Protein–RNA interactions for Protein: Q13112

CHAF1B, Chromatin assembly factor 1 subunit B, humanhuman

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Length 559 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHAF1BQ13112 U3.45-201ENST00000607547 219 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
CHAF1BQ13112 AC004908.2-201ENST00000609090 574 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
CHAF1BQ13112 TUG1_2.1-201ENST00000614234 87 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
CHAF1BQ13112 AC090132.2-201ENST00000615881 347 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
CHAF1BQ13112 AP003485.2-201ENST00000623636 610 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
CHAF1BQ13112 AL138713.1-201ENST00000624026 2130 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
CHAF1BQ13112 AC006927.3-201ENST00000638789 384 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
CHAF1BQ13112 GEN1-201ENST00000317402 9854 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.57□□□□□ -1.84
CHAF1BQ13112 KIF21A-203ENST00000541463 4866 ntTSL 1 (best) BASIC3.57□□□□□ -1.84
CHAF1BQ13112 ADGRL2-207ENST00000370723 5254 ntTSL 5 BASIC3.57□□□□□ -1.84
CHAF1BQ13112 IL6ST-205ENST00000381294 2574 ntTSL 1 (best) BASIC3.57□□□□□ -1.84
CHAF1BQ13112 AL161457.2-203ENST00000590767 2663 ntTSL 5 BASIC3.56□□□□□ -1.84
CHAF1BQ13112 RNY4P24-201ENST00000362735 96 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
CHAF1BQ13112 RNU6-501P-201ENST00000364072 100 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
CHAF1BQ13112 LINC00862-202ENST00000367356 759 ntTSL 3 BASIC3.56□□□□□ -1.84
CHAF1BQ13112 CD2-201ENST00000369477 478 ntTSL 2 BASIC3.56□□□□□ -1.84
CHAF1BQ13112 MIR19A-201ENST00000384878 82 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
CHAF1BQ13112 RNU4-72P-201ENST00000410754 173 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
CHAF1BQ13112 HMGN1P24-201ENST00000412282 298 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
CHAF1BQ13112 AC019064.1-201ENST00000414796 499 ntTSL 2 BASIC3.56□□□□□ -1.84
CHAF1BQ13112 UBE2FP1-201ENST00000416536 447 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
CHAF1BQ13112 NDUFB4P7-201ENST00000423198 363 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
CHAF1BQ13112 USP9YP36-201ENST00000424581 829 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
CHAF1BQ13112 AL391336.1-201ENST00000424678 484 ntTSL 3 BASIC3.56□□□□□ -1.84
CHAF1BQ13112 C1orf195-201ENST00000424792 255 ntTSL 2 BASIC3.56□□□□□ -1.84
CHAF1BQ13112 BBS9-205ENST00000425508 1252 ntTSL 1 (best) BASIC3.56□□□□□ -1.84
CHAF1BQ13112 AC092447.3-201ENST00000426027 686 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
CHAF1BQ13112 AC109583.1-201ENST00000432156 268 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
CHAF1BQ13112 OPA1-AS1-201ENST00000433105 492 ntTSL 3 BASIC3.56□□□□□ -1.84
CHAF1BQ13112 LINC01884-201ENST00000433429 440 ntTSL 3 BASIC3.56□□□□□ -1.84
CHAF1BQ13112 RPL37P21-201ENST00000435890 276 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
CHAF1BQ13112 AF228730.2-201ENST00000438784 848 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
CHAF1BQ13112 AC018643.1-201ENST00000445459 414 ntTSL 5 BASIC3.56□□□□□ -1.84
CHAF1BQ13112 TBL1XR1-AS1-201ENST00000454723 414 ntTSL 5 BASIC3.56□□□□□ -1.84
CHAF1BQ13112 LINC00374-201ENST00000454780 800 ntTSL 3 BASIC3.56□□□□□ -1.84
CHAF1BQ13112 DCUN1D1-204ENST00000469954 970 ntTSL 3 BASIC3.56□□□□□ -1.84
CHAF1BQ13112 RPL30P14-201ENST00000482744 348 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
CHAF1BQ13112 RPL31P61-201ENST00000496160 376 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
CHAF1BQ13112 AC114967.1-201ENST00000504890 259 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
CHAF1BQ13112 AC005178.1-201ENST00000508392 440 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
CHAF1BQ13112 SCARNA15.2-201ENST00000516409 127 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
CHAF1BQ13112 AC026407.1-201ENST00000518369 204 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
CHAF1BQ13112 ZFPM2-AS1-204ENST00000520433 748 ntTSL 3 BASIC3.56□□□□□ -1.84
CHAF1BQ13112 AP000907.2-201ENST00000530827 353 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
CHAF1BQ13112 MAL2-203ENST00000534619 578 ntTSL 4 BASIC3.56□□□□□ -1.84
CHAF1BQ13112 OR4H12P-201ENST00000556269 907 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
CHAF1BQ13112 PCMTD1P2-201ENST00000565017 355 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
CHAF1BQ13112 AC005951.2-201ENST00000576282 495 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
CHAF1BQ13112 MIR3200-201ENST00000580767 85 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
CHAF1BQ13112 PPP3CB-AS1-206ENST00000595935 675 ntTSL 5 BASIC3.56□□□□□ -1.84
