Protein–RNA interactions for Protein: P23467

PTPRB, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase beta, humanhuman

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Length 1,997 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRBP23467 LINC01326-201ENST00000495159 755 ntTSL 2 BASIC2.08□□□□□ -2.08
PTPRBP23467 AC008696.2-201ENST00000503323 825 ntTSL 3 BASIC2.08□□□□□ -2.08
PTPRBP23467 AC092542.1-201ENST00000513155 355 ntTSL 2 BASIC2.08□□□□□ -2.08
PTPRBP23467 MIR4448-201ENST00000584360 86 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
PTPRBP23467 AC091059.1-201ENST00000585190 215 ntTSL 3 BASIC2.08□□□□□ -2.08
PTPRBP23467 AC092650.2-201ENST00000619984 902 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
PTPRBP23467 AC090617.7-201ENST00000623952 126 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
PTPRBP23467 THUMPD3P1-201ENST00000506556 1480 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
PTPRBP23467 CEP83-202ENST00000397807 2737 ntTSL 5 BASIC2.08□□□□□ -2.08
PTPRBP23467 P4HA2-AS1-201ENST00000417667 839 ntTSL 3 BASIC2.07□□□□□ -2.08
PTPRBP23467 AC005517.2-201ENST00000424673 553 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
PTPRBP23467 MTATP6P4-201ENST00000427725 675 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
PTPRBP23467 LINC01359-202ENST00000436350 710 ntTSL 3 BASIC2.07□□□□□ -2.08
PTPRBP23467 RSL24D1P2-201ENST00000445584 366 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
PTPRBP23467 Z99714.1-201ENST00000450463 807 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
PTPRBP23467 AL445669.2-201ENST00000454425 421 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
PTPRBP23467 snoU13.18-201ENST00000459483 104 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
PTPRBP23467 AIG1P1-201ENST00000503376 148 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
PTPRBP23467 AC011363.1-201ENST00000524198 458 ntTSL 5 BASIC2.07□□□□□ -2.08
PTPRBP23467 STARD13-AS-208ENST00000589472 859 ntTSL 5 BASIC2.07□□□□□ -2.08
PTPRBP23467 AC128687.1-201ENST00000605304 619 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
PTPRBP23467 AL136164.4-201ENST00000625013 2135 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
PTPRBP23467 PTPRQ-209ENST00000616559 8165 ntTSL 5 BASIC2.07□□□□□ -2.08
PTPRBP23467 FER-201ENST00000281092 12119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.07□□□□□ -2.08
PTPRBP23467 METTL18-201ENST00000303469 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.07□□□□□ -2.08
PTPRBP23467 CCSAP-202ENST00000366686 4399 ntTSL 2 BASIC2.07□□□□□ -2.08
PTPRBP23467 CCDC169-201ENST00000239859 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.07□□□□□ -2.08
PTPRBP23467 VTRNA1-1-201ENST00000363120 99 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
PTPRBP23467 SNORA67.3-201ENST00000384366 140 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
PTPRBP23467 SFR1P1-201ENST00000403720 688 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
PTPRBP23467 AC109780.2-201ENST00000413467 845 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
PTPRBP23467 HIGD1AP11-201ENST00000438361 280 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
PTPRBP23467 AC018359.1-201ENST00000442567 574 ntTSL 4 BASIC2.07□□□□□ -2.08
PTPRBP23467 AC114316.1-201ENST00000511323 278 ntTSL 5 BASIC2.07□□□□□ -2.08
PTPRBP23467 AC093770.1-201ENST00000511559 571 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
PTPRBP23467 MTND5P4-201ENST00000514978 288 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
PTPRBP23467 NOP56P3-201ENST00000549457 385 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
PTPRBP23467 LINC01899-201ENST00000580323 312 ntTSL 5 BASIC2.07□□□□□ -2.08
PTPRBP23467 AL049779.4-201ENST00000604500 156 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
PTPRBP23467 HSPE1P14-201ENST00000605812 302 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
PTPRBP23467 AC067747.1-201ENST00000608026 250 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
PTPRBP23467 HOTTIP_4.1-201ENST00000618195 165 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
PTPRBP23467 AC020923.1-201ENST00000624021 917 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
PTPRBP23467 COMMD6-213ENST00000626103 120 ntTSL 5 BASIC2.07□□□□□ -2.08
PTPRBP23467 LINC01002-215ENST00000632203 314 ntTSL 5 BASIC2.07□□□□□ -2.08
PTPRBP23467 AL356118.1-201ENST00000635272 1078 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
PTPRBP23467 AC068620.4-201ENST00000636730 1182 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
PTPRBP23467 USP45-208ENST00000500704 5826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.06□□□□□ -2.08
