Protein–RNA interactions for Protein: Q16281

CNGA3, Cyclic nucleotide-gated cation channel alpha-3, humanhuman

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Length 694 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGA3Q16281 AL158801.5-201ENST00000623123 465 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
CNGA3Q16281 AL732618.1-201ENST00000623251 301 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
CNGA3Q16281 AL157786.1-207ENST00000627771 695 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
CNGA3Q16281 MIR4496-201ENST00000635896 61 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
CNGA3Q16281 ACSM3-201ENST00000289416 2845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.05□□□□□ -1.76
CNGA3Q16281 MBD5-212ENST00000627651 5610 ntTSL 5 BASIC4.05□□□□□ -1.76
CNGA3Q16281 MACF1-204ENST00000372915 23440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.05□□□□□ -1.76
CNGA3Q16281 MTND5P33-201ENST00000571250 1450 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
CNGA3Q16281 WDR49-201ENST00000308378 2594 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.05□□□□□ -1.76
CNGA3Q16281 STXBP4-201ENST00000376352 15590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.04□□□□□ -1.76
CNGA3Q16281 CPNE8-202ENST00000360449 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.04□□□□□ -1.76
CNGA3Q16281 OR6C2-202ENST00000641202 2105 ntAPPRIS P1 BASIC4.04□□□□□ -1.76
CNGA3Q16281 ZBTB37-201ENST00000367701 19128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.04□□□□□ -1.76
CNGA3Q16281 PARP15-206ENST00000493645 1311 ntTSL 1 (best) BASIC4.04□□□□□ -1.76
CNGA3Q16281 RPL17P50-201ENST00000396131 546 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
CNGA3Q16281 RPA3-203ENST00000401447 414 ntTSL 3 BASIC4.04□□□□□ -1.76
CNGA3Q16281 CCNG1P1-201ENST00000406783 885 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
CNGA3Q16281 RNU6-628P-201ENST00000410675 107 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
CNGA3Q16281 AC083900.1-201ENST00000421964 469 ntTSL 2 BASIC4.04□□□□□ -1.76
CNGA3Q16281 AL691449.1-201ENST00000426570 421 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
CNGA3Q16281 PSMA2P3-201ENST00000429685 675 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
CNGA3Q16281 EZH2P1-201ENST00000431167 291 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
CNGA3Q16281 AC011742.1-201ENST00000431448 434 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
CNGA3Q16281 AC092598.1-201ENST00000431708 797 ntTSL 3 BASIC4.04□□□□□ -1.76
CNGA3Q16281 AL138759.1-201ENST00000432120 645 ntTSL 2 BASIC4.04□□□□□ -1.76
CNGA3Q16281 TBCAP1-201ENST00000436520 327 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
CNGA3Q16281 UBE2V1P8-201ENST00000437166 265 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
CNGA3Q16281 AL451129.1-201ENST00000437471 285 ntTSL 3 BASIC4.04□□□□□ -1.76
CNGA3Q16281 AC079448.1-201ENST00000449377 373 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
CNGA3Q16281 AL353691.1-201ENST00000451332 387 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
CNGA3Q16281 snoU13.8-201ENST00000458890 104 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
CNGA3Q16281 DCUN1D1-204ENST00000469954 970 ntTSL 3 BASIC4.04□□□□□ -1.76
CNGA3Q16281 CSN1S2AP-204ENST00000512167 671 ntTSL 3 BASIC4.04□□□□□ -1.76
CNGA3Q16281 AC010342.1-201ENST00000514047 877 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
CNGA3Q16281 AC097460.1-201ENST00000514624 590 ntTSL 3 BASIC4.04□□□□□ -1.76
CNGA3Q16281 Y_RNA.672-201ENST00000516289 104 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
CNGA3Q16281 RNU6-314P-201ENST00000516574 104 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
CNGA3Q16281 RNU6-1231P-201ENST00000517185 103 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
CNGA3Q16281 AC099805.1-203ENST00000518177 773 ntTSL 2 BASIC4.04□□□□□ -1.76
CNGA3Q16281 AL354920.1-202ENST00000531661 1017 ntTSL 1 (best) BASIC4.04□□□□□ -1.76
CNGA3Q16281 AP004242.1-201ENST00000533701 349 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
