Protein–RNA interactions for Protein: Q14956

GPNMB, Transmembrane glycoprotein NMB, humanhuman

Predictions only

Length 572 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPNMBQ14956 AC090772.1-201ENST00000583782 507 ntTSL 5 BASIC2.92□□□□□ -1.94
GPNMBQ14956 AP005230.1-201ENST00000585072 675 ntTSL 5 BASIC2.92□□□□□ -1.94
GPNMBQ14956 AC090771.2-201ENST00000588794 571 ntTSL 3 BASIC2.92□□□□□ -1.94
GPNMBQ14956 AC024060.1-201ENST00000607052 494 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
GPNMBQ14956 AC107294.3-201ENST00000609211 526 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
GPNMBQ14956 ZNRD1-AS1_3.8-201ENST00000611686 104 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
GPNMBQ14956 AC090116.1-201ENST00000615679 446 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
GPNMBQ14956 AC006111.3-201ENST00000622137 383 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
GPNMBQ14956 AC026634.1-201ENST00000634369 198 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
GPNMBQ14956 MUM1L1-203ENST00000372552 3957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.92□□□□□ -1.94
GPNMBQ14956 KNL1-202ENST00000399668 7607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.92□□□□□ -1.94
GPNMBQ14956 SLC25A46-208ENST00000513807 1546 ntTSL 2 BASIC2.92□□□□□ -1.94
GPNMBQ14956 ROS1-202ENST00000368508 7435 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.92□□□□□ -1.94
GPNMBQ14956 KLRC1-202ENST00000359151 1407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.92□□□□□ -1.94
GPNMBQ14956 MTND5P27-201ENST00000428871 1720 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
GPNMBQ14956 RNU6-492P-201ENST00000363035 104 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
GPNMBQ14956 RNU6-707P-201ENST00000364647 95 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
GPNMBQ14956 LINC00862-202ENST00000367356 759 ntTSL 3 BASIC2.91□□□□□ -1.94
GPNMBQ14956 RNU6-339P-201ENST00000384310 107 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
GPNMBQ14956 MIR217-201ENST00000384817 110 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
GPNMBQ14956 RPS3AP26-201ENST00000398259 784 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
GPNMBQ14956 RNA5SP129-201ENST00000410276 118 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
GPNMBQ14956 AC092634.6-201ENST00000418558 192 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
GPNMBQ14956 AL358234.1-201ENST00000421132 273 ntTSL 5 BASIC2.91□□□□□ -1.94
GPNMBQ14956 RPL7P46-201ENST00000425129 740 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
GPNMBQ14956 AL035410.1-201ENST00000427409 427 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
GPNMBQ14956 BLOC1S2P1-201ENST00000428431 301 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
GPNMBQ14956 RPS29P6-201ENST00000438196 145 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
GPNMBQ14956 MTCO1P48-201ENST00000448024 1096 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
GPNMBQ14956 GJE1-201ENST00000450456 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.91□□□□□ -1.94
GPNMBQ14956 AL365273.2-201ENST00000491114 492 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.91□□□□□ -1.94
GPNMBQ14956 KLHL6-AS1-201ENST00000491676 503 ntTSL 2 BASIC2.91□□□□□ -1.94
GPNMBQ14956 AC004052.1-202ENST00000505680 516 ntTSL 3 BASIC2.91□□□□□ -1.94
GPNMBQ14956 AC113420.1-201ENST00000507903 571 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
GPNMBQ14956 AC093730.1-201ENST00000508825 448 ntTSL 3 BASIC2.91□□□□□ -1.94
GPNMBQ14956 AC096734.1-201ENST00000511279 1128 ntTSL 1 (best) BASIC2.91□□□□□ -1.94
GPNMBQ14956 RNA5SP282-201ENST00000516355 108 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
GPNMBQ14956 AC108515.1-201ENST00000517407 525 ntTSL 3 BASIC2.91□□□□□ -1.94
GPNMBQ14956 AC015468.3-201ENST00000518967 417 ntTSL 2 BASIC2.91□□□□□ -1.94
GPNMBQ14956 LINC01932-201ENST00000520323 573 ntTSL 5 BASIC2.91□□□□□ -1.94
GPNMBQ14956 MTND2P32-201ENST00000521584 1038 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
GPNMBQ14956 AP001189.2-201ENST00000527320 189 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
GPNMBQ14956 AP002993.1-201ENST00000538624 210 ntTSL 5 BASIC2.91□□□□□ -1.94
GPNMBQ14956 AC008127.2-201ENST00000549925 1075 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
GPNMBQ14956 LINC00640-203ENST00000556479 576 ntTSL 2 BASIC2.91□□□□□ -1.94
GPNMBQ14956 AC087286.1-201ENST00000560712 568 ntTSL 3 BASIC2.91□□□□□ -1.94
GPNMBQ14956 SULT1C2P1-202ENST00000562418 459 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
GPNMBQ14956 AC011518.1-202ENST00000592668 407 ntTSL 5 BASIC2.91□□□□□ -1.94
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GPNMBQ14956 AC023632.5-201ENST00000521010 491 ntTSL 3 BASIC2.9□□□□□ -1.95
GPNMBQ14956 AL163973.2-201ENST00000548096 288 ntTSL 3 BASIC2.9□□□□□ -1.95
GPNMBQ14956 MTND1P8-201ENST00000571424 950 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
GPNMBQ14956 AC091588.1-201ENST00000578504 359 ntTSL 3 BASIC2.9□□□□□ -1.95
GPNMBQ14956 AL669831.4-202ENST00000590817 238 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
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GPNMBQ14956 DMD-203ENST00000357033 13956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.95
GPNMBQ14956 MGAT4C-211ENST00000621808 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.95
GPNMBQ14956 CREBRF-201ENST00000296953 7778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.95
GPNMBQ14956 CC2D2B-210ENST00000636965 3247 ntTSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
GPNMBQ14956 OR4P4-201ENST00000314612 939 ntAPPRIS P1 BASIC2.89□□□□□ -1.95
GPNMBQ14956 SNORA36C-201ENST00000384289 132 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
GPNMBQ14956 RNU2-28P-201ENST00000410457 189 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
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