Protein–RNA interactions for Protein: Q16595

FXN, Frataxin, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 210 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FXNQ16595 AL137076.1-201ENST00000441046 551 ntTSL 2 BASIC4.74□□□□□ -1.65
FXNQ16595 RPS11P7-201ENST00000442125 465 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
FXNQ16595 LINC01034-201ENST00000448806 277 ntTSL 3 BASIC4.74□□□□□ -1.65
FXNQ16595 AC007557.1-201ENST00000451711 541 ntTSL 2 BASIC4.74□□□□□ -1.65
FXNQ16595 AP006216.2-201ENST00000457746 333 ntTSL 5 BASIC4.74□□□□□ -1.65
FXNQ16595 snoU13.24-201ENST00000458998 104 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
FXNQ16595 RN7SL51P-201ENST00000468230 285 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
FXNQ16595 RPL21P93-201ENST00000480465 489 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
FXNQ16595 RN7SL547P-201ENST00000490793 290 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
FXNQ16595 AP001086.1-201ENST00000494882 321 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
FXNQ16595 HMGB1P22-201ENST00000505315 124 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
FXNQ16595 SNORA31.3-201ENST00000516029 96 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
FXNQ16595 RNU6-1153P-201ENST00000516760 105 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
FXNQ16595 IGKV2D-23-201ENST00000518179 286 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
FXNQ16595 IGKV2-18-201ENST00000522607 343 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
FXNQ16595 LINC01947-201ENST00000523742 566 ntTSL 4 BASIC4.74□□□□□ -1.65
FXNQ16595 AP001804.3-201ENST00000525146 880 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
FXNQ16595 AP003400.1-201ENST00000528319 231 ntTSL 5 BASIC4.74□□□□□ -1.65
FXNQ16595 AC006206.2-202ENST00000537714 648 ntTSL 5 BASIC4.74□□□□□ -1.65
FXNQ16595 NACA-211ENST00000548563 827 ntTSL 5 BASIC4.74□□□□□ -1.65
FXNQ16595 OR11H5P-201ENST00000554039 926 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
FXNQ16595 LINC02104-202ENST00000604954 599 ntTSL 3 BASIC4.74□□□□□ -1.65
FXNQ16595 AL050343.2-201ENST00000607338 280 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
FXNQ16595 Z82243.1-201ENST00000609432 473 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
FXNQ16595 AC009570.1-201ENST00000609599 745 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
FXNQ16595 DUSP12P1-201ENST00000612874 516 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
FXNQ16595 AC022467.1-201ENST00000614738 749 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
FXNQ16595 AP003400.5-201ENST00000624827 617 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
FXNQ16595 VIPR1-AS1-223ENST00000627073 451 ntTSL 5 BASIC4.74□□□□□ -1.65
FXNQ16595 VPS8-228ENST00000628962 207 ntTSL 5 BASIC4.74□□□□□ -1.65
FXNQ16595 AC092442.1-201ENST00000636216 138 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.74□□□□□ -1.65
FXNQ16595 TMEM71-201ENST00000356838 1993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
FXNQ16595 TMEM71-210ENST00000523829 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.74□□□□□ -1.65
FXNQ16595 PTCD2-202ENST00000380639 11151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.74□□□□□ -1.65
FXNQ16595 AC011266.1-201ENST00000624119 3569 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
FXNQ16595 LRFN5-204ENST00000554171 4253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
FXNQ16595 CRISP1-202ENST00000335847 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
FXNQ16595 AC121333.1-201ENST00000567488 2709 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
FXNQ16595 TMEM68-218ENST00000617782 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.73□□□□□ -1.65
FXNQ16595 MUC2-202ENST00000613187 4845 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
FXNQ16595 PLEKHG7-201ENST00000344636 3868 ntTSL 5 BASIC4.73□□□□□ -1.65
FXNQ16595 IGSF11-AS1-201ENST00000477009 1604 ntTSL 2 BASIC4.73□□□□□ -1.65
FXNQ16595 C11orf65-208ENST00000615746 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
FXNQ16595 GRID2-208ENST00000611049 4844 ntTSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
FXNQ16595 SNORA51.1-201ENST00000363243 140 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
FXNQ16595 RN7SKP113-201ENST00000363891 295 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
FXNQ16595 RNU6-1181P-201ENST00000384191 106 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
FXNQ16595 SNORD70.1-201ENST00000391007 85 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
FXNQ16595 RNU6-817P-201ENST00000391083 104 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
FXNQ16595 AL391361.1-201ENST00000405580 489 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
