Protein–RNA interactions for Protein: Q16849

PTPRN, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase-like N, humanhuman

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Length 979 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRNQ16849 AL513550.1-201ENST00000418945 1638 ntTSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
PTPRNQ16849 STRBP-204ENST00000447404 6161 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
PTPRNQ16849 GPR85-202ENST00000424100 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
PTPRNQ16849 PIAS2-204ENST00000585916 11075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
PTPRNQ16849 AQP9-202ENST00000536493 2803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
PTPRNQ16849 TPTE2P2-202ENST00000605924 2113 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
PTPRNQ16849 FBXO3-208ENST00000530401 7410 ntTSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
PTPRNQ16849 GTDC1-201ENST00000241391 2356 ntTSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
PTPRNQ16849 CTAGE5-217ENST00000557038 2869 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
PTPRNQ16849 PPIAL4G-201ENST00000419275 3856 ntAPPRIS P1 BASIC5.84□□□□□ -1.47
PTPRNQ16849 CDC123-202ENST00000378900 933 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
PTPRNQ16849 RPL21P67-201ENST00000402896 478 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
PTPRNQ16849 AC007271.1-201ENST00000428188 382 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
PTPRNQ16849 ELOCP18-201ENST00000434209 337 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
PTPRNQ16849 INTS6-AS1-201ENST00000434512 466 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
PTPRNQ16849 AC090774.1-201ENST00000435925 246 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
PTPRNQ16849 USP9YP7-201ENST00000436723 430 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
PTPRNQ16849 GAPDHP58-201ENST00000438477 1006 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
PTPRNQ16849 AL050349.1-201ENST00000441029 401 ntTSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
PTPRNQ16849 RANP8-201ENST00000444720 713 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
PTPRNQ16849 USP9YP32-201ENST00000452432 430 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
PTPRNQ16849 RN7SL610P-201ENST00000463845 291 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
PTPRNQ16849 RN7SL570P-201ENST00000484405 292 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
PTPRNQ16849 WASHC5-AS1-201ENST00000519140 587 ntTSL 4 BASIC5.84□□□□□ -1.47
PTPRNQ16849 ST3GAL3-233ENST00000531816 344 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
PTPRNQ16849 SNHG1-211ENST00000539921 1071 ntTSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
PTPRNQ16849 AC073655.2-202ENST00000547927 401 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
PTPRNQ16849 AL049872.1-201ENST00000556323 322 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
PTPRNQ16849 AC009107.1-201ENST00000561923 330 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
PTPRNQ16849 AC006115.2-201ENST00000596823 202 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
PTPRNQ16849 AC098826.3-201ENST00000603823 466 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
PTPRNQ16849 Y_RNA.772-201ENST00000606692 102 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
PTPRNQ16849 AC074140.1-201ENST00000621617 208 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
PTPRNQ16849 SNX18P3-202ENST00000565670 1750 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
PTPRNQ16849 LRRC37A3-204ENST00000400877 3273 ntTSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
PTPRNQ16849 FILIP1L-201ENST00000331335 4219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
PTPRNQ16849 SGO2-201ENST00000357799 4214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
PTPRNQ16849 AC140479.2-201ENST00000421567 3130 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
PTPRNQ16849 PPFIBP1-201ENST00000228425 5933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
PTPRNQ16849 RUFY3-202ENST00000381006 3098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
PTPRNQ16849 C15orf41-201ENST00000338183 2578 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
PTPRNQ16849 PRO1804-201ENST00000623780 2050 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
PTPRNQ16849 OR7C1-204ENST00000642000 11290 ntAPPRIS P1 BASIC5.84□□□□□ -1.47
PTPRNQ16849 CTAGE5-204ENST00000341749 2912 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.48
PTPRNQ16849 AIG1-208ENST00000494282 3393 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.48
PTPRNQ16849 AC007159.1-201ENST00000566529 4706 ntBASIC5.84□□□□□ -1.48
PTPRNQ16849 CLSPN-202ENST00000318121 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.48
PTPRNQ16849 GCSAML-210ENST00000536561 4063 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC5.84□□□□□ -1.48
PTPRNQ16849 ZNF569-203ENST00000392150 1918 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.48
PTPRNQ16849 VEZF1-204ENST00000584396 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
PTPRNQ16849 CPS1-IT1-201ENST00000628368 2306 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
PTPRNQ16849 PROM1-201ENST00000447510 3977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
PTPRNQ16849 MAPK10-261ENST00000641050 3109 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
PTPRNQ16849 ZNF479-201ENST00000319636 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
PTPRNQ16849 SLC12A1-205ENST00000558405 3426 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
PTPRNQ16849 WDPCP-203ENST00000409120 5408 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
PTPRNQ16849 TESPA1-203ENST00000524622 4188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
PTPRNQ16849 YPEL5-204ENST00000402003 2197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
PTPRNQ16849 TBC1D15-210ENST00000485960 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
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PTPRNQ16849 RIMS1-206ENST00000425662 2799 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
PTPRNQ16849 AL050403.1-201ENST00000448859 2006 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
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PTPRNQ16849 ELAVL2-204ENST00000397312 3805 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
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PTPRNQ16849 EIF4A1P7-201ENST00000421800 1220 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
PTPRNQ16849 AC099336.2-201ENST00000422457 254 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
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PTPRNQ16849 AC009487.1-201ENST00000444164 403 ntTSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
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PTPRNQ16849 AL441989.1-201ENST00000454204 382 ntTSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
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PTPRNQ16849 AP006245.2-201ENST00000522004 300 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
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PTPRNQ16849 MIR4700-201ENST00000578311 74 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
PTPRNQ16849 AC022884.2-201ENST00000578535 580 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
PTPRNQ16849 AC009314.1-201ENST00000603871 304 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
PTPRNQ16849 AC004852.3-201ENST00000614131 326 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
PTPRNQ16849 LAMTOR5-AS1-244ENST00000629484 780 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
PTPRNQ16849 RMDN2-204ENST00000406384 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
PTPRNQ16849 TIPARP-207ENST00000542783 3681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
PTPRNQ16849 AL022344.1-201ENST00000439913 3965 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
PTPRNQ16849 PPEF1-202ENST00000361511 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
PTPRNQ16849 CALN1-204ENST00000405452 8571 ntTSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
PTPRNQ16849 APAF1-208ENST00000549007 3492 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
PTPRNQ16849 AC007681.1-201ENST00000604271 3438 ntTSL 4 BASIC5.83□□□□□ -1.48
PTPRNQ16849 TDRD5-202ENST00000367614 3632 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.82□□□□□ -1.48
PTPRNQ16849 STK3-216ENST00000523601 3107 ntTSL 2 BASIC5.82□□□□□ -1.48
PTPRNQ16849 MFSD8-239ENST00000641590 2479 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
PTPRNQ16849 AP004607.3-201ENST00000530354 3915 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
PTPRNQ16849 EPC2-201ENST00000258484 3649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
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