Protein–RNA interactions for Protein: Q16143

SNCB, Beta-synuclein, humanhuman

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Length 134 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNCBQ16143 OR6C71P-201ENST00000432580 913 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
SNCBQ16143 CYCSP32-201ENST00000440548 321 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
SNCBQ16143 LINC01683-201ENST00000443479 412 ntTSL 3 BASIC2.25□□□□□ -2.05
SNCBQ16143 RPS15AP27-201ENST00000449183 343 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
SNCBQ16143 AC087588.1-201ENST00000462203 316 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
SNCBQ16143 AC022493.1-201ENST00000492984 337 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
SNCBQ16143 RNU6-491P-201ENST00000516099 110 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
SNCBQ16143 AC118942.1-201ENST00000529674 1035 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
SNCBQ16143 AC012435.2-201ENST00000562869 361 ntTSL 3 BASIC2.25□□□□□ -2.05
SNCBQ16143 LINC02520-201ENST00000570443 537 ntTSL 4 BASIC2.25□□□□□ -2.05
SNCBQ16143 AC135178.3-204ENST00000585181 451 ntTSL 2 BASIC2.25□□□□□ -2.05
SNCBQ16143 AC016229.1-201ENST00000589242 487 ntTSL 5 BASIC2.25□□□□□ -2.05
SNCBQ16143 AL157786.1-204ENST00000594870 506 ntTSL 3 BASIC2.25□□□□□ -2.05
SNCBQ16143 SNORD14A-201ENST00000606526 91 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
SNCBQ16143 AC098657.3-201ENST00000620434 263 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
SNCBQ16143 AP001002.2-201ENST00000625137 386 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
SNCBQ16143 AL137790.1-201ENST00000634283 177 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
SNCBQ16143 AC068544.1-201ENST00000635064 248 ntTSL 5 BASIC2.25□□□□□ -2.05
SNCBQ16143 AL589740.1-205ENST00000635561 565 ntTSL 5 BASIC2.25□□□□□ -2.05
SNCBQ16143 NANOGNB-202ENST00000640040 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.25□□□□□ -2.05
SNCBQ16143 VIM-AS1-201ENST00000437232 1351 ntTSL 2 BASIC2.24□□□□□ -2.05
SNCBQ16143 Y_RNA.333-201ENST00000365274 102 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
SNCBQ16143 MIR483-201ENST00000385070 76 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
SNCBQ16143 AC019097.1-201ENST00000424783 735 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
SNCBQ16143 AC063976.3-201ENST00000426849 329 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
SNCBQ16143 MYL8P-204ENST00000431574 518 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
SNCBQ16143 ARF4P4-201ENST00000439608 520 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
SNCBQ16143 AP000146.1-202ENST00000441666 441 ntTSL 3 BASIC2.24□□□□□ -2.05
SNCBQ16143 RPL23AP7-203ENST00000449021 469 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
SNCBQ16143 LINC00888-204ENST00000487386 421 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
SNCBQ16143 AC080014.1-201ENST00000496877 1201 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
SNCBQ16143 SUMO1P1-201ENST00000497904 306 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
SNCBQ16143 AC105389.2-201ENST00000506475 435 ntTSL 3 BASIC2.24□□□□□ -2.05
SNCBQ16143 LINC02428-201ENST00000508099 527 ntTSL 5 BASIC2.24□□□□□ -2.05
SNCBQ16143 AC097467.3-212ENST00000512269 568 ntTSL 3 BASIC2.24□□□□□ -2.05
SNCBQ16143 TAS2R43-201ENST00000531678 1027 ntAPPRIS P1 BASIC2.24□□□□□ -2.05
SNCBQ16143 ANP32BP3-201ENST00000559213 706 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
SNCBQ16143 AL138976.2-201ENST00000563989 694 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
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SNCBQ16143 OR10AB1P-201ENST00000609613 938 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
SNCBQ16143 RFESD-202ENST00000380005 2587 ntTSL 2 BASIC2.24□□□□□ -2.05
SNCBQ16143 AC097714.1-201ENST00000511272 1647 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
