Protein–RNA interactions for Protein: Q13029

PRDM2, PR domain zinc finger protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,718 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRDM2Q13029 AC025033.1-201ENST00000463883 194 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
PRDM2Q13029 AC109486.1-201ENST00000486833 374 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
PRDM2Q13029 AC009511.1-201ENST00000543527 191 ntTSL 5 BASIC3.02□□□□□ -1.93
PRDM2Q13029 PPFIA2-AS1-202ENST00000549161 1080 ntTSL 3 BASIC3.02□□□□□ -1.93
PRDM2Q13029 ALDH3A2-208ENST00000571163 590 ntTSL 5 BASIC3.02□□□□□ -1.93
PRDM2Q13029 AC004542.1-201ENST00000602955 264 ntTSL 3 BASIC3.02□□□□□ -1.93
PRDM2Q13029 AL035411.2-201ENST00000604022 421 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
PRDM2Q13029 BX248123.2-201ENST00000606318 124 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
PRDM2Q13029 CLECL1-204ENST00000621400 611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.02□□□□□ -1.93
PRDM2Q13029 ZNF720P1-201ENST00000562403 1939 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
PRDM2Q13029 OR1A2-201ENST00000381951 930 ntAPPRIS P1 BASIC3.01□□□□□ -1.93
PRDM2Q13029 C1orf195-201ENST00000424792 255 ntTSL 2 BASIC3.01□□□□□ -1.93
PRDM2Q13029 AL591721.1-201ENST00000439849 751 ntTSL 3 BASIC3.01□□□□□ -1.93
PRDM2Q13029 AC093297.2-207ENST00000505401 692 ntTSL 3 BASIC3.01□□□□□ -1.93
PRDM2Q13029 SPINK7-205ENST00000523535 299 ntTSL 2 BASIC3.01□□□□□ -1.93
PRDM2Q13029 FGF7-206ENST00000614567 3936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3□□□□□ -1.93
PRDM2Q13029 ATP11C-201ENST00000327569 6115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3□□□□□ -1.93
PRDM2Q13029 MAPK10-266ENST00000641066 6555 ntBASIC3□□□□□ -1.93
PRDM2Q13029 RNU6-392P-201ENST00000364926 101 ntBASIC3□□□□□ -1.93
PRDM2Q13029 RN7SKP101-201ENST00000411376 320 ntBASIC3□□□□□ -1.93
PRDM2Q13029 RPS7P9-201ENST00000414704 586 ntBASIC3□□□□□ -1.93
PRDM2Q13029 FNDC3CP-201ENST00000420795 1155 ntBASIC3□□□□□ -1.93
PRDM2Q13029 HSPE1P1-201ENST00000421494 318 ntBASIC3□□□□□ -1.93
PRDM2Q13029 AL591475.1-201ENST00000429060 489 ntTSL 2 BASIC3□□□□□ -1.93
PRDM2Q13029 AMD1P1-201ENST00000457220 922 ntBASIC3□□□□□ -1.93
PRDM2Q13029 AC002558.3-201ENST00000574021 401 ntTSL 3 BASIC3□□□□□ -1.93
PRDM2Q13029 AC019159.1-201ENST00000605094 187 ntBASIC3□□□□□ -1.93
PRDM2Q13029 RNA5SP108-201ENST00000605921 117 ntBASIC3□□□□□ -1.93
PRDM2Q13029 JMJD1C-210ENST00000542921 8149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3□□□□□ -1.93
PRDM2Q13029 RPL7P37-201ENST00000425095 738 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
PRDM2Q13029 USP9YP10-201ENST00000454868 628 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
PRDM2Q13029 TH2LCRR-203ENST00000457489 439 ntTSL 3 BASIC2.99□□□□□ -1.93
PRDM2Q13029 LAMTOR5-AS1-203ENST00000585330 463 ntTSL 2 BASIC2.99□□□□□ -1.93
PRDM2Q13029 MIR502-201ENST00000606349 86 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
PRDM2Q13029 VN1R74P-201ENST00000613259 503 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
PRDM2Q13029 RNA5SP181-201ENST00000410246 98 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
PRDM2Q13029 HMGN2P21-201ENST00000447764 270 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
PRDM2Q13029 RPL21P131-201ENST00000497298 483 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
PRDM2Q13029 MTCYBP17-201ENST00000503579 789 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
PRDM2Q13029 VTRNA2-2P-201ENST00000516091 103 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
PRDM2Q13029 uc_338.5-201ENST00000611839 155 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
PRDM2Q13029 NDUFAF4-201ENST00000316149 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.98□□□□□ -1.93
PRDM2Q13029 RNU4-13P-201ENST00000364019 141 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
PRDM2Q13029 AC009237.2-201ENST00000421358 284 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
PRDM2Q13029 RNA5SP82-201ENST00000516707 92 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
PRDM2Q13029 PRELID2P1-201ENST00000552837 301 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
PRDM2Q13029 AC091057.2-201ENST00000602594 792 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
