Protein–RNA interactions for Protein: Q15270

NKX1-1, NK1 transcription factor-related protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 411 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKX1-1Q15270 DNAH17-202ENST00000585328 13708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.1□□□□□ -1.27
NKX1-1Q15270 ESRRG-205ENST00000366937 5365 ntTSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
NKX1-1Q15270 GPR1-201ENST00000407325 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
NKX1-1Q15270 FGF13-201ENST00000305414 1939 ntTSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
NKX1-1Q15270 TRIM69-201ENST00000329464 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
NKX1-1Q15270 UBE2L2-201ENST00000254302 429 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
NKX1-1Q15270 snoU2_19.2-201ENST00000363024 80 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
NKX1-1Q15270 Y_RNA.269-201ENST00000364685 89 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
NKX1-1Q15270 SNORA56-201ENST00000383966 129 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
NKX1-1Q15270 SNORA70E-201ENST00000384492 135 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
NKX1-1Q15270 TRBV24-1-201ENST00000390397 381 ntAPPRIS P1 BASIC7.1□□□□□ -1.27
NKX1-1Q15270 RNA5SP251-201ENST00000410614 137 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
NKX1-1Q15270 RNA5SP494-201ENST00000410653 129 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
NKX1-1Q15270 AL606753.1-201ENST00000427435 87 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
NKX1-1Q15270 AC087650.1-201ENST00000431445 468 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
NKX1-1Q15270 AL360169.1-201ENST00000435116 143 ntTSL 5 BASIC7.1□□□□□ -1.27
NKX1-1Q15270 LINC01757-201ENST00000435552 480 ntTSL 2 BASIC7.1□□□□□ -1.27
NKX1-1Q15270 HSPD1P21-201ENST00000436541 245 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
NKX1-1Q15270 AL590399.6-201ENST00000446396 307 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
NKX1-1Q15270 RNU7-120P-201ENST00000459334 63 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
NKX1-1Q15270 RN7SL860P-201ENST00000473738 223 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
NKX1-1Q15270 AC106894.1-201ENST00000511735 451 ntTSL 5 BASIC7.1□□□□□ -1.27
NKX1-1Q15270 TRAV37-201ENST00000553906 342 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
NKX1-1Q15270 MIR4300-201ENST00000581016 96 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
NKX1-1Q15270 AC098826.3-201ENST00000603823 466 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
NKX1-1Q15270 HSPA8P1-201ENST00000425843 1833 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
NKX1-1Q15270 UGT8-202ENST00000394511 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
NKX1-1Q15270 AC090826.1-202ENST00000562009 3337 ntTSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
NKX1-1Q15270 L3MBTL3-201ENST00000361794 4217 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC7.1□□□□□ -1.27
NKX1-1Q15270 CLASP2-205ENST00000461133 4814 ntTSL 5 BASIC7.1□□□□□ -1.27
NKX1-1Q15270 LINC01478-201ENST00000587877 2068 ntTSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
NKX1-1Q15270 HSPA4L-202ENST00000505726 2639 ntTSL 2 BASIC7.1□□□□□ -1.27
NKX1-1Q15270 KCNMB2-204ENST00000432997 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
NKX1-1Q15270 AC009643.2-201ENST00000603543 1448 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
NKX1-1Q15270 DSC1-202ENST00000257198 4225 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC7.09□□□□□ -1.27
NKX1-1Q15270 AL033543.1-201ENST00000623440 13454 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
NKX1-1Q15270 TFPI-203ENST00000392365 3649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.09□□□□□ -1.27
NKX1-1Q15270 MDM4-207ENST00000454264 9926 ntTSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
NKX1-1Q15270 DMD-228ENST00000541735 7080 ntTSL 5 BASIC7.09□□□□□ -1.27
NKX1-1Q15270 CYP3A4-201ENST00000336411 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
NKX1-1Q15270 ZNF334-203ENST00000593880 2635 ntTSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
NKX1-1Q15270 AL034549.2-201ENST00000618285 3373 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
NKX1-1Q15270 SETX-201ENST00000224140 11100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
NKX1-1Q15270 LRRIQ3-201ENST00000354431 2849 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.09□□□□□ -1.27
NKX1-1Q15270 SCN1A-204ENST00000423058 8191 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
NKX1-1Q15270 MIR215-201ENST00000384858 110 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
NKX1-1Q15270 MIR190B-201ENST00000401119 79 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
NKX1-1Q15270 ARHGEF7-AS1-201ENST00000435037 321 ntTSL 3 BASIC7.09□□□□□ -1.27
