Protein–RNA interactions for Protein: Q16585

SGCB, Beta-sarcoglycan, humanhuman

Predictions only

Length 318 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCBQ16585 AL136981.2-201ENST00000617319 734 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
SGCBQ16585 AC092628.2-201ENST00000622492 339 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
SGCBQ16585 AC009951.2-201ENST00000634873 644 ntTSL 5 BASIC3.16□□□□□ -1.9
SGCBQ16585 UBE2W-203ENST00000517608 8426 ntTSL 1 (best) BASIC3.16□□□□□ -1.9
SGCBQ16585 DDX10P1-201ENST00000448545 1933 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
SGCBQ16585 LMNTD1-204ENST00000458174 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.16□□□□□ -1.9
SGCBQ16585 GPRC6A-202ENST00000368549 2622 ntTSL 1 (best) BASIC3.16□□□□□ -1.9
SGCBQ16585 NBPF20-201ENST00000369373 18760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.16□□□□□ -1.9
SGCBQ16585 VPS13C-203ENST00000395896 14579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.15□□□□□ -1.9
SGCBQ16585 LINC00670-201ENST00000313495 2953 ntTSL 2 BASIC3.15□□□□□ -1.91
SGCBQ16585 OR6C70-201ENST00000327335 939 ntAPPRIS P1 BASIC3.15□□□□□ -1.91
SGCBQ16585 SNORA71.3-201ENST00000362582 128 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
SGCBQ16585 RNU6-223P-201ENST00000362830 107 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
SGCBQ16585 ESD-201ENST00000378697 1079 ntTSL 5 BASIC3.15□□□□□ -1.91
SGCBQ16585 SNORA36C-201ENST00000384289 132 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
SGCBQ16585 RNU6-83P-201ENST00000384568 112 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
SGCBQ16585 RNU6-114P-201ENST00000384704 105 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
SGCBQ16585 U3.20-201ENST00000390909 217 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
SGCBQ16585 SNORA48.8-201ENST00000391324 134 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
SGCBQ16585 MTCO1P17-201ENST00000411522 491 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
SGCBQ16585 DBIP2-201ENST00000419076 262 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
SGCBQ16585 AC008850.1-201ENST00000427546 362 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
SGCBQ16585 AP1S3-208ENST00000446015 499 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.15□□□□□ -1.91
SGCBQ16585 AL157373.1-201ENST00000456036 276 ntTSL 3 BASIC3.15□□□□□ -1.91
SGCBQ16585 GRM7-AS3-209ENST00000458713 454 ntTSL 3 BASIC3.15□□□□□ -1.91
SGCBQ16585 CCDC39-AS1-201ENST00000495357 283 ntTSL 3 BASIC3.15□□□□□ -1.91
SGCBQ16585 AC016933.1-201ENST00000504735 539 ntTSL 2 BASIC3.15□□□□□ -1.91
SGCBQ16585 AC018752.1-201ENST00000507813 206 ntTSL 5 BASIC3.15□□□□□ -1.91
SGCBQ16585 HTN1-204ENST00000511674 623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.15□□□□□ -1.91
SGCBQ16585 AC034159.1-201ENST00000513885 583 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
SGCBQ16585 SCARNA15.2-201ENST00000516409 127 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
SGCBQ16585 RNU6-798P-201ENST00000516912 103 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
SGCBQ16585 AP001372.4-201ENST00000524889 472 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
SGCBQ16585 CASP1P1-201ENST00000526345 212 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
SGCBQ16585 UBTFL10-201ENST00000528532 562 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
SGCBQ16585 PDCL2P2-201ENST00000533651 189 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
SGCBQ16585 MYL12A-202ENST00000536605 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.15□□□□□ -1.91
SGCBQ16585 AC007619.1-201ENST00000544086 412 ntTSL 5 BASIC3.15□□□□□ -1.91
SGCBQ16585 LINC01405-202ENST00000547607 674 ntTSL 3 BASIC3.15□□□□□ -1.91
SGCBQ16585 AC011611.1-201ENST00000552179 197 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
SGCBQ16585 DUXAP1-201ENST00000556632 463 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
SGCBQ16585 NR2F2-AS1-208ENST00000560395 441 ntTSL 5 BASIC3.15□□□□□ -1.91
SGCBQ16585 AC087286.1-201ENST00000560712 568 ntTSL 3 BASIC3.15□□□□□ -1.91
SGCBQ16585 AC074050.1-201ENST00000563247 211 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
SGCBQ16585 AP005433.1-202ENST00000580845 521 ntTSL 4 BASIC3.15□□□□□ -1.91
SGCBQ16585 MYL12A-209ENST00000580887 899 ntTSL 1 (best) BASIC3.15□□□□□ -1.91
SGCBQ16585 AC061975.8-201ENST00000587058 721 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
SGCBQ16585 AC022601.1-201ENST00000596954 577 ntTSL 4 BASIC3.15□□□□□ -1.91
SGCBQ16585 AP001972.3-202ENST00000603012 375 ntTSL 3 BASIC3.15□□□□□ -1.91
