Protein–RNA interactions for Protein: Q13951

CBFB, Core-binding factor subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBFBQ13951 MIR4801-201ENST00000582704 82 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
CBFBQ13951 MIR4293-201ENST00000584305 78 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
CBFBQ13951 AL022099.1-201ENST00000604551 712 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
CBFBQ13951 AL034351.1-201ENST00000605288 668 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
CBFBQ13951 MIR432-201ENST00000606207 94 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
CBFBQ13951 AC114781.5-201ENST00000615297 108 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
CBFBQ13951 GPR171-203ENST00000617554 960 ntAPPRIS P1 BASIC3.84□□□□□ -1.79
CBFBQ13951 AC015967.1-201ENST00000619893 476 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
CBFBQ13951 AC073534.2-201ENST00000620377 381 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
CBFBQ13951 AL161637.1-201ENST00000622380 412 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
CBFBQ13951 PTAR1-202ENST00000377200 9876 ntTSL 1 (best) BASIC3.84□□□□□ -1.79
CBFBQ13951 ASAH2-201ENST00000329428 2184 ntTSL 1 (best) BASIC3.84□□□□□ -1.79
CBFBQ13951 GABRA1-220ENST00000638159 4088 ntTSL 5 BASIC3.84□□□□□ -1.79
CBFBQ13951 AJ009632.2-204ENST00000635621 1401 ntTSL 5 BASIC3.84□□□□□ -1.79
CBFBQ13951 LRMP-201ENST00000354454 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.84□□□□□ -1.8
CBFBQ13951 TAB3-204ENST00000378932 3698 ntTSL 1 (best) BASIC3.84□□□□□ -1.8
CBFBQ13951 ZNF479-201ENST00000319636 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.84□□□□□ -1.8
CBFBQ13951 PTP4A1-205ENST00000626021 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.83□□□□□ -1.8
CBFBQ13951 AL133383.2-201ENST00000622958 2336 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
CBFBQ13951 SYNE2-204ENST00000358025 21842 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC3.83□□□□□ -1.8
CBFBQ13951 PAPPA-AS1-201ENST00000445861 2450 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
CBFBQ13951 PRKACB-208ENST00000394839 4200 ntTSL 2 BASIC3.83□□□□□ -1.8
CBFBQ13951 ADGRL2-210ENST00000370728 6302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.83□□□□□ -1.8
CBFBQ13951 PKIB-202ENST00000354275 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.83□□□□□ -1.8
CBFBQ13951 RNU6-511P-201ENST00000363496 107 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
CBFBQ13951 RNU6-1090P-201ENST00000364065 94 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
CBFBQ13951 Y_RNA.248-201ENST00000364501 109 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
CBFBQ13951 MIR607-201ENST00000385241 96 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
CBFBQ13951 AL590002.1-201ENST00000406554 418 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
CBFBQ13951 RPL23AP26-201ENST00000412728 464 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
CBFBQ13951 AC099677.1-201ENST00000420575 175 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
CBFBQ13951 AL596276.1-201ENST00000434465 418 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
CBFBQ13951 AC078993.1-203ENST00000435789 1037 ntTSL 5 BASIC3.83□□□□□ -1.8
CBFBQ13951 AC004866.2-201ENST00000438285 481 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
CBFBQ13951 AC005094.1-201ENST00000440420 368 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
CBFBQ13951 AL121760.1-201ENST00000447206 346 ntTSL 2 BASIC3.83□□□□□ -1.8
CBFBQ13951 AC098484.1-201ENST00000447572 484 ntTSL 3 BASIC3.83□□□□□ -1.8
CBFBQ13951 AC006480.1-201ENST00000449887 378 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
CBFBQ13951 LINC00430-201ENST00000457672 597 ntTSL 3 BASIC3.83□□□□□ -1.8
CBFBQ13951 AL672167.3-201ENST00000465951 960 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
CBFBQ13951 RPL31P13-201ENST00000484151 370 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
CBFBQ13951 ATP5J2-209ENST00000488775 306 ntTSL 2 BASIC3.83□□□□□ -1.8
CBFBQ13951 AC106872.2-201ENST00000494303 480 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
CBFBQ13951 AC109927.2-201ENST00000506416 303 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
CBFBQ13951 RPS3A-208ENST00000509736 576 ntTSL 2 BASIC3.83□□□□□ -1.8
CBFBQ13951 AC105914.1-201ENST00000511798 226 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
CBFBQ13951 AC010493.1-201ENST00000513479 292 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
CBFBQ13951 MTCYBP41-201ENST00000528913 1123 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
CBFBQ13951 AC105233.3-201ENST00000531125 744 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