FXNQ16595 AC068481.1-202ENST00000428379 555 ntTSL 4 BASIC4.73□□□□□ -1.65
FXNQ16595 AL591212.2-201ENST00000433923 257 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
FXNQ16595 LINC01208-202ENST00000434969 827 ntTSL 2 BASIC4.73□□□□□ -1.65
FXNQ16595 KRR1-202ENST00000438169 975 ntTSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
FXNQ16595 AC092637.1-201ENST00000444745 510 ntTSL 5 BASIC4.73□□□□□ -1.65
FXNQ16595 HMGN2P21-201ENST00000447764 270 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
FXNQ16595 RNU7-66P-201ENST00000459469 62 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
FXNQ16595 RPL35AP28-201ENST00000459730 331 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
FXNQ16595 AL049874.1-201ENST00000489560 388 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
FXNQ16595 LINC01997-201ENST00000494900 429 ntTSL 2 BASIC4.73□□□□□ -1.65
FXNQ16595 AC092994.1-201ENST00000498604 279 ntTSL 3 BASIC4.73□□□□□ -1.65
FXNQ16595 FXN-205ENST00000498653 856 ntTSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
FXNQ16595 RNU6-189P-201ENST00000516120 101 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
FXNQ16595 RNU6-864P-201ENST00000516256 108 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
FXNQ16595 Y_RNA.701-201ENST00000516812 110 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
FXNQ16595 SNRPGP16-201ENST00000533275 226 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
FXNQ16595 SNHG1-204ENST00000537068 629 ntTSL 5 BASIC4.73□□□□□ -1.65
FXNQ16595 AC007225.2-201ENST00000562529 256 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
FXNQ16595 AC005324.5-201ENST00000584540 571 ntTSL 5 BASIC4.73□□□□□ -1.65
FXNQ16595 AC008794.2-201ENST00000587779 293 ntTSL 2 BASIC4.73□□□□□ -1.65
FXNQ16595 AC109309.2-201ENST00000612597 332 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
FXNQ16595 AL360181.4-201ENST00000621752 134 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
FXNQ16595 Metazoa_SRP.93-201ENST00000622525 276 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
FXNQ16595 C2orf27A-204ENST00000623058 969 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
FXNQ16595 SMC2-203ENST00000374793 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
FXNQ16595 SYT14-204ENST00000472886 2966 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
FXNQ16595 KATNA1-202ENST00000335647 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
FXNQ16595 MS4A1-202ENST00000389939 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
FXNQ16595 RNMT-206ENST00000589866 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
FXNQ16595 ENPP3-202ENST00000358229 3026 ntTSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
FXNQ16595 UGT2A3-201ENST00000251566 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
FXNQ16595 AC139713.2-214ENST00000642059 1811 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
FXNQ16595 STARD4-201ENST00000296632 4606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.72□□□□□ -1.65
FXNQ16595 INPP4B-220ENST00000513000 8831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
FXNQ16595 DST-202ENST00000312431 17756 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.72□□□□□ -1.65
FXNQ16595 GSTA3-201ENST00000211122 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
FXNQ16595 RNU6-1252P-201ENST00000363054 104 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
FXNQ16595 RN7SKP162-201ENST00000363605 345 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
FXNQ16595 Y_RNA.301-201ENST00000364990 103 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
FXNQ16595 POU2F1-202ENST00000367862 14038 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
FXNQ16595 GSTA3-202ENST00000370968 775 ntTSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
FXNQ16595 Y_RNA.384-201ENST00000383909 102 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
FXNQ16595 MIR3074-201ENST00000384885 81 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
FXNQ16595 RNA5SP219-201ENST00000390940 113 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
FXNQ16595 U3.35-201ENST00000408405 208 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
FXNQ16595 SNORA77-201ENST00000408716 125 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
FXNQ16595 AL591848.1-201ENST00000413092 322 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
FXNQ16595 AC068483.1-201ENST00000413403 660 ntTSL 3 BASIC4.72□□□□□ -1.65
FXNQ16595 BX323845.1-201ENST00000432417 179 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
FXNQ16595 ZBTB40-IT1-201ENST00000438551 273 ntTSL 3 BASIC4.72□□□□□ -1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77.4 ms