2-201ENST00000514586 565 ntTSL 4 BASIC5.65□□□□□ -1.5
LAPTM4AQ15012 RNU6-1061P-201ENST00000516530 99 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
LAPTM4AQ15012 RNA5SP395-201ENST00000516567 118 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
LAPTM4AQ15012 RN7SKP272-201ENST00000516988 232 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
LAPTM4AQ15012 AL132800.1-201ENST00000555109 698 ntTSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.5
LAPTM4AQ15012 AC026462.2-201ENST00000565771 286 ntTSL 2 BASIC5.65□□□□□ -1.5
LAPTM4AQ15012 MIR3145-201ENST00000580727 82 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
LAPTM4AQ15012 Z98949.1-211ENST00000596813 773 ntTSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.5
LAPTM4AQ15012 AL442128.1-201ENST00000615151 90 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
LAPTM4AQ15012 OR1N2-202ENST00000616791 993 ntAPPRIS P2 BASIC5.65□□□□□ -1.5
LAPTM4AQ15012 AIMP1-202ENST00000394701 2586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.51
LAPTM4AQ15012 GLYATL1-202ENST00000317391 1627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.51
LAPTM4AQ15012 CDKAL1-201ENST00000274695 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.51
LAPTM4AQ15012 ZNF761-203ENST00000454407 3967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.51
LAPTM4AQ15012 TCF7L2-206ENST00000355995 4073 ntTSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.51
LAPTM4AQ15012 AC019080.1-201ENST00000397057 5202 ntTSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.51
LAPTM4AQ15012 OR2J1-202ENST00000641659 2144 ntAPPRIS P1 BASIC5.65□□□□□ -1.51
LAPTM4AQ15012 NCOA3-202ENST00000371998 4668 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.51
LAPTM4AQ15012 METTL6-203ENST00000443029 4020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
LAPTM4AQ15012 SLC41A2-201ENST00000258538 4449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
LAPTM4AQ15012 ZNF146-201ENST00000443387 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
LAPTM4AQ15012 TOR1AIP1-202ENST00000435319 3397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
LAPTM4AQ15012 CASC15-206ENST00000606851 1889 ntTSL 2 BASIC5.64□□□□□ -1.51
LAPTM4AQ15012 PTPRT-201ENST00000356100 12480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
LAPTM4AQ15012 PTPRT-202ENST00000373184 12483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
LAPTM4AQ15012 PTPRT-203ENST00000373187 12453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
LAPTM4AQ15012 SPATA6-202ENST00000371843 2297 ntTSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
LAPTM4AQ15012 TNFSF4-202ENST00000367718 3429 ntTSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
LAPTM4AQ15012 PIP5K1B-201ENST00000265382 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
LAPTM4AQ15012 ZNF204P-201ENST00000416749 2397 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
LAPTM4AQ15012 LINC01524-201ENST00000428009 4390 ntTSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
LAPTM4AQ15012 LZTFL1-201ENST00000296135 4073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
LAPTM4AQ15012 SCN1A-217ENST00000637988 8562 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
LAPTM4AQ15012 RNU4-80P-201ENST00000363200 141 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
LAPTM4AQ15012 SNORD1C-201ENST00000363315 78 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
LAPTM4AQ15012 U3.6-201ENST00000363622 211 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
LAPTM4AQ15012 TRAV9-2-201ENST00000390441 394 ntAPPRIS P1 BASIC5.64□□□□□ -1.51
LAPTM4AQ15012 RNU6-381P-201ENST00000391259 108 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
LAPTM4AQ15012 ARSFP1-201ENST00000398758 477 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
LAPTM4AQ15012 RNU6-588P-201ENST00000410281 105 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
LAPTM4AQ15012 Y_RNA.595-201ENST00000410403 105 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
LAPTM4AQ15012 RAB9AP3-201ENST00000412737 573 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
LAPTM4AQ15012 CYCSP49-201ENST00000420810 319 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
LAPTM4AQ15012 RPL23AP38-201ENST00000423801 469 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
LAPTM4AQ15012 Z82188.1-201ENST00000436709 154 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
LAPTM4AQ15012 RPL26P6-201ENST00000440913 438 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
LAPTM4AQ15012 AL118523.1-201ENST00000444436 480 ntTSL 3 BASIC5.64□□□□□ -1.51
