Protein–RNA interactions for Protein: Q13111

CHAF1A, Chromatin assembly factor 1 subunit A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 956 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHAF1AQ13111 TTTY13-201ENST00000330337 659 ntTSL 1 (best) BASIC4.39□□□□□ -1.71
CHAF1AQ13111 MT-ATP6-201ENST00000361899 681 ntAPPRIS P1 BASIC4.39□□□□□ -1.71
CHAF1AQ13111 RNU6-853P-201ENST00000364306 107 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
CHAF1AQ13111 RNU6-769P-201ENST00000384407 104 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
CHAF1AQ13111 RN7SKP285-201ENST00000410137 318 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
CHAF1AQ13111 RNU6-920P-201ENST00000410926 92 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
CHAF1AQ13111 AC019064.1-201ENST00000414796 499 ntTSL 2 BASIC4.39□□□□□ -1.71
CHAF1AQ13111 LHFPL3-AS1-203ENST00000417290 950 ntTSL 1 (best) BASIC4.39□□□□□ -1.71
CHAF1AQ13111 AL445669.1-201ENST00000426743 755 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
CHAF1AQ13111 CYCSP4-201ENST00000429682 331 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
CHAF1AQ13111 REG1CP-203ENST00000434852 460 ntTSL 4 BASIC4.39□□□□□ -1.71
CHAF1AQ13111 NDUFB1P1-201ENST00000435191 180 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
CHAF1AQ13111 AC092641.1-201ENST00000440229 772 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
CHAF1AQ13111 RPS3AP12-201ENST00000443616 753 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
CHAF1AQ13111 AC112653.1-201ENST00000443851 386 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
CHAF1AQ13111 Z83846.1-201ENST00000446798 265 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
CHAF1AQ13111 RPL21P104-201ENST00000464143 478 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
CHAF1AQ13111 RPL23AP14-201ENST00000468281 468 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
CHAF1AQ13111 VN1R17P-201ENST00000472048 1090 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
CHAF1AQ13111 HSPD1P15-201ENST00000505573 1122 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
CHAF1AQ13111 AC097467.3-212ENST00000512269 568 ntTSL 3 BASIC4.39□□□□□ -1.71
CHAF1AQ13111 TBCA-206ENST00000518338 551 ntTSL 2 BASIC4.39□□□□□ -1.71
CHAF1AQ13111 AC090739.1-201ENST00000522190 708 ntTSL 3 BASIC4.39□□□□□ -1.71
CHAF1AQ13111 AP000442.2-202ENST00000531311 601 ntTSL 3 BASIC4.39□□□□□ -1.71
CHAF1AQ13111 AP003781.1-201ENST00000543403 404 ntTSL 3 BASIC4.39□□□□□ -1.71
CHAF1AQ13111 AKIRIN1P1-201ENST00000547384 544 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
CHAF1AQ13111 AC123905.1-201ENST00000552098 541 ntTSL 4 BASIC4.39□□□□□ -1.71
CHAF1AQ13111 AC034268.2-201ENST00000571784 482 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
CHAF1AQ13111 AC023394.2-201ENST00000581987 792 ntTSL 5 BASIC4.39□□□□□ -1.71
CHAF1AQ13111 SATB1-AS1-207ENST00000593741 955 ntTSL 5 BASIC4.39□□□□□ -1.71
CHAF1AQ13111 FBXW7-AS1-201ENST00000605147 372 ntTSL 1 (best) BASIC4.39□□□□□ -1.71
CHAF1AQ13111 NCRUPAR_2.1-201ENST00000616308 99 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
CHAF1AQ13111 U4.6-201ENST00000621618 127 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
CHAF1AQ13111 INPP4B-223ENST00000630044 354 ntTSL 5 BASIC4.39□□□□□ -1.71
CHAF1AQ13111 AC092192.1-201ENST00000633154 1018 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
CHAF1AQ13111 IQCG-205ENST00000455191 1981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.39□□□□□ -1.71
CHAF1AQ13111 SGIP1-206ENST00000435165 3646 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.39□□□□□ -1.71
CHAF1AQ13111 AL158064.1-201ENST00000627044 2242 ntTSL 4 BASIC4.39□□□□□ -1.71
CHAF1AQ13111 ZC3H14-206ENST00000406216 1341 ntTSL 3 BASIC4.39□□□□□ -1.71
CHAF1AQ13111 AL133383.2-201ENST00000622958 2336 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
CHAF1AQ13111 RNF128-202ENST00000324342 2654 ntTSL 1 (best) BASIC4.39□□□□□ -1.71
CHAF1AQ13111 CLUL1-208ENST00000581619 2449 ntTSL 2 BASIC4.38□□□□□ -1.71
CHAF1AQ13111 SYNE1-201ENST00000341594 26584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.38□□□□□ -1.71
CHAF1AQ13111 MTCO1P9-201ENST00000505577 1534 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
CHAF1AQ13111 DDX60L-207ENST00000505890 4568 ntTSL 2 BASIC4.38□□□□□ -1.71
CHAF1AQ13111 RNY4P24-201ENST00000362735 96 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
CHAF1AQ13111 RNU6-501P-201ENST00000364072 100 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
CHAF1AQ13111 SNORA9-201ENST00000384215 133 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
CHAF1AQ13111 MIR135A2-201ENST00000384854 100 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
