Protein–RNA interactions for Protein: Q13370

PDE3B, cGMP-inhibited 3',5'-cyclic phosphodiesterase B, humanhuman

Predictions only

Length 1,112 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE3BQ13370 INPP4B-220ENST00000513000 8831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
PDE3BQ13370 KCNJ6-201ENST00000609713 19645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
PDE3BQ13370 EIF2AP4-201ENST00000424793 1781 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
PDE3BQ13370 RGS5-201ENST00000313961 5862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
PDE3BQ13370 RC3H1-201ENST00000258349 10988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
PDE3BQ13370 NPFFR2-203ENST00000358749 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
PDE3BQ13370 LRRC9-202ENST00000445360 4717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
PDE3BQ13370 FAM169A-203ENST00000510496 5810 ntTSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
PDE3BQ13370 ZBTB8OS-201ENST00000341885 312 ntTSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
PDE3BQ13370 Y_RNA.67-201ENST00000362870 100 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
PDE3BQ13370 5S_rRNA.1-201ENST00000364415 116 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
PDE3BQ13370 WFDC6-202ENST00000372670 620 ntTSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
PDE3BQ13370 Y_RNA.419-201ENST00000384041 102 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
PDE3BQ13370 SNORD37.1-201ENST00000390968 65 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
PDE3BQ13370 CD3D-202ENST00000392884 476 ntTSL 2 BASIC5.98□□□□□ -1.45
PDE3BQ13370 RN7SKP32-201ENST00000410167 303 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
PDE3BQ13370 AL109924.3-201ENST00000413324 393 ntTSL 2 BASIC5.98□□□□□ -1.45
PDE3BQ13370 AC009161.1-201ENST00000417306 376 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
PDE3BQ13370 LINC00368-201ENST00000422994 650 ntTSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
PDE3BQ13370 AL122034.1-201ENST00000427609 497 ntTSL 2 BASIC5.98□□□□□ -1.45
PDE3BQ13370 RPL23AP25-201ENST00000430973 463 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
PDE3BQ13370 OR4K11P-201ENST00000431829 904 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
PDE3BQ13370 AC093156.1-201ENST00000440382 670 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
PDE3BQ13370 AP000844.1-201ENST00000446631 577 ntTSL 3 BASIC5.98□□□□□ -1.45
PDE3BQ13370 NANOGP10-201ENST00000453325 895 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
PDE3BQ13370 AC092264.1-201ENST00000456002 713 ntTSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
PDE3BQ13370 AL049714.1-201ENST00000466686 347 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
PDE3BQ13370 AL163973.1-201ENST00000484753 577 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
PDE3BQ13370 NREP-AS1-201ENST00000503242 411 ntTSL 3 BASIC5.98□□□□□ -1.45
PDE3BQ13370 AC100773.1-201ENST00000505409 520 ntTSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
PDE3BQ13370 AC103851.1-201ENST00000506833 274 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
PDE3BQ13370 AC108517.1-201ENST00000512546 327 ntTSL 3 BASIC5.98□□□□□ -1.45
PDE3BQ13370 AC016065.2-201ENST00000514530 444 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
PDE3BQ13370 AC100768.1-201ENST00000525512 506 ntTSL 3 BASIC5.98□□□□□ -1.45
PDE3BQ13370 AC100770.1-201ENST00000532310 322 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
PDE3BQ13370 NACA-211ENST00000548563 827 ntTSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
PDE3BQ13370 AL442663.2-201ENST00000554385 511 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
PDE3BQ13370 AC023034.1-201ENST00000558141 518 ntTSL 3 BASIC5.98□□□□□ -1.45
PDE3BQ13370 OR4K8P-201ENST00000578842 1048 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
PDE3BQ13370 AC010928.3-201ENST00000587712 541 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
PDE3BQ13370 AC008739.3-201ENST00000603262 127 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
PDE3BQ13370 AL161729.3-201ENST00000603533 673 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
PDE3BQ13370 PART1_1.1-201ENST00000611761 217 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
PDE3BQ13370 AL122125.1-201ENST00000616999 600 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
PDE3BQ13370 MIR8059-201ENST00000620427 81 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
PDE3BQ13370 AL160413.1-201ENST00000622780 310 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
PDE3BQ13370 MIR548A1HG-201ENST00000636739 558 ntTSL 4 BASIC5.98□□□□□ -1.45
PDE3BQ13370 PTER-201ENST00000298942 3448 ntTSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
PDE3BQ13370 CPHL1P-201ENST00000461341 3407 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
