Protein–RNA interactions for Protein: Q13620

CUL4B, Cullin-4B, humanhuman

Predictions only

Length 913 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL4BQ13620 AC012531.5-201ENST00000611375 151 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
CUL4BQ13620 CT45A5-202ENST00000617203 726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.05□□□□□ -1.76
CUL4BQ13620 YWHAEP7-201ENST00000617508 639 ntTSL 3 BASIC4.05□□□□□ -1.76
CUL4BQ13620 AC015967.1-201ENST00000619893 476 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
CUL4BQ13620 AL591441.2-201ENST00000620059 535 ntTSL 5 BASIC4.05□□□□□ -1.76
CUL4BQ13620 AL353748.2-201ENST00000622148 471 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
CUL4BQ13620 AL732618.1-201ENST00000623251 301 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
CUL4BQ13620 AC244258.1-201ENST00000637553 1071 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
CUL4BQ13620 PRO1804-201ENST00000623780 2050 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
CUL4BQ13620 KIF21A-203ENST00000541463 4866 ntTSL 1 (best) BASIC4.05□□□□□ -1.76
CUL4BQ13620 XRCC4-203ENST00000396027 1530 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.05□□□□□ -1.76
CUL4BQ13620 ZNF99-202ENST00000596209 7817 ntTSL 5 BASIC4.04□□□□□ -1.76
CUL4BQ13620 KIAA0586-215ENST00000619722 5597 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.04□□□□□ -1.76
CUL4BQ13620 PTPN22-207ENST00000528414 3424 ntTSL 1 (best) BASIC4.04□□□□□ -1.76
CUL4BQ13620 ATM-203ENST00000452508 12954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.04□□□□□ -1.76
CUL4BQ13620 WDR72-201ENST00000360509 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.04□□□□□ -1.76
CUL4BQ13620 RNF17-201ENST00000255324 5119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.04□□□□□ -1.76
CUL4BQ13620 SPA17-201ENST00000227135 853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.04□□□□□ -1.76
CUL4BQ13620 MIR135A2-201ENST00000384854 100 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
CUL4BQ13620 RN7SKP142-201ENST00000411236 328 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
CUL4BQ13620 RPL21P32-201ENST00000419877 477 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
CUL4BQ13620 DUTP6-201ENST00000425573 462 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
CUL4BQ13620 ST13P20-201ENST00000447996 1065 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
CUL4BQ13620 AL163192.1-201ENST00000448858 708 ntTSL 5 BASIC4.04□□□□□ -1.76
CUL4BQ13620 AL590365.1-201ENST00000450788 243 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
CUL4BQ13620 FO393408.1-201ENST00000458577 582 ntTSL 5 BASIC4.04□□□□□ -1.76
CUL4BQ13620 GPX5-203ENST00000469384 428 ntTSL 1 (best) BASIC4.04□□□□□ -1.76
CUL4BQ13620 AL049830.2-201ENST00000480072 201 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
CUL4BQ13620 LINC01846-201ENST00000505908 651 ntTSL 5 BASIC4.04□□□□□ -1.76
CUL4BQ13620 AF131216.2-201ENST00000512316 564 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
CUL4BQ13620 MTCO3P28-201ENST00000513351 515 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
CUL4BQ13620 AC022483.1-201ENST00000514020 567 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
CUL4BQ13620 AC068993.2-201ENST00000546563 395 ntTSL 5 BASIC4.04□□□□□ -1.76
CUL4BQ13620 AC136188.1-201ENST00000546770 342 ntTSL 3 BASIC4.04□□□□□ -1.76
CUL4BQ13620 AC007115.1-201ENST00000546853 234 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
CUL4BQ13620 AC024909.2-201ENST00000553035 286 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
CUL4BQ13620 MTCYBP33-201ENST00000575007 1130 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
CUL4BQ13620 MIR3186-201ENST00000577404 85 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
CUL4BQ13620 UBE2L4-201ENST00000587688 464 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
CUL4BQ13620 AL158211.4-201ENST00000606988 584 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
CUL4BQ13620 AC138749.5-201ENST00000611461 208 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
CUL4BQ13620 AC116165.2-201ENST00000616705 206 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
CUL4BQ13620 AC108479.2-201ENST00000617314 601 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
CUL4BQ13620 AC009878.1-201ENST00000621819 340 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
CUL4BQ13620 AL158801.5-201ENST00000623123 465 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
CUL4BQ13620 UBE2E2-207ENST00000628311 267 ntTSL 5 BASIC4.04□□□□□ -1.76
CUL4BQ13620 LINC01002-206ENST00000631772 539 ntTSL 4 BASIC4.04□□□□□ -1.76
CUL4BQ13620 AP003171.2-202ENST00000634657 355 ntTSL 5 BASIC4.04□□□□□ -1.76
CUL4BQ13620 FOXP2-227ENST00000638397 240 ntTSL 5 BASIC4.04□□□□□ -1.76