CHAF1BQ13112 VGLL4-219ENST00000638314 93 ntTSL 5 BASIC3.56□□□□□ -1.84
CHAF1BQ13112 AC119674.1-207ENST00000641355 633 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
CHAF1BQ13112 EPS15-202ENST00000371730 4736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.56□□□□□ -1.84
CHAF1BQ13112 NUDT12-201ENST00000230792 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.56□□□□□ -1.84
CHAF1BQ13112 RTTN-201ENST00000255674 6960 ntTSL 5 BASIC3.56□□□□□ -1.84
CHAF1BQ13112 SERPINI2-209ENST00000616363 1769 ntTSL 5 BASIC3.56□□□□□ -1.84
CHAF1BQ13112 DCUN1D1-208ENST00000632685 3147 ntTSL 1 (best) BASIC3.55□□□□□ -1.84
CHAF1BQ13112 MFN1-201ENST00000263969 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.55□□□□□ -1.84
CHAF1BQ13112 SPRR2D-203ENST00000368757 800 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.55□□□□□ -1.84
CHAF1BQ13112 RNU1-39P-201ENST00000383897 165 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
CHAF1BQ13112 SNORA9-201ENST00000384215 133 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
CHAF1BQ13112 SNORA1.3-201ENST00000384676 136 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
CHAF1BQ13112 MIR491-201ENST00000384877 84 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
CHAF1BQ13112 MIR183-201ENST00000384958 110 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
CHAF1BQ13112 MIR483-201ENST00000385070 76 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
CHAF1BQ13112 MIR34B-201ENST00000385076 84 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
CHAF1BQ13112 TRAJ18-201ENST00000390519 66 ntAPPRIS P1 BASIC3.55□□□□□ -1.84
CHAF1BQ13112 RPL7P60-201ENST00000397636 735 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
CHAF1BQ13112 AL109755.1-201ENST00000401791 649 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
CHAF1BQ13112 CCNG1P1-201ENST00000406783 885 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
CHAF1BQ13112 RNU6-1077P-201ENST00000410506 102 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
CHAF1BQ13112 LINC01349-201ENST00000416343 497 ntTSL 3 BASIC3.55□□□□□ -1.84
CHAF1BQ13112 VPS26BP1-201ENST00000417155 755 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
CHAF1BQ13112 AC104653.1-201ENST00000420579 578 ntTSL 2 BASIC3.55□□□□□ -1.84
CHAF1BQ13112 AL449983.1-201ENST00000430640 414 ntTSL 2 BASIC3.55□□□□□ -1.84
CHAF1BQ13112 RPS6P15-201ENST00000431996 751 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
CHAF1BQ13112 AC093019.2-201ENST00000432294 384 ntTSL 3 BASIC3.55□□□□□ -1.84
CHAF1BQ13112 AC092573.2-201ENST00000434546 243 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
CHAF1BQ13112 KCTD9P3-201ENST00000434597 1169 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
CHAF1BQ13112 HIGD1AP11-201ENST00000438361 280 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
CHAF1BQ13112 AL590664.1-201ENST00000448065 339 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
CHAF1BQ13112 LINC01474-202ENST00000449235 628 ntTSL 3 BASIC3.55□□□□□ -1.84
CHAF1BQ13112 MTCO1P42-201ENST00000457379 726 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
CHAF1BQ13112 HMGN2P13-201ENST00000476476 274 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
CHAF1BQ13112 AC055855.1-201ENST00000489563 579 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
CHAF1BQ13112 AC083800.1-201ENST00000490594 246 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.55□□□□□ -1.84
CHAF1BQ13112 RPS15AP36-201ENST00000492022 382 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
CHAF1BQ13112 SLC7A11-AS1-201ENST00000510066 817 ntTSL 2 BASIC3.55□□□□□ -1.84
CHAF1BQ13112 AC074250.1-201ENST00000511117 192 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
CHAF1BQ13112 AC010261.1-201ENST00000514411 457 ntTSL 5 BASIC3.55□□□□□ -1.84
CHAF1BQ13112 AC116347.2-201ENST00000514912 523 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
CHAF1BQ13112 AC092436.2-201ENST00000515188 411 ntTSL 2 BASIC3.55□□□□□ -1.84
CHAF1BQ13112 RNU6-1256P-201ENST00000516539 103 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
CHAF1BQ13112 RNU4ATAC6P-201ENST00000516592 126 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
CHAF1BQ13112 RNU6-1231P-201ENST00000517185 103 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
CHAF1BQ13112 CASP1P1-201ENST00000526345 212 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
CHAF1BQ13112 RRAS2-210ENST00000534746 993 ntTSL 2 BASIC3.55□□□□□ -1.84
CHAF1BQ13112 AC018410.2-201ENST00000540410 610 ntTSL 5 BASIC3.55□□□□□ -1.84
CHAF1BQ13112 AL133153.1-201ENST00000557756 303 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
CHAF1BQ13112 MIR5187-201ENST00000583479 76 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
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