SGCBQ16585 AL133393.1-201ENST00000603277 287 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
SGCBQ16585 AC068313.1-201ENST00000604028 1008 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
SGCBQ16585 AC012409.2-201ENST00000619812 751 ntTSL 5 BASIC3.15□□□□□ -1.91
SGCBQ16585 AC110801.1-201ENST00000623590 212 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
SGCBQ16585 hsa-mir-4776-1.1-201ENST00000636364 80 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
SGCBQ16585 D21S2088E-201ENST00000262354 1725 ntTSL 1 (best) BASIC3.15□□□□□ -1.91
SGCBQ16585 ANKRD26P2-201ENST00000445530 1710 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
SGCBQ16585 AC058791.1-201ENST00000608412 3198 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
SGCBQ16585 GALNT1-201ENST00000269195 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.15□□□□□ -1.91
SGCBQ16585 CLOCK-201ENST00000309964 10304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.15□□□□□ -1.91
SGCBQ16585 MME-211ENST00000492661 2854 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.14□□□□□ -1.91
SGCBQ16585 MCF2-202ENST00000370573 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.14□□□□□ -1.91
SGCBQ16585 HSPA8P1-201ENST00000425843 1833 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
SGCBQ16585 C2orf73-208ENST00000615983 1376 ntTSL 1 (best) BASIC3.14□□□□□ -1.91
SGCBQ16585 ARHGAP12-201ENST00000311380 4625 ntTSL 1 (best) BASIC3.14□□□□□ -1.91
SGCBQ16585 RNMT-206ENST00000589866 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.14□□□□□ -1.91
SGCBQ16585 MANEA-201ENST00000358812 4575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.14□□□□□ -1.91
SGCBQ16585 GNGT1-201ENST00000248572 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.14□□□□□ -1.91
SGCBQ16585 C1orf189-201ENST00000368525 387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.14□□□□□ -1.91
SGCBQ16585 PARD3-204ENST00000374768 799 ntTSL 3 BASIC3.14□□□□□ -1.91
SGCBQ16585 MIR514A1-201ENST00000385133 98 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
SGCBQ16585 MIR513B-201ENST00000385136 84 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
SGCBQ16585 SAR1AP2-201ENST00000392696 594 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
SGCBQ16585 MS4A4E-201ENST00000398984 479 ntTSL 5 BASIC3.14□□□□□ -1.91
SGCBQ16585 DEFB116-201ENST00000400549 309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.14□□□□□ -1.91
SGCBQ16585 C1D-204ENST00000410067 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.14□□□□□ -1.91
SGCBQ16585 RN7SKP266-201ENST00000410232 287 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
SGCBQ16585 AC090952.1-201ENST00000424242 446 ntTSL 3 BASIC3.14□□□□□ -1.91
SGCBQ16585 GRM7-AS3-203ENST00000424366 486 ntTSL 3 BASIC3.14□□□□□ -1.91
SGCBQ16585 AL355303.1-201ENST00000428920 680 ntTSL 3 BASIC3.14□□□□□ -1.91
SGCBQ16585 AL035407.1-201ENST00000429211 571 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
SGCBQ16585 TAAR7P-201ENST00000436141 242 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
SGCBQ16585 AC097347.1-201ENST00000438499 517 ntTSL 3 BASIC3.14□□□□□ -1.91
SGCBQ16585 CHODL-AS1-201ENST00000447175 1117 ntTSL 2 BASIC3.14□□□□□ -1.91
SGCBQ16585 AL356270.1-201ENST00000456587 522 ntTSL 3 BASIC3.14□□□□□ -1.91
SGCBQ16585 AC092798.1-201ENST00000458542 409 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
SGCBQ16585 RNU6-420P-201ENST00000458780 107 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
SGCBQ16585 SETP11-201ENST00000473027 690 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
SGCBQ16585 AHI1-208ENST00000488690 712 ntTSL 5 BASIC3.14□□□□□ -1.91
SGCBQ16585 AC020893.1-201ENST00000502452 580 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
SGCBQ16585 AC106821.1-201ENST00000502861 572 ntTSL 5 BASIC3.14□□□□□ -1.91
SGCBQ16585 AC026780.1-201ENST00000512237 952 ntTSL 3 BASIC3.14□□□□□ -1.91
SGCBQ16585 AC117834.1-202ENST00000521203 561 ntTSL 4 BASIC3.14□□□□□ -1.91
SGCBQ16585 C11orf1-204ENST00000530214 599 ntTSL 5 BASIC3.14□□□□□ -1.91
SGCBQ16585 AP000756.1-201ENST00000532606 679 ntTSL 2 BASIC3.14□□□□□ -1.91
SGCBQ16585 AC023050.2-201ENST00000544968 387 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
SGCBQ16585 LINC01481-201ENST00000552998 629 ntTSL 2 BASIC3.14□□□□□ -1.91
SGCBQ16585 AC087463.3-201ENST00000570105 415 ntTSL 3 BASIC3.14□□□□□ -1.91
SGCBQ16585 TTN-AS1-212ENST00000582847 1036 ntTSL 5 BASIC3.14□□□□□ -1.91
SGCBQ16585 AC018816.2-201ENST00000621460 353 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
SGCBQ16585 AC244517.7-201ENST00000625144 398 ntTSL 3 BASIC3.14□□□□□ -1.91
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