Protein–RNA interactions for Protein: Q14264

ERV3-1, Endogenous retrovirus group 3 member 1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 604 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERV3-1Q14264 RNASEH2B-AS1-206ENST00000601286 657 ntTSL 5 BASIC3.98□□□□□ -1.77
ERV3-1Q14264 LINC00907-211ENST00000601948 795 ntTSL 5 BASIC3.98□□□□□ -1.77
ERV3-1Q14264 AC091834.1-201ENST00000614543 472 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
ERV3-1Q14264 SMCR2_2.1-201ENST00000619783 161 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
ERV3-1Q14264 WASF3-AS1-206ENST00000626779 381 ntTSL 5 BASIC3.98□□□□□ -1.77
ERV3-1Q14264 EPC1-203ENST00000375110 3909 ntTSL 1 (best) BASIC3.98□□□□□ -1.77
ERV3-1Q14264 AC084357.3-201ENST00000541353 2751 ntTSL 5 BASIC3.98□□□□□ -1.77
ERV3-1Q14264 AC005550.3-201ENST00000451240 3743 ntTSL 1 (best) BASIC3.98□□□□□ -1.77
ERV3-1Q14264 MACF1-231ENST00000564288 24828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.98□□□□□ -1.77
ERV3-1Q14264 CPB2-201ENST00000181383 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.98□□□□□ -1.77
ERV3-1Q14264 CCNYL2-202ENST00000637719 3311 ntTSL 2 BASIC3.98□□□□□ -1.77
ERV3-1Q14264 IFI44L-201ENST00000370751 5874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.98□□□□□ -1.77
ERV3-1Q14264 CCDC178-205ENST00000406524 3039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.97□□□□□ -1.77
ERV3-1Q14264 MNDA-201ENST00000368141 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.97□□□□□ -1.77
ERV3-1Q14264 ZBBX-202ENST00000392764 2849 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.97□□□□□ -1.77
ERV3-1Q14264 GDAP2-202ENST00000369443 8828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.97□□□□□ -1.77
ERV3-1Q14264 DAZ4-206ENST00000449750 3271 ntTSL 5 BASIC3.97□□□□□ -1.77
ERV3-1Q14264 ZNF43-210ENST00000598381 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.97□□□□□ -1.77
ERV3-1Q14264 OR2AP1-201ENST00000321688 930 ntAPPRIS P1 BASIC3.97□□□□□ -1.77
ERV3-1Q14264 SNORD6-201ENST00000365444 73 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
ERV3-1Q14264 RNA5SP88-201ENST00000365560 109 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
ERV3-1Q14264 CXorf65-201ENST00000374251 601 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.97□□□□□ -1.77
ERV3-1Q14264 MIR93-201ENST00000385024 80 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
ERV3-1Q14264 RNA5SP171-201ENST00000391071 115 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
ERV3-1Q14264 RNU2-41P-201ENST00000410991 178 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
ERV3-1Q14264 RNA5SP39-201ENST00000411245 120 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
ERV3-1Q14264 CYCSP19-201ENST00000411715 316 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
ERV3-1Q14264 AC003985.1-201ENST00000414127 362 ntTSL 3 BASIC3.97□□□□□ -1.77
ERV3-1Q14264 AC009237.5-201ENST00000414271 501 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
ERV3-1Q14264 AL590302.1-201ENST00000431017 359 ntTSL 2 BASIC3.97□□□□□ -1.77
ERV3-1Q14264 AC018742.1-201ENST00000435237 488 ntTSL 3 BASIC3.97□□□□□ -1.77
ERV3-1Q14264 AC244505.5-201ENST00000443639 207 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
ERV3-1Q14264 AC004692.2-202ENST00000458680 478 ntTSL 3 BASIC3.97□□□□□ -1.77
ERV3-1Q14264 VN1R105P-201ENST00000486595 910 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
ERV3-1Q14264 AC110792.1-201ENST00000491826 472 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
ERV3-1Q14264 ADGRL3-AS1-204ENST00000509461 481 ntTSL 5 BASIC3.97□□□□□ -1.77
ERV3-1Q14264 LINC02061-201ENST00000514225 335 ntTSL 3 BASIC3.97□□□□□ -1.77
ERV3-1Q14264 AC103783.1-201ENST00000520506 373 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
ERV3-1Q14264 PRH1-206ENST00000543626 710 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC3.97□□□□□ -1.77
ERV3-1Q14264 AC005908.2-201ENST00000546078 530 ntTSL 3 BASIC3.97□□□□□ -1.77
ERV3-1Q14264 GLYCAM1-201ENST00000546596 285 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
ERV3-1Q14264 AL163973.3-201ENST00000547093 430 ntTSL 3 BASIC3.97□□□□□ -1.77
ERV3-1Q14264 AL355922.1-201ENST00000555624 337 ntTSL 3 BASIC3.97□□□□□ -1.77
ERV3-1Q14264 AC092954.2-201ENST00000609103 430 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
ERV3-1Q14264 AC012531.5-201ENST00000611375 151 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
ERV3-1Q14264 AC091304.9-201ENST00000612091 226 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
ERV3-1Q14264 AC104260.1-201ENST00000616660 539 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
ERV3-1Q14264 AC012150.2-201ENST00000621300 544 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
ERV3-1Q14264 AC138649.3-201ENST00000622154 254 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
