Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYQ3

KRTAP9-3, Keratin-associated protein 9-3, humanhuman

Predictions only

Length 159 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP9-3Q9BYQ3 DTHD1-206ENST00000639862 3819 ntTSL 5 BASIC2.92□□□□□ -1.94
KRTAP9-3Q9BYQ3 ZBTB40-204ENST00000404138 8992 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.92□□□□□ -1.94
KRTAP9-3Q9BYQ3 ABCA6-201ENST00000284425 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.92□□□□□ -1.94
KRTAP9-3Q9BYQ3 DYRK1A-201ENST00000338785 5498 ntTSL 1 (best) BASIC2.92□□□□□ -1.94
KRTAP9-3Q9BYQ3 ZNF836-201ENST00000322146 2811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.92□□□□□ -1.94
KRTAP9-3Q9BYQ3 MYO3A-203ENST00000376302 2723 ntTSL 1 (best) BASIC2.91□□□□□ -1.94
KRTAP9-3Q9BYQ3 HSDL2-201ENST00000398803 2983 ntTSL 1 (best) BASIC2.91□□□□□ -1.94
KRTAP9-3Q9BYQ3 CALCOCO2-204ENST00000448105 1916 ntTSL 2 BASIC2.91□□□□□ -1.94
KRTAP9-3Q9BYQ3 AP005131.1-201ENST00000585366 4745 ntTSL 5 BASIC2.91□□□□□ -1.94
KRTAP9-3Q9BYQ3 NUP107-202ENST00000378905 2859 ntTSL 5 BASIC2.91□□□□□ -1.94
KRTAP9-3Q9BYQ3 C5orf34-201ENST00000306862 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.91□□□□□ -1.94
KRTAP9-3Q9BYQ3 ADH7-202ENST00000437033 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.91□□□□□ -1.94
KRTAP9-3Q9BYQ3 SPARCL1-205ENST00000503414 2520 ntTSL 2 BASIC2.91□□□□□ -1.94
KRTAP9-3Q9BYQ3 CYFIP1-208ENST00000617928 6793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.91□□□□□ -1.94
KRTAP9-3Q9BYQ3 C11orf72-201ENST00000333139 2431 ntTSL 2 BASIC2.91□□□□□ -1.94
KRTAP9-3Q9BYQ3 NUP98-202ENST00000355260 5628 ntTSL 5 BASIC2.91□□□□□ -1.94
KRTAP9-3Q9BYQ3 CCDC30-201ENST00000340612 2664 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.91□□□□□ -1.94
KRTAP9-3Q9BYQ3 NXF2-202ENST00000625106 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.91□□□□□ -1.94
KRTAP9-3Q9BYQ3 OR13C1P-202ENST00000641378 2919 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
KRTAP9-3Q9BYQ3 PPARA-203ENST00000407236 9995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.91□□□□□ -1.94
KRTAP9-3Q9BYQ3 ZNF711-203ENST00000373165 4124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.91□□□□□ -1.94
KRTAP9-3Q9BYQ3 CTAGE15-201ENST00000420911 2587 ntAPPRIS P1 BASIC2.91□□□□□ -1.94
KRTAP9-3Q9BYQ3 AL596244.1-201ENST00000567068 3779 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
KRTAP9-3Q9BYQ3 LMO7-207ENST00000465261 5580 ntTSL 1 (best) BASIC2.91□□□□□ -1.94
KRTAP9-3Q9BYQ3 KCNMA1-273ENST00000639913 12071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.91□□□□□ -1.94
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC008957.3-201ENST00000624112 2242 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
KRTAP9-3Q9BYQ3 IL23R-205ENST00000637002 2208 ntTSL 1 (best) BASIC2.91□□□□□ -1.94
KRTAP9-3Q9BYQ3 CASC15-207ENST00000607048 1634 ntTSL 2 BASIC2.91□□□□□ -1.94
KRTAP9-3Q9BYQ3 PAPOLG-201ENST00000238714 4263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.91□□□□□ -1.94
KRTAP9-3Q9BYQ3 PPARA-201ENST00000262735 9965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.91□□□□□ -1.94
KRTAP9-3Q9BYQ3 DAZ1-206ENST00000620725 1891 ntTSL 5 BASIC2.91□□□□□ -1.94
KRTAP9-3Q9BYQ3 NBPF3-202ENST00000318249 3591 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.91□□□□□ -1.94
