Protein–RNA interactions for Protein: Q13492

PICALM, Phosphatidylinositol-binding clathrin assembly protein, humanhuman

Predictions only

Length 652 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PICALMQ13492 KLHL13-208ENST00000541812 3102 ntTSL 2 BASIC4.38□□□□□ -1.71
PICALMQ13492 LINC01111-201ENST00000518732 1663 ntTSL 1 (best) BASIC4.38□□□□□ -1.71
PICALMQ13492 AL133383.2-201ENST00000622958 2336 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
PICALMQ13492 CD36-221ENST00000534394 1741 ntTSL 2 BASIC4.38□□□□□ -1.71
PICALMQ13492 CSNK1G3-203ENST00000361991 2424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.37□□□□□ -1.71
PICALMQ13492 LINC00158-201ENST00000332587 1476 ntTSL 1 (best) BASIC4.37□□□□□ -1.71
PICALMQ13492 PTP4A1-205ENST00000626021 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.37□□□□□ -1.71
PICALMQ13492 TMEM38B-201ENST00000374688 3956 ntTSL 2 BASIC4.37□□□□□ -1.71
PICALMQ13492 NT5C3A-202ENST00000381626 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.37□□□□□ -1.71
PICALMQ13492 RNU5E-8P-201ENST00000363502 116 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
PICALMQ13492 RNU6-754P-201ENST00000391166 107 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
PICALMQ13492 Z93403.1-201ENST00000411879 895 ntTSL 5 BASIC4.37□□□□□ -1.71
PICALMQ13492 AC092155.1-202ENST00000416111 932 ntTSL 1 (best) BASIC4.37□□□□□ -1.71
PICALMQ13492 CYP4F29P-201ENST00000420685 446 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
PICALMQ13492 AC245054.1-201ENST00000420944 258 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
PICALMQ13492 AP000907.1-201ENST00000428428 510 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
PICALMQ13492 AC020571.1-201ENST00000430904 768 ntTSL 2 BASIC4.37□□□□□ -1.71
PICALMQ13492 PCCA-AS1-203ENST00000455958 356 ntTSL 3 BASIC4.37□□□□□ -1.71
PICALMQ13492 LINC01510-203ENST00000458082 626 ntTSL 3 BASIC4.37□□□□□ -1.71
PICALMQ13492 AC108860.1-201ENST00000484521 383 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
PICALMQ13492 AC004069.2-201ENST00000505438 1114 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
PICALMQ13492 AC093534.2-201ENST00000511418 420 ntTSL 3 BASIC4.37□□□□□ -1.71
PICALMQ13492 RNA5SP468-201ENST00000516782 93 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
PICALMQ13492 RNU6-201P-201ENST00000517100 61 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
PICALMQ13492 AC008489.1-201ENST00000524271 483 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
PICALMQ13492 RRAS2-210ENST00000534746 993 ntTSL 2 BASIC4.37□□□□□ -1.71
PICALMQ13492 AC010175.1-201ENST00000538219 224 ntTSL 5 BASIC4.37□□□□□ -1.71
PICALMQ13492 LYZ-203ENST00000549690 669 ntTSL 2 BASIC4.37□□□□□ -1.71
PICALMQ13492 AC012379.1-201ENST00000558304 406 ntTSL 3 BASIC4.37□□□□□ -1.71
PICALMQ13492 MED28P6-201ENST00000558776 231 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
PICALMQ13492 AP005136.1-201ENST00000579765 429 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
PICALMQ13492 AC104534.1-201ENST00000594558 566 ntTSL 4 BASIC4.37□□□□□ -1.71
PICALMQ13492 AP001981.2-201ENST00000603241 418 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
PICALMQ13492 AC093783.1-201ENST00000612976 329 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
PICALMQ13492 AC009159.1-201ENST00000618386 642 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
PICALMQ13492 WFDC11-203ENST00000618797 561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.37□□□□□ -1.71
PICALMQ13492 AP000553.6-201ENST00000641242 118 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
PICALMQ13492 PRO1804-201ENST00000623780 2050 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
PICALMQ13492 IQCH-201ENST00000335894 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.37□□□□□ -1.71
PICALMQ13492 AC005832.2-201ENST00000538921 1430 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
PICALMQ13492 RFX7-201ENST00000559447 10426 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC4.36□□□□□ -1.71
PICALMQ13492 AGTR1-208ENST00000475347 1669 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.36□□□□□ -1.71
PICALMQ13492 CCDC14-217ENST00000485727 7917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.36□□□□□ -1.71
PICALMQ13492 PARP8-201ENST00000281631 7177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.36□□□□□ -1.71
PICALMQ13492 N4BP2L2-201ENST00000267068 9427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.36□□□□□ -1.71
PICALMQ13492 MIR19A-201ENST00000384878 82 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
PICALMQ13492 SNORD115.1-201ENST00000391109 76 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
PICALMQ13492 RNU4-65P-201ENST00000410473 140 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
PICALMQ13492 Y_RNA.608-201ENST00000410647 95 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
