Protein–RNA interactions for Protein: Q16878

CDO1, Cysteine dioxygenase type 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDO1Q16878 SLC30A6-203ENST00000379343 2354 ntTSL 1 (best) BASIC3.36□□□□□ -1.87
CDO1Q16878 AC009975.2-201ENST00000635306 1429 ntTSL 5 BASIC3.36□□□□□ -1.87
CDO1Q16878 ZNF883-201ENST00000619044 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.35□□□□□ -1.87
CDO1Q16878 AC005550.3-201ENST00000451240 3743 ntTSL 1 (best) BASIC3.35□□□□□ -1.87
CDO1Q16878 SAGE1-203ENST00000537770 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.35□□□□□ -1.87
CDO1Q16878 LRMP-221ENST00000636465 4540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.35□□□□□ -1.87
CDO1Q16878 PEX3-201ENST00000367591 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.35□□□□□ -1.87
CDO1Q16878 RNU6-853P-201ENST00000364306 107 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
CDO1Q16878 RNU6-723P-201ENST00000383973 107 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
CDO1Q16878 Y_RNA.548-201ENST00000384656 105 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
CDO1Q16878 RNU6-328P-201ENST00000390887 106 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
CDO1Q16878 RPS7P13-201ENST00000413955 498 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
CDO1Q16878 AC093865.1-201ENST00000415387 433 ntTSL 3 BASIC3.35□□□□□ -1.87
CDO1Q16878 AC007390.1-201ENST00000415722 356 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
CDO1Q16878 AC005326.1-201ENST00000429197 123 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
CDO1Q16878 DIAPH2-AS1-202ENST00000445414 606 ntTSL 2 BASIC3.35□□□□□ -1.87
CDO1Q16878 Z75741.1-201ENST00000446793 314 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
CDO1Q16878 AC104978.1-201ENST00000449387 391 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
CDO1Q16878 LINC01546-201ENST00000457435 674 ntTSL 2 BASIC3.35□□□□□ -1.87
CDO1Q16878 AC021382.1-201ENST00000483523 359 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
CDO1Q16878 AC126121.2-201ENST00000486137 698 ntTSL 3 BASIC3.35□□□□□ -1.87
CDO1Q16878 RPL7P23-201ENST00000493874 747 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
CDO1Q16878 NREP-AS1-201ENST00000503242 411 ntTSL 3 BASIC3.35□□□□□ -1.87
CDO1Q16878 LINC02496-201ENST00000509559 584 ntTSL 3 BASIC3.35□□□□□ -1.87
CDO1Q16878 AC110751.1-201ENST00000511916 462 ntTSL 3 BASIC3.35□□□□□ -1.87
CDO1Q16878 RNU1-143P-201ENST00000516296 146 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
CDO1Q16878 MRPS36P3-201ENST00000519284 130 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
CDO1Q16878 AC103952.1-201ENST00000521872 590 ntTSL 3 BASIC3.35□□□□□ -1.87
CDO1Q16878 AC092747.1-201ENST00000538920 351 ntTSL 5 BASIC3.35□□□□□ -1.87
CDO1Q16878 AC125611.2-201ENST00000551907 647 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
CDO1Q16878 FOPNL-204ENST00000573396 735 ntTSL 3 BASIC3.35□□□□□ -1.87
CDO1Q16878 MIR2682-201ENST00000580305 110 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
CDO1Q16878 AC006116.8-203ENST00000587448 465 ntTSL 3 BASIC3.35□□□□□ -1.87
CDO1Q16878 U1.23-201ENST00000610293 146 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
CDO1Q16878 AC087683.2-201ENST00000611384 326 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
CDO1Q16878 uc_338.25-201ENST00000613756 156 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
CDO1Q16878 AL392048.1-201ENST00000613946 534 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
CDO1Q16878 PDCD6IPP1-201ENST00000615124 579 ntTSL 2 BASIC3.35□□□□□ -1.87
CDO1Q16878 RNU1-68P-201ENST00000615382 146 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
CDO1Q16878 AL450472.3-201ENST00000615578 367 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
CDO1Q16878 AC021755.4-201ENST00000616620 456 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
CDO1Q16878 U1.39-201ENST00000621562 146 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
CDO1Q16878 AC068631.1-219ENST00000625826 668 ntTSL 5 BASIC3.35□□□□□ -1.87
CDO1Q16878 AC007218.2-201ENST00000636913 179 ntTSL 5 BASIC3.35□□□□□ -1.87
CDO1Q16878 SLAIN1-203ENST00000351546 2394 ntTSL 2 BASIC3.35□□□□□ -1.87
CDO1Q16878 ATF2-221ENST00000538946 1325 ntTSL 5 BASIC3.35□□□□□ -1.87
CDO1Q16878 BCLAF3-202ENST00000379682 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.35□□□□□ -1.87
CDO1Q16878 WDR49-201ENST00000308378 2594 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.35□□□□□ -1.87
CDO1Q16878 PTPN22-207ENST00000528414 3424 ntTSL 1 (best) BASIC3.35□□□□□ -1.87
CDO1Q16878 VNN1-201ENST00000367928 3106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.35□□□□□ -1.87