CBFBQ13951 AC018630.1-201ENST00000541376 925 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
CBFBQ13951 LINC01479-202ENST00000546170 444 ntTSL 2 BASIC3.83□□□□□ -1.8
CBFBQ13951 LINC02459-201ENST00000551761 474 ntTSL 3 BASIC3.83□□□□□ -1.8
CBFBQ13951 AL160191.1-201ENST00000555480 566 ntTSL 4 BASIC3.83□□□□□ -1.8
CBFBQ13951 ZNF519P2-201ENST00000557032 169 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
CBFBQ13951 AC044798.1-201ENST00000565146 418 ntTSL 5 BASIC3.83□□□□□ -1.8
CBFBQ13951 LINC01909-202ENST00000584919 815 ntTSL 3 BASIC3.83□□□□□ -1.8
CBFBQ13951 AC022706.1-202ENST00000585387 540 ntTSL 3 BASIC3.83□□□□□ -1.8
CBFBQ13951 AC097467.3-204ENST00000595229 827 ntTSL 5 BASIC3.83□□□□□ -1.8
CBFBQ13951 Z84480.1-201ENST00000605131 311 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
CBFBQ13951 AC024941.1-201ENST00000612250 334 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
CBFBQ13951 AC004696.1-201ENST00000614345 607 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
CBFBQ13951 RMST_9.1-201ENST00000619945 193 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
CBFBQ13951 LINC01515-217ENST00000620859 694 ntTSL 5 BASIC3.83□□□□□ -1.8
CBFBQ13951 MIR4727-201ENST00000622232 55 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
CBFBQ13951 AC011944.2-201ENST00000624440 683 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
CBFBQ13951 AC048347.1-201ENST00000624621 427 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
CBFBQ13951 AP3S1-209ENST00000640413 489 ntTSL 5 BASIC3.83□□□□□ -1.8
CBFBQ13951 VBP1-204ENST00000625964 1547 ntTSL 5 BASIC3.83□□□□□ -1.8
CBFBQ13951 KCNT2-202ENST00000367433 5883 ntTSL 1 (best) BASIC3.83□□□□□ -1.8
CBFBQ13951 LRRC63-203ENST00000595396 2327 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC3.83□□□□□ -1.8
CBFBQ13951 FAN1-202ENST00000561594 2738 ntTSL 1 (best) BASIC3.83□□□□□ -1.8
CBFBQ13951 CCDC178-204ENST00000403303 3354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.83□□□□□ -1.8
CBFBQ13951 ZNF43-207ENST00000595461 3399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.83□□□□□ -1.8
CBFBQ13951 ABCA12-202ENST00000389661 7005 ntTSL 1 (best) BASIC3.82□□□□□ -1.8
CBFBQ13951 ADGRG2-201ENST00000340581 3594 ntTSL 2 BASIC3.82□□□□□ -1.8
CBFBQ13951 ADAM7-201ENST00000175238 3367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.82□□□□□ -1.8
CBFBQ13951 ADAM29-201ENST00000359240 3325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.82□□□□□ -1.8
CBFBQ13951 AC106871.1-201ENST00000568324 3102 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
CBFBQ13951 RNF180-202ENST00000389100 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.82□□□□□ -1.8
CBFBQ13951 ANKRD20A10P-201ENST00000457591 1515 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
CBFBQ13951 MAPK10-253ENST00000641010 4072 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
CBFBQ13951 SYF2-202ENST00000354361 926 ntTSL 2 BASIC3.82□□□□□ -1.8
CBFBQ13951 OR8D1-201ENST00000357821 1026 ntAPPRIS P1 BASIC3.82□□□□□ -1.8
CBFBQ13951 MIR383-201ENST00000362257 73 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
CBFBQ13951 RNA5SP388-201ENST00000362584 119 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
CBFBQ13951 SNORD56.2-201ENST00000363242 71 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
CBFBQ13951 SNORA7.2-201ENST00000364446 145 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
CBFBQ13951 Y_RNA.256-201ENST00000364594 104 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
CBFBQ13951 RNU6-1283P-201ENST00000365314 105 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
CBFBQ13951 TRAV9-2-201ENST00000390441 394 ntAPPRIS P1 BASIC3.82□□□□□ -1.8
CBFBQ13951 RNU6-754P-201ENST00000391166 107 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
CBFBQ13951 SNORA11B-201ENST00000408175 129 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
CBFBQ13951 RNU2-36P-201ENST00000410361 191 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
CBFBQ13951 RNU4-65P-201ENST00000410473 140 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
CBFBQ13951 PSMA4-202ENST00000413382 1019 ntTSL 1 (best) BASIC3.82□□□□□ -1.8
CBFBQ13951 AL353771.1-201ENST00000422107 457 ntTSL 3 BASIC3.82□□□□□ -1.8
CBFBQ13951 RPL23AP38-201ENST00000423801 469 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
CBFBQ13951 USP9YP18-201ENST00000425912 695 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
CBFBQ13951 AC091493.1-201ENST00000426218 411 ntTSL 3 BASIC3.82□□□□□ -1.8
CBFBQ13951 LINC01037-201ENST00000427337 424 ntTSL 5 BASIC3.82□□□□□ -1.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 112.1 ms