CUL4BQ13620 AC119674.1-207ENST00000641355 633 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
CUL4BQ13620 PCLO-206ENST00000437081 3786 ntTSL 1 (best) BASIC4.04□□□□□ -1.76
CUL4BQ13620 MUC7-203ENST00000456088 2479 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC4.04□□□□□ -1.76
CUL4BQ13620 POSTN-203ENST00000379747 3373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.04□□□□□ -1.76
CUL4BQ13620 OSBPL9P4-201ENST00000371707 1800 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
CUL4BQ13620 FKTN-209ENST00000602661 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.04□□□□□ -1.76
CUL4BQ13620 ADAM28-201ENST00000265769 7052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.03□□□□□ -1.76
CUL4BQ13620 BIRC3-206ENST00000532808 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.03□□□□□ -1.76
CUL4BQ13620 GABPAP-201ENST00000419271 1356 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
CUL4BQ13620 SLC30A6-203ENST00000379343 2354 ntTSL 1 (best) BASIC4.03□□□□□ -1.76
CUL4BQ13620 Y_RNA.46-201ENST00000362695 102 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
CUL4BQ13620 Y_RNA.51-201ENST00000362725 102 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
CUL4BQ13620 RN7SKP280-201ENST00000364196 304 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
CUL4BQ13620 MEIG1-201ENST00000378240 507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.03□□□□□ -1.76
CUL4BQ13620 RPL7P25-201ENST00000404151 721 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
CUL4BQ13620 Y_RNA.598-201ENST00000410480 95 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
CUL4BQ13620 Y_RNA.608-201ENST00000410647 95 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
CUL4BQ13620 AC114763.2-201ENST00000412593 826 ntTSL 2 BASIC4.03□□□□□ -1.76
CUL4BQ13620 AL158839.1-201ENST00000413943 575 ntTSL 2 BASIC4.03□□□□□ -1.76
CUL4BQ13620 MORF4L1P6-201ENST00000418771 268 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
CUL4BQ13620 AC006989.1-201ENST00000427212 131 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
CUL4BQ13620 MTND1P28-201ENST00000435623 950 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
CUL4BQ13620 RPL22P17-201ENST00000438729 315 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
CUL4BQ13620 MRPS31P2-201ENST00000451581 518 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
CUL4BQ13620 AC092608.1-201ENST00000503505 267 ntTSL 2 BASIC4.03□□□□□ -1.76
CUL4BQ13620 CSN1S1-202ENST00000505782 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.03□□□□□ -1.76
CUL4BQ13620 AC010424.1-201ENST00000506336 297 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
CUL4BQ13620 MTND4P2-201ENST00000507767 1203 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
CUL4BQ13620 CSN1S1-204ENST00000507772 895 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.03□□□□□ -1.76
CUL4BQ13620 ZCCHC10-206ENST00000509008 608 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.03□□□□□ -1.76
CUL4BQ13620 AC024587.2-201ENST00000509458 805 ntTSL 3 BASIC4.03□□□□□ -1.76
CUL4BQ13620 HMGN1P28-201ENST00000521340 364 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
CUL4BQ13620 AC009623.2-201ENST00000522524 465 ntTSL 3 BASIC4.03□□□□□ -1.76
CUL4BQ13620 RGS5-206ENST00000527988 373 ntTSL 1 (best) BASIC4.03□□□□□ -1.76
CUL4BQ13620 AP002892.1-201ENST00000537727 550 ntTSL 4 BASIC4.03□□□□□ -1.76
CUL4BQ13620 MRPL42-204ENST00000548545 692 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC4.03□□□□□ -1.76
CUL4BQ13620 AL162311.1-201ENST00000553046 601 ntTSL 3 BASIC4.03□□□□□ -1.76
CUL4BQ13620 ALDH3A2-208ENST00000571163 590 ntTSL 5 BASIC4.03□□□□□ -1.76
CUL4BQ13620 OR4K8P-201ENST00000578842 1048 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
CUL4BQ13620 AC090371.2-202ENST00000582239 644 ntTSL 5 BASIC4.03□□□□□ -1.76
CUL4BQ13620 MIR4697-201ENST00000582977 78 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
CUL4BQ13620 AC011461.1-201ENST00000592671 357 ntTSL 3 BASIC4.03□□□□□ -1.76
CUL4BQ13620 PPP3CB-AS1-206ENST00000595935 675 ntTSL 5 BASIC4.03□□□□□ -1.76
CUL4BQ13620 AC008946.1-201ENST00000599756 421 ntTSL 3 BASIC4.03□□□□□ -1.76
CUL4BQ13620 AC006077.1-201ENST00000604746 343 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
CUL4BQ13620 AC239868.4-201ENST00000608318 671 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
CUL4BQ13620 OR10AB1P-201ENST00000609613 938 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
CUL4BQ13620 AL109811.3-202ENST00000612387 651 ntTSL 3 BASIC4.03□□□□□ -1.76
CUL4BQ13620 AC011939.3-201ENST00000613686 466 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
CUL4BQ13620 AC104010.1-201ENST00000616889 150 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
CUL4BQ13620 AL360181.4-201ENST00000621752 134 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
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