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| FXN | Q16595 | CRISP1-202 | ENST00000335847 | 1911 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 4.74 | □□□□□ -1.65 | | |
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| FXN | Q16595 | SYT14-204 | ENST00000472886 | 2966 nt | APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC | 4.73 | □□□□□ -1.65 | | |
| FXN | Q16595 | KATNA1-202 | ENST00000335647 | 1684 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 4.73 | □□□□□ -1.65 | | |
| FXN | Q16595 | MS4A1-202 | ENST00000389939 | 3372 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 4.73 | □□□□□ -1.65 | | |
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| FXN | Q16595 | ENPP3-202 | ENST00000358229 | 3026 nt | TSL 1 (best) BASIC | 4.72 | □□□□□ -1.65 | | |
| FXN | Q16595 | UGT2A3-201 | ENST00000251566 | 2965 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 4.72 | □□□□□ -1.65 | | |
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| FXN | Q16595 | INPP4B-220 | ENST00000513000 | 8831 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 4.72 | □□□□□ -1.65 | | |
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| FXN | Q16595 | Y_RNA.301-201 | ENST00000364990 | 103 nt | BASIC | 4.72 | □□□□□ -1.65 | | |
| FXN | Q16595 | POU2F1-202 | ENST00000367862 | 14038 nt | APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC | 4.72 | □□□□□ -1.65 | | |
| FXN | Q16595 | GSTA3-202 | ENST00000370968 | 775 nt | TSL 1 (best) BASIC | 4.72 | □□□□□ -1.65 | | |
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| FXN | Q16595 | U3.35-201 | ENST00000408405 | 208 nt | BASIC | 4.72 | □□□□□ -1.65 | | |
| FXN | Q16595 | SNORA77-201 | ENST00000408716 | 125 nt | BASIC | 4.72 | □□□□□ -1.65 | | |
| FXN | Q16595 | AL591848.1-201 | ENST00000413092 | 322 nt | BASIC | 4.72 | □□□□□ -1.65 | | |
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| FXN | Q16595 | BX323845.1-201 | ENST00000432417 | 179 nt | BASIC | 4.72 | □□□□□ -1.65 | | |
| FXN | Q16595 | ZBTB40-IT1-201 | ENST00000438551 | 273 nt | TSL 3 BASIC | 4.72 | □□□□□ -1.65 | | |