Protein–RNA interactions for Protein: Q13332

PTPRS, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase S, humanhuman

Predictions only

Length 1,948 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRSQ13332 MTCYBP41-201ENST00000528913 1123 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
PTPRSQ13332 LINC01479-201ENST00000545520 509 ntTSL 2 BASIC2.21□□□□□ -2.06
PTPRSQ13332 MIR5002-201ENST00000584713 97 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
PTPRSQ13332 AC006116.7-201ENST00000590141 756 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
PTPRSQ13332 AC110609.1-201ENST00000608228 303 ntTSL 3 BASIC2.21□□□□□ -2.06
PTPRSQ13332 AL355578.1-201ENST00000607405 1328 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
PTPRSQ13332 AC007342.9-201ENST00000623877 1385 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
PTPRSQ13332 ACTR6-212ENST00000552376 1659 ntTSL 5 BASIC2.2□□□□□ -2.06
PTPRSQ13332 NEB-220ENST00000618972 26307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.2□□□□□ -2.06
PTPRSQ13332 TRIQK-204ENST00000517858 1882 ntTSL 3 BASIC2.2□□□□□ -2.06
PTPRSQ13332 TAB3-205ENST00000378933 6671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.2□□□□□ -2.06
PTPRSQ13332 BX248415.1-201ENST00000367421 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.2□□□□□ -2.06
PTPRSQ13332 SNORA26.9-201ENST00000391322 122 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
PTPRSQ13332 RNU4-65P-201ENST00000410473 140 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
PTPRSQ13332 RPL23AP39-201ENST00000415533 405 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
PTPRSQ13332 RBM6-203ENST00000421682 684 ntTSL 2 BASIC2.2□□□□□ -2.06
PTPRSQ13332 ACTR3BP6-201ENST00000422332 1241 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
PTPRSQ13332 AC006333.1-201ENST00000422401 410 ntTSL 3 BASIC2.2□□□□□ -2.06
PTPRSQ13332 AL590783.1-201ENST00000424138 456 ntTSL 2 BASIC2.2□□□□□ -2.06
PTPRSQ13332 RPL21P66-201ENST00000426566 466 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
PTPRSQ13332 AC008067.1-203ENST00000430876 359 ntTSL 3 BASIC2.2□□□□□ -2.06
PTPRSQ13332 SETP8-201ENST00000435341 628 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
PTPRSQ13332 AL590399.3-201ENST00000438072 543 ntTSL 5 BASIC2.2□□□□□ -2.06
PTPRSQ13332 RPL7P54-201ENST00000438336 674 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
PTPRSQ13332 AC132942.1-201ENST00000486753 483 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
PTPRSQ13332 LINC02276-201ENST00000508388 138 ntTSL 3 BASIC2.2□□□□□ -2.06
PTPRSQ13332 MEF2C-AS1-208ENST00000512585 741 ntTSL 5 BASIC2.2□□□□□ -2.06
PTPRSQ13332 LINC02382-201ENST00000515840 614 ntTSL 1 (best) BASIC2.2□□□□□ -2.06
PTPRSQ13332 LINC02490-201ENST00000559915 601 ntTSL 3 BASIC2.2□□□□□ -2.06
PTPRSQ13332 AC034268.2-201ENST00000571784 482 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
PTPRSQ13332 AP001029.3-201ENST00000588063 596 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
PTPRSQ13332 AC128687.1-201ENST00000605304 619 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
PTPRSQ13332 KERA-201ENST00000266719 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.2□□□□□ -2.06
PTPRSQ13332 DYNC2H1-202ENST00000375735 13678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.2□□□□□ -2.06
PTPRSQ13332 NUP35-203ENST00000409798 1470 ntTSL 2 BASIC2.19□□□□□ -2.06
PTPRSQ13332 MTND4P35-201ENST00000604257 1375 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
PTPRSQ13332 Y_RNA.118-201ENST00000363300 101 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
PTPRSQ13332 RNU6-1181P-201ENST00000384191 106 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
PTPRSQ13332 SAR1AP2-201ENST00000392696 594 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
PTPRSQ13332 EEF1E1-BLOC1S5-201ENST00000397456 768 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.19□□□□□ -2.06
PTPRSQ13332 TAF9BP2-201ENST00000400856 499 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
PTPRSQ13332 LINC01347-201ENST00000417964 355 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
PTPRSQ13332 AL442647.1-201ENST00000449485 481 ntTSL 5 BASIC2.19□□□□□ -2.06
PTPRSQ13332 RPS29P11-201ENST00000496507 171 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
PTPRSQ13332 AC107463.1-203ENST00000509713 284 ntTSL 5 BASIC2.19□□□□□ -2.06
PTPRSQ13332 LINC02480-201ENST00000511875 612 ntTSL 2 BASIC2.19□□□□□ -2.06
PTPRSQ13332 AC104997.1-201ENST00000519761 717 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
PTPRSQ13332 AC025300.1-201ENST00000526616 384 ntTSL 3 BASIC2.19□□□□□ -2.06
PTPRSQ13332 AC007450.1-201ENST00000536492 188 ntTSL 3 BASIC2.19□□□□□ -2.06