KRTAP9-3Q9BYQ3 MEGF10-203ENST00000503335 7571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.91□□□□□ -1.94
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC126755.2-208ENST00000327792 462 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC138969.1-213ENST00000331436 462 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
KRTAP9-3Q9BYQ3 RNU1-150P-201ENST00000362491 162 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
KRTAP9-3Q9BYQ3 SNORD114-7-201ENST00000362520 77 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
KRTAP9-3Q9BYQ3 SNORD16-201ENST00000362803 99 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
KRTAP9-3Q9BYQ3 SNORD56.1-201ENST00000362913 68 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
KRTAP9-3Q9BYQ3 RNA5SP65-201ENST00000363166 119 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
KRTAP9-3Q9BYQ3 SNORA58B-201ENST00000364259 136 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
KRTAP9-3Q9BYQ3 SNORD45B-201ENST00000364617 72 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
KRTAP9-3Q9BYQ3 SNORD87-201ENST00000364849 89 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
KRTAP9-3Q9BYQ3 RNU6-1201P-201ENST00000384227 107 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
KRTAP9-3Q9BYQ3 MIR544A-201ENST00000384855 91 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC244452.1-201ENST00000413798 141 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
KRTAP9-3Q9BYQ3 AL109914.1-201ENST00000414740 146 ntTSL 5 BASIC2.91□□□□□ -1.94
KRTAP9-3Q9BYQ3 RPL36AP10-201ENST00000421785 322 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
KRTAP9-3Q9BYQ3 RPS12P18-201ENST00000442381 270 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC010099.1-201ENST00000455434 375 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
KRTAP9-3Q9BYQ3 AL133244.1-201ENST00000456007 258 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
KRTAP9-3Q9BYQ3 RN7SL326P-201ENST00000477493 296 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
KRTAP9-3Q9BYQ3 RN7SL271P-201ENST00000487601 295 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
KRTAP9-3Q9BYQ3 COX6B1P2-201ENST00000489624 230 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
KRTAP9-3Q9BYQ3 ENPP7P11-201ENST00000505915 627 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC114781.3-201ENST00000512083 142 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
KRTAP9-3Q9BYQ3 RNA5SP434-201ENST00000516647 121 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
KRTAP9-3Q9BYQ3 RNA5SP290-201ENST00000517133 127 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
KRTAP9-3Q9BYQ3 AL160262.1-201ENST00000522264 254 ntTSL 3 BASIC2.91□□□□□ -1.94
KRTAP9-3Q9BYQ3 AP000424.2-201ENST00000523784 233 ntTSL 3 BASIC2.91□□□□□ -1.94
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC009803.1-201ENST00000551531 416 ntTSL 3 BASIC2.91□□□□□ -1.94
KRTAP9-3Q9BYQ3 ADAMTS7P4-205ENST00000560651 453 ntTSL 3 BASIC2.91□□□□□ -1.94
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC007225.2-201ENST00000562529 256 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC040977.1-201ENST00000573222 343 ntTSL 3 BASIC2.91□□□□□ -1.94
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC005703.3-201ENST00000579159 373 ntTSL 3 BASIC2.91□□□□□ -1.94