CDO1Q16878 SLC35A1-201ENST00000369552 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.35□□□□□ -1.87
CDO1Q16878 EVI2A-202ENST00000461237 1540 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC3.34□□□□□ -1.87
CDO1Q16878 AL050331.3-201ENST00000448740 2081 ntTSL 2 BASIC3.34□□□□□ -1.87
CDO1Q16878 NUDT12-201ENST00000230792 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.34□□□□□ -1.87
CDO1Q16878 CDK1-201ENST00000316629 1733 ntTSL 5 BASIC3.34□□□□□ -1.87
CDO1Q16878 AC004972.1-201ENST00000623934 2209 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
CDO1Q16878 ABCD2-201ENST00000308666 6238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.34□□□□□ -1.87
CDO1Q16878 SNORD56.3-201ENST00000363507 71 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
CDO1Q16878 RNA5SP72-201ENST00000364442 117 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
CDO1Q16878 RNU6-1078P-201ENST00000364522 103 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
CDO1Q16878 MIR493-201ENST00000385254 89 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
CDO1Q16878 AF130351.1-202ENST00000400562 808 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC3.34□□□□□ -1.87
CDO1Q16878 SKINT1L-201ENST00000401057 817 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
CDO1Q16878 ZRANB2-AS2-201ENST00000411721 518 ntTSL 3 BASIC3.34□□□□□ -1.87
CDO1Q16878 LINC00845-201ENST00000417931 696 ntTSL 2 BASIC3.34□□□□□ -1.87
CDO1Q16878 RPL31P12-201ENST00000422587 358 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
CDO1Q16878 AL035407.1-201ENST00000429211 571 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
CDO1Q16878 AL357793.2-201ENST00000447056 850 ntTSL 3 BASIC3.34□□□□□ -1.87
CDO1Q16878 Z98749.1-201ENST00000454123 541 ntTSL 5 BASIC3.34□□□□□ -1.87
CDO1Q16878 MTND2P14-201ENST00000482139 351 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
CDO1Q16878 LINC02447-203ENST00000504402 292 ntTSL 3 BASIC3.34□□□□□ -1.87
CDO1Q16878 AC008652.1-201ENST00000505261 469 ntTSL 3 BASIC3.34□□□□□ -1.87
CDO1Q16878 AC110794.1-201ENST00000505816 425 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
CDO1Q16878 AC018752.1-201ENST00000507813 206 ntTSL 5 BASIC3.34□□□□□ -1.87
CDO1Q16878 AC022483.1-201ENST00000514020 567 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
CDO1Q16878 AP003730.2-201ENST00000526385 546 ntTSL 3 BASIC3.34□□□□□ -1.87
CDO1Q16878 AP003086.2-201ENST00000534168 437 ntTSL 3 BASIC3.34□□□□□ -1.87
CDO1Q16878 AC022509.2-201ENST00000540392 699 ntTSL 3 BASIC3.34□□□□□ -1.87
CDO1Q16878 GLIPR1L1-204ENST00000548623 484 ntTSL 3 BASIC3.34□□□□□ -1.87
CDO1Q16878 ELOCP32-201ENST00000548625 324 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
CDO1Q16878 AC055876.1-202ENST00000567053 138 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
CDO1Q16878 AC104534.1-201ENST00000594558 566 ntTSL 4 BASIC3.34□□□□□ -1.87
CDO1Q16878 LINC01515-204ENST00000595269 402 ntTSL 5 BASIC3.34□□□□□ -1.87
CDO1Q16878 AC024563.1-202ENST00000597533 419 ntTSL 3 BASIC3.34□□□□□ -1.87
CDO1Q16878 AL606834.2-201ENST00000602954 668 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
CDO1Q16878 AC110741.2-201ENST00000605278 268 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
CDO1Q16878 AL390240.1-201ENST00000612950 384 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
CDO1Q16878 AC244517.5-201ENST00000624139 722 ntTSL 3 BASIC3.34□□□□□ -1.87
CDO1Q16878 AP000676.4-201ENST00000624659 623 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
CDO1Q16878 PAPOLA-202ENST00000392990 2588 ntTSL 5 BASIC3.34□□□□□ -1.88
CDO1Q16878 TFEC-203ENST00000393485 2704 ntTSL 2 BASIC3.34□□□□□ -1.88
CDO1Q16878 SLC9C1-205ENST00000487372 3979 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.34□□□□□ -1.88
CDO1Q16878 FAP-201ENST00000188790 2780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.34□□□□□ -1.88
CDO1Q16878 CLOCK-201ENST00000309964 10304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.33□□□□□ -1.88
CDO1Q16878 AGTR1-208ENST00000475347 1669 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.33□□□□□ -1.88
CDO1Q16878 AC009812.4-201ENST00000569134 1805 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
CDO1Q16878 FAM214A-216ENST00000619572 3548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.33□□□□□ -1.88
CDO1Q16878 DST-204ENST00000361203 22431 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.33□□□□□ -1.88
CDO1Q16878 HELZ-201ENST00000358691 13810 ntTSL 1 (best) BASIC3.33□□□□□ -1.88
CDO1Q16878 Y_RNA.18-201ENST00000362461 102 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
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