PTPRSQ13332 AMZ2P1-203ENST00000565833 850 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
PTPRSQ13332 AL137847.3-201ENST00000611521 109 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
PTPRSQ13332 ZFAT-AS1_1.1-201ENST00000620907 79 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
PTPRSQ13332 ENAM-201ENST00000396073 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.19□□□□□ -2.06
PTPRSQ13332 STAU2-225ENST00000523558 1603 ntTSL 2 BASIC2.19□□□□□ -2.06
PTPRSQ13332 RN7SKP226-201ENST00000364912 300 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
PTPRSQ13332 MIR583-201ENST00000384846 75 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
PTPRSQ13332 RNU4-62P-201ENST00000410125 130 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
PTPRSQ13332 AC096632.1-201ENST00000427395 310 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
PTPRSQ13332 LINC02532-205ENST00000430094 628 ntTSL 5 BASIC2.19□□□□□ -2.06
PTPRSQ13332 LINC01986-201ENST00000440867 590 ntTSL 5 BASIC2.19□□□□□ -2.06
PTPRSQ13332 AC018359.1-201ENST00000442567 574 ntTSL 4 BASIC2.19□□□□□ -2.06
PTPRSQ13332 C1orf143-201ENST00000443836 762 ntTSL 2 BASIC2.19□□□□□ -2.06
PTPRSQ13332 AC016556.1-201ENST00000510004 935 ntTSL 2 BASIC2.19□□□□□ -2.06
PTPRSQ13332 LINC01609-201ENST00000519506 424 ntTSL 3 BASIC2.19□□□□□ -2.06
PTPRSQ13332 AC011773.2-201ENST00000551479 285 ntTSL 5 BASIC2.19□□□□□ -2.06
PTPRSQ13332 AF099810.1-201ENST00000554219 525 ntTSL 3 BASIC2.19□□□□□ -2.06
PTPRSQ13332 VN1R80P-201ENST00000597126 338 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
PTPRSQ13332 AL359198.2-201ENST00000611836 194 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
PTPRSQ13332 AC006963.1-201ENST00000624003 1052 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
PTPRSQ13332 GMFB-210ENST00000628554 639 ntTSL 4 BASIC2.19□□□□□ -2.06
PTPRSQ13332 AC010680.1-201ENST00000590024 3590 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
PTPRSQ13332 NT5C3A-202ENST00000381626 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.18□□□□□ -2.06
PTPRSQ13332 PYGO1-201ENST00000302000 8488 ntTSL 1 (best) BASIC2.18□□□□□ -2.06
PTPRSQ13332 RNU6-1151P-201ENST00000384684 107 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
PTPRSQ13332 RNU1-101P-201ENST00000391171 127 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
PTPRSQ13332 PRRC2CP1-201ENST00000404428 159 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
PTPRSQ13332 AP000567.1-201ENST00000406413 156 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
PTPRSQ13332 RNU6-77P-201ENST00000410554 91 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
PTPRSQ13332 RNA5SP270-201ENST00000411361 118 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
PTPRSQ13332 HMGN2P35-201ENST00000412164 270 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
PTPRSQ13332 LUZP4P1-201ENST00000415420 344 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
PTPRSQ13332 AC093422.2-201ENST00000452599 686 ntTSL 2 BASIC2.18□□□□□ -2.06
PTPRSQ13332 AL137802.1-201ENST00000452795 327 ntTSL 5 BASIC2.18□□□□□ -2.06
PTPRSQ13332 MTCO3P35-201ENST00000485582 781 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
PTPRSQ13332 HMGB1P38-201ENST00000490557 577 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
PTPRSQ13332 AC108729.3-201ENST00000513484 108 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
PTPRSQ13332 HMGB1P46-201ENST00000520062 610 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
PTPRSQ13332 DIAPH2-AS1-203ENST00000542084 450 ntTSL 5 BASIC2.18□□□□□ -2.06
PTPRSQ13332 LINC01481-201ENST00000552998 629 ntTSL 2 BASIC2.18□□□□□ -2.06
PTPRSQ13332 AL355812.1-201ENST00000603215 216 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
PTPRSQ13332 ZNF461-214ENST00000618437 774 ntTSL 5 BASIC2.18□□□□□ -2.06
PTPRSQ13332 VN1R7P-201ENST00000619242 903 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
PTPRSQ13332 AC091953.2-201ENST00000623979 160 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
PTPRSQ13332 KIAA1107-202ENST00000636278 4065 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.18□□□□□ -2.06
PTPRSQ13332 MUC15-205ENST00000529533 2084 ntTSL 1 (best) BASIC2.18□□□□□ -2.06
PTPRSQ13332 TMEM27-201ENST00000380342 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.18□□□□□ -2.06
PTPRSQ13332 OR2B2-201ENST00000303324 1212 ntAPPRIS P1 BASIC2.17□□□□□ -2.06
PTPRSQ13332 RNU6-335P-201ENST00000364563 113 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
PTPRSQ13332 AKR1C1-201ENST00000380859 858 ntTSL 3 BASIC2.17□□□□□ -2.06
PTPRSQ13332 MIR591-201ENST00000385290 95 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 94.5 ms