Protein–RNA interactions for Protein: C9JPN9

USP17L12, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 17-like protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 530 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP17L12C9JPN9 ZNF284-201ENST00000421176 4351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
USP17L12C9JPN9 ZNF704-201ENST00000327835 14386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
USP17L12C9JPN9 SERPINB7-202ENST00000398019 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
USP17L12C9JPN9 PSG7-202ENST00000446844 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
USP17L12C9JPN9 RNMT-206ENST00000589866 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
USP17L12C9JPN9 EIF4EBP2-201ENST00000373218 7257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
USP17L12C9JPN9 AGO3-203ENST00000373191 19687 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
USP17L12C9JPN9 AL022311.1-201ENST00000623726 19416 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
USP17L12C9JPN9 AL050331.3-201ENST00000448740 2081 ntTSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
USP17L12C9JPN9 SULF1-204ENST00000458141 5551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
USP17L12C9JPN9 MECOM-201ENST00000264674 4900 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
USP17L12C9JPN9 OR9G1-202ENST00000642097 3611 ntAPPRIS P1 BASIC5.82□□□□□ -1.48
USP17L12C9JPN9 FGF7-202ENST00000560270 1688 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
USP17L12C9JPN9 DNAH8-201ENST00000327475 14360 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
USP17L12C9JPN9 WDR5B-201ENST00000330689 3720 ntAPPRIS P1 BASIC5.82□□□□□ -1.48
USP17L12C9JPN9 EFTUD1P2-201ENST00000514817 1603 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
USP17L12C9JPN9 HSP90AA5P-201ENST00000438353 2192 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
USP17L12C9JPN9 A1CF-205ENST00000374001 9221 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
USP17L12C9JPN9 IREB2-201ENST00000258886 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
USP17L12C9JPN9 Y_RNA.5-201ENST00000362334 102 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
USP17L12C9JPN9 SNORA73.1-201ENST00000363107 205 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
USP17L12C9JPN9 TEX35-202ENST00000367639 785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
USP17L12C9JPN9 DEFB110-201ENST00000371148 384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
USP17L12C9JPN9 RNU6-1032P-201ENST00000384100 107 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
USP17L12C9JPN9 RNU6-574P-201ENST00000384265 107 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
USP17L12C9JPN9 AL589987.2-201ENST00000417426 582 ntTSL 2 BASIC5.82□□□□□ -1.48
USP17L12C9JPN9 AC006369.1-201ENST00000419425 548 ntTSL 3 BASIC5.82□□□□□ -1.48
USP17L12C9JPN9 AC079790.1-201ENST00000420365 507 ntTSL 3 BASIC5.82□□□□□ -1.48
USP17L12C9JPN9 AL590399.6-201ENST00000446396 307 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
USP17L12C9JPN9 FO393408.1-201ENST00000458577 582 ntTSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
USP17L12C9JPN9 TIPARP-AS1-202ENST00000478005 554 ntTSL 4 BASIC5.82□□□□□ -1.48
USP17L12C9JPN9 AP006587.4-201ENST00000526053 529 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
USP17L12C9JPN9 AC004817.2-201ENST00000561794 651 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
USP17L12C9JPN9 AC144836.1-201ENST00000575911 340 ntTSL 2 BASIC5.82□□□□□ -1.48
USP17L12C9JPN9 AC104763.2-201ENST00000604179 382 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
USP17L12C9JPN9 AC011890.2-201ENST00000613393 294 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
USP17L12C9JPN9 RNF123-214ENST00000629802 207 ntTSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
USP17L12C9JPN9 CAPZA2-215ENST00000639546 129 ntTSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
USP17L12C9JPN9 NLRP11-202ENST00000589824 3231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
USP17L12C9JPN9 ANO6-205ENST00000441606 5955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
USP17L12C9JPN9 DTHD1-205ENST00000507598 2606 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
USP17L12C9JPN9 CDKL3-209ENST00000523054 1775 ntTSL 2 BASIC5.82□□□□□ -1.48
USP17L12C9JPN9 CBLL1-201ENST00000222597 2003 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
USP17L12C9JPN9 TMEM68-202ENST00000434581 2549 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
USP17L12C9JPN9 OR5AU1-203ENST00000641697 7755 ntAPPRIS P1 BASIC5.82□□□□□ -1.48
