Protein–RNA interactions for Protein: Q13485

SMAD4, Mothers against decapentaplegic homolog 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 552 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD4Q13485 RNA5SP283-201ENST00000365604 119 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
SMAD4Q13485 AKAP14-202ENST00000371422 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
SMAD4Q13485 RNU6-1297P-201ENST00000384415 104 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
SMAD4Q13485 TRAV26-1-201ENST00000390455 537 ntAPPRIS P1 BASIC4.75□□□□□ -1.65
SMAD4Q13485 CTNNA2-204ENST00000409266 432 ntTSL 3 BASIC4.75□□□□□ -1.65
SMAD4Q13485 AC003092.1-201ENST00000415536 639 ntTSL 3 BASIC4.75□□□□□ -1.65
SMAD4Q13485 AL031736.2-201ENST00000426573 787 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
SMAD4Q13485 AC241644.1-201ENST00000431525 446 ntTSL 3 BASIC4.75□□□□□ -1.65
SMAD4Q13485 AL683807.1-202ENST00000432272 382 ntTSL 2 BASIC4.75□□□□□ -1.65
SMAD4Q13485 RPS20P5-201ENST00000434808 360 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
SMAD4Q13485 AL033504.1-204ENST00000434985 413 ntTSL 2 BASIC4.75□□□□□ -1.65
SMAD4Q13485 RPS3AP52-201ENST00000435639 297 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
SMAD4Q13485 NANOGP10-201ENST00000453325 895 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
SMAD4Q13485 APOA2-207ENST00000470459 416 ntTSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
SMAD4Q13485 MTCO1P29-201ENST00000496868 288 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
SMAD4Q13485 AC021146.2-201ENST00000504736 556 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
SMAD4Q13485 AC008883.2-201ENST00000505796 414 ntTSL 3 BASIC4.75□□□□□ -1.65
SMAD4Q13485 AC096577.1-203ENST00000506386 541 ntTSL 3 BASIC4.75□□□□□ -1.65
SMAD4Q13485 HMGB3P15-201ENST00000507326 574 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
SMAD4Q13485 LINC02149-201ENST00000511443 558 ntTSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
SMAD4Q13485 AC009597.1-201ENST00000521215 584 ntTSL 4 BASIC4.75□□□□□ -1.65
SMAD4Q13485 AC091944.1-201ENST00000521984 449 ntTSL 3 BASIC4.75□□□□□ -1.65
SMAD4Q13485 AC009511.1-201ENST00000543527 191 ntTSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
SMAD4Q13485 LSM3P2-201ENST00000551246 273 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
SMAD4Q13485 AC134312.3-201ENST00000566155 213 ntTSL 2 BASIC4.75□□□□□ -1.65
SMAD4Q13485 AC116003.1-202ENST00000579386 501 ntTSL 3 BASIC4.75□□□□□ -1.65
SMAD4Q13485 MIR4286-201ENST00000580651 93 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
SMAD4Q13485 GLUD1P4-201ENST00000590914 418 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
SMAD4Q13485 LINC01515-204ENST00000595269 402 ntTSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
SMAD4Q13485 RPL23AP92-201ENST00000603609 255 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
SMAD4Q13485 AC130324.3-201ENST00000614165 542 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
SMAD4Q13485 AL713922.2-201ENST00000619384 716 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
SMAD4Q13485 RPS4Y2-201ENST00000629237 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
SMAD4Q13485 HMBOX1-202ENST00000355231 1694 ntTSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
SMAD4Q13485 WDR72-202ENST00000396328 7507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
SMAD4Q13485 OR56A1-202ENST00000641423 6096 ntAPPRIS P1 BASIC4.75□□□□□ -1.65
SMAD4Q13485 KIF21A-201ENST00000361418 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
SMAD4Q13485 LIMA1-212ENST00000552491 2652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.75□□□□□ -1.65
SMAD4Q13485 SGMS2-201ENST00000359079 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
SMAD4Q13485 LPAR4-201ENST00000435339 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
SMAD4Q13485 DOCK7-211ENST00000634264 6303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
SMAD4Q13485 AL450345.1-202ENST00000605741 3881 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
SMAD4Q13485 NLRP11-202ENST00000589824 3231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.74□□□□□ -1.65
SMAD4Q13485 DENND4A-201ENST00000431932 5875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
SMAD4Q13485 OR6K3-201ENST00000368145 1844 ntAPPRIS P1 BASIC4.74□□□□□ -1.65
SMAD4Q13485 AC128685.1-201ENST00000490357 1834 ntTSL 5 BASIC4.74□□□□□ -1.65
SMAD4Q13485 WEE2-201ENST00000397541 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
SMAD4Q13485 SKP1-202ENST00000353411 9474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
SMAD4Q13485 DNAAF4-CCPG1-201ENST00000565113 4589 ntTSL 2 BASIC4.74□□□□□ -1.65
SMAD4Q13485 DSE-204ENST00000452085 10586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