ERV3-1Q14264 LINC01090-203ENST00000632331 466 ntTSL 5 BASIC3.97□□□□□ -1.77
ERV3-1Q14264 AC099654.5-201ENST00000636479 350 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
ERV3-1Q14264 AL672296.1-201ENST00000427780 2158 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
ERV3-1Q14264 AC024560.2-201ENST00000507981 1497 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
ERV3-1Q14264 USH2A-202ENST00000366942 6320 ntTSL 1 (best) BASIC3.97□□□□□ -1.77
ERV3-1Q14264 LMNTD1-204ENST00000458174 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.97□□□□□ -1.77
ERV3-1Q14264 ENPP2-202ENST00000259486 3233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.97□□□□□ -1.77
ERV3-1Q14264 PPP1R9A-202ENST00000340694 9689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.97□□□□□ -1.77
ERV3-1Q14264 ATF2-221ENST00000538946 1325 ntTSL 5 BASIC3.96□□□□□ -1.77
ERV3-1Q14264 AL049830.3-201ENST00000555108 1991 ntTSL 1 (best) BASIC3.96□□□□□ -1.77
ERV3-1Q14264 GABRG2-222ENST00000639975 3662 ntTSL 5 BASIC3.96□□□□□ -1.78
ERV3-1Q14264 ZNF382-203ENST00000435416 3865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.96□□□□□ -1.78
ERV3-1Q14264 RC3H2-203ENST00000373670 9248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.96□□□□□ -1.78
ERV3-1Q14264 OR5T2-201ENST00000313264 1248 ntAPPRIS P2 BASIC3.96□□□□□ -1.78
ERV3-1Q14264 SPAG11A-202ENST00000326625 445 ntTSL 5 BASIC3.96□□□□□ -1.78
ERV3-1Q14264 RNU5F-6P-201ENST00000362979 116 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
ERV3-1Q14264 RNU6-343P-201ENST00000364709 104 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
ERV3-1Q14264 RNU6-359P-201ENST00000365466 108 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
ERV3-1Q14264 RGS4-201ENST00000367906 930 ntTSL 1 (best) BASIC3.96□□□□□ -1.78
ERV3-1Q14264 RNA5SP372-201ENST00000390836 115 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
ERV3-1Q14264 FGF7P8-201ENST00000402994 292 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
ERV3-1Q14264 HDGFP1-201ENST00000405943 252 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
ERV3-1Q14264 RNA5SP129-201ENST00000410276 118 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
ERV3-1Q14264 RN7SKP159-201ENST00000410657 292 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
ERV3-1Q14264 HMGB3P23-201ENST00000414981 585 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
ERV3-1Q14264 AC245054.1-201ENST00000420944 258 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
ERV3-1Q14264 AL355314.2-201ENST00000427182 436 ntTSL 3 BASIC3.96□□□□□ -1.78
ERV3-1Q14264 MTATP6P30-201ENST00000443540 664 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
ERV3-1Q14264 AP000431.2-201ENST00000450653 790 ntTSL 2 BASIC3.96□□□□□ -1.78
ERV3-1Q14264 MTND3P10-201ENST00000450967 341 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
ERV3-1Q14264 MCCC1-AS1-201ENST00000471731 765 ntTSL 5 BASIC3.96□□□□□ -1.78
ERV3-1Q14264 AP000797.1-201ENST00000478870 387 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
ERV3-1Q14264 AC008628.2-201ENST00000502605 298 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
ERV3-1Q14264 AC079467.1-201ENST00000508512 503 ntTSL 3 BASIC3.96□□□□□ -1.78
ERV3-1Q14264 ZCCHC10-206ENST00000509008 608 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.96□□□□□ -1.78
ERV3-1Q14264 RNU6-714P-201ENST00000516963 103 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
ERV3-1Q14264 RN7SKP289-201ENST00000517244 295 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
ERV3-1Q14264 SMIM18-201ENST00000517349 905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.96□□□□□ -1.78
ERV3-1Q14264 AP002748.2-201ENST00000528671 348 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
ERV3-1Q14264 OR5AP1P-201ENST00000529730 940 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
ERV3-1Q14264 C11orf1-204ENST00000530214 599 ntTSL 5 BASIC3.96□□□□□ -1.78
ERV3-1Q14264 AC100770.1-201ENST00000532310 322 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
ERV3-1Q14264 SNRPGP16-201ENST00000533275 226 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
ERV3-1Q14264 LINC00640-203ENST00000556479 576 ntTSL 2 BASIC3.96□□□□□ -1.78
ERV3-1Q14264 AC006960.3-201ENST00000561845 705 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
ERV3-1Q14264 MIR3913-1-201ENST00000577744 102 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
ERV3-1Q14264 LINC00310-206ENST00000609947 892 ntTSL 5 BASIC3.96□□□□□ -1.78
ERV3-1Q14264 AC008162.2-201ENST00000613352 291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.96□□□□□ -1.78
ERV3-1Q14264 AL590099.1-201ENST00000615276 138 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
ERV3-1Q14264 AC027807.2-201ENST00000616099 408 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
ERV3-1Q14264 AL353748.2-201ENST00000622148 471 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 82 ms