LAPTM4AQ15012 AC008264.1-201ENST00000447612 367 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
LAPTM4AQ15012 MTND6P5-201ENST00000448266 512 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
LAPTM4AQ15012 RAB9AP1-201ENST00000449393 573 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
LAPTM4AQ15012 AL162739.1-201ENST00000450606 307 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
LAPTM4AQ15012 TEX41-209ENST00000451478 452 ntTSL 2 BASIC5.64□□□□□ -1.51
LAPTM4AQ15012 MID1-209ENST00000453318 6393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
LAPTM4AQ15012 Z92846.1-201ENST00000456203 268 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
LAPTM4AQ15012 RNU6-1037P-201ENST00000459571 107 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
LAPTM4AQ15012 AP000870.1-201ENST00000472927 406 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
LAPTM4AQ15012 RPS27AP1-201ENST00000475545 471 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
LAPTM4AQ15012 TRBV5-2-201ENST00000489095 273 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
LAPTM4AQ15012 AC015524.1-201ENST00000491585 472 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
LAPTM4AQ15012 IGKV1OR2-1-201ENST00000514060 354 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
LAPTM4AQ15012 RNU7-175P-201ENST00000515915 61 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
LAPTM4AQ15012 RNU6ATAC17P-201ENST00000516074 71 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
LAPTM4AQ15012 AC104241.1-201ENST00000530039 628 ntTSL 3 BASIC5.64□□□□□ -1.51
LAPTM4AQ15012 AC133485.4-201ENST00000561835 220 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
LAPTM4AQ15012 AC138907.4-201ENST00000570107 226 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
LAPTM4AQ15012 MIR4744-201ENST00000581563 82 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
LAPTM4AQ15012 AC015911.9-201ENST00000591634 185 ntTSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
LAPTM4AQ15012 IGKV1OR2-118-201ENST00000603238 347 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
LAPTM4AQ15012 MIR8076-201ENST00000611401 83 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
LAPTM4AQ15012 AL121890.5-201ENST00000620848 304 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
LAPTM4AQ15012 AC068213.1-201ENST00000625124 226 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
LAPTM4AQ15012 LINC00906-206ENST00000589921 3444 ntTSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
LAPTM4AQ15012 FBXO3-208ENST00000530401 7410 ntTSL 2 BASIC5.64□□□□□ -1.51
LAPTM4AQ15012 CCR2-201ENST00000292301 2671 ntTSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
LAPTM4AQ15012 ADAM21-201ENST00000603540 2658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.64□□□□□ -1.51
LAPTM4AQ15012 PNISR-202ENST00000438806 3142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.64□□□□□ -1.51
LAPTM4AQ15012 AC021092.1-201ENST00000592946 3199 ntTSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
LAPTM4AQ15012 ZNF624-201ENST00000311331 4241 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.64□□□□□ -1.51
LAPTM4AQ15012 ESRRG-205ENST00000366937 5365 ntTSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
LAPTM4AQ15012 AFP-202ENST00000395792 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
LAPTM4AQ15012 FAM229B-201ENST00000368656 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
LAPTM4AQ15012 ENPP2-208ENST00000522826 2667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
LAPTM4AQ15012 ENPP2-201ENST00000075322 2651 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
LAPTM4AQ15012 WDR72-203ENST00000557913 5900 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
LAPTM4AQ15012 AL157938.3-201ENST00000502188 3084 ntTSL 4 BASIC5.63□□□□□ -1.51
LAPTM4AQ15012 OR6K2-201ENST00000359610 975 ntAPPRIS P1 BASIC5.63□□□□□ -1.51
LAPTM4AQ15012 RNU6-879P-201ENST00000364328 108 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
LAPTM4AQ15012 RNU6-407P-201ENST00000365280 104 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
LAPTM4AQ15012 SPRR2B-201ENST00000368755 617 ntAPPRIS P1 BASIC5.63□□□□□ -1.51
LAPTM4AQ15012 PLEKHA1-203ENST00000368990 14010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
LAPTM4AQ15012 RNU6-20P-201ENST00000384106 107 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
LAPTM4AQ15012 MIR450A2-201ENST00000385022 100 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
LAPTM4AQ15012 IGLV3-16-201ENST00000390311 385 ntAPPRIS P1 BASIC5.63□□□□□ -1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 100.4 ms