SMAD4Q13485 PRTG-201ENST00000389286 11967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
SMAD4Q13485 ATP8B4-211ENST00000559829 4894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.74□□□□□ -1.65
SMAD4Q13485 PIGW-206ENST00000620233 2264 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.74□□□□□ -1.65
SMAD4Q13485 ADGRL3-203ENST00000506700 4838 ntTSL 5 BASIC4.74□□□□□ -1.65
SMAD4Q13485 LDHAL6CP-202ENST00000550738 3224 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
SMAD4Q13485 TSHB-201ENST00000256592 537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.74□□□□□ -1.65
SMAD4Q13485 AL139276.1-201ENST00000311910 1001 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
SMAD4Q13485 MIR208A-201ENST00000362287 71 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
SMAD4Q13485 RNU6-28P-201ENST00000362378 107 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
SMAD4Q13485 Y_RNA.22-201ENST00000362492 102 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
SMAD4Q13485 RNA5SP387-201ENST00000364226 106 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
SMAD4Q13485 Y_RNA.301-201ENST00000364990 103 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
SMAD4Q13485 Y_RNA.339-201ENST00000365325 102 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
SMAD4Q13485 RGS4-201ENST00000367906 930 ntTSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
SMAD4Q13485 LST1-207ENST00000376092 285 ntTSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
SMAD4Q13485 PTMAP2-201ENST00000397627 327 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
SMAD4Q13485 CYCSP19-201ENST00000411715 316 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
SMAD4Q13485 AC009237.10-201ENST00000414112 510 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
SMAD4Q13485 AC245054.2-201ENST00000415639 319 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
SMAD4Q13485 AL161631.1-201ENST00000417933 486 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
SMAD4Q13485 AC011243.1-201ENST00000420184 415 ntTSL 3 BASIC4.74□□□□□ -1.65
SMAD4Q13485 AC012065.2-201ENST00000421295 375 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
SMAD4Q13485 AC018630.2-202ENST00000422992 927 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
SMAD4Q13485 LINC01037-201ENST00000427337 424 ntTSL 5 BASIC4.74□□□□□ -1.65
SMAD4Q13485 TRAPPC2P3-201ENST00000443200 321 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
SMAD4Q13485 AL590639.1-201ENST00000456484 337 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
SMAD4Q13485 RPL7L1P8-201ENST00000469911 741 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
SMAD4Q13485 AC087879.1-201ENST00000474343 374 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
SMAD4Q13485 AC012181.1-201ENST00000479895 423 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
SMAD4Q13485 AC111194.2-201ENST00000511222 455 ntTSL 5 BASIC4.74□□□□□ -1.65
SMAD4Q13485 RNU6-559P-201ENST00000516151 98 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
SMAD4Q13485 RN7SKP219-201ENST00000516825 296 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
SMAD4Q13485 NARSP2-201ENST00000518524 679 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
SMAD4Q13485 AC109466.1-211ENST00000519327 496 ntTSL 3 BASIC4.74□□□□□ -1.65
SMAD4Q13485 AC068992.1-201ENST00000521411 543 ntTSL 5 BASIC4.74□□□□□ -1.65
SMAD4Q13485 AC009509.2-201ENST00000538640 429 ntTSL 2 BASIC4.74□□□□□ -1.65
SMAD4Q13485 PYM1-205ENST00000547925 499 ntTSL 3 BASIC4.74□□□□□ -1.65
SMAD4Q13485 DYNLL1P4-201ENST00000549314 266 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
SMAD4Q13485 AC026116.1-201ENST00000551729 474 ntTSL 3 BASIC4.74□□□□□ -1.65
SMAD4Q13485 AL163153.1-201ENST00000554223 283 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
SMAD4Q13485 AC006270.2-201ENST00000578523 652 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
SMAD4Q13485 MIR3944-201ENST00000581277 108 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
SMAD4Q13485 AC011518.1-202ENST00000592668 407 ntTSL 5 BASIC4.74□□□□□ -1.65
SMAD4Q13485 AL627309.6-201ENST00000606857 840 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
SMAD4Q13485 OR6R2P-201ENST00000609216 300 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
SMAD4Q13485 MIR8059-201ENST00000620427 81 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
SMAD4Q13485 7SK.10-201ENST00000621414 298 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
SMAD4Q13485 AC112484.5-201ENST00000624189 228 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
SMAD4Q13485 TTK-211ENST00000627129 240 ntTSL 5 BASIC4.74□□□□□ -1.65
SMAD4Q13485 CYP3A51P-201ENST00000633513 256 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
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