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC011476.3-202ENST00000586845 553 ntTSL 3 BASIC2.91□□□□□ -1.94
KRTAP9-3Q9BYQ3 LINC00904-201ENST00000604453 471 ntTSL 2 BASIC2.91□□□□□ -1.94
KRTAP9-3Q9BYQ3 CCL23-201ENST00000612516 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.91□□□□□ -1.94
KRTAP9-3Q9BYQ3 RN7SL787P-201ENST00000613000 284 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
KRTAP9-3Q9BYQ3 AP005431.1-201ENST00000618479 319 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
KRTAP9-3Q9BYQ3 NPPA-AS1_2.1-201ENST00000618496 149 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC034229.6-201ENST00000623704 224 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC120057.5-201ENST00000623840 154 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
KRTAP9-3Q9BYQ3 5S_rRNA.28-201ENST00000638107 119 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
KRTAP9-3Q9BYQ3 ABHD2-201ENST00000352732 8735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.91□□□□□ -1.94
KRTAP9-3Q9BYQ3 AL499616.1-201ENST00000415437 2633 ntTSL 2 BASIC2.91□□□□□ -1.94
KRTAP9-3Q9BYQ3 TLN2-211ENST00000636159 7441 ntTSL 5 BASIC2.91□□□□□ -1.94
KRTAP9-3Q9BYQ3 CU638689.4-201ENST00000623047 5990 ntTSL 5 BASIC2.91□□□□□ -1.94
KRTAP9-3Q9BYQ3 USP46-202ENST00000451218 4622 ntTSL 5 BASIC2.91□□□□□ -1.94
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC079915.1-201ENST00000584382 2780 ntTSL 2 BASIC2.91□□□□□ -1.94
KRTAP9-3Q9BYQ3 PRLR-201ENST00000231423 1679 ntTSL 1 (best) BASIC2.91□□□□□ -1.94
KRTAP9-3Q9BYQ3 TSLP-202ENST00000379706 2411 ntTSL 1 (best) BASIC2.91□□□□□ -1.94
KRTAP9-3Q9BYQ3 DEUP1-201ENST00000298050 2664 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.91□□□□□ -1.94
KRTAP9-3Q9BYQ3 SEM1-202ENST00000356686 2667 ntTSL 5 BASIC2.91□□□□□ -1.94
KRTAP9-3Q9BYQ3 NECAB1-202ENST00000521366 2908 ntTSL 1 (best) BASIC2.91□□□□□ -1.94
KRTAP9-3Q9BYQ3 NTRK3-212ENST00000558676 4670 ntTSL 1 (best) BASIC2.91□□□□□ -1.94
KRTAP9-3Q9BYQ3 ZNF112-201ENST00000337401 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.91□□□□□ -1.94
KRTAP9-3Q9BYQ3 PNPLA4-204ENST00000537427 2559 ntTSL 2 BASIC2.91□□□□□ -1.94
KRTAP9-3Q9BYQ3 TRIM34-201ENST00000429814 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.91□□□□□ -1.94
KRTAP9-3Q9BYQ3 NSD2-208ENST00000420906 5109 ntTSL 1 (best) BASIC2.91□□□□□ -1.94
KRTAP9-3Q9BYQ3 GTF2IRD2P1-201ENST00000449689 2749 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
KRTAP9-3Q9BYQ3 B4GALT4-207ENST00000467604 5794 ntTSL 1 (best) BASIC2.91□□□□□ -1.94
KRTAP9-3Q9BYQ3 ANLN-201ENST00000265748 4787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.91□□□□□ -1.94
KRTAP9-3Q9BYQ3 SLC2A14-221ENST00000616981 3366 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.91□□□□□ -1.94
KRTAP9-3Q9BYQ3 CLASP1-208ENST00000455322 5660 ntTSL 5 BASIC2.9□□□□□ -1.94
KRTAP9-3Q9BYQ3 PHF2P2-202ENST00000444553 2865 ntBASIC2.9□□□□□ -1.94
KRTAP9-3Q9BYQ3 HEATR4-202ENST00000553558 3523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.9□□□□□ -1.94
KRTAP9-3Q9BYQ3 CENPI-201ENST00000372926 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.9□□□□□ -1.94
KRTAP9-3Q9BYQ3 HEPH-203ENST00000419594 3694 ntTSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.94
KRTAP9-3Q9BYQ3 EIF4G2-205ENST00000525681 3654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 110.4 ms