Protein–RNA interactions for Protein: Q17RB0

RTL8B, Retrotransposon Gag-like protein 8B, humanhuman

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Length 113 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTL8BQ17RB0 LINC02465-201ENST00000507099 532 ntTSL 4 BASIC1.88□□□□□ -2.11
RTL8BQ17RB0 AC109927.1-202ENST00000511951 282 ntTSL 3 BASIC1.88□□□□□ -2.11
RTL8BQ17RB0 SNORA70.16-201ENST00000516390 95 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
RTL8BQ17RB0 AC083973.1-205ENST00000518994 601 ntTSL 2 BASIC1.88□□□□□ -2.11
RTL8BQ17RB0 AC009435.1-201ENST00000519555 574 ntTSL 4 BASIC1.88□□□□□ -2.11
RTL8BQ17RB0 AC104997.1-201ENST00000519761 717 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
RTL8BQ17RB0 SULT6B1-205ENST00000535679 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.88□□□□□ -2.11
RTL8BQ17RB0 AC092746.1-201ENST00000542819 562 ntTSL 4 BASIC1.88□□□□□ -2.11
RTL8BQ17RB0 LINC02460-201ENST00000543558 536 ntTSL 4 BASIC1.88□□□□□ -2.11
RTL8BQ17RB0 AP002373.1-201ENST00000544347 729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC1.88□□□□□ -2.11
RTL8BQ17RB0 AC116003.2-201ENST00000579278 748 ntTSL 2 BASIC1.88□□□□□ -2.11
RTL8BQ17RB0 AC022069.1-201ENST00000582910 658 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
RTL8BQ17RB0 AC012669.1-201ENST00000603209 283 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
RTL8BQ17RB0 AC018618.2-201ENST00000604770 446 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
RTL8BQ17RB0 AL033523.1-201ENST00000605153 153 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
RTL8BQ17RB0 UCA1.1-201ENST00000620952 75 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
RTL8BQ17RB0 TRAPPC13-208ENST00000505553 1410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC1.88□□□□□ -2.11
RTL8BQ17RB0 CASC1-205ENST00000545133 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC1.88□□□□□ -2.11
RTL8BQ17RB0 KTN1-223ENST00000555573 1712 ntTSL 2 BASIC1.88□□□□□ -2.11
RTL8BQ17RB0 CPXCR1-201ENST00000276127 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.88□□□□□ -2.11
RTL8BQ17RB0 RNU6-444P-201ENST00000383988 108 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
RTL8BQ17RB0 RNU6-441P-201ENST00000384545 106 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
RTL8BQ17RB0 RNA5SP354-201ENST00000391247 136 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
RTL8BQ17RB0 RPS4XP8-201ENST00000402039 771 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
RTL8BQ17RB0 STAT4-203ENST00000409995 709 ntTSL 5 BASIC1.87□□□□□ -2.11
RTL8BQ17RB0 NANOGP5-201ENST00000424456 877 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
RTL8BQ17RB0 AL365496.1-201ENST00000426885 215 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
RTL8BQ17RB0 RPS15AP28-201ENST00000435088 386 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
RTL8BQ17RB0 SDAD1P2-201ENST00000441308 2028 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
RTL8BQ17RB0 RAB11AP1-201ENST00000442978 646 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
RTL8BQ17RB0 AC002383.1-201ENST00000448260 671 ntTSL 5 BASIC1.87□□□□□ -2.11
RTL8BQ17RB0 AC011753.1-201ENST00000451001 220 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
RTL8BQ17RB0 RPS3P1-201ENST00000456781 192 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
RTL8BQ17RB0 AC092798.1-201ENST00000458542 409 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
RTL8BQ17RB0 AC015724.1-201ENST00000478577 156 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
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RTL8BQ17RB0 AC008696.2-201ENST00000503323 825 ntTSL 3 BASIC1.87□□□□□ -2.11
RTL8BQ17RB0 LINC02229-201ENST00000508486 661 ntTSL 3 BASIC1.87□□□□□ -2.11
RTL8BQ17RB0 SMARCAD1-206ENST00000509418 2348 ntTSL 2 BASIC1.87□□□□□ -2.11
RTL8BQ17RB0 LINC00824-201ENST00000517583 805 ntTSL 5 BASIC1.87□□□□□ -2.11
RTL8BQ17RB0 MRPL42-204ENST00000548545 692 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC1.87□□□□□ -2.11