USP17L12C9JPN9 MAP2-205ENST00000392194 5303 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
USP17L12C9JPN9 GOLPH3L-201ENST00000271732 2999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
USP17L12C9JPN9 MED13-201ENST00000397786 10465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
USP17L12C9JPN9 ZC3H12B-201ENST00000338957 7256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
USP17L12C9JPN9 GRIA2-202ENST00000296526 5621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
USP17L12C9JPN9 CCDC82-202ENST00000423339 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
USP17L12C9JPN9 AC016576.1-201ENST00000637153 3585 ntTSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
USP17L12C9JPN9 OR8H2-201ENST00000313503 3088 ntAPPRIS P2 BASIC5.81□□□□□ -1.48
USP17L12C9JPN9 TRBV21OR9-2-201ENST00000331828 367 ntAPPRIS P1 BASIC5.81□□□□□ -1.48
USP17L12C9JPN9 RNVU1-6-201ENST00000364688 164 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
USP17L12C9JPN9 RNU6-890P-201ENST00000384121 107 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
USP17L12C9JPN9 MRPL42P3-201ENST00000401492 326 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
USP17L12C9JPN9 RNU6ATAC16P-201ENST00000408591 138 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
USP17L12C9JPN9 RNU6-985P-201ENST00000410182 104 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
USP17L12C9JPN9 RNU2-43P-201ENST00000410306 190 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
USP17L12C9JPN9 AC018865.2-201ENST00000423631 129 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
USP17L12C9JPN9 AC091153.2-202ENST00000441700 384 ntTSL 3 BASIC5.81□□□□□ -1.48
USP17L12C9JPN9 RPL29P29-201ENST00000448725 423 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
USP17L12C9JPN9 AC104472.2-201ENST00000469035 601 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
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USP17L12C9JPN9 Y_RNA.689-201ENST00000516589 107 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
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USP17L12C9JPN9 AL391358.1-201ENST00000605342 190 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
USP17L12C9JPN9 AL450472.3-201ENST00000615578 367 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
USP17L12C9JPN9 GTDC1-202ENST00000344850 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
USP17L12C9JPN9 LINC00504-201ENST00000505089 4672 ntTSL 2 BASIC5.81□□□□□ -1.48
USP17L12C9JPN9 LCMT1-AS2-202ENST00000565214 5666 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
USP17L12C9JPN9 DPY19L2P2-203ENST00000435536 1858 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
USP17L12C9JPN9 SDAD1P1-202ENST00000524156 2051 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
USP17L12C9JPN9 MLH3-210ENST00000556257 4229 ntTSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
USP17L12C9JPN9 GPR34-201ENST00000378138 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
USP17L12C9JPN9 FLG2-201ENST00000388718 9124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
USP17L12C9JPN9 AC090971.4-201ENST00000560291 1800 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
USP17L12C9JPN9 C1orf112-201ENST00000286031 4355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
USP17L12C9JPN9 DUSP19-202ENST00000354221 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
USP17L12C9JPN9 WDR35-202ENST00000345530 6960 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
USP17L12C9JPN9 ZNF567-203ENST00000585696 3734 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
USP17L12C9JPN9 TIPARP-207ENST00000542783 3681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
USP17L12C9JPN9 GRID2-208ENST00000611049 4844 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
USP17L12C9JPN9 TRPM3-209ENST00000377110 12258 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
USP17L12C9JPN9 SNORA5.1-201ENST00000384275 131 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
USP17L12C9JPN9 TRAV24-201ENST00000390453 343 ntAPPRIS P1 BASIC5.8□□□□□ -1.48
USP17L12C9JPN9 AMMECR1LP1-201ENST00000415152 841 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
USP17L12C9JPN9 AL449043.1-202ENST00000427318 582 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
USP17L12C9JPN9 MTCYBP9-201ENST00000431021 303 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
USP17L12C9JPN9 PLCE1-AS2-203ENST00000433038 396 ntTSL 2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
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