Protein–RNA interactions for Protein: Q13618

CUL3, Cullin-3, humanhuman

Predictions only

Length 768 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL3Q13618 CYCSP4-201ENST00000429682 331 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
CUL3Q13618 POU6F2-AS1-201ENST00000433519 381 ntTSL 3 BASIC3.38□□□□□ -1.87
CUL3Q13618 AC007389.2-201ENST00000434630 306 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
CUL3Q13618 MIR548XHG-203ENST00000437492 853 ntTSL 1 (best) BASIC3.38□□□□□ -1.87
CUL3Q13618 RAC1P7-201ENST00000445367 377 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
CUL3Q13618 AC104308.1-201ENST00000454621 333 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
CUL3Q13618 OR6K1P-201ENST00000456766 971 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
CUL3Q13618 RPL30P6-201ENST00000475925 342 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
CUL3Q13618 RPS4XP13-201ENST00000483219 789 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
CUL3Q13618 KLHL6-AS1-201ENST00000491676 503 ntTSL 2 BASIC3.38□□□□□ -1.87
CUL3Q13618 AC034222.1-201ENST00000494052 532 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
CUL3Q13618 OR2A20P-203ENST00000498397 1268 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
CUL3Q13618 RPF2P2-201ENST00000504693 896 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
CUL3Q13618 AC111000.2-201ENST00000507775 550 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
CUL3Q13618 AC005178.1-201ENST00000508392 440 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
CUL3Q13618 AC091906.1-201ENST00000511310 391 ntTSL 2 BASIC3.38□□□□□ -1.87
CUL3Q13618 MTND4LP31-201ENST00000514859 294 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
CUL3Q13618 AC092436.2-201ENST00000515188 411 ntTSL 2 BASIC3.38□□□□□ -1.87
CUL3Q13618 RN7SKP18-201ENST00000516005 275 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
CUL3Q13618 NECAB1-205ENST00000522820 811 ntTSL 2 BASIC3.38□□□□□ -1.87
CUL3Q13618 AP003497.1-201ENST00000528472 562 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
CUL3Q13618 AC026894.1-202ENST00000533843 477 ntTSL 5 BASIC3.38□□□□□ -1.87
CUL3Q13618 AC006518.2-202ENST00000544947 297 ntTSL 2 BASIC3.38□□□□□ -1.87
CUL3Q13618 AC106785.1-201ENST00000565935 262 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
CUL3Q13618 AP001004.1-201ENST00000582468 324 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
CUL3Q13618 LINC01905-206ENST00000593180 524 ntTSL 2 BASIC3.38□□□□□ -1.87
CUL3Q13618 AC008277.1-203ENST00000594921 1149 ntTSL 5 BASIC3.38□□□□□ -1.87
CUL3Q13618 TEX41-222ENST00000597173 1134 ntTSL 1 (best) BASIC3.38□□□□□ -1.87
CUL3Q13618 AP001330.4-201ENST00000604350 154 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
CUL3Q13618 AC122133.1-201ENST00000613964 233 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
CUL3Q13618 Z99129.2-201ENST00000619967 314 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
CUL3Q13618 AF246928.1-201ENST00000623768 87 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
CUL3Q13618 RPS4Y2-201ENST00000629237 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.38□□□□□ -1.87
CUL3Q13618 AC073172.1-201ENST00000636967 851 ntTSL 5 BASIC3.38□□□□□ -1.87
CUL3Q13618 AC119674.1-207ENST00000641355 633 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
CUL3Q13618 CHORDC1-206ENST00000529987 1698 ntTSL 3 BASIC3.38□□□□□ -1.87
CUL3Q13618 MBNL3-204ENST00000370853 2661 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC3.38□□□□□ -1.87
CUL3Q13618 ARID2-206ENST00000457135 4356 ntTSL 1 (best) BASIC3.38□□□□□ -1.87
CUL3Q13618 AC072062.1-210ENST00000628464 1315 ntTSL 5 BASIC3.38□□□□□ -1.87
CUL3Q13618 AL356274.2-201ENST00000624379 3752 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
CUL3Q13618 SLAIN1-203ENST00000351546 2394 ntTSL 2 BASIC3.38□□□□□ -1.87
CUL3Q13618 RXFP1-201ENST00000307765 3842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.38□□□□□ -1.87
CUL3Q13618 USP45-208ENST00000500704 5826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.38□□□□□ -1.87
CUL3Q13618 HERC5-203ENST00000508159 2243 ntTSL 2 BASIC3.38□□□□□ -1.87
CUL3Q13618 TOP2A-201ENST00000423485 5758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.37□□□□□ -1.87
CUL3Q13618 FIGNL1-212ENST00000613602 3187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.37□□□□□ -1.87
CUL3Q13618 CHD9-213ENST00000564845 11504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.37□□□□□ -1.87
CUL3Q13618 ESD-201ENST00000378697 1079 ntTSL 5 BASIC3.37□□□□□ -1.87