RTL8BQ17RB0 LINC02386-203ENST00000552182 501 ntTSL 3 BASIC1.87□□□□□ -2.11
RTL8BQ17RB0 AC068643.2-202ENST00000552759 622 ntTSL 3 BASIC1.87□□□□□ -2.11
RTL8BQ17RB0 TRAV28-201ENST00000557548 323 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
RTL8BQ17RB0 AC090888.1-201ENST00000561335 1141 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
RTL8BQ17RB0 LINC01290-201ENST00000566787 502 ntTSL 2 BASIC1.87□□□□□ -2.11
RTL8BQ17RB0 VN1R78P-201ENST00000597393 564 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
RTL8BQ17RB0 UBE2Q2P2-203ENST00000613592 761 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
RTL8BQ17RB0 AC025588.4-201ENST00000615802 908 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
RTL8BQ17RB0 AC009159.1-201ENST00000618386 642 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
RTL8BQ17RB0 MIR6766-201ENST00000622641 72 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
RTL8BQ17RB0 CTSLP2-204ENST00000629029 392 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
RTL8BQ17RB0 AC119674.1-220ENST00000641502 1048 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
RTL8BQ17RB0 RNF128-202ENST00000324342 2654 ntTSL 1 (best) BASIC1.87□□□□□ -2.11
RTL8BQ17RB0 ANP32E-209ENST00000616917 2989 ntTSL 2 BASIC1.86□□□□□ -2.11
RTL8BQ17RB0 SPAM1-206ENST00000460182 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.86□□□□□ -2.11
RTL8BQ17RB0 AC111188.2-201ENST00000529697 1387 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
RTL8BQ17RB0 SENP7-205ENST00000394091 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.86□□□□□ -2.11
RTL8BQ17RB0 FTLP6-201ENST00000355274 422 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
RTL8BQ17RB0 IVNS1ABP-201ENST00000367497 746 ntTSL 5 BASIC1.86□□□□□ -2.11
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RTL8BQ17RB0 RNU1-52P-201ENST00000384190 164 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
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RTL8BQ17RB0 AC107081.1-201ENST00000414975 361 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
RTL8BQ17RB0 LINC01318-201ENST00000423593 597 ntTSL 4 BASIC1.86□□□□□ -2.11
RTL8BQ17RB0 MORF4L1P7-201ENST00000426038 703 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
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RTL8BQ17RB0 AC104073.1-201ENST00000451988 151 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
RTL8BQ17RB0 CCNB1IP1P3-201ENST00000454702 829 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
RTL8BQ17RB0 ANKRD36B-207ENST00000497329 649 ntTSL 1 (best) BASIC1.86□□□□□ -2.11
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RTL8BQ17RB0 AC040168.1-201ENST00000623594 991 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
RTL8BQ17RB0 CU459211.1-201ENST00000635667 749 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
RTL8BQ17RB0 MTND4P1-201ENST00000457501 1466 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
RTL8BQ17RB0 ZBED5-201ENST00000413761 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.86□□□□□ -2.11
RTL8BQ17RB0 AC009902.3-201ENST00000606235 2172 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
RTL8BQ17RB0 TAS2R13-201ENST00000390677 1637 ntAPPRIS P1 BASIC1.85□□□□□ -2.11
RTL8BQ17RB0 AC009812.4-201ENST00000569134 1805 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
RTL8BQ17RB0 HOMER1-201ENST00000282260 774 ntTSL 1 (best) BASIC1.85□□□□□ -2.11
RTL8BQ17RB0 RNU6-173P-201ENST00000364215 104 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
RTL8BQ17RB0 STATH-202ENST00000381060 534 ntTSL 1 (best) BASIC1.85□□□□□ -2.11
RTL8BQ17RB0 RNU6-1151P-201ENST00000384684 107 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
RTL8BQ17RB0 AL136372.1-201ENST00000403060 228 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
RTL8BQ17RB0 ATF1P1-201ENST00000406040 927 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
RTL8BQ17RB0 TATDN1P1-201ENST00000414123 891 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
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