CHAF1AQ13111 MIR491-201ENST00000384877 84 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
CHAF1AQ13111 PTMAP5-201ENST00000393073 333 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
CHAF1AQ13111 HSPE1P26-201ENST00000405341 275 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
CHAF1AQ13111 RPS27AP14-201ENST00000422868 454 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
CHAF1AQ13111 AC013402.2-201ENST00000424257 437 ntTSL 3 BASIC4.38□□□□□ -1.71
CHAF1AQ13111 BX119904.4-201ENST00000424402 301 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
CHAF1AQ13111 MTCO1P39-201ENST00000426148 480 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
CHAF1AQ13111 AC097713.2-201ENST00000430199 356 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
CHAF1AQ13111 AL354977.1-201ENST00000438147 679 ntTSL 5 BASIC4.38□□□□□ -1.71
CHAF1AQ13111 AL355997.1-202ENST00000454361 610 ntTSL 3 BASIC4.38□□□□□ -1.71
CHAF1AQ13111 AL136097.1-201ENST00000456945 913 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
CHAF1AQ13111 TMED11P-201ENST00000479478 690 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
CHAF1AQ13111 LINC02462-201ENST00000503009 430 ntTSL 5 BASIC4.38□□□□□ -1.71
CHAF1AQ13111 LINC01846-201ENST00000505908 651 ntTSL 5 BASIC4.38□□□□□ -1.71
CHAF1AQ13111 GYPA-209ENST00000512789 258 ntTSL 1 (best) BASIC4.38□□□□□ -1.71
CHAF1AQ13111 AC010261.1-201ENST00000514411 457 ntTSL 5 BASIC4.38□□□□□ -1.71
CHAF1AQ13111 SNORA70.24-201ENST00000517233 118 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
CHAF1AQ13111 LINC01493-203ENST00000534756 509 ntTSL 3 BASIC4.38□□□□□ -1.71
CHAF1AQ13111 LINC02442-202ENST00000540761 382 ntTSL 2 BASIC4.38□□□□□ -1.71
CHAF1AQ13111 AC118755.1-201ENST00000572923 195 ntTSL 3 BASIC4.38□□□□□ -1.71
CHAF1AQ13111 AP005059.2-201ENST00000577527 578 ntTSL 3 BASIC4.38□□□□□ -1.71
CHAF1AQ13111 OR4K8P-201ENST00000578842 1048 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
CHAF1AQ13111 MIR3200-201ENST00000580767 85 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
CHAF1AQ13111 AC004223.2-201ENST00000590309 544 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
CHAF1AQ13111 WISP1-OT1-201ENST00000602893 642 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
CHAF1AQ13111 BCRP9-201ENST00000605312 388 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
CHAF1AQ13111 AL356266.1-201ENST00000623311 483 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
CHAF1AQ13111 AC079597.1-201ENST00000624306 508 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
CHAF1AQ13111 RMDN2-AS1-204ENST00000626669 448 ntTSL 5 BASIC4.38□□□□□ -1.71
CHAF1AQ13111 ASPN-201ENST00000375543 2237 ntTSL 2 BASIC4.38□□□□□ -1.71
CHAF1AQ13111 CALCRL-203ENST00000410068 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.38□□□□□ -1.71
CHAF1AQ13111 MTND5P1-201ENST00000445440 1375 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
CHAF1AQ13111 D21S2088E-201ENST00000262354 1725 ntTSL 1 (best) BASIC4.38□□□□□ -1.71
CHAF1AQ13111 OR51L1-203ENST00000641819 7300 ntAPPRIS P1 BASIC4.37□□□□□ -1.71
CHAF1AQ13111 XRCC4-203ENST00000396027 1530 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.37□□□□□ -1.71
CHAF1AQ13111 FIGNL1-203ENST00000419119 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.37□□□□□ -1.71
CHAF1AQ13111 GABRG2-213ENST00000639046 3058 ntTSL 5 BASIC4.37□□□□□ -1.71
CHAF1AQ13111 SNORD6-201ENST00000365444 73 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
CHAF1AQ13111 Y_RNA.548-201ENST00000384656 105 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
CHAF1AQ13111 MIR184-201ENST00000384962 84 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
CHAF1AQ13111 U3.20-201ENST00000390909 217 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
CHAF1AQ13111 RNU6-882P-201ENST00000391025 103 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
CHAF1AQ13111 AL512286.1-201ENST00000439244 400 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
CHAF1AQ13111 AC019330.1-202ENST00000440609 504 ntTSL 4 BASIC4.37□□□□□ -1.71
CHAF1AQ13111 AC234775.1-201ENST00000454247 670 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
CHAF1AQ13111 AC091770.1-201ENST00000456513 373 ntTSL 2 BASIC4.37□□□□□ -1.71
CHAF1AQ13111 AL122001.1-201ENST00000457027 370 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
CHAF1AQ13111 RPL21P10-201ENST00000463521 490 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
CHAF1AQ13111 AC008155.2-201ENST00000464337 397 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
CHAF1AQ13111 RPS3AP43-201ENST00000479743 781 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
CHAF1AQ13111 RPL7P47-201ENST00000497299 556 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
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