CUL3Q13618 Y_RNA.560-201ENST00000384689 102 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
CUL3Q13618 RPL21P3-201ENST00000395517 478 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
CUL3Q13618 RPL5P18-201ENST00000406671 891 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
CUL3Q13618 RNU2-43P-201ENST00000410306 190 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
CUL3Q13618 AC004870.4-201ENST00000424359 360 ntTSL 2 BASIC3.37□□□□□ -1.87
CUL3Q13618 RPL7P46-201ENST00000425129 740 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
CUL3Q13618 MTCO1P39-201ENST00000426148 480 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
CUL3Q13618 NUTM2A-AS1-209ENST00000447424 571 ntTSL 3 BASIC3.37□□□□□ -1.87
CUL3Q13618 ZNF736P5Y-201ENST00000451173 805 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
CUL3Q13618 AC234775.1-201ENST00000454247 670 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
CUL3Q13618 AC007967.1-201ENST00000455422 1159 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
CUL3Q13618 SNORD121B-201ENST00000458838 81 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
CUL3Q13618 AC146507.2-201ENST00000460608 476 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
CUL3Q13618 RPL7P15-201ENST00000461190 712 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
CUL3Q13618 ACTR3P3-201ENST00000480448 893 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
CUL3Q13618 AC112198.1-201ENST00000505369 1220 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
CUL3Q13618 MTND4LP22-201ENST00000508209 276 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
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CUL3Q13618 AC007536.1-201ENST00000533382 349 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
CUL3Q13618 LINC02235-201ENST00000534675 466 ntTSL 5 BASIC3.37□□□□□ -1.87
CUL3Q13618 AC007834.2-201ENST00000536310 343 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
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CUL3Q13618 AC009803.1-201ENST00000551531 416 ntTSL 3 BASIC3.37□□□□□ -1.87
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CUL3Q13618 AP005059.2-201ENST00000577527 578 ntTSL 3 BASIC3.37□□□□□ -1.87
CUL3Q13618 ZNF573-209ENST00000585724 453 ntTSL 5 BASIC3.37□□□□□ -1.87
CUL3Q13618 AC006116.10-201ENST00000591836 581 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
CUL3Q13618 CLIC4P2-201ENST00000601934 717 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
CUL3Q13618 AC010591.1-201ENST00000603941 649 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
CUL3Q13618 BCRP9-201ENST00000605312 388 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
CUL3Q13618 ADPRM-204ENST00000609540 1138 ntTSL 5 BASIC3.37□□□□□ -1.87
CUL3Q13618 MIR7851-201ENST00000610611 160 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
CUL3Q13618 AL354810.1-201ENST00000618134 635 ntTSL 3 BASIC3.37□□□□□ -1.87
CUL3Q13618 VPS13C-203ENST00000395896 14579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.37□□□□□ -1.87
CUL3Q13618 MBNL1-206ENST00000357472 5256 ntTSL 5 BASIC3.37□□□□□ -1.87
CUL3Q13618 CR383658.2-201ENST00000547576 1525 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
CUL3Q13618 P2RY13-201ENST00000325602 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.37□□□□□ -1.87
CUL3Q13618 OXR1-205ENST00000442977 2956 ntTSL 2 BASIC3.36□□□□□ -1.87
CUL3Q13618 AC007256.1-201ENST00000392253 2765 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
CUL3Q13618 API5P2-201ENST00000397055 1498 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
CUL3Q13618 USP15-203ENST00000353364 14950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.36□□□□□ -1.87
CUL3Q13618 MME-211ENST00000492661 2854 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.36□□□□□ -1.87
CUL3Q13618 MTCO1P9-201ENST00000505577 1534 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
CUL3Q13618 ERBIN-212ENST00000508515 4374 ntTSL 5 BASIC3.36□□□□□ -1.87
CUL3Q13618 RNU1-64P-201ENST00000365443 163 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
CUL3Q13618 RNU6-769P-201ENST00000384407 104 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
CUL3Q13618 CASP3-203ENST00000393588 677 ntTSL 4 BASIC3.36□□□□□ -1.87
CUL3Q13618 AP000567.1-201ENST00000406413 156 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
CUL3Q13618 RNU6ATAC-201ENST00000408749 126 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
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