SNCBQ16143 KTN1-223ENST00000555573 1712 ntTSL 2 BASIC2.23□□□□□ -2.05
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SNCBQ16143 AC005703.2-201ENST00000453339 343 ntTSL 2 BASIC2.23□□□□□ -2.05
SNCBQ16143 snoU13.28-201ENST00000459235 104 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
SNCBQ16143 LINC00492-201ENST00000504436 593 ntTSL 3 BASIC2.23□□□□□ -2.05
SNCBQ16143 AC008885.2-201ENST00000509506 930 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
SNCBQ16143 XKRY-201ENST00000510392 1100 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
SNCBQ16143 SNORA70.16-201ENST00000516390 95 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
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SNCBQ16143 COX6CP8-201ENST00000522620 226 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
SNCBQ16143 ERP27-202ENST00000540097 993 ntTSL 2 BASIC2.23□□□□□ -2.05
SNCBQ16143 LINC02165-201ENST00000563061 443 ntTSL 3 BASIC2.23□□□□□ -2.05
SNCBQ16143 AC011260.1-201ENST00000578420 472 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
SNCBQ16143 AC092954.1-201ENST00000609121 445 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
SNCBQ16143 AL445584.2-201ENST00000614030 616 ntTSL 5 BASIC2.23□□□□□ -2.05
SNCBQ16143 AC090116.1-201ENST00000615679 446 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
SNCBQ16143 AP006248.3-201ENST00000623580 594 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
SNCBQ16143 VPS54-202ENST00000354504 3594 ntTSL 1 (best) BASIC2.23□□□□□ -2.05
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SNCBQ16143 ABCC5-AS1-201ENST00000422946 469 ntTSL 2 BASIC2.22□□□□□ -2.05
SNCBQ16143 AL391832.1-201ENST00000423963 423 ntTSL 5 BASIC2.22□□□□□ -2.05
SNCBQ16143 AL357832.1-201ENST00000427460 420 ntTSL 3 BASIC2.22□□□□□ -2.05
SNCBQ16143 AC004865.1-201ENST00000442276 1003 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
SNCBQ16143 AL021397.1-201ENST00000451806 248 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
SNCBQ16143 TRGVB-201ENST00000453257 471 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
SNCBQ16143 MRPL35P4-201ENST00000453682 566 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
SNCBQ16143 AL049548.1-201ENST00000458194 385 ntTSL 2 BASIC2.22□□□□□ -2.05
SNCBQ16143 AC025033.1-201ENST00000463883 194 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
SNCBQ16143 OR52A4P-202ENST00000481634 799 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
SNCBQ16143 AC109486.1-201ENST00000486833 374 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
SNCBQ16143 SRI-210ENST00000490437 570 ntTSL 2 BASIC2.22□□□□□ -2.05
SNCBQ16143 OR52A4P-203ENST00000498233 1014 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
SNCBQ16143 AC135457.1-201ENST00000503553 664 ntTSL 3 BASIC2.22□□□□□ -2.05
SNCBQ16143 PCNAP1-201ENST00000505363 709 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
SNCBQ16143 MRPS36P2-201ENST00000512569 299 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
SNCBQ16143 AC106895.1-201ENST00000515825 548 ntTSL 4 BASIC2.22□□□□□ -2.05
SNCBQ16143 AP001636.3-202ENST00000525714 894 ntTSL 3 BASIC2.22□□□□□ -2.05
SNCBQ16143 LINC02329-201ENST00000554753 511 ntTSL 5 BASIC2.22□□□□□ -2.05
SNCBQ16143 HMGB1P14-201ENST00000557424 591 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
SNCBQ16143 AL049874.4-201ENST00000557593 255 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
SNCBQ16143 AC012100.2-201ENST00000558317 304 ntTSL 5 BASIC2.22□□□□□ -2.05
SNCBQ16143 HMGB1P6-201ENST00000569046 646 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
SNCBQ16143 AC105137.2-201ENST00000569073 466 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
SNCBQ16143 MIR3935-201ENST00000583472 104 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
SNCBQ16143 ANKRD36C-207ENST00000612359 650 ntTSL 1 (best) BASIC2.22□□□□□ -2.05
SNCBQ16143 MIR7106-201ENST00000612419 65 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
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