NKX1-1Q15270 AL137076.1-201ENST00000441046 551 ntTSL 2 BASIC7.09□□□□□ -1.27
NKX1-1Q15270 AC026316.2-201ENST00000473110 263 ntTSL 3 BASIC7.09□□□□□ -1.27
NKX1-1Q15270 SNORA31.22-201ENST00000517204 135 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
NKX1-1Q15270 AC109479.2-201ENST00000517842 174 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
NKX1-1Q15270 AC025871.1-201ENST00000523935 443 ntTSL 2 BASIC7.09□□□□□ -1.27
NKX1-1Q15270 SYF2P1-201ENST00000550658 413 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
NKX1-1Q15270 AC123912.5-201ENST00000605470 343 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
NKX1-1Q15270 UBA3-213ENST00000631029 123 ntTSL 5 BASIC7.09□□□□□ -1.27
NKX1-1Q15270 ANKRD36C-201ENST00000295246 2272 ntTSL 5 BASIC7.09□□□□□ -1.27
NKX1-1Q15270 ADAM29-213ENST00000615367 3386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.09□□□□□ -1.27
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NKX1-1Q15270 CLCN3-211ENST00000613795 5874 ntTSL 5 BASIC7.09□□□□□ -1.28
NKX1-1Q15270 FAM197Y2-202ENST00000448006 2338 ntTSL 2 BASIC7.09□□□□□ -1.28
NKX1-1Q15270 EIF2A-201ENST00000273435 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
NKX1-1Q15270 PBRM1-202ENST00000337303 4825 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
NKX1-1Q15270 TMOD2-201ENST00000249700 9191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
NKX1-1Q15270 RNF128-202ENST00000324342 2654 ntTSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
NKX1-1Q15270 MDM4-205ENST00000391947 10008 ntTSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
NKX1-1Q15270 RAG2-201ENST00000311485 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
NKX1-1Q15270 ATP1B4-202ENST00000361319 3856 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
NKX1-1Q15270 RIMKLB-207ENST00000538135 5392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
NKX1-1Q15270 F2RL2-201ENST00000296641 3429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
NKX1-1Q15270 MDGA2-201ENST00000357362 2965 ntTSL 5 BASIC7.08□□□□□ -1.28
NKX1-1Q15270 MIR412-201ENST00000362142 91 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
NKX1-1Q15270 Y_RNA.199-201ENST00000364014 102 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
NKX1-1Q15270 OR51I1-201ENST00000380211 945 ntAPPRIS P1 BASIC7.08□□□□□ -1.28
NKX1-1Q15270 PCNPP3-201ENST00000393579 471 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
NKX1-1Q15270 RPL23AP17-201ENST00000401064 499 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
NKX1-1Q15270 AC093162.1-201ENST00000419682 124 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
NKX1-1Q15270 AC138024.1-201ENST00000420867 699 ntTSL 3 BASIC7.08□□□□□ -1.28
NKX1-1Q15270 AL592045.1-201ENST00000429867 352 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
NKX1-1Q15270 STXBP5-AS1-204ENST00000431143 644 ntTSL 3 BASIC7.08□□□□□ -1.28
NKX1-1Q15270 AL772161.1-201ENST00000439130 476 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
NKX1-1Q15270 AL356981.1-201ENST00000454879 684 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
NKX1-1Q15270 RPL12P39-201ENST00000455456 496 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
NKX1-1Q15270 AC011389.1-201ENST00000509170 594 ntTSL 4 BASIC7.08□□□□□ -1.28
NKX1-1Q15270 AC008694.2-201ENST00000517591 306 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
NKX1-1Q15270 G2E3-AS1-202ENST00000550118 609 ntTSL 5 BASIC7.08□□□□□ -1.28
NKX1-1Q15270 AC013565.1-201ENST00000565938 597 ntTSL 2 BASIC7.08□□□□□ -1.28
NKX1-1Q15270 AC022884.2-201ENST00000578535 580 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
NKX1-1Q15270 AC009318.2-201ENST00000610917 651 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
NKX1-1Q15270 NCBP1-205ENST00000629069 249 ntTSL 5 BASIC7.08□□□□□ -1.28
NKX1-1Q15270 MYPN-204ENST00000540630 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
NKX1-1Q15270 MUC7-203ENST00000456088 2479 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC7.08□□□□□ -1.28
NKX1-1Q15270 TMEM132B-201ENST00000299308 10906 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.08□□□□□ -1.28
NKX1-1Q15270 NLRP11-204ENST00000592953 3077 ntTSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
NKX1-1Q15270 STXBP5-201ENST00000321680 3456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.08□□□□□ -1.28
NKX1-1Q15270 PLXNA4-201ENST00000321063 13061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.08□□□□□ -1.28
NKX1-1Q15270 RCAN2-201ENST00000306764 3240 ntTSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
NKX1-1Q15270 SLC12A6-218ENST00000560611 4239 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
NKX1-1Q15270 PSMB2-202ENST00000621781 4217 ntTSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
NKX1-1Q15270 CTBS-202ENST00000370630 6600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
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