Protein–RNA interactions for Protein: Q12948

FOXC1, Forkhead box protein C1, humanhuman

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Length 553 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXC1Q12948 MRPS21P7-201ENST00000566937 238 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
FOXC1Q12948 AP005271.1-201ENST00000582470 412 ntTSL 3 BASIC5.57□□□□□ -1.52
FOXC1Q12948 Metazoa_SRP.134-201ENST00000610965 327 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
FOXC1Q12948 MIR6129-201ENST00000616087 109 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
FOXC1Q12948 AC091953.3-201ENST00000623220 236 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
FOXC1Q12948 SLC4A4-202ENST00000340595 7640 ntTSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
FOXC1Q12948 ZMAT1-201ENST00000372782 3185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
FOXC1Q12948 AC027228.2-201ENST00000567141 2154 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
FOXC1Q12948 TMEM68-218ENST00000617782 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.57□□□□□ -1.52
FOXC1Q12948 MUC5B-204ENST00000529681 17911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.57□□□□□ -1.52
FOXC1Q12948 KIF27-204ENST00000413982 4493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
FOXC1Q12948 PYGO1-202ENST00000563719 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.57□□□□□ -1.52
FOXC1Q12948 RIMS1-205ENST00000414192 1787 ntTSL 2 BASIC5.57□□□□□ -1.52
FOXC1Q12948 AC007938.2-201ENST00000604666 2634 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
FOXC1Q12948 EXO1-208ENST00000518483 2899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
FOXC1Q12948 KIAA1328-201ENST00000280020 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
FOXC1Q12948 MLIP-206ENST00000502396 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.57□□□□□ -1.52
FOXC1Q12948 AL137141.1-201ENST00000624622 4836 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
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FOXC1Q12948 ASXL2-203ENST00000435504 12878 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.52
FOXC1Q12948 RTN4-203ENST00000357376 4110 ntTSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
FOXC1Q12948 NAT1-209ENST00000541942 1948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.56□□□□□ -1.52
FOXC1Q12948 SAMSN1-201ENST00000285670 2185 ntTSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
FOXC1Q12948 DLGAP5-202ENST00000395425 2954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
FOXC1Q12948 LEPR-205ENST00000371060 5135 ntTSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
FOXC1Q12948 ZNF711-202ENST00000360700 4844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
FOXC1Q12948 MRE11-203ENST00000393241 2604 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.52
FOXC1Q12948 CRNDE-212ENST00000613942 2601 ntTSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.52
FOXC1Q12948 CNTN5-204ENST00000524871 6258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
FOXC1Q12948 HMMR-203ENST00000393915 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
FOXC1Q12948 CACNB2-207ENST00000377329 3396 ntTSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
FOXC1Q12948 GPAM-202ENST00000369425 5664 ntTSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
FOXC1Q12948 ZNF486-201ENST00000335117 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
FOXC1Q12948 U8.7-201ENST00000364940 136 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
FOXC1Q12948 RNU1-106P-201ENST00000384382 164 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
FOXC1Q12948 RNU6-476P-201ENST00000384726 107 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
FOXC1Q12948 Y_RNA.570-201ENST00000384750 101 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
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FOXC1Q12948 CYB5AP4-201ENST00000396692 399 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
FOXC1Q12948 AL031386.1-201ENST00000411940 142 ntTSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.52
FOXC1Q12948 AC063979.1-201ENST00000415539 377 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
FOXC1Q12948 AC078960.1-201ENST00000422160 177 ntTSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.52
FOXC1Q12948 AL021153.1-201ENST00000427360 308 ntTSL 3 BASIC5.56□□□□□ -1.52
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FOXC1Q12948 AC245427.2-201ENST00000438839 263 ntTSL 3 BASIC5.56□□□□□ -1.52
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FOXC1Q12948 AL589740.1-204ENST00000634677 630 ntTSL 4 BASIC5.56□□□□□ -1.52
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FOXC1Q12948 SENP8-201ENST00000340912 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
FOXC1Q12948 AL138820.1-201ENST00000617901 5305 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
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FOXC1Q12948 FAM208A-210ENST00000614531 3441 ntTSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
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FOXC1Q12948 OPALIN-202ENST00000393870 3578 ntTSL 3 BASIC5.55□□□□□ -1.52
FOXC1Q12948 CCR2-201ENST00000292301 2671 ntTSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
FOXC1Q12948 OR4E2-202ENST00000641524 2855 ntAPPRIS P1 BASIC5.55□□□□□ -1.52
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FOXC1Q12948 KIAA1109-201ENST00000264501 15896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
FOXC1Q12948 MITF-206ENST00000394351 1956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
FOXC1Q12948 CENPJ-206ENST00000616936 5020 ntTSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
FOXC1Q12948 CFHR4-202ENST00000367416 2178 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.55□□□□□ -1.52
FOXC1Q12948 DGKB-203ENST00000403951 6917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
FOXC1Q12948 BRWD3-201ENST00000373275 11381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
FOXC1Q12948 TBC1D5-201ENST00000253692 7854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
FOXC1Q12948 FNIP1-202ENST00000307968 6388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
FOXC1Q12948 RNA5SP183-201ENST00000362452 119 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
FOXC1Q12948 RNU6-827P-201ENST00000365553 106 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
FOXC1Q12948 RNU6-211P-201ENST00000384047 107 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
FOXC1Q12948 RPS4XP3-201ENST00000398541 413 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
FOXC1Q12948 RNU2-21P-201ENST00000410368 188 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
FOXC1Q12948 RNU2-2P-201ENST00000410396 191 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
FOXC1Q12948 SNORD56-201ENST00000413522 71 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
FOXC1Q12948 LINC01698-201ENST00000443636 727 ntTSL 3 BASIC5.55□□□□□ -1.52
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