PDE3BQ13370 VIRMA-201ENST00000297591 6528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
PDE3BQ13370 CNTN5-209ENST00000528682 3800 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
PDE3BQ13370 RAP1B-201ENST00000250559 13438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
PDE3BQ13370 MLIP-213ENST00000514921 5743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
PDE3BQ13370 HACD4-202ENST00000495827 8267 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.98□□□□□ -1.45
PDE3BQ13370 RASA1-205ENST00000512763 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.97□□□□□ -1.45
PDE3BQ13370 LRMP-201ENST00000354454 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
PDE3BQ13370 AKAP11-201ENST00000025301 9920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
PDE3BQ13370 MATR3-228ENST00000620916 3134 ntTSL 5 BASIC5.97□□□□□ -1.45
PDE3BQ13370 LARP1BP1-201ENST00000506036 1359 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
PDE3BQ13370 CEP295-201ENST00000325212 8057 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC5.97□□□□□ -1.45
PDE3BQ13370 KLF12-201ENST00000377669 10637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
PDE3BQ13370 ZNF208-207ENST00000609966 3653 ntTSL 5 BASIC5.97□□□□□ -1.45
PDE3BQ13370 WAC-221ENST00000628285 2740 ntTSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
PDE3BQ13370 RNA5SP513-201ENST00000364648 118 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
PDE3BQ13370 RGS4-201ENST00000367906 930 ntTSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
PDE3BQ13370 RNU6-39P-201ENST00000384344 107 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
PDE3BQ13370 AF228730.4-201ENST00000421457 183 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
PDE3BQ13370 MTCYBP8-201ENST00000422855 651 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
PDE3BQ13370 DDX3P2-201ENST00000446138 111 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
PDE3BQ13370 AL356010.1-201ENST00000456364 102 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
PDE3BQ13370 AC053481.1-201ENST00000467217 306 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
PDE3BQ13370 AC022795.1-201ENST00000473808 480 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
PDE3BQ13370 HSPD1P15-201ENST00000505573 1122 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
PDE3BQ13370 LINC02149-201ENST00000511443 558 ntTSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
PDE3BQ13370 AC114797.1-201ENST00000514003 728 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
PDE3BQ13370 AC114550.2-201ENST00000524008 397 ntTSL 3 BASIC5.97□□□□□ -1.45
PDE3BQ13370 AC055720.2-201ENST00000537724 172 ntTSL 3 BASIC5.97□□□□□ -1.45
PDE3BQ13370 AC005668.1-201ENST00000571142 476 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
PDE3BQ13370 AC090409.2-202ENST00000585706 604 ntTSL 5 BASIC5.97□□□□□ -1.45
PDE3BQ13370 AC005498.1-201ENST00000592125 465 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
PDE3BQ13370 AC004853.1-201ENST00000604902 698 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
PDE3BQ13370 AP000569.1-201ENST00000607953 591 ntTSL 2 BASIC5.97□□□□□ -1.45
PDE3BQ13370 uc_338.5-201ENST00000611839 155 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
PDE3BQ13370 AC015908.5-201ENST00000623289 343 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
PDE3BQ13370 TPTEP1-208ENST00000636884 213 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
PDE3BQ13370 MTRNR2L10-201ENST00000545075 1530 ntAPPRIS P1 BASIC5.97□□□□□ -1.45
PDE3BQ13370 SERPINI2-209ENST00000616363 1769 ntTSL 5 BASIC5.97□□□□□ -1.45
PDE3BQ13370 CSMD3-201ENST00000297405 13212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
PDE3BQ13370 UBE3A-203ENST00000428984 2986 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.97□□□□□ -1.45
PDE3BQ13370 CCSER2-210ENST00000543283 5888 ntTSL 2 BASIC5.96□□□□□ -1.45
PDE3BQ13370 PCDH11X-204ENST00000373088 4069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
PDE3BQ13370 MUCL1-201ENST00000308796 470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
PDE3BQ13370 RNU5A-8P-201ENST00000364102 114 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
PDE3BQ13370 RNVU1-3-201ENST00000364313 161 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
PDE3BQ13370 RNU1-63P-201ENST00000383902 164 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
PDE3BQ13370 RNU1-44P-201ENST00000384453 163 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
PDE3BQ13370 RNU6-606P-201ENST00000384721 111 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
PDE3BQ13370 MIR200C-201ENST00000384980 68 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
PDE3BQ13370 AL354751.2-201ENST00000415471 210 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
PDE3BQ13370 CRYBB2P1-203ENST00000415709 538 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 106.6 ms