PTPRBP23467 AC010733.2-201ENST00000589496 5702 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
PTPRBP23467 NBPF20-202ENST00000392971 18450 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.06□□□□□ -2.08
PTPRBP23467 OR2B2-201ENST00000303324 1212 ntAPPRIS P1 BASIC2.06□□□□□ -2.08
PTPRBP23467 MIR221-201ENST00000385135 110 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
PTPRBP23467 BTBD10P2-201ENST00000404779 676 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
PTPRBP23467 RNA5SP344-201ENST00000411081 104 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
PTPRBP23467 UBE2V1P9-201ENST00000414760 368 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
PTPRBP23467 AC009414.1-201ENST00000427200 443 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
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PTPRBP23467 AL137802.1-201ENST00000452795 327 ntTSL 5 BASIC2.06□□□□□ -2.08
PTPRBP23467 AL162742.2-201ENST00000472915 244 ntTSL 5 BASIC2.06□□□□□ -2.08
PTPRBP23467 RNA5SP200-201ENST00000516360 103 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
PTPRBP23467 AL353699.1-201ENST00000529078 365 ntTSL 3 BASIC2.06□□□□□ -2.08
PTPRBP23467 SNRPGP16-201ENST00000533275 226 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
PTPRBP23467 SUB1P3-201ENST00000564581 315 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
PTPRBP23467 AC004775.1-201ENST00000607389 753 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
PTPRBP23467 AC010378.1-201ENST00000619270 362 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
PTPRBP23467 AC006963.1-201ENST00000624003 1052 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
PTPRBP23467 INPP4B-223ENST00000630044 354 ntTSL 5 BASIC2.06□□□□□ -2.08
PTPRBP23467 ROCK2-203ENST00000401753 4017 ntTSL 1 (best) BASIC2.06□□□□□ -2.08
PTPRBP23467 RNA5SP139-201ENST00000364340 117 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
PTPRBP23467 SNORA27.3-201ENST00000364937 134 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
PTPRBP23467 CD3D-202ENST00000392884 476 ntTSL 2 BASIC2.05□□□□□ -2.08
PTPRBP23467 AC004022.2-201ENST00000413824 193 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
PTPRBP23467 TTTY20-201ENST00000434487 259 ntTSL 1 (best) BASIC2.05□□□□□ -2.08
PTPRBP23467 RPS15AP28-201ENST00000435088 386 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
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PTPRBP23467 snoU13.3-201ENST00000459441 104 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
PTPRBP23467 LINC02364-201ENST00000514802 687 ntTSL 2 BASIC2.05□□□□□ -2.08
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PTPRBP23467 HMGB1P46-201ENST00000520062 610 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
PTPRBP23467 LINC01479-201ENST00000545520 509 ntTSL 2 BASIC2.05□□□□□ -2.08
PTPRBP23467 AC092470.1-201ENST00000546187 132 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
PTPRBP23467 ETFRF1-208ENST00000556402 874 ntTSL 3 BASIC2.05□□□□□ -2.08
PTPRBP23467 LINC02490-201ENST00000559915 601 ntTSL 3 BASIC2.05□□□□□ -2.08
PTPRBP23467 MIR3670-2-201ENST00000582974 65 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
PTPRBP23467 MIR3670-1-201ENST00000584160 65 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
PTPRBP23467 MIR3670-3-201ENST00000584855 65 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
PTPRBP23467 AL009028.1-201ENST00000604895 802 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
PTPRBP23467 BX664608.1-201ENST00000610519 487 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
PTPRBP23467 MIR3670-4-201ENST00000612260 65 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
PTPRBP23467 STATH-208ENST00000615994 598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.05□□□□□ -2.08
PTPRBP23467 MIR6076-201ENST00000617521 113 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
PTPRBP23467 AC244517.12-201ENST00000623581 663 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
PTPRBP23467 AC245427.3-201ENST00000632041 51 ntAPPRIS P1 BASIC2.05□□□□□ -2.08
PTPRBP23467 AC008432.1-201ENST00000615912 1320 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
PTPRBP23467 IL6ST-205ENST00000381294 2574 ntTSL 1 (best) BASIC2.05□□□□□ -2.08
PTPRBP23467 TMEM27-201ENST00000380342 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.05□□□□□ -2.08
PTPRBP23467 SOCS4-201ENST00000339298 6667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.05□□□□□ -2.08
PTPRBP23467 AC005539.1-201ENST00000443768 1479 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
PTPRBP23467 RNU6-173P-201ENST00000364215 104 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
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