CNGA3Q16281 KLRC2-204ENST00000536833 771 ntTSL 5 BASIC4.04□□□□□ -1.76
CNGA3Q16281 AC022509.2-201ENST00000540392 699 ntTSL 3 BASIC4.04□□□□□ -1.76
CNGA3Q16281 OR8R1P-201ENST00000543943 764 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
CNGA3Q16281 GNRHR2P1-201ENST00000555315 631 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
CNGA3Q16281 CENPUP2-201ENST00000555897 1186 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
CNGA3Q16281 ZNF192P1-203ENST00000565888 810 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
CNGA3Q16281 AC007495.1-203ENST00000569025 888 ntTSL 5 BASIC4.04□□□□□ -1.76
CNGA3Q16281 MIR3186-201ENST00000577404 85 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
CNGA3Q16281 MIR3682-201ENST00000581338 84 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
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CNGA3Q16281 CCNH-206ENST00000508855 2391 ntTSL 1 (best) BASIC4.04□□□□□ -1.76
CNGA3Q16281 LIG4-201ENST00000356922 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.04□□□□□ -1.76
CNGA3Q16281 ZNF66-201ENST00000344519 1745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.04□□□□□ -1.76
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CNGA3Q16281 AL391684.1-201ENST00000416191 2998 ntTSL 5 BASIC4.03□□□□□ -1.76
CNGA3Q16281 CENPJ-205ENST00000545981 4299 ntTSL 2 BASIC4.03□□□□□ -1.76
CNGA3Q16281 RFX7-201ENST00000559447 10426 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC4.03□□□□□ -1.76
CNGA3Q16281 LRRTM4-201ENST00000409088 3616 ntTSL 1 (best) BASIC4.03□□□□□ -1.76
CNGA3Q16281 UACA-202ENST00000379983 4859 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.03□□□□□ -1.76
CNGA3Q16281 TAS2R3-201ENST00000247879 1101 ntAPPRIS P1 BASIC4.03□□□□□ -1.76
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CNGA3Q16281 CRLS1-202ENST00000378868 994 ntTSL 5 BASIC4.03□□□□□ -1.76
CNGA3Q16281 SNORA57.1-201ENST00000391227 145 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
CNGA3Q16281 ISCA1P1-201ENST00000426679 387 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
CNGA3Q16281 AL033539.1-201ENST00000427775 743 ntTSL 3 BASIC4.03□□□□□ -1.76
CNGA3Q16281 MRPS10P2-201ENST00000431226 381 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
CNGA3Q16281 AC087650.1-201ENST00000431445 468 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
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CNGA3Q16281 AC005019.2-201ENST00000434321 359 ntTSL 5 BASIC4.03□□□□□ -1.76
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CNGA3Q16281 AC003071.1-201ENST00000451219 789 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
CNGA3Q16281 AP1S2P1-201ENST00000457344 379 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
CNGA3Q16281 RPS20P24-201ENST00000457473 361 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
CNGA3Q16281 CDKN3-205ENST00000458126 845 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.03□□□□□ -1.76
CNGA3Q16281 LINC02045-201ENST00000460324 679 ntTSL 3 BASIC4.03□□□□□ -1.76
CNGA3Q16281 RPL7P15-201ENST00000461190 712 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
CNGA3Q16281 AC138057.1-201ENST00000497258 696 ntTSL 3 BASIC4.03□□□□□ -1.76
CNGA3Q16281 LINC02174-201ENST00000508977 553 ntTSL 3 BASIC4.03□□□□□ -1.76
CNGA3Q16281 SLC7A11-AS1-201ENST00000510066 817 ntTSL 2 BASIC4.03□□□□□ -1.76
CNGA3Q16281 AP001330.2-201ENST00000523121 979 ntTSL 2 BASIC4.03□□□□□ -1.76
CNGA3Q16281 AKAP7-208ENST00000537868 1006 ntTSL 5 BASIC4.03□□□□□ -1.76
CNGA3Q16281 AL352984.1-201ENST00000556949 276 ntTSL 3 BASIC4.03□□□□□ -1.76
CNGA3Q16281 AL391840.1-201ENST00000571144 367 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
CNGA3Q16281 AP003117.2-201ENST00000606010 545 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
CNGA3Q16281 AC024941.1-201ENST00000612250 334 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
CNGA3Q16281 AC090517.2-201ENST00000614966 680 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
CNGA3Q16281 AC012150.2-201ENST00000621300 544 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
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