Protein–RNA interactions for Protein: Q9H2S5

RNF39, RING finger protein 39, humanhuman

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Length 420 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF39Q9H2S5 SLC4A8-203ENST00000453097 11824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
RNF39Q9H2S5 RPL24P4-201ENST00000326586 421 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
RNF39Q9H2S5 SNORD116-10-201ENST00000363791 102 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
RNF39Q9H2S5 SNORD45B-201ENST00000364617 72 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
RNF39Q9H2S5 AC026310.1-201ENST00000396004 378 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
RNF39Q9H2S5 U3.36-201ENST00000408418 213 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
RNF39Q9H2S5 AL451081.1-201ENST00000413159 245 ntTSL 3 BASIC7.48□□□□□ -1.21
RNF39Q9H2S5 Z75741.1-201ENST00000446793 314 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
RNF39Q9H2S5 AC097463.1-201ENST00000447288 481 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
RNF39Q9H2S5 AC005165.2-201ENST00000466070 380 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
RNF39Q9H2S5 RN7SL502P-201ENST00000481857 290 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
RNF39Q9H2S5 AC091544.4-201ENST00000555268 342 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
RNF39Q9H2S5 HSPE1P19-201ENST00000603327 295 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
RNF39Q9H2S5 AL591034.3-201ENST00000605511 685 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
RNF39Q9H2S5 AC061999.1-201ENST00000624454 177 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
RNF39Q9H2S5 HHIP-201ENST00000296575 10072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
RNF39Q9H2S5 ZNF555-201ENST00000334241 8557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
RNF39Q9H2S5 GUSBP1-205ENST00000607545 4157 ntTSL 2 BASIC7.48□□□□□ -1.21
RNF39Q9H2S5 SEPT14-201ENST00000388975 3785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.48□□□□□ -1.21
RNF39Q9H2S5 MYO3A-203ENST00000376302 2723 ntTSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
RNF39Q9H2S5 CSDE1-218ENST00000610726 4312 ntTSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
RNF39Q9H2S5 A2M-201ENST00000318602 4844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
RNF39Q9H2S5 DOCK2-211ENST00000520908 4654 ntTSL 2 BASIC7.48□□□□□ -1.21
RNF39Q9H2S5 RNASEL-201ENST00000367559 4238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
RNF39Q9H2S5 PARD3-212ENST00000544292 2475 ntTSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
RNF39Q9H2S5 ESRG-201ENST00000583516 3140 ntTSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
RNF39Q9H2S5 SLC38A2-209ENST00000551374 2802 ntTSL 2 BASIC7.47□□□□□ -1.21
RNF39Q9H2S5 SIPA1L1-203ENST00000537413 4129 ntTSL 2 BASIC7.47□□□□□ -1.21
RNF39Q9H2S5 PTPRR-202ENST00000342084 2037 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.47□□□□□ -1.21
RNF39Q9H2S5 CACNA1C-220ENST00000399655 13433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
RNF39Q9H2S5 BRD8-202ENST00000254900 4388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
RNF39Q9H2S5 MTM1-203ENST00000370396 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
RNF39Q9H2S5 RGS22-215ENST00000523437 3975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
RNF39Q9H2S5 RNA5SP308-201ENST00000362532 115 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
RNF39Q9H2S5 SNORD56.1-201ENST00000362913 68 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
RNF39Q9H2S5 SNORA7A-201ENST00000384765 139 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
RNF39Q9H2S5 RN7SKP293-201ENST00000411389 296 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
RNF39Q9H2S5 AL662874.1-201ENST00000426065 230 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
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RNF39Q9H2S5 RPL23AP1-201ENST00000428990 471 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
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RNF39Q9H2S5 AC018761.4-201ENST00000585742 272 ntTSL 3 BASIC7.47□□□□□ -1.21
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RNF39Q9H2S5 KIF4A-201ENST00000374403 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
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RNF39Q9H2S5 CYP4F32P-201ENST00000426492 504 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
RNF39Q9H2S5 AC244670.1-201ENST00000436879 112 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
RNF39Q9H2S5 RPL23AP28-201ENST00000448062 470 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
RNF39Q9H2S5 AC005017.1-201ENST00000482002 490 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
RNF39Q9H2S5 TOMM22P4-201ENST00000511318 336 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
RNF39Q9H2S5 RNA5SP278-201ENST00000517055 102 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
RNF39Q9H2S5 AC087752.2-201ENST00000521219 281 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
RNF39Q9H2S5 IGKV2D-19-201ENST00000523346 262 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
RNF39Q9H2S5 AC140063.1-201ENST00000541343 259 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
RNF39Q9H2S5 GNG2-203ENST00000553432 577 ntTSL 4 BASIC7.46□□□□□ -1.22
RNF39Q9H2S5 AL355922.1-201ENST00000555624 337 ntTSL 3 BASIC7.46□□□□□ -1.22
RNF39Q9H2S5 AC019159.1-201ENST00000605094 187 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
RNF39Q9H2S5 PRLR-201ENST00000231423 1679 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
RNF39Q9H2S5 NAV2-216ENST00000540292 11003 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
RNF39Q9H2S5 BEST3-212ENST00000553096 2929 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
RNF39Q9H2S5 AASDH-203ENST00000502617 3004 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
RNF39Q9H2S5 STXBP4-204ENST00000434978 2807 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
RNF39Q9H2S5 SELP-203ENST00000367788 2427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
RNF39Q9H2S5 ZFP90-201ENST00000398253 4384 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC7.45□□□□□ -1.22
RNF39Q9H2S5 OR2T2-203ENST00000642130 3331 ntAPPRIS P1 BASIC7.45□□□□□ -1.22
RNF39Q9H2S5 AL033384.1-202ENST00000431554 3104 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
RNF39Q9H2S5 UTY-213ENST00000612274 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
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