PRDM2Q13029 MLF1-203ENST00000392822 2157 ntTSL 5 BASIC2.98□□□□□ -1.93
PRDM2Q13029 AC022022.1-201ENST00000430304 178 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
PRDM2Q13029 AC005912.1-201ENST00000495392 255 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
PRDM2Q13029 AL358333.2-201ENST00000556834 529 ntTSL 5 BASIC2.97□□□□□ -1.93
PRDM2Q13029 AP001542.2-201ENST00000593141 364 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
PRDM2Q13029 AC092954.1-201ENST00000609121 445 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
PRDM2Q13029 CNOT1-223ENST00000628857 291 ntTSL 5 BASIC2.97□□□□□ -1.93
PRDM2Q13029 AC090897.3-201ENST00000636973 1157 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
PRDM2Q13029 MIR7-2-201ENST00000384970 110 ntBASIC2.96□□□□□ -1.93
PRDM2Q13029 AL138775.1-201ENST00000429539 575 ntTSL 1 (best) BASIC2.96□□□□□ -1.93
PRDM2Q13029 LINC01309-201ENST00000444795 492 ntTSL 3 BASIC2.96□□□□□ -1.93
PRDM2Q13029 AC090515.1-201ENST00000465295 476 ntBASIC2.96□□□□□ -1.93
PRDM2Q13029 TET2-AS1-201ENST00000515414 537 ntTSL 5 BASIC2.96□□□□□ -1.93
PRDM2Q13029 SYF2P1-201ENST00000550658 413 ntBASIC2.96□□□□□ -1.93
PRDM2Q13029 KATNBL1P1-201ENST00000605192 748 ntBASIC2.96□□□□□ -1.93
PRDM2Q13029 LINC02112-205ENST00000606744 236 ntTSL 1 (best) BASIC2.96□□□□□ -1.93
PRDM2Q13029 AC034102.8-201ENST00000615146 484 ntBASIC2.96□□□□□ -1.93
PRDM2Q13029 UHMK1-204ENST00000545294 8117 ntTSL 2 BASIC2.96□□□□□ -1.94
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PRDM2Q13029 AL078590.2-202ENST00000422736 568 ntTSL 3 BASIC2.96□□□□□ -1.94
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PRDM2Q13029 AC078918.1-201ENST00000498515 228 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
PRDM2Q13029 AC090071.1-201ENST00000507713 644 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
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PRDM2Q13029 OR5H8-201ENST00000394191 1045 ntAPPRIS P1 BASIC2.95□□□□□ -1.94
PRDM2Q13029 AC027124.2-201ENST00000428249 105 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
PRDM2Q13029 AC091906.1-201ENST00000511310 391 ntTSL 2 BASIC2.95□□□□□ -1.94
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PRDM2Q13029 PIGY-201ENST00000527353 217 ntAPPRIS P1 BASIC2.95□□□□□ -1.94
PRDM2Q13029 AC008687.2-201ENST00000597865 520 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
PRDM2Q13029 ZNF451-208ENST00000491832 3632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.95□□□□□ -1.94
PRDM2Q13029 NBPF20-202ENST00000392971 18450 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.95□□□□□ -1.94
PRDM2Q13029 RNU6-53P-201ENST00000365367 106 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
PRDM2Q13029 AL078645.1-201ENST00000414377 423 ntTSL 3 BASIC2.94□□□□□ -1.94
PRDM2Q13029 C1orf143-201ENST00000443836 762 ntTSL 2 BASIC2.94□□□□□ -1.94
PRDM2Q13029 LINC01474-202ENST00000449235 628 ntTSL 3 BASIC2.94□□□□□ -1.94
PRDM2Q13029 SSXP1-201ENST00000453640 473 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
PRDM2Q13029 AC090453.1-201ENST00000495560 436 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
PRDM2Q13029 AC010625.1-201ENST00000511296 403 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
PRDM2Q13029 AL355076.2-202ENST00000553754 574 ntTSL 4 BASIC2.94□□□□□ -1.94
PRDM2Q13029 AP005057.1-201ENST00000583827 574 ntTSL 4 BASIC2.94□□□□□ -1.94
PRDM2Q13029 MME-216ENST00000615825 5523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.94□□□□□ -1.94
PRDM2Q13029 RNA5SP37-201ENST00000365420 130 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
PRDM2Q13029 HMGB1P10-201ENST00000395823 563 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
PRDM2Q13029 LINC01307-201ENST00000439146 474 ntTSL 3 BASIC2.93□□□□□ -1.94
PRDM2Q13029 RPS15AP7-201ENST00000439294 405 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
PRDM2Q13029 OR51B8P-201ENST00000449892 769 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
PRDM2Q13029 AL137159.1-201ENST00000452808 512 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
PRDM2Q13029 RPL23AP55-201ENST00000498163 452 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
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