PICALMQ13492 RN7SKP142-201ENST00000411236 328 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
PICALMQ13492 AC019064.1-201ENST00000414796 499 ntTSL 2 BASIC4.36□□□□□ -1.71
PICALMQ13492 AC079163.1-201ENST00000418416 407 ntTSL 2 BASIC4.36□□□□□ -1.71
PICALMQ13492 SLC44A3-AS1-205ENST00000424505 612 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
PICALMQ13492 AC004160.1-205ENST00000428967 577 ntTSL 4 BASIC4.36□□□□□ -1.71
PICALMQ13492 AL138916.1-201ENST00000436295 455 ntTSL 3 BASIC4.36□□□□□ -1.71
PICALMQ13492 MTND4P32-201ENST00000437189 1237 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
PICALMQ13492 AL049734.2-201ENST00000441066 616 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
PICALMQ13492 AL161725.2-201ENST00000442442 403 ntTSL 3 BASIC4.36□□□□□ -1.71
PICALMQ13492 AC006480.1-201ENST00000449887 378 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
PICALMQ13492 SNRPFP4-201ENST00000456366 242 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
PICALMQ13492 RNA5SP269-201ENST00000459032 137 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
PICALMQ13492 AC135721.1-201ENST00000497954 479 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
PICALMQ13492 AL139147.1-201ENST00000502413 1156 ntTSL 2 BASIC4.36□□□□□ -1.71
PICALMQ13492 AC093297.2-205ENST00000508123 572 ntTSL 3 BASIC4.36□□□□□ -1.71
PICALMQ13492 DEFB108D-201ENST00000527787 222 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
PICALMQ13492 LINC02442-202ENST00000540761 382 ntTSL 2 BASIC4.36□□□□□ -1.71
PICALMQ13492 AC092718.6-202ENST00000563072 408 ntTSL 2 BASIC4.36□□□□□ -1.71
PICALMQ13492 COX6CP3-201ENST00000580869 223 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
PICALMQ13492 NBR2-204ENST00000587322 63 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
PICALMQ13492 AL358072.1-201ENST00000604156 575 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
PICALMQ13492 AC112191.3-201ENST00000604371 277 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
PICALMQ13492 AL359999.1-201ENST00000604513 294 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
PICALMQ13492 AC080013.6-201ENST00000606185 215 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
PICALMQ13492 AC007038.2-201ENST00000608095 740 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
PICALMQ13492 AC004067.1-201ENST00000608733 700 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
PICALMQ13492 AC004908.2-201ENST00000609090 574 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
PICALMQ13492 AC025594.3-201ENST00000613068 790 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
PICALMQ13492 uc_338.32-201ENST00000615087 172 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
PICALMQ13492 AC091953.5-201ENST00000622919 233 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
PICALMQ13492 DDX10P1-201ENST00000448545 1933 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
PICALMQ13492 GABRG2-208ENST00000638552 3710 ntTSL 5 BASIC4.36□□□□□ -1.71
PICALMQ13492 ZNF883-201ENST00000619044 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.36□□□□□ -1.71
PICALMQ13492 AP001486.2-201ENST00000561652 5113 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
PICALMQ13492 AL138713.1-201ENST00000624026 2130 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
PICALMQ13492 UBE3A-202ENST00000397954 2873 ntTSL 5 BASIC4.35□□□□□ -1.71
PICALMQ13492 MUC7-203ENST00000456088 2479 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC4.35□□□□□ -1.71
PICALMQ13492 DLD-204ENST00000437604 1859 ntTSL 2 BASIC4.35□□□□□ -1.71
PICALMQ13492 SYT14-208ENST00000637265 13567 ntTSL 5 BASIC4.35□□□□□ -1.71
PICALMQ13492 CCDC110-202ENST00000393540 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.35□□□□□ -1.71
PICALMQ13492 FGF7P2-201ENST00000332473 296 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
PICALMQ13492 TEX43-201ENST00000357147 464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.35□□□□□ -1.71
PICALMQ13492 RNU4-91P-201ENST00000364778 135 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
PICALMQ13492 LGI1-201ENST00000371413 1247 ntTSL 1 (best) BASIC4.35□□□□□ -1.71
PICALMQ13492 DEFB109C-201ENST00000382575 264 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
PICALMQ13492 DEFB109B-201ENST00000382656 264 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
PICALMQ13492 RNU6-76P-201ENST00000384060 104 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
PICALMQ13492 RNA5SP306-201ENST00000411087 107 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
PICALMQ13492 DBIP2-201ENST00000419076 262 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
PICALMQ13492 EIF4EP1-201ENST00000422311 642 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
PICALMQ13492 PPP1R11P2-201ENST00000423543 382 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
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